Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 925,902 | A→G | 7.1% | W242R (TGG→CGG) ‡ | PP_0805 ← | outer membrane efflux protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 925,902 | 0 | A | G | 7.1% | 241.4 / 6.2 | 84 | W242R (TGG→CGG) ‡ | PP_0805 | outer membrane efflux protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (40/38); new base G (3/3); total (43/41) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.68e-01 |
GCGCGCTGGGCCAGGGCCATCAGCACGGCGGGCAGGCGATCATCACCCTGTGCAGGGCGCTTGCAGGCCTGGTCCAGCTCGGCGGGTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCGGAACGGGTGCTGGCGCCCATGTCGCTGCGCTGGCGGGCCATGCCGGCAATGTCGCCCACGCCGCGAATCT > NC_002947/925754‑926048 | gcgcgcTGGGCCAGGGCCATCAGCACGGCGGGCAGGCGATCATCACCCTGTGCAGGGCGCTTGCAGGCCTGGTCCAGCTCGGCGGGTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCa < 6:38383/149‑1 (MQ=255) gcgcTGGGCCAGGGCCATCAGCACGGCGGGCAGGCGATCATCACCCTGTGCAGGGCGCTTGCAGGCCTGGTCCAGCTCGGCGGGTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAgc > 6:401094/1‑149 (MQ=255) gcgcTGGGCCAGGGCCATCAGCACGGCGGGCAGGCGATCATCACCCTGTGCAGGGCGCTTGCAGGCCTGGTCCAGCTCGGCGGGTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAgc > 6:214821/1‑149 (MQ=255) cTGGGCCAGGGCCATCAGCACGGCGGGCAGGCGATCATCACCCTGTGCAGGGCGCTTGCAGGCCTGGTCCAGCTCGGCGGGTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCt < 8:190417/149‑1 (MQ=255) ccagggccaTCAGCACGGCGGGCAGGCGATCATCACCCTGTGCAGGGCGCTTGCAGGCCTGGTCCAGCTCGGCGGGTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTAc > 7:141696/1‑149 (MQ=255) ccagggccaTCAGCACGGCGGGCAGGCGATCATCACCCTGTGCAGGGCGCTTGCAGGCCTGGTCCAGCTCGGCGGGTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTAc > 8:340140/1‑149 (MQ=255) gccaTCAGCACGGCGGGCAGGCGATCATCACCCTGTGCAGGGCGCTTGCAGGCCTGGTCCAGCTCGGCGGGTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGGCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGa < 5:263847/149‑1 (MQ=255) aTCAGCACGGCGGGCAGGCGATTATCACCCTGTGCAGGGCGCTTGCAGGCCTGGTCCAGCTCGGCGGGTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTg < 5:419253/149‑1 (MQ=255) tCAGCACGGCGGGCAGGCGATCATCACCCTGTGCAGGGCGCTTGCAGGCCTGGTCCAGCTCGGCGGGTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTgg < 8:277142/149‑1 (MQ=255) aGCACGGCGGGCAGGCGATCATCACCCTGTGCAGGGCGCTTGCAGGCCTGGTCCAGCTCGGCGGGTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTa < 8:241272/149‑1 (MQ=255) gcggGCAGGCGATCATCACCCTGTGCAGGGCGCTTGCAGGCCTGGTCCAGCTCGGCGGGTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCTGGCGCTCgacc < 6:234183/132‑4 (MQ=255) gCAGGCGATCATCACCCTGTGCAGGGCGCTTGCAGGCCTGGTCCAGCTCGGCGGGTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAgg < 8:141696/149‑1 (MQ=255) gCGATCATCACCCTGTGCAGGGCGCTTGCAGGCCTGGTCCAGCTCGGCGGGTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTgg > 3:13739/1‑149 (MQ=255) gATCATCACCCTGTGCAGGGCGCTTGCAGGCCTGGTCCAGCTCGGCGGGTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCa < 7:192575/149‑1 (MQ=255) gATCATCACCCTGTGCAGGGCGCTTGCAGGCCTGGTCCAGCTCGGCGGGTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCa > 4:137392/1‑149 (MQ=255) catcaCCCTGTGCAGGGCGCTTGCAGGCCTGGTCCAGCTCGGCGGGTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACgg > 2:117269/1‑149 (MQ=255) catcaCCCTGTGCAGGGCGCTTGCAGGCCTGGTCCAGCTCGGCGGGTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACgg > 3:303264/1‑149 (MQ=255) atcaCCCTGTGCAGGGCGCTTGCAGGCCTGGTCCAGCTCGGCGGGTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTActc < 6:129901/132‑1 (MQ=255) atcaCCCTGTGCAGGGCGCTTGCAGGCCTGGTCCAGCTCGGCGGGTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTActc > 5:129901/1‑132 (MQ=255) atcaCCCTGTGCAGGGCGCTTGCAGGCCTGGTCCAGCTCGGCGGGTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACggg < 1:234375/149‑1 (MQ=255) cccTGTGCAGGGCGCTTGCAGGCCTGGTCCAGCTCGGCGGGTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCt < 8:9981/149‑1 (MQ=255) tgtgCAGGGCGCTTGCAGGCCTGGTCCAGCTCGGCGGGTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTc > 2:122573/1‑149 (MQ=255) tgtgCAGGGCGCTTGCAGGCCTGGTCCAGCTCGGCGGGTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTc > 4:272536/1‑149 (MQ=255) cAGGGCGCTTGCAGGCCTGGTCCAGCTCGGCGGGTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCGTTCCAcg > 4:38757/1‑149 (MQ=255) aGGGCGCTTGCAGGCCTGGTCCAGCTCGGCGGGTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCAcgc > 1:183340/1‑149 (MQ=255) gcTTGCAGGCCTGGTCCAGCTCGGCGGGTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGa < 5:128790/106‑1 (MQ=255) gcTTGCAGGCCTGGTCCAGCTCGGCGGGTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGa > 6:128790/1‑106 (MQ=255) cAGGCCTGGGCCAGCTCGGCGGTTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTGCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGc < 7:221772/149‑1 (MQ=255) aGGCCTGGTCCAGCTCGGCGGGTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGcc < 5:129025/149‑1 (MQ=255) ccTGGTCCAGCTCGGCGGGTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGt < 3:157417/149‑1 (MQ=255) gTCCAGCTCGGCGGGTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCa > 5:67510/1‑149 (MQ=255) gTCCAGCTCGGCGGGTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCa > 5:56695/1‑149 (MQ=255) gTCCAGCTCGGCGGGTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCA‑GGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCAc > 7:351160/1‑149 (MQ=255) cAGCTCGGCGGGTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCTCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGt < 8:272167/149‑1 (MQ=255) aGCTCGGCGGGTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCAAGGGTGGCACGGGCGCTTTCAACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTc > 1:79765/1‑149 (MQ=255) cggcggGTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCgg < 4:62959/147‑1 (MQ=255) cggcggGTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCgg > 3:62959/1‑147 (MQ=255) ggcggGTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCGGAAc < 6:62901/149‑1 (MQ=255) cggGTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCGGAACgg < 6:67510/149‑1 (MQ=255) cggGTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCGGAACgg > 5:391351/1‑149 (MQ=255) ggTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCGGAACGGGt < 8:8258/149‑1 (MQ=255) gTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGt < 5:138206/97‑1 (MQ=255) gTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGt > 6:138206/1‑97 (MQ=255) cTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCGGAACGGGTGCTGgcgc > 4:65730/1‑149 (MQ=255) tCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTc > 4:86522/1‑116 (MQ=255) tCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTc < 3:86522/116‑1 (MQ=255) ggCCAGTGCCGTAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCGGAACGGGTGCTGGCGcc < 7:340140/147‑1 (MQ=255) gCCAGTGCCGGAGGGGGAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCGGAACGGGTGCTGGCGCCCAt < 3:272682/149‑1 (MQ=255) cAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTAc > 3:115667/1‑73 (MQ=255) cAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTAc < 4:115667/73‑1 (MQ=255) cAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCGGAACGGGTGCTGGCGCCCATGt > 2:340968/1‑149 (MQ=255) aGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCGGAACGGGTGCTGGCGCCCATGTc > 3:378352/1‑149 (MQ=255) gTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCGGAACGGGTGCTGGCGCCCATGTcg > 7:285445/1‑149 (MQ=255) ggAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCGGAACGGGTGCTGGCGCCCATGTcgctgcg > 5:148285/1‑149 (MQ=255) ggAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCGGAACGGGTGCTGGCGCCCATGTcgctgcg > 5:133341/1‑149 (MQ=255) gatcatAACGCGCCCCATCAGCGACGCGAGGGGCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGGACTCCTCCCGGGTGGCACGGGCGCTTACCACGCGGGACGCGGCCTGGACCACGGCGGACCGGGGGCTGGCGCCCATGTcgctgcgct < 5:305957/144‑1 (MQ=255) gaaCGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGCTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCAGTACCACGTCGGAACGGGTGCTGGCGCCCATGTCGCTGCGCTGGCgg < 4:212386/148‑1 (MQ=255) aaCGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGCGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCAAGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCGGAACGGGTGCTGGCGCCCATGTcgctgcgct > 6:305957/1‑143 (MQ=255) aaCGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCGGAACGGGTGCTGGCGCCCATGTCGCTGCGCTGGCggg > 2:304019/1‑149 (MQ=255) aCGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCGGAACGGGTGCTGGCGCCCATGTCGCTGCGCTGGCGGGc > 1:221456/1‑149 (MQ=255) cgcgACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCGGAACGGGTGCTGGCGCCCATGTCGCTGCGCTGGCGGGcc < 5:390722/149‑1 (MQ=255) cgcgACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCGGAACGGGTGCTGGCGCCCATGTCGCTGCGCTGGCGGGcc < 5:384899/149‑1 (MQ=255) cgcgACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCGGAACGGGTGCTGGCGCCCATGTCGCTGCGCTGGCGGGcc < 1:117269/149‑1 (MQ=255) gcgACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCGGAACGGGTGCTGGCGCCCATGTCGCTGCGCTGGCGGGCCa > 8:368035/1‑149 (MQ=255) cgACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCGGAACGGGTGCTGGCGCCCATGTCGCTGCGCTGGCGGGcctt < 4:303264/149‑3 (MQ=255) gACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTACGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCGGAACGGGTGCTGGCGCCCATGTCGCTGCGCTGGCGGGCCATg > 8:33668/1‑149 (MQ=255) ccATCAGCGCCGCCAGGGGCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCGGAACGGGTGCTGGCGCCCATGTCGCTGCGCTGGCGGGCCATGCCg < 5:401094/149‑1 (MQ=255) cATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCGGAACGGGTGCTGGCGCCCATGTCGCTGCGCTGGCGGGCCATGCCgg < 2:183340/149‑1 (MQ=255) aTCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCGGAACGGGTGCTGGCGccc < 7:125590/120‑1 (MQ=255) aTCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCGGAACGGGTGCTGGCGccc > 8:125590/1‑120 (MQ=255) tCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCGGAACGGGTGCTGGCGCCCATGTCGCTGCGCTGGCGGGCCATGCCGGc > 2:345161/1‑148 (MQ=255) cAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCGGAACGGGTGCTGGCGCCCATGTCGCTGCGCTGGCGGGc > 6:40074/1‑138 (MQ=255) cAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCGGAACGGGTGCTGGCGCCCATGTCGCTGCGCTGGCGGGc < 5:40074/138‑1 (MQ=255) aGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCGGAACGGGTGCTGGCGCCCATGTCGCTGCGCTGGCGGGCCATGCCGGCAAt > 4:346704/1‑149 (MQ=255) agtacGAGCGCTGTCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCGGAACGGGTGCTGGCGCCCATGTCGCTGCGCTGGCGGGCCATGCCGGCAATGTCGc < 2:218881/140‑1 (MQ=255) agtacGAGCGCTGGCGCTCGTACTGCTCCTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCGGAACGGGTGCTGGCGCCCATGTCGCTGCGCTGGCGGGCCATGCCGGCAATGTCGc > 1:218881/5‑144 (MQ=255) agtacGAGCGCTGGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCGGAACGGGTGCTGGCGCCCATGTCGCTGCGCTGGCGGGCCATGCCGGCAATGTCGc > 1:212284/5‑144 (MQ=255) agtacGAGCGCTGGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGCGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCGGAACGGGTGCTGGCGCCCATGTCGCTGCGCTGGCGGGCCATGCCGGCAATGTCGc < 2:212284/140‑1 (MQ=255) tacGAGCGCTGGCGCTCGTACTGCGACAGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCGGAACGGGTGCTGGCGCCCATGTCGCTGCGCTGGCGGGCCATGCCGGCAATGTCGCCCAcgcc > 5:346696/3‑149 (MQ=255) gAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGCCTCGGCCTGTACCACGTCGGAACGGGTGCTGGCGCCCATGTCGCTGCGCTGGCGGGCCATGCCGGCAATGTCGCCCAcgccgc > 5:312773/1‑148 (MQ=255) gAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCGGAACGGGTGCTGGCGCCCATGTCGCTGCGCTGGCGGGCCATGCCGGCAATGTCGCCCAcgccgc > 3:182082/1‑148 (MQ=255) aGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCGGAACGGGTGCTGGCGCCCATGTCGCTGCGCTGGCGGGCCATGCCGGCAATGTCGCCCACGCCGCGa < 8:285445/149‑1 (MQ=255) gcCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCGGAACGGGTGCTGGCGCCCATGTCGCTGCGCTGGCGGGCCATGCCGGCAATGTCGCCCACGCCGCGAATc < 2:232634/149‑1 (MQ=255) gcCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCGGAACGGGTGCTGGCGCCCATGTCGCTGCGCTGGCGGGCCATGCCGGCAATGTCGCCCACGCCGCGAATc < 1:122573/149‑1 (MQ=255) ccAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCGGAACGGGTGCTGGCGCCCATGTCGCTGCGCTGGCGGGCCATGCCGGCAATGTCGCCCACGCCGCGAATCt < 3:137392/149‑1 (MQ=255) | GCGCGCTGGGCCAGGGCCATCAGCACGGCGGGCAGGCGATCATCACCCTGTGCAGGGCGCTTGCAGGCCTGGTCCAGCTCGGCGGGTGAGCCCTCGGCCAGTGCCGGAGGGGTAACGCGACCCATCAGCGCCGCCAGGGTCGAGCGCCAGCGCTCGTACTGCGACTGGTACTCCTCCAGGGTGGCACGGGCGCTTTCCACGCGGGACTCGGCCTGTACCACGTCGGAACGGGTGCTGGCGCCCATGTCGCTGCGCTGGCGGGCCATGCCGGCAATGTCGCCCACGCCGCGAATCT > NC_002947/925754‑926048 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |