| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,706 | G→C | 7.2% | L39V (CTC→GTC) | parA ← | chromosome partition protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,706 | 0 | G | C | 7.2% | 249.8 / 8.6 | 83 | L39V (CTC→GTC) | parA | chromosome partition protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (40/37); new base C (3/3); total (43/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.97e-01 | |||||||||||
TTGGCCGGCAGCAACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCTTGCGGCGC > NC_002947/1558‑1854 | ttGGCCGGCAGCAACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAg < 3:172264/149‑1 (MQ=255) gCCGGCAGCAACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGt < 3:277579/148‑1 (MQ=255) cGGCAGCAACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTTCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGa < 3:271040/149‑1 (MQ=255) agcaACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATcag > 3:234450/1‑149 (MQ=255) gcaACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATcagc < 4:370252/149‑1 (MQ=255) caACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTAGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATcag > 3:383039/1‑147 (MQ=255) aaCTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATcagcag < 7:316757/149‑1 (MQ=255) aCTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCTGATCGACCTCGATCCGCAgg < 5:107216/149‑1 (MQ=255) aCTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTACCCTGCTGATCGACCTCGATCCGCAgg < 3:70615/149‑1 (MQ=255) cTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCCCACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGATGAACGAGGTCGATCAGCAGGa > 6:284083/1‑149 (MQ=255) tGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCTTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCTGATCGACCTCGATccgca > 1:155978/1‑145 (MQ=255) tGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCTTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCTGATCGACCTCGATccgca < 2:155978/145‑1 (MQ=255) gAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGac < 6:241370/147‑1 (MQ=255) aGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACacga < 4:219045/149‑1 (MQ=255) gTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTgg < 4:309191/149‑1 (MQ=255) gTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTgg < 4:303849/149‑1 (MQ=255) cTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCg > 5:58063/1‑149 (MQ=255) tagtGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGcagccag > 4:151600/1‑149 (MQ=255) tGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGa < 1:194016/149‑1 (MQ=255) cATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAgg > 2:101059/1‑149 (MQ=255) cATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAgg > 1:56339/1‑149 (MQ=255) cTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAggcggc > 1:68037/1‑147 (MQ=255) gCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGAtt > 5:358742/1‑149 (MQ=255) ccAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGAtt > 4:97961/1‑148 (MQ=255) cAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGa < 1:101059/149‑1 (MQ=255) aGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATa > 3:12989/1‑149 (MQ=255) gTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATa > 1:296123/1‑148 (MQ=255) gTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATAc < 3:351715/149‑1 (MQ=255) gTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATAc < 4:12989/149‑1 (MQ=255) cACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAggt < 7:192681/149‑1 (MQ=255) cccGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTg > 7:182950/1‑149 (MQ=255) cccGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTg > 8:221945/1‑149 (MQ=255) gATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGtt < 2:340213/145‑1 (MQ=255) gATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGAGCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGtt > 1:340213/1‑145 (MQ=255) gATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGGCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCt < 1:272901/149‑1 (MQ=255) cAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCca > 5:329645/1‑149 (MQ=255) cAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCca > 1:131932/1‑149 (MQ=255) gTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCAcaccac > 5:310970/1‑149 (MQ=255) aGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCt > 3:148515/1‑149 (MQ=255) gACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTAGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGACTTGCACACaccaccat > 3:343000/1‑147 (MQ=255) ccGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTc < 4:234450/149‑1 (MQ=255) aaTGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGGCCACCCAACCTTTCTgg > 8:271587/1‑149 (MQ=255) aTGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCGTCCCATGGGCTCGTTGCCCTGCGGATCGAGCTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGGCTCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATAAAGTTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTg < 4:383039/147‑1 (MQ=255) gCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTc > 3:69879/1‑149 (MQ=255) gCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTc > 3:140652/1‑149 (MQ=255) tCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTcgc > 3:402752/1‑149 (MQ=255) gCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGAtt < 4:148515/149‑1 (MQ=255) cTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTg < 6:329645/149‑1 (MQ=255) tCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTg > 7:284525/1‑148 (MQ=255) gTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTg < 8:284525/146‑1 (MQ=255) gTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCg < 6:310970/148‑1 (MQ=255) cTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAAt < 3:97961/148‑1 (MQ=255) gTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAAt > 3:36516/1‑145 (MQ=255) gTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAAt < 4:36516/145‑1 (MQ=255) gTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCt > 6:44726/1‑149 (MQ=255) cacaCCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTa < 4:166675/148‑1 (MQ=255) cacaCCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAg > 2:74777/1‑149 (MQ=255) acacCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGc > 5:131226/1‑149 (MQ=255) acacCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTACTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGc > 5:125386/1‑149 (MQ=255) gccGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCtt < 1:96747/143‑1 (MQ=255) gccGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCtt > 2:96747/2‑144 (MQ=255) acCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCa > 6:103341/1‑149 (MQ=255) acCGATGCCCATTGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGAGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCa < 4:343000/149‑1 (MQ=255) gCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCAttg < 4:402752/149‑1 (MQ=255) cccATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGc > 7:175682/1‑149 (MQ=255) cccATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGc < 4:69879/149‑1 (MQ=255) cATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGc > 5:54653/1‑147 (MQ=255) cATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGa < 3:151600/149‑1 (MQ=255) aTGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAg > 1:133760/1‑149 (MQ=255) aTGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAg > 5:330634/1‑149 (MQ=255) tggtggCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCAttg > 8:138915/1‑141 (MQ=255) tggtggCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCAttg < 7:138915/141‑1 (MQ=255) tggCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGtt < 2:56339/149‑1 (MQ=255) gCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTc < 2:133760/148‑1 (MQ=255) cGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTccc < 5:103341/149‑1 (MQ=255) gTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCATCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCa < 7:148156/149‑1 (MQ=255) ttGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAg < 5:44726/149‑1 (MQ=255) gCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGt < 6:358742/148‑1 (MQ=255) ctgctgATCGACCTCGATCCGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATg > 7:284405/1‑149 (MQ=255) ctgctgATCGACCTCGATCCGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATg > 5:287234/1‑149 (MQ=255) gCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGcc > 7:161333/1‑149 (MQ=255) cGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCt < 2:296123/149‑1 (MQ=255) gAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCTTgcggc > 7:294825/1‑149 (MQ=255) aGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCTTgtggcg > 5:269854/1‑149 (MQ=255) ggTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCTCACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCTTGCGgcgc < 2:68037/149‑1 (MQ=255) ggTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCa > 6:381831/1‑136 (MQ=255) ggTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCa < 5:381831/136‑1 (MQ=255) | TTGGCCGGCAGCAACTGGAAGCCTCCGTGCTCGGAGTAGTGCATAGCCTGGGCCAAGTCGCACTCCCCGATGAGCAGGTCGTAGACCGAATGCTCGAGCTCGTGCTTGTCCACACCGCTGCCCATGGTGGCGTTGCCCTGCGGATCGAGGTCGATCAGCAGGACACGACGCTTGGTCGCAGCCAGCGAGGCGGCGAGATTGATACAGGTGGTTGTCTTGCCCACACCACCTTTCTGGTTCGCGATTGCGAATACCTTAGCCATTGTTGCGAGTGTTCCCAGTCATGCCTTGCGGCGC > NC_002947/1558‑1854 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |