Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,515,926 | G→C | 5.7% | P34A (CCC→GCC) | cbpA ← | curved DNA‑binding protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,515,926 | 0 | G | C | 5.7% | 225.4 / 3.5 | 70 | P34A (CCC→GCC) | cbpA | curved DNA‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (28/38); new base C (2/2); total (30/40) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.79e-01 |
TGGTGCCTGGAACGGCCGGCCATGCTGGCCGCCGTACTTGCGGATTTCATCGAACTCGGCACGTTTCTGC‑GCGTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTCGTC‑CGCAGTGGGCTCTACGCCGAGTATCTTGTAATAGTCTTTGAAGTCCATTTATGGATCACCAATGTGAATGTGCATGTTGCAACTGAAGATAGGGGT > NC_002947/5515780‑5516073 | tggtgCCTGGAACGGCCGGCCATGCTGGCCGCCGTACTTGCGGATTTCATCGAACTCGGCACGTTTCTGC‑GCGTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGt < 3:41509/149‑1 (MQ=255) tggtgCCTGGAACGGCCGGCCATGCTGGCCGCCGTACTTGCGGATTTCATCGAACTCGGCACGTTTCTGC‑GCGTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGt < 7:360475/149‑1 (MQ=255) tggtgCCTGGAACGGCCGGCCATGCTGGCCGCCGTACTTGCGGATTTCATCGAACTCGGCACGTTTCTGC‑GCGTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGt < 4:171329/149‑1 (MQ=255) gtgCCTGGAAAGGCCGGGCATGCTGGCCGCCGTACTTGCGGATTTCATCGAACTCGGCACGTTTGTTCGGGGTCCTCCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCggg < 1:330509/148‑1 (MQ=255) ccTGGAACGGCCGGCCATGCTGGCCGCCGTACTTGCGGATTTCATCGAACTCGGCACGTTTCTGC‑GCGTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATAc > 4:358485/1‑149 (MQ=255) gAACGGCCGGCCATGCTGGCCGCCGTACTTGCGGATTTCATCGAACTCGGCACGTTTCTGC‑GCGTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACtt < 4:14113/147‑1 (MQ=255) aCGGCCGGCCATGCTGGCCGCCGTACTTGCGGATTTCATCGAACTCGGCACGTTTCTGC‑GCGTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTgcgc < 1:355667/149‑1 (MQ=255) aCGGCCGGCCATGCTGGCCGCCGTACTTGCGGATTTCATCGAACTCGGCACGTTTCTGC‑GCGTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTgcgc < 5:23078/149‑1 (MQ=255) ccggccATGCTGGCCGCCGTACTTGCGGATTTCATCGAACTCGGCACGTTTCTGC‑GCGTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTgcgcgc > 4:331039/1‑147 (MQ=255) ccggccATGCTGGCCGCCGTACTTGCGGATTTCATCGAACTCGGCACGTTTCTGC‑GCGTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTgcgcgc > 5:207073/1‑147 (MQ=255) aTGCTGGCCGCCGTACTTGCGGATTTCATCGAACTCGGCACGTTTCTGC‑GCGTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGc < 6:207073/149‑1 (MQ=255) tGCTGGCCGCCGTACTTGCGGATTTCATCGAACTCGGCACGTTTCTGC‑GCGTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCg < 3:331039/149‑1 (MQ=255) tGCTGGCCGCCGTACTTGCGGATTTCATCGAACTCGGCACGTTTCTGC‑GCGTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCg > 3:68455/1‑149 (MQ=255) tGGCCGCCGTACTTGCGGATTTCATCGAACTCGGCACGTTTCTGC‑GCGTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTa > 3:42615/1‑149 (MQ=255) gccgccGTACTTGCGGATTTCATCGAACTCGGCACGTTTCTGC‑GCGTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTAcg > 6:199196/1‑149 (MQ=255) gccgTACTTGCGGATTTCATCGAACTCGGCACGTTTCTGC‑GCGTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCgg < 7:101370/149‑1 (MQ=255) ccgTACTTGCGGATTTCATCGAACTCGGCACGTTTCTGC‑GCGTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGc > 3:354477/1‑149 (MQ=255) ccgTACTTGCGGATTTCATCGAACTCGGCACGTTTCTGC‑GCGTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGc < 7:223774/149‑1 (MQ=255) gTACTTGCGGATTTCATCGAACTCGGCACGTTTCTGC‑GCGTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCt < 3:358485/149‑1 (MQ=255) tACTTGCGGATTTCATCGAACTCGGCACGTTTCTGC‑GCGTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTCCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCtt < 1:12297/149‑1 (MQ=255) ttGCGGATTTCATCGAACTCGGCACGTTTCTGC‑GCGTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGAt > 1:53195/1‑149 (MQ=255) gCGGATTTCATCGAACTCGGCACGTTTCTGC‑GCGTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATc < 8:222892/148‑1 (MQ=255) ggATTTCATCGAACTCGGCACGTTTCTGC‑GCGTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGcc > 2:220469/1‑149 (MQ=255) gATTTCATCGAACTCGGCACGTTTCTGC‑GCGTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCt > 1:300341/1‑149 (MQ=255) aTTTCATCGAACTCGGCACGTTTCTGC‑GCGTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCtt < 3:113029/149‑1 (MQ=255) aTTTCATCGAACTCGGCACGTTTCTGC‑GCGTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCtt < 3:149515/149‑1 (MQ=255) tCATCGAACTCGGCACGTTTCTGC‑GCGTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCtttt < 4:330508/148‑1 (MQ=255) cATCGAACTCGGCACGTTTCTGC‑GCGTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTc < 2:229291/148‑1 (MQ=255) cATCGAACTCGGCACGTTTCTGC‑GCGTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTCg > 3:356503/1‑149 (MQ=255) aTCGAACTCGGCACGTTTCTGC‑GCGTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTCGt > 4:365340/1‑149 (MQ=255) tCGAACTCGGCACGTTTCTGC‑GCGTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTCGTc < 4:354477/149‑1 (MQ=255) gAACTCGGCACGTTTCTGC‑GCGTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTGCATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTCGTc‑c < 1:95154/149‑1 (MQ=255) gAACTCGGCACGTTTCTGC‑GCGTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTCGTc‑c < 3:334022/148‑1 (MQ=255) gAACTCGGCACGTTTCTGC‑GCGTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTCGTC‑Cg < 1:220469/149‑1 (MQ=255) ggCACGTTTCTGC‑GCGTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTCGTC‑CGCAGTgg > 6:368651/1‑149 (MQ=255) gCACGTTTCTGC‑GCGTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTc > 8:353810/1‑137 (MQ=255) gCACGTTTCTGC‑GCGTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTc < 7:353810/137‑1 (MQ=255) tttCTGC‑GCGTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTCGTC‑CGCAGTGGGCTCTa < 4:42615/149‑1 (MQ=255) c‑gcgTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTCGTC‑CGCAGTGGGCTCTACGc < 8:32480/146‑1 (MQ=255) c‑gcgTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTCGTC‑CGCAGTGGGCTCTACGCCGa < 5:199196/149‑1 (MQ=255) gTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTg > 8:96370/1‑85 (MQ=255) gTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTg < 7:96370/85‑1 (MQ=255) c‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATGGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTCGTC‑CGCAGTTGGCTCTACGCCGAGTATc < 1:250049/149‑1 (MQ=255) gCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTCGTC‑CGCAGTGGGCTCTACGCCGAGTATc < 2:300341/148‑1 (MQ=255) gCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTCGTC‑CGCAGTGGGCTCTACGCCGAGTATCt > 2:80208/1‑149 (MQ=255) ccAGCACCACAAAGGCCACGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGAGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTCGTC‑CGCAGTGGGCTCTACGCCGAGTaacatg > 8:309854/1‑144 (MQ=255) cAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTCGTC‑CGCAGTGGGCTCTACGCCGAGTATCTTg > 2:304177/1‑148 (MQ=255) cTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTg > 5:163734/1‑85 (MQ=255) cTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTg < 6:163734/85‑1 (MQ=255) cTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCCTTTCGTC‑CGCAGTGGGCTCTACGCCGAGTATCTTGTAATAGt < 4:68455/149‑1 (MQ=255) ggCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTCGTC‑CGCAGTGGGCTCTACGCCGAGTATCTTGTAATAGTCTTTg < 6:218183/148‑1 (MQ=255) gCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTCGTC‑CGCAGTGGGCTCTACGCCGAGTATCTTGTAATAGTCTTTg > 2:346587/1‑147 (MQ=255) ccTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTCGTC‑CGCAGTGGGCTCTACGCCGAGTATCTTGTAATAGTCTTTGAAg > 7:223528/1‑149 (MQ=255) gCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTc < 3:174364/95‑1 (MQ=255) gCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTc > 4:174364/1‑95 (MQ=255) ctcctTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTCGTCTCGCAGTGGGCTCTACGCCGAGTATCTTGTAATAGTCTTTGAAGTCCATTTAt < 1:304177/149‑1 (MQ=255) ctTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTCGTC‑CGCAGTGGGCTCTACGCCGAGTATCTTGTAATAGTCTTTGAAGTCCATTTATgg < 8:286308/147‑1 (MQ=255) ctTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTCGTC‑CGCAGTGGGCTCTACGCCGAGTATCTTGTAATAGTCTTTGAAGTCCATTTATgg < 1:62810/147‑1 (MQ=255) ctTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGCGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTCGTC‑CGCAGTGGGCTCTACGCCGAGTATCTTGTAATAGTCTTTGAAGTCCATTTATGGAt > 6:186667/1‑149 (MQ=255) ctTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGCGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTCGTC‑CGCAGTGGGCTCTACGCCGAGTATCTTGTAATAGTCTTTGAAGTCCATTTATGGAt > 6:180655/1‑149 (MQ=255) tcGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTCGTC‑CGCAGTGGGCTCTACGCCGAGTATCTTGTAATAGTCTTTGAAGTCCATTTATGGATCACCaatgtgaat > 2:351625/1‑149 (MQ=255) ggCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTCGTC‑CGCAGTGGGCTCTACGCCGAGTATCTTGTAATAGTCTTTGAAGTCCATTTATGGATCACCaatgtgaatgt < 1:80208/149‑1 (MQ=255) ggCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTCGTC‑CGCAGTGGGCTCTACGCCGAGTATCTTGTAATAGTCTTTGAAGTCCATTTATGGATCACCaatgtgaat < 3:365340/147‑1 (MQ=255) ggCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGCGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTCGTC‑CGCAGTGGGCTCTACGCCGAGTATCTTGTAATAGTCTTTGAAGTCCATTTATGGATCACCaatgtgaat < 5:180655/147‑1 (MQ=255) ggCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGCGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTCGTC‑CGCAGTGGGCTCTACGCCGAGTATCTTGTAATAGTCTTTGAAGTCCATTTATGGATCACCaatgtgaat < 5:186667/147‑1 (MQ=255) cgcTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTCGTC‑CGCAGTGGGCTCTACGCCGAGTATCTTGTAATAGTCTTTGAAGTCCATTTATGGATCACCAATGTGAATGTGCATGtt > 7:267786/1‑149 (MQ=255) cTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTCGTC‑CGCAGTGGGCTCTACGCCGAGTATCTTGTAATAGTCTTTGAAGTCCATTTATGGATCACCAATGTGAATGTGCATGTTGc < 4:356503/149‑1 (MQ=255) tCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTCGTC‑CGCAGTGGGCTCTACGCCGAGTATCTTGTAATAGTCTTTGAAGTCCATTTATGGATCACCAATGTGAATGTGCATGTTGc > 1:63995/1‑148 (MQ=255) cTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTCGTC‑CGCAGTGGGCTCTACGCCGAGTATCTTGTAATAGTCTTTGAAGTCCATTTATGGATCACCAATGTGAATGTGCATGTTGCAACTGaa > 7:218716/1‑149 (MQ=255) aCATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTCGTC‑CGCAGTGGGCTCTACGCCGAGTATCTTGTAATAGTCTTTGAAGTCCATTTATGGATCACCAATGTGAATGTGCATGTTGCAACTGAAGa > 6:279363/1‑148 (MQ=255) tCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTCGTC‑CGCAGTGGGCTCTACGCCGAGTATCTTGTAATAGTCTTTGAAGTCCATTTATGGATCACCAATGTGAATGTGCATGTTGCAACTGAAGATAgg > 3:165161/1‑149 (MQ=255) ggggTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTCGTC‑CGCAGTGGGCTCTACGCCGAGTATCTTGTAATAGTCTTTGAAGTCCATTTATGGATCACCAATGTGAATGTGCATGTTGCAACTGAAGATAgggg > 4:33351/1‑149 (MQ=255) ggggTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTCGTC‑CGCAGTGGGCTCTACGCCGAGTATCTTGTAATAGTCTTTGAAGTCCATTTATGGATCACCAATGTGAATGTGCATGTTGCAACTGAAGATAggg < 1:351625/148‑1 (MQ=255) ggggTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTCGTC‑CGCAGTGGGCTCTACGCCGAGTATCTTGTAATAGTCTTTGAAGTCCATTTATGGATCACCAATGTGAATGTGCATGTTGCAACTGAAGATAggg < 8:223528/148‑1 (MQ=255) ggggTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTCGTC‑CGCAGTGGGCTCTACGCCGAGTATCTTGTAATAGTCTTTGAAGTCCATTTATGGATCACCAATGTGAATGTGCATGTTGCAACTGAAGATAggg < 2:19106/148‑1 (MQ=255) gggTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTCGTC‑CGCAGTGGGCTCTACGCCGAGTATCTTGTAATAGTCTTTGAAGTCCATTTATGGATCACCAATGTGAATGTGCATGTTGCAACTGAAGATAGGGGt > 2:403836/1‑149 (MQ=255) | TGGTGCCTGGAACGGCCGGCCATGCTGGCCGCCGTACTTGCGGATTTCATCGAACTCGGCACGTTTCTGC‑GCGTC‑‑GCCCAGCACCTCATAGGCCTCGTTGGCCTCCTTGAATTTCTCCTCGGCGTCGCGCTCCTTACTGACATCGGGGTG‑ATACTTGCGCGCCAGTTTGCGGTACGCGGCCTTGATCGCCTTTTCGTC‑CGCAGTGGGCTCTACGCCGAGTATCTTGTAATAGTCTTTGAAGTCCATTTATGGATCACCAATGTGAATGTGCATGTTGCAACTGAAGATAGGGGT > NC_002947/5515780‑5516073 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |