| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 6,045,721 | A→C | 6.8% | R130R (CGT→CGG) ‡ | PP_5298 ← | glutamine amidotransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,045,721 | 0 | A | C | 6.8% | 222.5 / 5.6 | 73 | R130R (CGT→CGG) ‡ | PP_5298 | glutamine amidotransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (32/36); new base C (3/2); total (35/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.66e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.67e-01 | |||||||||||
GCGAATTGACCTCGAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAGGGTCAGGCGATCACGCGCCAGATCATGCCGGGTACC > NC_002947/6045573‑6045861 | gCGAATTGACCTCGAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGcaca > 2:211706/1‑149 (MQ=255)gCGAATTGACCTCGAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGcaca > 1:278555/1‑149 (MQ=255)gCGAATTGACCTCGAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGCGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTAcaca > 8:57228/1‑149 (MQ=255) tGACCTCGAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCCGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCCCACGCTgg > 7:159396/1‑149 (MQ=255) gACCTCGAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTgg < 4:178117/148‑1 (MQ=255) gACCTCGAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTgg < 2:361591/148‑1 (MQ=255) cTCGAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTg > 4:128752/1‑147 (MQ=255) tCGAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAg > 3:341417/1‑149 (MQ=255) gAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAg < 8:149298/147‑1 (MQ=255) gAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAg < 1:150069/147‑1 (MQ=255) gAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAg < 1:211706/147‑1 (MQ=255) aaCTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACCAGCGTGTGCAggaa < 3:282255/149‑3 (MQ=255) cacgaACCCCAGGGGCTGGAACAACCCGCCAGGGTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAATGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCGaa < 7:62244/149‑1 (MQ=255) accaACCCCAGGCGCTCGACCAAGCCGCCATGCTCGTTGGTGACCTCGTGGCGAGGGCCTTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTAAGGTTCGCGGTGTGCAAGGTAGCCAGGCTGTTCCCGCACACGCTGGTGCAGGCTgcc < 7:61829/143‑1 (MQ=255) aCCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTTCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGcc > 4:69408/1‑149 (MQ=255) cAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGt > 3:350808/1‑149 (MQ=255) ggCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGtt > 2:128511/1‑148 (MQ=255) gcgcTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAgg > 7:136607/1‑139 (MQ=255) gcgcTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAgg < 8:136607/139‑1 (MQ=255) gAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCt > 5:392346/1‑149 (MQ=255) aacaacCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTg > 7:298226/1‑149 (MQ=255) aacaacCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTg > 6:65587/1‑149 (MQ=255) aacCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGt < 4:376127/112‑1 (MQ=255) aacCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGt > 3:376127/1‑112 (MQ=255) aacCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTgg > 2:382004/1‑147 (MQ=255) aacCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTa < 7:180381/149‑1 (MQ=255) cccGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACCAGCGTGTGCAgg < 8:262319/115‑1 (MQ=255) cccGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACCAGCGTGTGCAgg > 7:262319/1‑115 (MQ=255) cccGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGc > 7:101511/1‑149 (MQ=255) cGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCt < 5:379465/149‑1 (MQ=255) cccgggtCGATGCTGACCGTGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCTGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCGGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCg < 6:392346/143‑1 (MQ=255) cAGGCTCGATTCTGACCGTGTGGCGATGGCCGTATTGCTCCTCCAGGGGGGCGTCGTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCgg < 8:159396/149‑1 (MQ=255) aGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGc < 5:65587/149‑1 (MQ=255) tCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGAt > 7:133076/1‑149 (MQ=255) aTGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCt < 3:147798/127‑1 (MQ=255) aTGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCt > 4:147798/1‑127 (MQ=255) aTGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCa < 8:133076/149‑1 (MQ=255) aCCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATAc < 1:128511/149‑1 (MQ=255) aCCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATAc > 3:125413/1‑149 (MQ=255) gAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACggg < 1:382004/149‑1 (MQ=255) gAGCGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTACACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACggg < 7:57228/149‑1 (MQ=255) gCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATTCAGAATACGGGGacac > 5:105889/1‑149 (MQ=255) gAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCg > 3:352611/1‑149 (MQ=255) gAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCAGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACAcc > 1:129211/1‑148 (MQ=255) ttGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATg < 4:350808/148‑1 (MQ=255) cACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGct < 3:133773/148‑1 (MQ=255) tCCCGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGctgcct > 5:387792/1‑148 (MQ=255) tCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGctgcctg > 2:353169/1‑149 (MQ=255) tCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGctgcctg > 2:37825/1‑149 (MQ=255) tCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGctgc > 5:417314/1‑146 (MQ=255) tCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGctgc < 6:417314/146‑1 (MQ=255) tCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCAGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGctgcctg > 8:349104/1‑149 (MQ=255) ccggggggCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGctgcct < 6:387792/144‑1 (MQ=255) cAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCa < 8:101511/149‑1 (MQ=255) aGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGcc > 4:1513/1‑81 (MQ=255) aGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGcc < 3:1513/81‑1 (MQ=255) aGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCaa < 2:278555/149‑1 (MQ=255) gTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGAACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCgg > 7:68692/1‑147 (MQ=255) tCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCg > 6:185025/1‑145 (MQ=255) tCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCg < 5:185025/145‑1 (MQ=255) cTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAggg > 3:162893/1‑149 (MQ=255) cTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAggg > 3:379717/1‑149 (MQ=255) cTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAgg < 4:341417/148‑1 (MQ=255) tCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGc > 3:86066/1‑141 (MQ=255) tCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGc < 4:86066/141‑1 (MQ=255) aGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAGGGTCa < 3:128752/149‑1 (MQ=255) cgGTGGTCAAGGGAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAGGGTCAGGCGATc < 3:69408/149‑1 (MQ=255) gtggtCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAGGGTCAGGCGATCAc < 4:352611/149‑1 (MQ=255) cAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAGGGTCAGGCGATCACgcgc > 8:163480/1‑148 (MQ=255) tAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAGGGTCAGGCGATCACGCGCCAGATc < 4:125413/149‑1 (MQ=255) gCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAGGGTCAGGCGATCACGCGCCAGATCAt < 1:353169/149‑1 (MQ=255) aGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAGGGTCAGGCGATCAcgc < 2:154459/136‑1 (MQ=255) aGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAGGGTCAGGCGATCAcgc > 1:154459/1‑136 (MQ=255) gCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAGGGTCAGGCGATCACGCGCCAGATCATGCCgg < 7:349104/149‑1 (MQ=255) gccTGCACCAGCGTGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAGGGTCAGGCGATCACGCGCCAGATCATGCCGGGTAcc > 7:21729/2‑149 (MQ=255) gccTGCACCAGCGTGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAGGGTCAGGCGATCACGCGCCAGATCATGCCGGGTAcc > 4:377067/2‑149 (MQ=255) | GCGAATTGACCTCGAACTGCGCCACCAACCCCAGGCGCTCGAACAACCCGCCAGGCTCGATGCTGACCGAGTGGCGAGGGCCGTATTGCACCTCCAGGGGGGCGTCCTCAGGTTCGCGGTGGTCAAGGTAGCCAGGCAGTTCCTGCACACGCTGGTGCAGGCTGCCGCCAAGGGCCACGTTCAGCTCCTGGTAGCCTCGGCAGATGCAGAATACGGGCACACCGACGGCAATGGCTGCCTGCAACAGCGGCAGGGTCAGGCGATCACGCGCCAGATCATGCCGGGTACC > NC_002947/6045573‑6045861 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |