| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 503,832 | A→T | 6.8% | intergenic (+35/‑116) | PP_0414 → / → rpe | polyamine ABC transporter permease/ribulose‑5‑phosphate 3‑epimerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 503,832 | 0 | A | T | 6.8% | 221.3 / 5.3 | 73 | intergenic (+35/‑116) | PP_0414/rpe | polyamine ABC transporter permease/ribulose‑5‑phosphate 3‑epimerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (33/35); new base T (2/3); total (35/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.48e-01 | |||||||||||
ATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCATGCAGCCCTACGCTATTGCCCCCTCCATTC > NC_002947/503690‑503978 | aTTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGc > 3:34298/1‑146 (MQ=255) gCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTGCCGGCCTCTTC‑CGGCTTTAGCCgcgaa < 3:115006/148‑5 (MQ=255) gCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑Gaa < 6:103721/148‑1 (MQ=255) gCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑Gaa < 4:71502/148‑1 (MQ=255) ccGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑Gaa > 7:326457/1‑147 (MQ=255) ccGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAag < 4:305900/148‑1 (MQ=255) ccGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTC‑CGGCTTTAGCCGCGAaga < 5:231507/149‑1 (MQ=255) gcggcgACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCg < 4:309217/149‑1 (MQ=255) gACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGcaca < 6:76967/149‑1 (MQ=255) gACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGca > 6:133909/1‑147 (MQ=255) cTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCg < 3:32028/149‑1 (MQ=255) tGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGt > 2:192446/1‑149 (MQ=255) aTTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGt < 5:133909/147‑1 (MQ=255) aTTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGGTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCTCGTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGt < 1:305043/148‑1 (MQ=255) tGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAgg < 4:177433/139‑1 (MQ=255) tGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAgg > 3:177433/1‑139 (MQ=255) gCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGt < 7:62400/148‑1 (MQ=255) gCGTTCTCGGTGCTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTc > 8:67194/1‑149 (MQ=255) cGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTc < 2:103290/148‑1 (MQ=255) gTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGa > 3:152331/1‑149 (MQ=255) gTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGa < 2:233055/149‑1 (MQ=255) ttCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGac < 8:326457/149‑1 (MQ=255) tctcGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGaca > 8:335048/1‑149 (MQ=255) tcGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGacac > 7:318338/1‑148 (MQ=255) ggTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGGTGCGTTGGGCGccacca > 6:282678/1‑148 (MQ=255) ttgttgCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTg > 5:116900/1‑148 (MQ=255) ttgttgCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGa < 1:192446/149‑1 (MQ=255) gttgCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGt > 1:119050/1‑130 (MQ=255) gttgCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGt < 2:119050/130‑1 (MQ=255) gttgCTGCGGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGACGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGTGGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGAt < 8:48869/148‑1 (MQ=255) ttgCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATAc > 3:204226/1‑149 (MQ=255) tgctgACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAAt > 5:415764/1‑149 (MQ=255) ctgACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAAt < 4:152331/147‑1 (MQ=255) gACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGc > 6:177990/1‑149 (MQ=255) cccTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCt < 3:194646/149‑1 (MQ=255) ccTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTGCCGGCCTCTTC‑CGGCTTTAGCCGCGAAGAgg < 6:53598/102‑1 (MQ=25) ccTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTGCCGGCCTCTTC‑CGGCTTTAGCCGCGAAGAgg > 5:53598/1‑102 (MQ=25) ccTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCt > 1:403192/1‑148 (MQ=255) gTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCttt > 6:304831/1‑149 (MQ=255) gTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCtt > 8:87659/1‑148 (MQ=255) gCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTcc < 1:409269/148‑1 (MQ=255) gCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTcc < 6:415764/148‑1 (MQ=255) tGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGa < 8:318338/149‑1 (MQ=255) tGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGa < 5:304831/149‑1 (MQ=255) gCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGa < 7:367813/146‑1 (MQ=255) gCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGa > 8:367813/1‑146 (MQ=255) tAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACa < 7:87659/149‑1 (MQ=255) gaAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCA‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATgcgc < 4:34298/149‑1 (MQ=255) aGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCCGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCTCCAcc < 4:2706/148‑1 (MQ=255) aGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTTCCTGAGTTACAATGCGGGCCAcc < 6:116900/148‑1 (MQ=255) aGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTACCTGAGTTACAATGGGCGCCAcc < 2:403192/148‑1 (MQ=255) aaCAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAAttt > 5:366531/1‑149 (MQ=255) aaCAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAAttt > 5:242343/1‑149 (MQ=255) cAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCTTGAAttttc > 3:221670/1‑147 (MQ=255) cAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGc < 4:204226/149‑1 (MQ=255) gCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAg < 6:366531/149‑1 (MQ=255) gatgGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTgcgc > 1:1546/1‑148 (MQ=255) cT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGcc > 8:189332/1‑139 (MQ=255) cT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGcc < 7:189332/139‑1 (MQ=255) cT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCATGCAGccc > 7:117239/1‑148 (MQ=255) cT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCATGCAGccc > 3:289756/1‑148 (MQ=255) gTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCATGCAGCCCTAc > 3:152200/1‑149 (MQ=255) tACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTGACAATGCCCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCATGCAGCCCTACg > 5:244928/1‑149 (MQ=255) ggCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCCGCCTTCATCGCTTTCGCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCATGCAGCCCTACGCTAt < 5:282678/149‑1 (MQ=255) ggCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCATGCAGCCCTACGCTAt > 5:315914/1‑149 (MQ=255) gCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCATGCAGCCCTACGCTAtt < 7:67194/149‑1 (MQ=255) ctctTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCATGCAGCCCTACGCTATTGc > 3:22853/1‑149 (MQ=255) ttccgGCTTTAGCCGCGAAGAGGCCGGTACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCATGCAGCCCTACGCTATTGcccc > 5:57051/4‑149 (MQ=255) gcgGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCATGCAGCCCTACGCTATTGCCCCCTc > 3:244446/1‑149 (MQ=255) gcgGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCATGCAGCCCTACGCTATTGCCCCCTc > 8:32634/1‑149 (MQ=255) gCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTgc < 4:162600/117‑1 (MQ=255) gCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTgc > 3:162600/1‑117 (MQ=255) tAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCATGCAGCCCTACGCTATTGCCCCCTCCATtc < 4:152200/149‑1 (MQ=255) | ATTGCCGCGGCGGCGACCTTGCTGATTGCGTTCTCGGTGTTGTTGCTGCTGACCCTGGAGTGGTTGCGTGGGCGTAGCGAGAAGCTGAGGACTCAACAGCCGGCTTGATGATGGCTTGCCT‑GTACCGGCCTCTTCGCGGCTAAAGCCG‑GAAGAGGCCGGCACAGGTTGCGTTGGTCGACACCAATTGATACCAATCAGCCTTCATCGCTTTCCCTGAGTTACAATGCGCGCCACCGTGAATTTGCCAACAGGTGCGCCATGCAGCCCTACGCTATTGCCCCCTCCATTC > NC_002947/503690‑503978 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |