Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,013,766 | A→C | 6.0% | V206G (GTG→GGG) ‡ | potF‑I ← | putrescine‑binding protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,013,766 | 0 | A | C | 6.0% | 254.6 / 6.5 | 84 | V206G (GTG→GGG) ‡ | potF‑I | putrescine‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (38/41); new base C (2/3); total (40/44) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.44e-01 |
CCACCTTCACGCCATTGTTCGCCTCGTCGGCGCGGTTCTTCGCCTGCAGCACATCCC‑‑‑CT‑GAGAACCC‑‑‑‑‑‑CACTACCACGCAGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGACGAGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTGGCCTTCTCGTAGTCCTTGGGGTCTTGGCTGTGATGGGGCAAGCCCAGGTA‑GTGCAGGGCGATCGGCAGCAGTTCGGGGCCATTGTCCAGCACCGCGACGCCACAGCTTTTCAGCTTGCTCATGTACTC > NC_002947/1013623‑1013914 | ccACCTTCACGCCATTGTTCGCCTCGTCGGCGCGGTTCTTCGCCTGCAGCACATCCC‑‑‑CT‑GAGAACCC‑‑‑‑‑‑CACTACCACGCAGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGACGAGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTtc < 1:9143/149‑1 (MQ=255) ccACCTTCACGCCATTGTTCGCCTCGTCGGCGCGGTTCTTCGCCTGCAGCACATCCC‑‑‑CT‑GAGAACCC‑‑‑‑‑‑CACTACCACGCAGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGACGAGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTtc < 6:259063/149‑1 (MQ=255) cACCTTCACGCCATTGTTCGCCTCGTCGGCGCGGTTCTTCGCCTGCAGCACATCCC‑‑‑CT‑GAGAACCC‑‑‑‑‑‑CACTACCACGCAGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGACGAGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTtca > 7:318673/1‑149 (MQ=255) aCCTTCACGCCATTGTTCGCCTCGTCGGCGCGGTTCTTCCCCTGCAGCACATCCC‑‑‑CT‑GAGAACCC‑‑‑‑‑‑CACTACCACGCAGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGACGAGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTtcat > 6:168941/1‑149 (MQ=255) cTTCACGCCATTGTTCGCCTCGTCGGCGCGGTTCTTCGCCTGCAGCACATCCC‑‑‑CT‑GAGAACCC‑‑‑‑‑‑CACTACCACGCAGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGACGAGTGGAAATAGCTGATGAAAGTGCGGCCTTacatca < 1:96982/149‑1 (MQ=255) cACGCCTTTGTTCGCCTCGTCGGGGGGGTTCTTCGCCTGCAGCACATCCCTTTCTCTTCATCCCTTTTAACTCTACCACGCAGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGACGAGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCa < 1:334597/147‑1 (MQ=16) cATTGTTCGCCTCGTCGGCGCGGTTCTTCGCCTGCAGCACATCCC‑‑‑CT‑GAGAACCC‑‑‑‑‑‑CACTACCACGCAGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCGTGTACTCTGGACGAGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTc < 1:299876/149‑1 (MQ=255) cATTGTTCGCCTCGTCGGCGCGGTTCTTCGCCTGCAGCACATCCC‑‑‑CT‑GAGAACCC‑‑‑‑‑‑CACTACCACGCAGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGACGAGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCACGTcc > 2:394520/1‑149 (MQ=255) aTTGTTCGCCTCGTCGGCGCGGTTCTTCGCCTGCAGCACATCCC‑‑‑CT‑GAGAACCC‑‑‑‑‑‑CACTACCACGCAGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGACGAGTGGAAATAGCTGATGAAAGTGCGGCCTTACATcagctatttcc < 4:354127/149‑8 (MQ=38) gTTCGCCTCGTCGGCGCGGTTCTTCGCCTGCAGCACATCCC‑‑‑CT‑GAGAACCC‑‑‑‑‑‑CACTACCACGCAGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGACGAGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTg < 1:326040/148‑1 (MQ=255) gTTCGCCTCGTCGGCGCGGTTCTTCGCCTGCAGCACATCCC‑‑‑CT‑GAGAACCC‑‑‑‑‑‑CACTACCACGCAGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGACGAGTGGAAATAGCTGATCTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTg < 1:34315/148‑1 (MQ=255) gCCTCGTCGGCGCGGTTCTTCGCCTGCAGCACATCCC‑‑‑CT‑GAGAACCC‑‑‑‑‑‑CACTACCACGCAGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGACGAGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTGGCCtt > 3:10924/1‑149 (MQ=255) ccTCGTCGGCGCGGTTCTTCGCCTGCAGCACATCCC‑‑‑CT‑GAGAACCC‑‑‑‑‑‑CACTACCACGCAGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGACGAGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTGGCCTtc > 1:195625/1‑149 (MQ=255) ccTCGTCGGCGCGGTTCTTCGCCTGCAGCACAAACC‑‑‑CT‑GAGAACCC‑‑‑‑‑‑CACTACCACGCAGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGAGGAGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCCGGTCCTTGGCCTtc > 6:136518/1‑149 (MQ=255) gtcgGCGCGGTTCTTCGCCTGCAGCACATCCC‑‑‑CT‑GAGAACCC‑‑‑‑‑‑CACTACCACGCAGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGACGAGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTGGCCTtctc < 1:81382/147‑1 (MQ=255) gtcgGCGCGGTTCTTCGCCTGCAGCACATCCC‑‑‑CT‑GAGAACCC‑‑‑‑‑‑CACTACCACGCAGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGACGAGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTGGCCTtctc < 4:400854/147‑1 (MQ=255) gtcgGCGCGGTTCTTCGCCTGCAGCACATCCC‑‑‑CT‑GAGAACCC‑‑‑‑‑‑CACTAACACGCAGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGACGAGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTGGCCTTCTCg < 1:310840/148‑1 (MQ=255) tcgGCGCGGTTCTTCGCCTGCAGCACATCCC‑‑‑CT‑GAGAACCC‑‑‑‑‑‑CACTACCACGCAGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGACGAGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTGGCCTTCTCGTa < 3:1871/149‑1 (MQ=255) ggCGCGGTTCTTCGCCTGCAGCACATCCC‑‑‑CT‑GAGAACCC‑‑‑‑‑‑CACTACCACGCAGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGACGAGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTg < 2:387528/136‑1 (MQ=255) ggCGCGGTTCTTCGCCTGCAGCACATCCC‑‑‑CT‑GAGAACCC‑‑‑‑‑‑CACTACCACGCAGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGACGAGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTg > 1:387528/1‑136 (MQ=255) gTTCTTCGCCTGCAGCACATCCC‑‑‑CT‑GAGAACCC‑‑‑‑‑‑CACTACCACGCAGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGACGAGTGGAAATGGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATTAGCAGGTCCTTGGCCTTCTCGTAGTCCTTgg > 7:222488/1‑149 (MQ=255) gTTCTTCGCCTGCAGCACATCCC‑‑‑CT‑GAGAACCC‑‑‑‑‑‑CACTACCACGCAGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGACGAGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTg < 7:133244/130‑1 (MQ=255) gTTCTTCGCCTGCAGCACATCCC‑‑‑CT‑GAGAACCC‑‑‑‑‑‑CACTACCACGCAGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGACGAGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTg > 8:133244/1‑130 (MQ=255) gTTCTTCGCCTGCAGCACATCCC‑‑‑CT‑GAGAACCC‑‑‑‑‑‑CACTACCACGCAGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCATGTACT‑TGGACGAGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTGGCCTTCTCGTAGTCCTTgg > 1:191904/1‑149 (MQ=255) ttcttcGCCTGCAGCACATCCC‑‑‑CT‑GAGAACCC‑‑‑‑‑‑CACTACCACGCAGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGACGAGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTGGCCTTCTCGTAGTCCTTggg < 8:318673/149‑1 (MQ=255) ccTGCAGCACATCCC‑‑‑CT‑GAGAACCC‑‑‑‑‑‑CACTACCACGCAGATATCGCCGTTGGACCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGACGAGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTGGCCTTCTCGTAGTCCTTGGGGTCTTg > 1:305118/1‑149 (MQ=255) gcaCATCCC‑‑‑CT‑GAGAACCC‑‑‑‑‑‑CACTACCACGCAGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGACGAGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTGGCCTTCTCGTAGTCCTTGGGGTCTTGGCTGTGa < 5:244972/149‑1 (MQ=255) acaTCCC‑‑‑CT‑GAGAACCC‑‑‑‑‑‑CACTACCACGCAGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGACGAGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTGGCCTTCTCGTAGTCCTTGGGGTCTTGGCTGTGATg > 4:306675/1‑149 (MQ=255) caTCCC‑‑‑CT‑GAGAACCC‑‑‑‑‑‑CACTACCACGCAGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGACGAGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTGCATCAGCAGGTCCTTGGCCTTCTCGTAGTCCTTGGGGTCTTGGCTGTGATgg > 8:155826/1‑149 (MQ=255) aTCCC‑‑‑CT‑GAGAACCC‑‑‑‑‑‑CACTACCACGCAGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGACGAGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTGGCCTTCTCGTAGTCCTTGGGGTCTTGGCTGTGATggg < 2:195625/149‑1 (MQ=255) aTCCC‑‑‑CT‑GAGAACCC‑‑‑‑‑‑CACTACAACGCAGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGACGAGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTGGCCTTCTCGTAGTCCTTGGGGTCTTGGCTGTGATggg > 8:138047/1‑149 (MQ=255) cc‑‑‑cT‑GAGAACCC‑‑‑‑‑‑CACTACCACGCAGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGACGAGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTGGCCTTCTCGTAGTCCTTGGGGTCTTGGCTGTGATGGGGc > 4:157662/1‑148 (MQ=255) gagaACCC‑‑‑‑‑‑CACTACCACGCAGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGACGAGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTGGCCTTCTCGTAGTCCTTGGGGTCTTGGCTGTGATGGGGCAAGcc > 6:355361/1‑149 (MQ=255) aCCC‑‑‑‑‑‑CACTACCACGCAGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGACGAGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTGGCCTTCTCGTAGTCCTTGGGGTCTTGGCTGTGATGGGGCAAGCCCAgg < 4:68296/149‑1 (MQ=255) aCCC‑‑‑‑‑‑CACTACCACGCAGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCATGTACT‑TGGACGAGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTGGCCTTCTCGTAGTCCTTGGGGTCTTGGCTGTGATGGGGCAAGCCCAgg < 2:191904/149‑1 (MQ=255) ccc‑‑‑‑‑‑cACTACCACGCAGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGACTAGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGTTCCTTGGCCTTCTCGTAGTCCTTGGGGTCTTGGCTGTGATGGGGCAAGCCCAGGt < 1:210433/149‑1 (MQ=255) cc‑‑‑‑‑‑cACTACCACGCAGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGACGAGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTGGCCTTCTCGTAGTCCTTGGGGTCTTGGCTGTGATGGGGCAAGCCCAGGTa > 2:246668/1‑149 (MQ=255) c‑‑‑‑‑‑cACTACCACGCAGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGACGAGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTGGCCTTCTCGTAGTCCTTGGGGTCTTGGCTGTGATGGGGCAAGCCCAGGTA‑g > 3:317647/1‑149 (MQ=255) 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aCGCAGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGACGAGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTGGCCTTCTCGTAGTCCTTGGGGTCTTGGCTGTGATGGGGCAAGCCCAg < 1:377681/137‑1 (MQ=255) aCGCAGATATCGCCGTTCG‑CCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGACGAGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTGGCCTTCTCGTAGTCCTAGGGGTCTTGGCTGTGATGGGGCAAGCCCAGGTA‑CTGCAGGGc > 7:106501/1‑149 (MQ=255) aGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGACGAGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTGGCCTTCTCGTAGTCCTTGGGGTCTTGGCTGTGATTGGGCAAGCCCAGGTA‑GTGCAgagatcc > 1:143120/1‑142 (MQ=255) aGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGACGAGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTGGCCTTCTCGTAGTCCTTGGGGTCTTGGCTGTGATGGGGCAAGCCCAGGTA‑GTGCa < 2:143120/141‑1 (MQ=255) aGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGACGAGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTGGCCTTCTCGTAGTCCTTGGGGTCTTGGCTGTGATGGGGCAAGCCCAGGTA‑GTGCAGGGCGATc < 7:246205/149‑1 (MQ=255) 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aGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTGGCCTTCTCGTAGTCCTTGGGGTCTTGGCTGTGATGGGGCAAGCCCAGGTA‑GTGCAGGGCGATCGGCAGCAGTTCGGGGCCATTGTCCAGCACCGCGACGCca < 1:246668/149‑1 (MQ=255) aGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTGGCCTTCTCGTAGTCCTTGGGGTCTTGGCTGTGATGGGGCAAGCCCAGGTA‑GTGCAGGGCGATCGGCAGCAGTTCGGGGCCATTGTCCAGCACCGCGACGCca > 3:8365/1‑149 (MQ=255) gTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTGGCCTTCTCGTAGTCCTTGGGGTCTTGGCTGTGATGGGGCAAGCCCAGGTA‑GTGCAGGGCGATCGGCAGCAGTTCGGGGCCATTGTCCAGCACCGCGACGCca > 4:225200/1‑148 (MQ=255) gAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTGGCCTTCTCGTAGTCCTTGGGGTCTTGGCTGTGATGGGGCAAGCCCa < 5:200888/89‑1 (MQ=255) gAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTGGCCTTCTCGTAGTCCTTGGGGTCTTGGCTGTGATGGGGCAAGCCCa > 6:200888/1‑89 (MQ=255) gAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTGGCCTTCTCGTAGTCCTTGGGGTCTTGGCTGTGATGGGGCAAGCCCAGGTA‑GTGCAGGGCGATCGGCAGGAGTTCGGGGCCATTGTCCAGCACCGCGACGCCACAGc > 2:276205/1‑149 (MQ=255) 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ctgCTGATGAAAGTGCGGCCTTACATCAGCAGGTCCTTGGCCTTCTCGTAGTCCTTGGGGTCTTGGCTGTGATGGGGCAAGCCCAGGTA‑GTGCAGGGCGATCGGCAGCAGTTCGGGGCCATTGTCCAGCACCGCGACGCCACAGCtt < 8:372513/145‑1 (MQ=255) gCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTGGCCTTCTCGTAGTCCTTGGGGTCTTGGCTGTGATGGGGCAAGCCCAGGTA‑GTGCAGGGCGATCGGCAGCAGTTCGGGGCCATTGTCCAGCACCGCGACGCCACAGCTTTTCa < 3:306675/149‑1 (MQ=255) gCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTGGCCTTCTCGTAGTCCTTGGGGTCTTGGCTGTGATGGGGCAAGCCCAGGTA‑GTGCAGGGCGATCGGCAGCAGTTCGGGGCCATTGTCCAGCACCGCGACGCCACAGCTTTTCa < 3:157662/149‑1 (MQ=255) gCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTGGCCTTCTCGTAGTCCTTGGGGTCTTGGCTGTGATGGGGCAAGCCCAGGTA‑GTGCAGGGCGATCGGCAGCAGTTCGGGGCCATTGTCCAGCACCGCGACGCCACAGCTTTTCa < 5:136518/149‑1 (MQ=255) cTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTGGCCTTCTCGTAGTCCTTGGGGTCTTGGCTGTGATGGGGCAAGCCCAGGTA‑GTGCAGGGCGATCGGCAGCAGTTCGGGGCCATTGTCCAGCACCGCGACGCCACAGCTTTTCAg > 6:261174/1‑149 (MQ=255) tAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTGGCCTTCTCGTAGTCCTTGGGGTCTTGGCTGTGATGGGGCAAGCCCAGGTA‑GTGCAGGGCGATCGGCAGCAGTTCGGGGCCATTGTCCAGCACCGCGACGCCACAGCTTTTCAGCTTGc < 5:41620/148‑1 (MQ=255) gCACTTTCATCAGCAGGTCCTTGGCCTTCTCGTAGTCCTTGGGGTCTTGGCTGTGATGGGGCAAGCCCAGGTA‑GTGCAGGGCGATc > 7:336584/1‑86 (MQ=255) gCACTTTCATCAGCAGGTCCTTGGCCTTCTCGTAGTCCTTGGGGTCTTGGCTGTGATGGGGCAAGCCCAGGTA‑GTGCAGGGCGATc < 8:336584/86‑1 (MQ=255) cACTTTCATCAGCAGGTCCTTGGCCTTCTCGTAGTCCTTGGGGTCTTGGCTGTGATGGGGCAAGCCCAGGTA‑GTGCAGGGCGATCGGCAGCAGTTCGGGGCCATTGTCCAGCACCGCGACGCCACAGCTTTTCAGCTTGCTCATGTACt > 5:107970/1‑149 (MQ=255) aCTTTCATCAGCAGGTCCTTGGCCTTCTCGTAGTCCTTGGGGTCTTGGCTGTGATGGGGCAAGCCCAGGTA‑GTGCAGGGCGATCGGCAGCAGTTCGGGGCCATTGTCCAGCACCGCGACGCCACAGCTTTTCAGCTTGCTCATGTACTc < 8:8920/149‑1 (MQ=255) | CCACCTTCACGCCATTGTTCGCCTCGTCGGCGCGGTTCTTCGCCTGCAGCACATCCC‑‑‑CT‑GAGAACCC‑‑‑‑‑‑CACTACCACGCAGATATCGCCGTTGG‑CCAGGTCGCCCGTGTACT‑TGGACGAGTGGAAATAGCTGATGTAAGGCCGCACTTTCATCAGCAGGTCCTTGGCCTTCTCGTAGTCCTTGGGGTCTTGGCTGTGATGGGGCAAGCCCAGGTA‑GTGCAGGGCGATCGGCAGCAGTTCGGGGCCATTGTCCAGCACCGCGACGCCACAGCTTTTCAGCTTGCTCATGTACTC > NC_002947/1013623‑1013914 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |