| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,906,148 | G→A | 6.7% | T218I (ACC→ATC) ‡ | spuF ← | spermidine/putrescine ABC transporter ATP binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,906,148 | 0 | G | A | 6.7% | 224.3 / 4.0 | 74 | T218I (ACC→ATC) ‡ | spuF | spermidine/putrescine ABC transporter ATP binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (28/41); new base A (2/3); total (30/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.03e-01 | |||||||||||
CGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGG‑CTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTCTTGTCCAGTGCACCCATTGGCTCGTCGAGCAGCAGCAGTTTAGGGCG > NC_002947/5906002‑5906293 | cgtcgtCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGG‑CTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTc < 2:167281/149‑1 (MQ=255) gtcgACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGG‑CTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATg < 4:328716/148‑1 (MQ=255) gACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGG‑CTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCct < 4:37571/149‑1 (MQ=255) gACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGG‑CTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCct > 6:232423/1‑149 (MQ=255) gACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGG‑CTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCct > 6:378123/1‑149 (MQ=255) gACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGG‑CTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGACCATGGcc < 7:370831/148‑1 (MQ=255) ccACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGG‑CTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGACCATGGcccag < 3:173371/149‑4 (MQ=255) gTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGG‑CTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGTTGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCt < 1:33798/149‑1 (MQ=255) tCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGG‑CTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTg < 6:305306/149‑1 (MQ=255) tCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGG‑CTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTg < 5:411941/149‑1 (MQ=255) aCCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGG‑CTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGt > 6:131023/1‑149 (MQ=255) cTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGG‑CTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCg > 2:353048/1‑149 (MQ=255) aaCAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGG‑CTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGt > 6:241083/1‑149 (MQ=255) gACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGG‑CTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATc < 1:353048/148‑1 (MQ=255) gTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGGACTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACg > 1:25511/1‑149 (MQ=255) gTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGG‑CTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACg > 7:314255/1‑148 (MQ=255) gTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGG‑CTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGc < 6:377419/149‑1 (MQ=255) aCCGATGAACTCGCACACCAGGCGG‑CTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAgg > 2:166524/1‑149 (MQ=255) aCCGATGAACTCGCACACCAGGCGG‑CTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAg < 4:220134/148‑1 (MQ=255) aCCGATGAACTCGCACACCAGGCGG‑CTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAg < 5:232423/148‑1 (MQ=255) cGATGAACTCGCACACCAGGCGG‑CTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGtt < 3:248391/149‑1 (MQ=255) cGATGAACTCGCACACCAGGCGG‑CTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGt > 4:158395/1‑148 (MQ=255) cGATGAACTCGCACACCAGGCGG‑CTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGt > 5:185638/1‑148 (MQ=255) cGATGAACTCGCACACCAGGCGG‑CTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGT‑GGTCACCATCACGCAGGTTa > 8:220980/1‑149 (MQ=255) cGATGAACTCGCACACCAGGCGG‑CTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGACCATGGcccag < 3:244106/119‑4 (MQ=255) cGATGAACTCGCACACCAGGCGG‑CTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGACCATGGcccag > 4:244106/1‑116 (MQ=255) tCGCACACCAGGCGG‑CTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCAc > 5:45304/1‑149 (MQ=255) tCGCACACCAGGCGG‑CTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCAc > 7:174855/1‑149 (MQ=255) gCACACCAGGCGG‑CTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCtt > 2:266931/1‑110 (MQ=255) gCACACCAGGCGG‑CTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCtt < 1:266931/110‑1 (MQ=255) cacCAGGCGG‑CTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCt < 5:241083/149‑1 (MQ=255) acCAGGCGG‑CTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGACTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTc > 8:376698/1‑149 (MQ=255) ggcgg‑cTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCgatg < 5:225781/149‑1 (MQ=255) ggcgg‑cTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCgatg < 5:131023/149‑1 (MQ=255) gg‑cTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGAtc > 6:257593/1‑149 (MQ=255) gTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGa < 5:278079/148‑1 (MQ=255) gTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGAc < 1:166524/149‑1 (MQ=255) gTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGAc < 6:185638/149‑1 (MQ=255) gTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCAT‑GTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGAc < 5:61046/148‑1 (MQ=255) gATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGc < 3:243206/148‑1 (MQ=255) tGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCCCGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCAt > 8:203911/1‑148 (MQ=255) cACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGc < 5:199434/148‑1 (MQ=255) cACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGc < 8:174855/148‑1 (MQ=255) cACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGT‑GGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCg < 7:220980/148‑1 (MQ=255) aCTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCg > 1:389021/1‑148 (MQ=255) aCTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTACg > 1:307871/1‑148 (MQ=255) ggCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACg > 2:376202/1‑149 (MQ=255) gCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACg > 6:352825/1‑148 (MQ=255) gAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAg > 8:330998/1‑149 (MQ=255) aGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCGAAATCTGCGAACGCAGt > 1:138909/1‑149 (MQ=255) tCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTCTTg > 2:32102/1‑149 (MQ=255) ggCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTc < 2:383149/142‑1 (MQ=255) ggCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTc < 6:211895/142‑1 (MQ=255) ggCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTCTTGTCCa < 8:314255/149‑1 (MQ=255) ggCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTCTTGTCCa < 2:25511/149‑1 (MQ=255) ggCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGCCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTc < 1:85803/142‑1 (MQ=255) cGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTCTTGTCCAGt < 5:378123/149‑1 (MQ=255) gCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTCTTGTCCAGTGCACCCa > 3:401690/1‑149 (MQ=255) aGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTCTTGTCCAGTGCAc < 5:278053/142‑1 (MQ=255) aGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTCTTGTCCAGTGAAc > 6:278053/1‑142 (MQ=255) aGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTACGAACGCAGTTTCTTGTCCAGTGCACCCATTgg < 2:307871/149‑1 (MQ=255) tGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCGTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTCTTGTCCAGTGCACCCATTGGCtc < 5:351140/149‑1 (MQ=255) atgatgGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTCTTGTCCAGTGCACCCATTGGCtcgtc < 7:330998/149‑1 (MQ=255) atgatgGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTCTTGTCCAGTGCACCCATTGGCtcgtc < 3:158395/149‑1 (MQ=255) atgatgGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTCTTGTCCAGTGCACCCATTGGCtcgtc < 5:352825/149‑1 (MQ=255) gatgGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTTGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACGAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTCTTGTCCa < 7:269411/128‑1 (MQ=255) gatgGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTCCATCTGCGACCGCAGTTTCTTGTCCa > 8:269411/1‑128 (MQ=255) atgGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTCTTGTCCAGTGCACCCATTGGCTCGTCGag < 5:257593/149‑1 (MQ=255) atgGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTCTTGTCCAGTGCACCCATTGGCTCGTCGa < 1:32102/148‑1 (MQ=255) tgGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGACCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTCTTGTCCAGTGCACCCATTGGCTCGTCGagc < 5:176571/149‑1 (MQ=255) cgcTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTCTTGTCCAGTGCACCCATTGGCTCGTCGAGcagcagcag < 6:2356/149‑1 (MQ=255) tGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTCTTGTCCAGTGCACCCATTGGCTCGTCGAGCAGCAGCAGtt > 1:26007/1‑148 (MQ=255) gaggCCATGACCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCAACATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGATGCATCTGCGAACGCAGTTTCTTGTACAGTGCACCCATTGGATCGTCGAGCAGAATCAGtt > 5:197657/3‑148 (MQ=255) aTGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTCTTGTCCAGTGCACCCATTGGCTCGTCGAGCAGCAGCAGTTTAGGgcg < 2:26007/149‑1 (MQ=255) | CGTCGTCGACCACGTCACCTTCGAACAGGTTGACGTTACCGATGAACTCGCACACCAGGCGG‑CTGGTAGGCGTCTCGTAGATGTCCACTGGCGAGCCGATCTGGGCGATCCAGCCCAGGTGCATGATGGCGATGCGCTGGGCCATGGTCATGGCCTCTTCCTGGTCGTGGGTCACCATCACGCAGGTTACACCCACGCGCTCGATGATCTCGACCAGCTCCAGCTGCATCTGCGAACGCAGTTTCTTGTCCAGTGCACCCATTGGCTCGTCGAGCAGCAGCAGTTTAGGGCG > NC_002947/5906002‑5906293 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |