| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 431,343 | A→G | 5.1% | I324T (ATC→ACC) | PP_0354 ← | CBS domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 431,343 | 0 | A | G | 5.1% | 235.4 / 2.1 | 78 | I324T (ATC→ACC) | PP_0354 | CBS domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (38/36); new base G (2/2); total (40/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.66e-01 | |||||||||||
GCTAAACGGCACGCCCGGGTCGCCACGTTCGGCCAGGGCCAGTTCGATGACCCGGCACACGGTATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGCGTATGGTGCGCGCCAGGTGAACCAGATCGACCCGTTGCAGGGAGAACAGGTCGCGCTCGGAAACCACGCCGCACAGGCGTCCGTTTTCCACCAGGCAGACATG > NC_002947/431198‑431491 | gcTAAACGGCACGCCCGGGTCGCCACGTTCGGCCAGGGCCAGTTCGATGACCCGGCACACGGTATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGAttt > 3:255256/1‑149 (MQ=255) tAAACGGCACGCCCGGGTCGCCACGTTCGGCCAGGGCCAGTTCGATGACCCGGCACACGGTATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTcg > 8:220454/1‑149 (MQ=255) tAAACGGCACGCCCGGGTCGCCACGTTCGGCCAGGGCCAGTTCGATGACCCGGCACACGGTATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTcg > 6:410597/1‑149 (MQ=255) aaaCGGCACGCCCGGGTCGCCACGTTCGGCCAGGGCCAGTTCGATGACCCGGCACACGGTATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTcgc < 2:373013/149‑1 (MQ=255) ggCACGCCCGGGTCGCCACGTTCGGCCAGGGCCAGTTCGATGACCCGGCACACGGTATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGAt > 5:305327/1‑140 (MQ=255) ggCACGCCCGGGTCGCCACGTTCGGCCAGGGCCAGTTCGATGACCCGGCACACGGTATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGAt < 6:305327/140‑1 (MQ=255) ggCACGCCCGGGTCGCCACGTTCGGCCAGGGCCAGTTCGATGACCCGGCACACGGTATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCcgcg > 4:52460/1‑149 (MQ=255) gCACGCCCGGGTCGCCACGTTCGGCCAGGGCCAGTTCGATGACCCGGCACACGGTATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCgcgc < 4:279387/149‑1 (MQ=255) gCCCGGGTCGCCACGTTCGGCCAGGGCCAGTTCGATCACCCGGCACACGGTATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCg < 2:7403/149‑1 (MQ=255) ccGGGTCGCCACGTTCGGCCAGGGCCAGTTCGATGACCCGGCACACGGTATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGaa < 2:325227/149‑1 (MQ=255) ccGGGTCGCCACGTTCGGCCAGGGCCAGTTCGATGACCCGGCACACGGTATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGaa < 7:220454/149‑1 (MQ=255) gggTCGCCACGTTCGGCCAGGGCCAGTTCGATGACCCGGCACACGGTATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAAc < 6:104514/149‑1 (MQ=255) gCCACGTTCGGCCAGGGCCAGTTCGATGACCCGGCACACGGTATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGGTTTCGCTGCGCGGCGAAATCAGcc < 2:46195/149‑2 (MQ=255) gCCACGTTCGGCCAGGGCCAGTTCGATGACCCGGCACACGGTATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCa < 6:47812/146‑1 (MQ=255) gCCACGTTCGGCCAGGGCCAGTTCGATGACCCGGCACACGGTATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCa > 5:47812/1‑146 (MQ=255) gCCACGTTCGGCCAGGGCCAGTTCGATGACCCGGCACACGGTATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGc < 4:175079/148‑1 (MQ=255) ccACGTTCGGCCAGGGCCAGTTCGATGACCCGGCACACGGTATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCg > 1:42779/1‑148 (MQ=255) ccACGTTCGGCCAGGGCCAGTTCGATGACCCGGCACACGGTATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGAATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACAAGCg > 5:401471/1‑148 (MQ=255) cACGTTCGGCCAGGGCCAGTTCGATGACCCGGCACACGGTATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGGTTTCGCTGCGCGGCGAAATCAGc < 4:80637/146‑1 (MQ=255) cACGTTCGGCCAGGGCCAGTTCGATGACCCGGCACACGGTATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGGTTTCGCTGCGCGGCGAAATCAGc > 3:80637/1‑146 (MQ=255) cGGCCAGGGCCAGTTCGATGACCGGGCACACGGTATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATATGCGTCGACCATGCGACATGGGCCAGCATGCGTTCTAGAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAg < 6:86081/148‑1 (MQ=255) gccagggccagTTCGATGACCCGGCACACGGTATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCg > 1:217812/1‑149 (MQ=255) ccagggccagTTCGATGACCCGGCACACGGTATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGt > 3:334941/1‑149 (MQ=255) ccagggccagTTCGATGACCCGGCACACGGTATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGt > 3:58623/1‑149 (MQ=255) cagggccagTTCGATGACCCGGCACACGGTATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGc > 4:174004/1‑136 (MQ=255) cagggccagTTCGATGACCCGGCACACGGTATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGc < 3:174004/136‑1 (MQ=255) cagggccagTTCGATGACCCGGCACACGGTATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTg > 6:402220/1‑149 (MQ=255) aggtcaagTTCGATGACCCGGCACCCGGTATGGGCGTTGACCAAGGTAATGATCTGGGGGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTgg < 8:366014/143‑1 (MQ=255) gccagTTCGATGACCCGGCACACGGTATGGTCGTTGAGCAACGTAATGATCTGGGTGCTCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGgcgc < 8:181183/149‑1 (MQ=255) ccagTTCGATGACCCGGCACACGGTATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCa > 1:304198/1‑149 (MQ=255) ccagTTCGATGACCCGGCACACGGTATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGATGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCa > 6:42652/1‑149 (MQ=255) cagTTCGATGACCCGGCACACGGTATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAAc < 6:263275/126‑1 (MQ=255) cagTTCGATGACCCGGCACACGGTATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAAc > 5:263275/1‑126 (MQ=255) ttCGATGACCCGGCACACGGTATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGc > 1:144262/1‑149 (MQ=255) aTGACCCGGCACACGGTATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGCGTAt > 7:367788/1‑149 (MQ=255) gACCCGGCACACGGTATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGc > 8:372739/1‑112 (MQ=255) gACCCGGCACACGGTATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGc < 7:372739/112‑1 (MQ=255) ggCACACGGTATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCa > 8:140609/1‑114 (MQ=255) ggCACACGGTATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCa < 7:140609/114‑1 (MQ=255) cGGTATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGCGTATGGTGCGCGCCAgg < 2:42779/149‑1 (MQ=255) ggTATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGCGTATGGTGCGCGCCAGGt < 5:410597/149‑1 (MQ=255) tATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGCGTATGGTGCGCGCCAGGTg > 7:262914/1‑148 (MQ=255) ggTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGaa < 2:226343/98‑1 (MQ=255) ggTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGaa > 1:226343/1‑98 (MQ=255) gTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGCGTATGGTGCGCGCCAGGTGAAcc < 8:262914/148‑1 (MQ=255) gTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGCGTATGGTGCGCGCCAGGTGAACCAGa < 1:261435/148‑1 (MQ=255) gtcaGCAAGGTAATGATCTGGGTGCTCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGGTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGCTTATGGTGCGCGCCAGGTGAACCAGATc < 3:50621/146‑1 (MQ=255) aGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGCGTATGGTGCGCGCCAGGTGAACCAGATCGAc < 3:52460/149‑1 (MQ=255) gCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGCGTATGGTGCGCGCCAGGTGAACCAGATCGAc < 4:334941/148‑1 (MQ=255) ggTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGCGTATGGTGCGCGCCAGGTGAACCAGATCGACCCGtt < 8:367788/149‑1 (MQ=255) tAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGCGTATGGTGCGCGCCAGGTGAACCAGATCGACCCGTTGc < 5:351606/149‑1 (MQ=255) aTGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGCGTATGGTGCGCGCCAGGTGAACCAGATCGACCCGTTGCAg > 1:312118/1‑149 (MQ=255) aTGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGCGTATGGTGCGCGCCAGGTGAACCAGATCGACCCGTTGCAg > 5:57661/1‑149 (MQ=255) tCTGGGTGATGTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGCGTATGGTGCGCGCCAGGTGAACCAGATCGACCCGTTGCAGGga < 4:255256/148‑1 (MQ=255) ggTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGCGTATGGTGCGCGCCAGGTGAACCAGATCGACCCGTTGCAGGga < 2:217812/144‑1 (MQ=255) gTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGCGTATGGTGCGCGCCAGGTGAACCAGATCGACCCGTTGCAGGGAGaa > 3:336693/1‑146 (MQ=255) gTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGCGTATGGTGCGCGCCAGGTGAACCAGATCGACCCGTTGCAGGGAGAACa < 4:336693/148‑1 (MQ=255) gATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGCGTATGGTGCGCGCCAGGTGAACCAGATCGACCCGTTGCAGGGAGAACAGGt > 2:180262/1‑149 (MQ=255) cGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGCGTATGGTGCGCGCCAGGTGAACCAGATCGACCCGTTGCAGGGAGAACAGGTCgcgc < 6:57661/148‑1 (MQ=255) tCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGCGTATGGTGCGCGCCAGGTGAAc > 8:282641/1‑112 (MQ=255) tCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGCGTATGGTGCGCGCCAGGTGAAc < 7:282641/112‑1 (MQ=255) gacgaTGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGCGTATGGTGCGCGCCAGGTGAACCAGATCGACCCGTTGCAGGGAGAACAGGTCGCGCTCgg < 5:402220/148‑1 (MQ=255) cgaTGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGCGTATGGTGCGCGCCAGGTGAACCAGATCGa > 6:391256/1‑116 (MQ=255) cgaTGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGCGTATGGTGCGCGCCAGGTGAACCAGATCGa < 5:391256/116‑1 (MQ=255) gcgcCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGCGTATGGTGCGCGCCAGGTGAACCAGATCGACCCGTTGCAGGGAGAACAGGTCGCGCTCGGAAACCAc > 6:413378/1‑149 (MQ=255) cgcCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGCGTATGGTGCGCGCCAGGTGAACCAGATCGACCCGTTGCAGGGAGAACAGGTCGCGCTCGGAAACCAcg > 7:288200/1‑149 (MQ=255) gcCATGGGCCAGCATGCGTTCTACTAGCTGGCTGATTTCGCCTGGCAGCGAAACGAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGCGTATGGTGCGCGCCAGGTGAACCAGATCGACCCGTTGCAGGGAGAACAGGTCGCGCTCGGAAACCAcgc < 6:401471/149‑1 (MQ=255) gcCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGCGTATGGTGCGCGCCAGGTGAACCAGATCGACCCGTTGCAGGGAGAACAGGTCGCGCTCGGAACCCAcgc > 3:302476/1‑149 (MQ=255) cATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGCGTATGGTGCGCGCCAGGTGAACCAGATCGACCCGTTGCAGGGAGAACAGGTCGCGCTCGGAAACCACGCCGCACAGGCGTc > 6:251564/1‑149 (MQ=255) cGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGCGTATGGTGCGCGCCAGGTGAACCAGATCGACCCGTTGCAGGGAGAACAGGTCGCGCTCGGAAACCACGCCGCACAGGCGTCCGtt > 4:223407/1‑149 (MQ=255) gTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGCGTATGGTGCGCGCCAGGTGAACCAGATCGACCCGTTGCAGGGAGAACAGGTCGCGCTCGGAAACCACGCCGCACAGGCGTCCGttt > 1:389149/1‑149 (MQ=255) gTTCTACAAGCTGGATGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGCGTATGGTGCGCGCCAGGTGAACCAGATCGACCCGTTGCAGGGAGAACAGGTCGCGCTCGGAAACCACGCCGCACAGGCGTCCGttt < 5:42652/149‑1 (MQ=255) ttCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGCGTATGGTGCGCGCCAGGTGAACCAGATCGACCCGTTGCAGGGAGAACAGGTCGCGCTCGGAAACCACGCCGCACAGGCGTCCGttt > 2:5468/1‑148 (MQ=255) tACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGCGTATGGTGCGCGCCAGGTGAACCAGATCGACCCGTTGCAGGGAGAACAGGTCGCGCTCGGAAACCACGCCGCACAGGCGTCCGTTTTcca > 5:329428/1‑149 (MQ=255) cAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGCGTATGGTGCGCGCAAGGTGAACCAGATCGACCCGTTGCAGGGAGAACAGGTCGCGCTCGGAAACCACGCCGCACAGGCGTCCGTTTTccacc < 2:312118/149‑1 (MQ=255) gctgGTTTCGCTGCGCGGCGAAATCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGCGTATGGTGCGCGCCAGGTGAACCAGATCGACCCGTTGCAGGGAGAACAGGTCGCGCTCGGAAACCACGCCGCACAGGCGTCCGTTTTCCACCAGGCAGa > 3:257436/1‑149 (MQ=255) ctgATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGCGTATGGTGCGCGCCAGGTGAACCAGATCGACCCGTTGCAGGGAGAACAGGTCGCGCTCGGAAACCACGCCGCACAGGCGTCCGTTTTCCACCAGGCAGa > 4:327505/1‑148 (MQ=255) gATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGCGTATGGTGCGCGCCAGGTGAACCAGATCGACCCGTTGCAGGGAGAACAGGTCGCGCTCGGAAACCACGCCGCACAGGCGTCCGTTTTCCACCAGGCAGACAt > 2:236239/1‑149 (MQ=255) aTTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGCGTATGGTGCGCGCCAGGTGAACCAGATCGACCCGTTGCAGGGAGAACAGGTCGCGCTCGGAAACCACGCCGCACAGGCGTCCGTTTTCCACCAGGCAGACATg < 4:302476/149‑1 (MQ=255) | GCTAAACGGCACGCCCGGGTCGCCACGTTCGGCCAGGGCCAGTTCGATGACCCGGCACACGGTATGGTCGTTGAGCAAGGTAATGATCTGGGTGATCTGCGTCGACGATGCGCCATGGGCCAGCATGCGTTCTACAAGCTGGCTGATTTCGCCGCGCAGCGAAACCAGCGTATCCAGGCGTGGCGCATGGCGTATGGTGCGCGCCAGGTGAACCAGATCGACCCGTTGCAGGGAGAACAGGTCGCGCTCGGAAACCACGCCGCACAGGCGTCCGTTTTCCACCAGGCAGACATG > NC_002947/431198‑431491 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |