| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 532,678 | A→T | 7.6% | intergenic (+21/‑58) | PP_t03 → / → tufA | tRNA‑Thr/elongation factor Tu‑A |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 532,678 | 0 | A | T | 7.6% | 247.3 / 9.2 | 92 | intergenic (+21/‑58) | PP_t03/tufA | tRNA‑Thr/elongation factor Tu‑A |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (46/39); new base T (5/2); total (51/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.55e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.94e-01 | |||||||||||
TCGATTCCCGCTACCCGCTCCAAGTTTGTCGGATTTTGCACAAAGTGTTTCGCTCTTGTAGCTCAGTTGGTAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATCGATGGCTAAGGAAAAGTTTGATCGTTCCCTTCCCCACGTTAACGTCGGCACTATCGGCCACGTTGACCACGGTAAGACCACTCTGACCG > NC_002947/532531‑532823 | tCGATTCCCGCTACCCGCTCCAAGTTTGTCGGATTTTGCACAAAGTGTTTCGCTCTTGTAGCTCAGTTGGTAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGaa > 8:219110/1‑148 (MQ=255) gATTCCCGCTACCCGCTCCAAGTTTGTCGGATTTTGCACAAAGTGTTTCGCTCTTGTAGCTCAGTTGGTAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGaaaa > 2:31545/1‑148 (MQ=255) gATTCCCGCTACCCGCTCCAAGTTTGTCGGATTTTGCACAAAGTGTTTCGCTCTTGTAGCTCAGTTGGTAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAat < 5:145713/149‑1 (MQ=255) cGCTACCCGCTCCAAGTTTGTCGGATTTTGCACAAAGTGTTTCGCTCTTGTAGCTCAGTTGGTAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGc > 8:283460/1‑149 (MQ=255) gCTACCCGCTCCAAGTTTGTCGGATTTTGCACAAAGTGTTTCGCTCTTGTAGCTCAGTTGGTAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATTTTCATATCTGcc < 6:30290/149‑1 (MQ=255) cTACCCGCTCCAAGTTTGTCGGATTTTGCACAAAGTGTTTCGCTCTTGTAGCTCAGTTGGTAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCt < 7:289120/149‑1 (MQ=255) cccGCTCCTAGTTTGTCGGATTTTGCACAAAGTGTTTCGCTCTTGTAGCTCAGTTGGTAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTg < 5:256934/149‑1 (MQ=255) cccGCTCCGAGTTTGTCGGATTTTGCACAAAGTGTTTCGCTATTGTAGCTCAGTTGGTAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTg > 4:29408/1‑149 (MQ=255) cccGCTCCAAGTTTGTCGGATTTTGCACAAAGTGTTTCGCTCTTGTAGCTCAGTTGGTAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTg > 1:363753/1‑149 (MQ=255) cGCTCCGAGTTTGTCGGATTTTGCACAAAGTGTTTCGCTCTTGTAGCTCAGTTGGTAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGtt < 3:29408/149‑1 (MQ=255) ccAAGTTTGTCGGATTTTGCACAAAGTGTTTCGCTCTTGTAGCTCAGTTGGTAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTa > 8:75665/1‑148 (MQ=255) caattatGTCGTATTTTTCACAAAGTGTTTCGCTATTGTATCTCAGTTGGTAGAGCACACCCTTGGTAATTGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGt < 8:361203/137‑1 (MQ=255) cAAGTTTGTCGGATTTTGCACAAAGTGTTTCGCTCTTGTAGCTCAGTTGGTAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCCCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATATGCCTTTGt > 7:361203/1‑143 (MQ=255) tCGGATTTTGCACAAAGTGTTTCGCTCTTGTAGCTCAGTTGGTAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGc < 8:189270/146‑1 (MQ=255) tCGGATTTTGCACAAAGTGTTTCGCTCTTGTAGCTCAGTTGGTAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGc > 7:189270/1‑146 (MQ=255) tCGGATTTTGCACAAAGTGTTTCGCTCTTGTAGCTCAGTTGGTAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGc > 7:283497/1‑146 (MQ=255) tCGGATTTTGCACAAAGTGTTTCGCTCTTGTAGCTCAGTTGGTAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCaa < 8:246737/148‑1 (MQ=255) tCGGATTTTGCACAAAGTGTTTCGCTCTTGTAGCTCAGTTGGTAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCa < 2:376696/147‑1 (MQ=255) tCGGATTTTGCACAAAGTGTTTCGCTCTTGTAGCTCAGTTGGTAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCa > 1:376696/1‑147 (MQ=255) tCGGATTTTGCACAAAGTGTTTCGCTCTTGTAGCTCAGTTGGTAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATAAGTGc > 7:305693/1‑146 (MQ=255) ggATTTTGCACAAAGTGTTTCGCTCTTGTAGCTCAGTTGGTAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGa < 7:75665/148‑1 (MQ=255) ggATTTTGCACAAAGTGTTTCGCTCTTGTAGCTCAGTTGGTAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGa < 2:363753/148‑1 (MQ=255) ggATTTTGCACAAAGTGTTTCGCTCTTGTAGCTCAGTTGGTAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGACATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGAc > 2:95305/1‑149 (MQ=255) gATTTTGCACAAAGTGTTTCGCTCTTGTAGCTCAGTTGGTAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGAc > 5:215134/1‑148 (MQ=255) aTTTTGCACAAAGTGTTTCGCTCTTGTAGCGCAGTTGGTAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGATGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAATACTa < 7:372185/149‑1 (MQ=255) ttttGCACAAAGTGTTTCGCTCTTGTAGCTCAGTTGGTAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTAt > 5:18683/1‑149 (MQ=255) ttttGCACAAAGTGTTTCGCTCTTGTAGCTCAGTTGGTAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTAt < 2:203737/149‑1 (MQ=255) cacaAAGTGTTTCGCTCTTGTAGCTCAGTTGGTAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATttct > 3:308767/1‑148 (MQ=255) aGTGTTTCGCTCTTGTAGCTCAGTTGGTAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCg < 4:308767/149‑1 (MQ=255) aGTGTTTCGCTCTTGTAGCTCAGTTGGTAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCg < 1:31545/149‑1 (MQ=255) tttCGCTCTTGTAGCTCAGTTGGTAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCggag > 2:69782/1‑148 (MQ=255) tttCGCTCTTGTAGCTCAGTTGGTAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCAGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGTCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTACTCCggag > 7:115214/1‑148 (MQ=255) cGCTCTTGTAGCTCAGTTGGTAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGAtt > 8:341243/1‑149 (MQ=255) ctctTGTAGCTCAGTTGGTATAGCACACCCTTGGTAAGTGTGAGGTCAGAGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCggagga < 7:179425/145‑1 (MQ=255) ctctTGTAGCTCAGTTGGTAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCATTGCAAGACTATTTCTTCTGAGTAGGAtata > 8:179425/1‑146 (MQ=255) ttGTAGCTCAGTTGGTAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTa < 5:79367/147‑1 (MQ=255) ttGTAGCTCAGTTGGTAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATc > 7:60858/1‑149 (MQ=255) aGCTCAGTTGGTAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATCGAt < 8:305693/148‑1 (MQ=255) gCTCAGTTGGTAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATCGATgg < 1:262117/149‑1 (MQ=255) gTTGGTAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATCGATGGCTAAg > 8:19194/1‑149 (MQ=255) tAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATCGATGGCTAAGGaaaa < 7:219110/149‑1 (MQ=255) tAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATCGATGGCTAAGGaaaa > 5:237210/1‑149 (MQ=255) tAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATCGATGGCTAAGGaaaa < 2:6943/149‑1 (MQ=255) ctgacctcacCCTTACCAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATCGATGGCTAAGGaa > 4:397266/8‑147 (MQ=255) ctcacCCTTACCAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTGAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATATGCCTTTGTTTTTTCAGTGCAACACTATTTATTCTGAGGAGGAATGTATCGAAGTGTAACGAAATGttt > 8:189814/3‑148 (MQ=255) ctcacCCTTACCAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATCGATGGCTAAGGAAAAGttt > 3:15384/3‑148 (MQ=255) acacCCTTGTTAAGGGTGATGTAAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATCGATGGCTAAGGAAAAGTTTGa < 5:315172/149‑1 (MQ=255) acCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATCGATGGCTAAGGAAAAGTTTGATc > 6:355119/1‑149 (MQ=255) acCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATCGATGGCTAAGGAAAAGTTTGATc < 8:372142/149‑1 (MQ=255) tGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATCGATGGCTAAGGAAAAGTTTGATCGttcc > 6:262473/1‑149 (MQ=255) ggTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAATGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATCTATGGCTAAGGAAAAGTTTGATCGttc < 5:355119/147‑1 (MQ=255) gggTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATCGATGGCTAAGGAAAAGTTTGATCGttcccttccc > 3:164162/1‑149 (MQ=255) gggTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATCGATGGCTAAGGAAAAGTTTGATCGttcccttccc < 7:283460/149‑1 (MQ=255) ggTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATCGATGGCTAAGGAAAAGTTTGATCGTTCCCTTCCCCACGtt < 6:215134/149‑1 (MQ=255) 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tCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATCGATGGCTAAGGAAAAGTTTGATCGTTCCCTTCCCCACGTTAACGTCGGCACTATc > 1:161792/1‑149 (MQ=255) cGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATCGATGGCTAAGGAAAAGTTTGATCGTTCCCTTCCCCACGTTAACGTCGGCACTATCg < 7:341243/148‑1 (MQ=255) gCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATCGATGGCTAAGGAAAAGTTTGATCGTTCCCTTCCCCACGTTAACGTCGGCACTATCGGc > 7:102073/1‑149 (MQ=255) gCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATCGATGGCTAAGGAAAAGTTTGATCGTTCCCTTCCCCACGTTAACGTCGGCACTATCGGc < 7:51479/149‑1 (MQ=255) tCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATCGATGGCTAAGGAAAAGTTTGATCGTTCCCTTCCCCACGTTAACGTCGGCACTATCGGCCa > 4:43985/1‑149 (MQ=255) 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(MQ=255) tCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATCGATGGCTAAGGAAAAGTTTGa > 2:365435/1‑102 (MQ=255) tCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATCGATGGCTAAGGAAAAGTTTGATCGttcccttc > 4:119947/1‑113 (MQ=255) tCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATCGATGGCTAAGGAAAAGTTTGATCGttcccttc < 3:119947/113‑1 (MQ=255) cATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATCGATGGCTAAGGAAAAGTTTGATCGTTCCCTTCCCCACGTTAACGTCGGCACTATCGGCCACGTTg > 7:13140/1‑144 (MQ=255) cATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATCGATGGCTAAGGAAAAGTTTGATCGTTCCCTTCCCCACGTTAACGTCGGCACTATCGGCCACGTTg < 8:13140/144‑1 (MQ=255) atatAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATCGATGGCTAAGGAAAAGTTTGATCGTTCCCTTCCCCACGTTAACGTGGGCACTATCGGCCACGTTGACCACg > 3:339021/1‑149 (MQ=255) ataAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATCGATGGCTAAGGAAAAGTTTGATCGTTCCCTTCCCCACGTTAACGTCGGCACTATCGGCCACGTTGACCACGGt < 5:212763/149‑1 (MQ=255) aaacaaaGGCAGATATTTTCATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATCGATGGCTAAGGAAAAGTTTGATCGTTCCCTTCCCCACGTTTACGTCGGCACTATCGGCCACGTTGACCACGGt > 1:244519/6‑148 (MQ=37) aaaCAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATCGATGGCTAAGGAAAAGTTTGATCGTTCCCTTCCCCACGTTAACGTCGGCACTATCGGCCACGTTGa < 7:180349/140‑1 (MQ=255) aaaCAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATCGATGGCTAAGGAAAAGTTTGATCGTTCCCTTCCCCACGTTAACGTCGGCACTATCGGCCACGTTGa > 8:180349/1‑140 (MQ=255) aaaCAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATCGATGGCTAAGGAAAAGTTTGATCGTTCCCTTCCCCACGTTAACGTCGGCACTATCGGCCACGTTGACCACGGt > 5:110987/1‑147 (MQ=255) aaCAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATCGATGGCTAAGGAAAAGTTTGATCGTTCCCTTCCCCACGTTAACGTCGGCACTATCGGCCACGTTGACCACGGt > 5:200336/1‑146 (MQ=255) aaCAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTATTCTGCGGAGGATTGTATCGATTGCTAAGGAAAAGTTTGATCGTTCCATTCCCCACGTTAACGTCGGCACTATCTGCCACTTTGACCACGGt > 8:297738/1‑146 (MQ=38) cAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATCGATGGCTAAGGAAAAGTTTGATCGTTCCCTTCCCCACGTTAACGTGGGCACTATCGGCCACGTTGACCACGGTAAGAc < 4:339021/149‑1 (MQ=255) aaaGGCAGATATTTTCATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATCGATGGCTAAGGAAAAGTTTGATCGTTCCCTTCCCCACGTTAACGTCGGCACTATCGGCCACGTTGACCACGGTAAGAc > 4:41065/2‑149 (MQ=255) aGGCAGATATTTTCATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATCGATGGCTAAGGAAAAGTTTGATCGTTCCCTTCCCCACGTTAACGTCGGCACTATCGGCCACGTTGACCACgg > 5:179168/1‑141 (MQ=255) 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gCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATCGATGGCTAAGGAAAAGTTTGATCGTTCACTTCACCACGTTAACCTCGGAACTAACGGACACGTTCAACACTGTAAGACCAc > 7:157993/1‑148 (MQ=255) gAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATCGATGGCTAAGGAAAAGTTTGATCGTTCCCTTCCCCACGTTAACGTCGGCACTATCGGCCACGTTGACCACGGTAAGACCACTCTGACCg > 2:3688/1‑148 (MQ=255) gAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATCGATGGCTAAGGAAAAGTTTGATCGTTCCATTCCCCACGTTAACGTCGGCACTATCGGCCACGTTGACCACGGTAAGACAACTCTGACCg > 3:244337/1‑148 (MQ=255) | TCGATTCCCGCTACCCGCTCCAAGTTTGTCGGATTTTGCACAAAGTGTTTCGCTCTTGTAGCTCAGTTGGTAGAGCACACCCTTGGTAAGGGTGAGGTCAGCGGTTCAAGTCCGCTCAAGAGCTCCATATAAACAAGGCAGATATGAAAATATCTGCCTTTGTTTTATCAGTGCAAGACTATTTCTTCTGCGGAGGATTGTATCGATGGCTAAGGAAAAGTTTGATCGTTCCCTTCCCCACGTTAACGTCGGCACTATCGGCCACGTTGACCACGGTAAGACCACTCTGACCG > NC_002947/532531‑532823 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |