| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 6,061,258 | T→A | 8.0% | D37V (GAC→GTC) | hupA ← | DNA‑binding protein HU‑alpha |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,061,258 | 0 | T | A | 8.0% | 251.2 / 9.8 | 87 | D37V (GAC→GTC) | hupA | DNA‑binding protein HU‑alpha |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (44/36); new base A (3/4); total (47/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.98e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.59e-01 | |||||||||||
TCACGCAGGTTCTTGCCAGGCTTGAAGGCCACGGTATTGCTGGCCTTGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGACGGAATTCTTGTTGTTATGCCGT > NC_002947/6061111‑6061406 | tCACGCAGGTTCTTGCCAGGCTTGAAGGCCACGGTATTGCTGGCCTTGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTc > 1:387746/1‑149 (MQ=255) gTTCTTGCCAGGCTTGAAGGCCACGGTATTGCTGGCCTTGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGCCCTGGACAAGGacac < 3:147162/149‑1 (MQ=255) ttCTTGCCAGGCTTGAAGGCCACGGTATTGCTGGCCTTGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGCCCTGGACAAGGACAcc < 1:357503/149‑1 (MQ=255) ctCTTGCCAGGCTTGAAGGCCACGGTATTGCTGGCCTTGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGCCCTGGACAAGGACAcc < 8:141302/148‑1 (MQ=255) gCCAGGCTTGAAGGCCACGGTATTGCTGGCCTTGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGa > 1:119218/1‑149 (MQ=255) ccAGGCTTGAAGGCCACGGTATTGCTGGCCTTGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCa < 7:218489/136‑1 (MQ=255) ccAGGCTTGAAGGCCACGGTATTGCTGGCCTTGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCa > 8:218489/1‑136 (MQ=255) ccAGGCTTGAAGGCCACGGTATTGCTGGCCTTGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGAt > 8:109742/1‑149 (MQ=255) cAGGCTTGAAGGCCACGGTATTGCTGGCCTTGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATg < 2:387746/149‑1 (MQ=255) cAGGCTTGAAGGCCACGGTATTGCTGGCCTTGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATg > 7:74787/1‑149 (MQ=255) ttGAAGGCCACGGTATTGCTGGCCTTGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTc > 1:38625/1‑149 (MQ=255) ttGAAGGCCACGGTATTGCTGGCCTTGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTc < 2:294878/149‑1 (MQ=255) gAAGGCCACGGTATTGCTGGCCTTGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTc < 4:232042/147‑1 (MQ=255) aaGGCCACGGGATTGCTGGCCTTGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCga < 8:293717/148‑1 (MQ=255) aGGCCACGGTATTGCTGGCCTTGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCgaga < 2:119218/149‑1 (MQ=255) ggCCACGGTATTGCTGGCCTTGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGaa < 7:139793/149‑1 (MQ=255) gCCACGGTATTGCTGGCCTTGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCGTGAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGaa < 1:325129/149‑1 (MQ=255) cACGGTATTGCTGGCCTTGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATcg > 1:127547/1‑149 (MQ=255) tATTGCTGGCCTTGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTc < 3:65194/149‑1 (MQ=255) gCTGGCCTTGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCaaaa > 2:204869/1‑149 (MQ=255) gCTGGCCTTGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCaaaa > 8:120421/1‑149 (MQ=255) gCTGGCCTTGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCaaaa > 6:3638/1‑149 (MQ=255) cTGGCCTTGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCaaaa < 7:109742/148‑1 (MQ=255) gCCTTGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAAcc < 4:154742/147‑1 (MQ=255) gCCTTGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCt > 6:116333/1‑148 (MQ=255) gCCTTGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCt > 4:33456/1‑148 (MQ=255) ttGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAAcc < 7:344732/144‑1 (MQ=255) ttGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAAcc > 8:344732/1‑144 (MQ=255) tGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCt < 7:165575/144‑1 (MQ=255) tGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCt > 8:165575/1‑144 (MQ=255) gATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGAtt > 6:271911/1‑147 (MQ=255) gATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGAtt < 5:271911/147‑1 (MQ=255) gATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTgg > 5:339838/1‑149 (MQ=255) aTCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGc > 3:53045/1‑149 (MQ=255) ttGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCtt > 2:374056/1‑149 (MQ=255) gACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCtttt > 1:54046/1‑149 (MQ=255) ccGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGAGCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTcc > 1:33949/1‑149 (MQ=255) cGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCt < 5:3638/149‑1 (MQ=255) gTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTg < 1:204869/149‑1 (MQ=255) gTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTg > 3:287550/1‑149 (MQ=255) ccccAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGt > 3:58795/1‑148 (MQ=255) ccccAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGt < 8:76598/148‑1 (MQ=255) cccAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTc < 4:287550/148‑1 (MQ=255) ccAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTcc < 5:368538/141‑1 (MQ=255) ccAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTcc > 6:368538/1‑141 (MQ=255) cAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGt > 3:42248/1‑145 (MQ=255) gCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGTCTTTTCCTTGGTCAGATCAGc < 7:120421/148‑1 (MQ=255) cGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTg > 4:261036/1‑136 (MQ=255) cGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGcc < 1:132784/148‑1 (MQ=255) cTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCg < 4:53045/148‑1 (MQ=255) ttGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGc > 3:204111/1‑149 (MQ=255) gCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGAGCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCg < 2:33949/148‑1 (MQ=255) gCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGc < 8:74787/147‑1 (MQ=255) gCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCg < 2:127547/148‑1 (MQ=255) ccGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGAt < 6:339838/149‑1 (MQ=255) gTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGAc > 1:147195/1‑149 (MQ=255) cgcACCGCGATGACGTTTTTCG‑AATGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGAcggcgg < 8:60268/149‑1 (MQ=255) aCCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGa < 3:33456/149‑1 (MQ=255) gTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGa > 5:30366/1‑138 (MQ=255) gTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGa < 6:30366/138‑1 (MQ=255) gTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTg > 5:144770/1‑149 (MQ=255) ttttCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTgc < 4:204111/148‑1 (MQ=255) g‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCa > 6:292141/1‑146 (MQ=255) g‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATa < 4:42248/148‑1 (MQ=255) g‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATa < 5:292141/148‑1 (MQ=255) aaGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGt > 6:115853/1‑149 (MQ=255) tGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAg < 1:374056/149‑1 (MQ=255) gCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGc > 4:193617/1‑149 (MQ=255) ccGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGcc > 7:382610/1‑149 (MQ=255) 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tcaccGGTGCCCTGGACAAGGACACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGAc > 7:305720/5‑142 (MQ=255) tcaccGGTGCCCTGGACAAGGACACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGAc < 8:305720/138‑1 (MQ=255) tCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCCTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGACGGAATTCt > 8:78073/1‑149 (MQ=255) tCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCAACGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGACGGAATTCt > 6:366920/1‑149 (MQ=255) caccGGTGCCCTGGACAAGGACACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGACGGAATTCt > 3:181644/4‑149 (MQ=255) caccGGTGCCCTGGACAAGGACACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGACGGAATTCt > 5:397946/4‑149 (MQ=255) aCGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCACGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGACGGAATTCtt < 7:314637/148‑1 (MQ=255) cTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGACGGAATTCTTGTTGTTATg > 3:264430/1‑149 (MQ=255) cTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGACGGAATTCTTGTTGTTATg < 2:38625/149‑1 (MQ=255) cTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGACGGAATTCTTGTTGTTATg < 4:58795/149‑1 (MQ=255) cTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGACGGAATTCTTGTTGTTATg > 7:64742/1‑149 (MQ=255) cTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACATGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTAGAAGGAATTCTTGTTGTTATg > 6:348431/1‑149 (MQ=255) ttGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGACGGAATTCTTGTTGTTATGc > 6:125538/1‑149 (MQ=255) tCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGACGGAATTCTTGTTGTTATGCCGt > 7:354989/1‑149 (MQ=255) tCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGACGGAATTCTTGATGTTATGCCGt > 8:169384/1‑149 (MQ=255) | TCACGCAGGTTCTTGCCAGGCTTGAAGGCCACGGTATTGCTGGCCTTGATCTTGACCGGTTCCCCAGTTTGCGGGTTCTTGCCGGTACGCGCACCGCGATGACGTTTTTCG‑AAGGTGCCGAAACCGACCAGGGTCACGGTGTCCTTGTCCAGGGCACCGGTGATGCTGTCGAGAATCGCGTTCAAAACCTGATTGGCCTTTTCCTTGGTCAGATCAGCCTTATCGGCGATGACGGCGGCGAGTTCTGGTTTGCGCATAGTGAAGCCTCTTTGACGGAATTCTTGTTGTTATGCCGT > NC_002947/6061111‑6061406 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |