| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 6,002,326 | G→T | 5.3% | intergenic (‑26/+120) | amaA ← / ← amaB | L‑pipecolate oxidase/L‑piperidine‑6‑carboxylate dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,002,326 | 0 | G | T | 5.3% | 250.9 / 2.8 | 76 | intergenic (‑26/+120) | amaA/amaB | L‑pipecolate oxidase/L‑piperidine‑6‑carboxylate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (31/41); new base T (2/2); total (33/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.10e-01 | |||||||||||
ACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAACACGATACCCTGCGC > NC_002947/6002178‑6002469 | aCCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAgg > 2:88077/1‑149 (MQ=255) ccgccgccgATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAggg < 4:394926/149‑1 (MQ=255) cgccgccgATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGCCGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCCCAAGCATTGTTTACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAAGTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGggc > 7:84656/1‑149 (MQ=255) cgccgccgATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGggc > 7:90173/1‑149 (MQ=255) ccgccgATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTAGGGGCCGCAGggcgg > 1:138786/1‑149 (MQ=255) gccgATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGcc < 1:27321/149‑1 (MQ=255) ccgATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCCCTGCGGccc > 7:21301/1‑149 (MQ=255) cgATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCCCTGCGGcccc < 8:21301/149‑2 (MQ=255) cacaGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCCCTGCGGccccaacaag < 1:54057/149‑8 (MQ=255) acaGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCgg < 6:111599/149‑1 (MQ=255) acaGACATCGGCCGTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCgg < 5:393858/149‑1 (MQ=255) caGACATCGGCCTTGTGCTGACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACTGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCTTTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCggg < 3:77655/149‑1 (MQ=255) caGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCGCTACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCgg < 1:320254/149‑1 (MQ=255) aCATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTa > 5:343650/1‑148 (MQ=255) aTCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAAc < 7:201340/149‑1 (MQ=255) aTCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAAc < 3:191682/149‑1 (MQ=255) tCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAAcc < 8:90173/149‑1 (MQ=255) gtccTGGTTCTCACCGGCCAGTGCCGGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCAACAAGCATTGTTGACGAAGTTCT‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTTGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAAcc < 8:84656/145‑1 (MQ=255) gtgCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTa > 1:133682/1‑149 (MQ=255) gtgCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTa > 6:181263/1‑149 (MQ=255) gCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTa > 8:191595/1‑147 (MQ=255) cTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACTTGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACa < 6:389621/148‑1 (MQ=255) cTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAg < 6:50123/149‑1 (MQ=255) tCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAgg > 5:58780/1‑149 (MQ=255) agcGGCCAGGGCCTGGGAGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGGATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGTCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAggg < 5:61777/146‑1 (MQ=255) aCCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGggcggc > 5:47531/1‑118 (MQ=255) aCCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGggcggc < 6:47531/118‑1 (MQ=255) aCCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAgggg > 3:374734/1‑149 (MQ=255) ccGGCCAGGGCCCGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGt < 5:117943/149‑1 (MQ=255) ggCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCg < 5:331845/149‑1 (MQ=255) ccAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGgt > 2:383156/1‑149 (MQ=255) ccTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCt < 1:383156/149‑1 (MQ=255) ggcggcGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTggc < 5:181263/149‑2 (MQ=255) ggcggcGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTgg < 1:88077/148‑1 (MQ=255) ggcggcGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTg < 8:75651/147‑1 (MQ=255) gcggcgACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGAc > 3:43906/1‑149 (MQ=255) cgACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAAc > 8:202763/1‑149 (MQ=255) cggtTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAg > 7:355442/1‑149 (MQ=255) gtTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAgg < 5:136348/118‑1 (MQ=255) gtTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAgg > 6:136348/1‑118 (MQ=255) gtTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGa > 8:238044/1‑135 (MQ=255) gtTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGa < 7:238044/135‑1 (MQ=255) tGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGc < 4:131354/148‑1 (MQ=255) gCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCgg > 3:138262/1‑149 (MQ=255) tGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAggg < 5:323623/113‑1 (MQ=255) tGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAggg > 6:323623/1‑113 (MQ=255) tGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGc < 2:383511/145‑1 (MQ=255) tGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGc > 1:383511/1‑145 (MQ=255) gtgtTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTAc < 8:355442/149‑1 (MQ=255) tgtTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGcc < 5:18920/79‑1 (MQ=255) tgtTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGcc > 6:18920/1‑79 (MQ=255) ccACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCcgcg > 4:293329/1‑148 (MQ=255) ccACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCcgcg > 6:1900/1‑148 (MQ=255) ccACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCcgcg > 5:144549/1‑148 (MQ=255) aaGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCg > 7:116820/1‑149 (MQ=255) aGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCgg < 4:374734/149‑1 (MQ=255) cATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCgggg > 3:239872/1‑149 (MQ=255) cATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCgggg > 1:78991/1‑149 (MQ=255) aTTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCggggg > 7:51369/1‑149 (MQ=255) ttgttgACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCCACTGGGTTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTTTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGc < 2:138786/149‑1 (MQ=255) ttgACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTg < 7:128693/105‑1 (MQ=255) ttgACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTg > 8:128693/1‑105 (MQ=255) tgACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAg < 4:43906/148‑1 (MQ=255) 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aCATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATgc < 2:78991/149‑1 (MQ=255) ccGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATc < 6:144549/149‑1 (MQ=255) aaTTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCgg > 6:376732/1‑126 (MQ=255) aaTTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCgg < 5:376732/126‑1 (MQ=255) aaTTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGt < 2:133682/149‑1 (MQ=255) gTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGaa > 8:212801/1‑148 (MQ=255) ttCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAac < 2:76106/148‑1 (MQ=255) ttCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGGCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAac < 4:73871/148‑1 (MQ=255) ttgttgGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAACACg > 2:353707/1‑148 (MQ=255) gttgGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAACACGAt < 7:191595/148‑1 (MQ=255) gaaagggCCGCCCTGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAACACGATa > 5:113310/5‑149 (MQ=255) ttgGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGAc < 7:297805/65‑1 (MQ=255) ttgGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGAc > 8:297805/1‑65 (MQ=255) cGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAACACGATACCCTgcgc > 1:69927/1‑149 (MQ=255) ggcggcCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCAt > 7:322462/1‑113 (MQ=255) | ACCGCCGCCGATCACACAGACATCGGCCTTGTGCTCACCGGCCAGGGCCTGGGCGGCGACGGTCGGTTTGCTGACGTGTTCCCACAAGCATTGTTGACGCAGTTCG‑GACATGGCCGGCTCCAGCAATTTGTTCTTGTTGGGGCCGCAGGGCGGCCCTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGGGTCGGTGTCGCTTGGACGAACCCTGTAGGAGCGGGTCTACCCGCGAACCGGGGGCCAGGCCCCCGGCCATGCAGCATCAATACATCAGTCGAACACGATACCCTGCGC > NC_002947/6002178‑6002469 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |