Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,570,178 | G→C | 6.4% | A24G (GCA→GGA) ‡ | nnrD ← | ADP‑dependent (S)‑NAD(P)H‑hydrate dehydratase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,570,178 | 0 | G | C | 6.4% | 200.9 / 3.9 | 62 | A24G (GCA→GGA) ‡ | nnrD | ADP‑dependent (S)‑NAD(P)H‑hydrate dehydratase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (27/31); new base C (2/2); total (29/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.23e-01 |
GTGCTCGGGCCGGGTTGCCACGCTGACCAGCCCGGCGCCGCAACGCAGGGCGGCTTCGGCACTGAGCAACACAGCGCCTCCGGTACCCAGGTCG‑CCCCCGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCGGCATGGGGTCAAAGGCTCCAATGTCTGGCAGAATTATACGCACCTGAGCCCGTATTGCCTTGCCCATCCATGTCCGCCTC > NC_002947/5570030‑5570324 | gTGCTCGGGCCGGGTTGCCACGCTGACCAGCCCGGCGCCGCAACGCAGGGCGGCTTCGGCACTGAGCAACACAGCGCCTCCGGTACCCAGGTCG‑CCCCCGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCtgccgtg > 7:121260/1‑149 (MQ=255) cTCGGGCCGGGTTGCCACGCTGACCAGCCCGGCGCCGCAACGCAGGGCGGCTTCGGCACTGAGCAACACAGCGCCTCCGGTACCCAGGTCGCCCCCCGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCtgccgtgcc > 7:50119/1‑149 (MQ=255) ccGGGTTGCCACGCTGACCAGCCCGGCGCCGCAACGCAGGGCGGCTTCGGCACTGAGCAACACAGCGCCTCCGGTACCCAGGTCG‑CCCCCGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGc > 7:259049/1‑149 (MQ=255) ccGGGTTGCCACGCTGACCAGCCCGGCGCCGCAACGCAGGGCGGCTTCGGCACTGAGCAACACAGCGCCTCCGGTACCCAGGTCG‑CCCCCGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGGCACGGCAGGc < 1:373257/149‑1 (MQ=255) cACGCTGACCAGCCCGGCGCCGCAACGCAGGGCGGCTTCGGCACTGAGCAACACAGCGCCTCCGGTACCCAGGTCG‑CCCCCGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCgg > 4:349982/1‑135 (MQ=255) cACGCTGACCAGCCCGGCGCCGCAACGCAGGGCGGCTTCGGCACTGAGCAACACAGCGCCTCCGGTACCCAGGTCG‑CCCCCGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCgg < 3:349982/135‑1 (MQ=255) cTGACCAGCCCGGCGCCGCAACGCAGGGCGGCTTCGGCACTGAGCAACACAGCGCCTCCGGTACCCAGGTCG‑CCCCCGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCAc < 6:350412/149‑1 (MQ=255) gCCCGGCGCCGCAACGCAGGGCGGCTTCGGCACTGAGCAACACAGCGCCTCCGGTACCCAGGTCG‑CCCCCGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTCCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGctgctg > 7:135418/1‑149 (MQ=255) gCCCGGCGCCGCAACGCAGGGCGGCTTCGGCACTGAGCAACACAGCGCCTCCGGTACCCAGGTCG‑CCCCCGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCAGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACgctgct > 2:393956/1‑148 (MQ=255) cccGGCGCCGCAACGCAGGGCGGCTTCGGCACTGAGCAACACAGCGCCTCCGGTACCCAGGTCG‑CCCCCGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACgctgct > 3:338727/1‑147 (MQ=255) gcAACGCAGGGCGGCTTCGGCACTGAGCAACACAGCGCCTCCGGTACCCAGGTCG‑CCCCCGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATtgtg < 8:108369/149‑1 (MQ=255) gcAACGCAGGGCGGCTTCGGCACTGAGCAACACAGCGCCTCCGGTACCCAGGTCG‑CCCCCGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCCGAGCAATtgtg > 7:130885/1‑149 (MQ=255) cAACGCAGGGCGGCTTCGGCACTGAGCAACACAGCGCCTCCGGTACCCAGGTCG‑CCCCCGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTgg < 8:121260/149‑1 (MQ=255) cGCAGGGCGGCTTCGGCACTGAGCAACACAGCGCCTCCGGTACCCAGGTCGCCCCCCGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTgggg < 8:50119/149‑1 (MQ=255) gcTTCGGCACTGAGCAACACAGCGCCTCCGGTACCCAGGTCG‑CCCCCGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTggg < 1:149334/149‑1 (MQ=255) gcTTCGGCACTGAGCAACACAGCGCCTCCGGTACCCAGGTCG‑CCCCCGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTggg > 7:305297/1‑149 (MQ=255) gcTTCGGCACTGAGCAACACAGCGCCTCCGGTACCCAGGTCG‑CCCCCGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCCGAGCAATTGTGGGGCATTACTggg < 8:130885/149‑1 (MQ=255) cTTCGGCACTGAGCAACACAGCGCCTCCGGTACCCAGGTCG‑CCCCCGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCAGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTgggg < 1:393956/149‑1 (MQ=255) ttCGGCACTGAGCAACACAGCGCCTCCGGTACCCAGGTCG‑CCCCCGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGgt > 7:94013/1‑149 (MQ=255) cACTGAGCAACACAGCGCCTCCGGTACCCAGGTCG‑CCCCCGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCgg < 5:48200/101‑1 (MQ=255) cACTGAGCAACACAGCGCCTCCGGTACCCAGGTCG‑CCCCCGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCgg > 6:48200/1‑101 (MQ=255) cAACACAGCGCCTCCGGTACCCAGGTCG‑CCCCCGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCg > 5:395412/1‑149 (MQ=255) aaCACAGCGCCTCCGGTACCCAGGTCG‑CCCCCGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTggg > 4:315093/1‑134 (MQ=255) aaCACAGCGCCTCCGGTACCCAGGTCG‑CCCCCGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTggg < 3:315093/134‑1 (MQ=255) cacaGCGCCTCCGGTACCCAGGTCG‑CCCCCGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACgctg > 4:94394/1‑106 (MQ=255) cacaGCGCCTCCGGTACCCAGGTCG‑CCCCCGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACgctg < 3:94394/106‑1 (MQ=255) cacaGCGCCTCCGGTACCCAGGTCG‑CCCCCGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCGGCa > 1:379089/1‑149 (MQ=255) cacaGCGCCTCCGGTACCCAGGTCG‑CCCCCGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTATGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCGGCa > 7:344563/1‑149 (MQ=255) aGCGCCTCCGGTACCCAGGTCG‑CCCCCGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCGGCATgg < 8:88782/149‑1 (MQ=255) aGCGCCTCCGGTACCCAGGTCG‑CCCCCGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGAATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCGGCATgg > 8:2188/1‑149 (MQ=255) cGGTACCCAGGTCG‑CCCCCGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCGGCATggg < 5:336311/142‑1 (MQ=255) cGGTACCCAGGTCG‑CCCCCGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCGGCATggg > 6:336311/1‑142 (MQ=255) cGGTACCCAGGTCG‑CCCCCGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCGGCATGAGGTCaaa < 1:402923/148‑1 (MQ=255) ccAGGTCG‑CCCCCGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCGGCATGGGGTCAAAGGc > 6:122018/1‑145 (MQ=255) ccAGGTCG‑CCCCCGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCGGCATGGGGTCAAAGGc < 5:122018/145‑1 (MQ=255) ccAGGTCG‑CCCCCGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCGGCATGGGGTCAAAGGCTcc > 6:376878/1‑148 (MQ=255) g‑CCCCCGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCGGCATGGGGTCAAAGGCTCCAATGTCt < 8:94013/148‑1 (MQ=255) g‑CCCCCGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCGGCATGGGGTCAAAGGCTCCAATGTCt < 3:65129/148‑1 (MQ=255) ccGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCGGCATGGGGTCAAAGGCTcc < 3:2646/137‑1 (MQ=255) ccGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCGGCATGGGGTCAAAGGCTcc > 4:2646/1‑137 (MQ=255) gACCACCAGTACATGGCGAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCGGCATGGGGTCAAAGGCTCCAATGTCTGGCAGaa < 6:395412/149‑1 (MQ=255) accaGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGAATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCGGCATGGGGTCAAAGGCTCCAATGTCTGGCAGAATtat < 7:2188/149‑1 (MQ=255) ccaGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCGGCATGGGGTCAAAGGCTCCAATGTCTGGCAGAATtata < 4:338727/149‑1 (MQ=255) ccaGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCGGCATGGGGTCAAAGGCTCCAATGTCTGGCAGAATtata > 6:9107/1‑149 (MQ=255) ccaGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCGGCATGGGGTCAAAGGCTCCAATGTCTGGCAGAATtata > 3:287811/1‑149 (MQ=255) caGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCGGCATGGGGTCAAAGGCTCCAATGTCTGGCAGAATTATAc > 3:208801/1‑149 (MQ=255) gCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCGGCATGGGGTCAAAGGCTCCAATGTCTGGCAGAATtatagatcggg > 7:13788/1‑139 (MQ=255) gCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCGGCATGGGGTCAAAGGCTCCAATGTCTGGCAGAATta < 8:13788/137‑1 (MQ=255) cAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCg > 6:135648/1‑99 (MQ=255) cAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCg < 5:135648/99‑1 (MQ=255) gCCTTTGTGCGCCTGCGCCTGCCGGGCCGGCTTGCTGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTCTTTCGTCTGCGGCATGGGGTCAAAGGCTCCAATGTCTGGCAGAATTATACGCACCTCAGCCCGTAttg < 6:248429/149‑1 (MQ=255) tgGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCGGCATGGGGTCAAAGGCTCCAATGTCTGGCAGAATTATACGCACCTGAGCCCGTAttgccttgc < 8:259049/148‑1 (MQ=255) tgGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCGGCATGGGGTCAAAGGCTCCAATGTCTGGCAGAATTATACGCACCTGAGCCCGTAtt < 8:214603/141‑1 (MQ=255) tgGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCGGCATGGGGTCAAAGGCTCCAATGTCTGGCAGAATTATACGCACCTGAGCCCGTAtt > 7:214603/1‑141 (MQ=255) gCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCGGCATGGGGTCAAAGGCTCCAATGTCTGGCAGAATTATACGCACCTGAGCCCGTATTGCCTTGCccat < 5:376878/149‑1 (MQ=255) aTGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCGTCATGGGGTCAAAGGCTCCAATGTCTGGCAGAATTATACGCACCTGAGCCCGTATTGCCTTGCccatcc < 4:208801/149‑1 (MQ=255) aTGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCGGCATGGGGTCAAAGGCTCCAATGTCTGGCAGAATTATACGCACCTGAGCCCGTATTGCCTTGCccatcc < 5:9107/149‑1 (MQ=255) aTGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGGCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCGGCATGGGGTCAACGGCTCCAATGTCTGGCAGAATTATACGCACCTGAGCCCGTATTGCCTTGCccatcc < 5:87410/149‑1 (MQ=255) gcgcCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAATCCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCGGCAGGGGGTCAAAGGCTCCAATGTCTGGCAGAATTATACGCACCTGAGCCCGTATTGCCTTGCccatcca > 1:218379/1‑149 (MQ=255) gcgcCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCGGCATGGGGTCAAAGGCTCCAATGTCTGGCAg < 6:91070/109‑1 (MQ=255) gcgcCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCGGCATGGGGTCAAAGGCTCCAATGTCTGGCAg > 5:91070/1‑109 (MQ=255) ccgcCTGCCGGCACGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCGGCATGGGGTCAAAGGCTCCAATGTCTGGCAGAATTATACGCACCTGAGCCCGTATTGCCTTGCccatccat < 4:325886/148‑1 (MQ=255) ccgcCTGCCGGCACGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCGGCATGGGGTCAAAGGCTCCAATGTCTGGCAGAATTATACGCACCTGAGCCCGTATTGCCTTGCccatccat > 3:325886/2‑149 (MQ=255) cgcCTGCCGGCACGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCGGCATGGGGTCAAAGGCTCCAATGTCTGGCAGAATTATACGCACCTGAGCCCGTATTGCCTTGCCCATCCATg > 3:4860/1‑149 (MQ=255) ccgtgccgGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCGGCATGGGGTCAAAGGCTCCAATGTCTGGCAGAATTATACGCACCTGAGCCCGTATTGCCTTGCCCATCCATGTCCGcc < 2:379089/149‑1 (MQ=255) gtgccgGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCGGCATGGGGTCAAAGGCTCCAATGTCTGGCAGAATTATACGCACCTGAGCCCGTATTGCCTTGCCCATCCATGTCCGCctc > 4:27227/1‑149 (MQ=255) tgccgGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGCGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCGGCATGGGGTCAAAGGCTCCAATGTCTGGCAGAATTATACGCACCTGAGCCCGTATTGCCTTGCCCATCCATGTCCGCctc > 4:129019/1‑148 (MQ=255) | GTGCTCGGGCCGGGTTGCCACGCTGACCAGCCCGGCGCCGCAACGCAGGGCGGCTTCGGCACTGAGCAACACAGCGCCTCCGGTACCCAGGTCG‑CCCCCGACCACCAGTACATGGCCAAAGTCGCCTTTGTGGGCATGCGCCTGCCGTGCCGGCAGGCGGGCAA‑CCGTCACGCTGCTGAGCAATTGTGGGGCATTACTGGGGTGTTTGGTCTGCGGCATGGGGTCAAAGGCTCCAATGTCTGGCAGAATTATACGCACCTGAGCCCGTATTGCCTTGCCCATCCATGTCCGCCTC > NC_002947/5570030‑5570324 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |