| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,046,230 | C→G | 7.6% | S716S (TCG→TCC) | PP_0906 ← | RND family multidrug transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,046,230 | 0 | C | G | 7.6% | 201.4 / 6.8 | 66 | S716S (TCG→TCC) | PP_0906 | RND family multidrug transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (30/30); new base G (3/2); total (33/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.82e-01 | |||||||||||
CACGTAGTAGTTGTTCAGCCAGCCGGGGTTGTCGCGGTAAGGCCGTTCAACCTGGGCGATCACCTTGTAACTGCGGCC‑TTCAAGGGTGAAACGGTTGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTCGGGTTTGTCGAAGGCAAGATCGATATCGAGGAAGGCGAACTTGCCCGATTCCTGAGCGCGCGTCTTGATGCGTTGGGCCACGTCCAGCAGT > NC_002947/1046083‑1046371 | caggtagttTTTGTTCAGCCTGCCGGGGTTGTCGCGGTAAGGCCGTTCTACATGGGCGATCACCTTGTAACTGCGGCG‑TTCAAGTGTGAAACGGTTGATTTCCGCGTCGCGCAGAAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCTAGGGTGTCCATc < 8:161097/145‑1 (MQ=255)cACGTAGTAGTTGTTCAGCCAGCCGGGGTTGTCGCGGTAAGGCCGTTCAACCTGGGCGATCACCTTGTAACTGCGGCC‑TTCAAGGGTGAAACGGTTGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATc > 2:258075/1‑148 (MQ=255) aCGTAGTAGTTGTTCAGCCAGCCGGGGTTGTCGCGGTAAGGCCGTTCAACCTGGGCGATCACCTTGTAACTGCGGCC‑TTCAAGGGTGAAACGGTTGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGa < 3:239555/149‑1 (MQ=255) gtagtaGTTGTTCAGCCAGCCGGGGTTGTCGCGGTAAGGCCGTTCAACCTGGGCGATCACCTTGTAACTGCGGCC‑TTCAAGGGTGAAACGGTTGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGaca > 4:313518/1‑149 (MQ=255) gtagtTGTTCAGCCAGCCGGGGTTGTCGCGGTAAGGCCGTTCAACCTGGGCGATCACCTTGTAACTGCGGCC‑TTCAAGGGTGAAACGGTTGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACAcc < 1:258075/148‑1 (MQ=255) gttgttCAGCCAGCCGGGGTTGTCGCGGTAAGGCCGTTCAACCTGGGCGATCACCTTGTAACTGCGGCC‑TTCAAGGGTGAAACGGTTGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACAccccc > 6:275471/1‑148 (MQ=255) ttgatCAGCCAGCCGCGGGTGTCCCGGTAAGCGCGTTCTACCTGTGCGATCACCTTGTAACTGCGGCC‑TTCAAGGGTGAAACGGTTGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCGATGGACAccctcgg < 8:198884/149‑5 (MQ=255) gttCAGCCAGCCGGGGTTGTCGCGGTAAGGCCGTTCAACCTGGGCGATCACCTTGTAACTGCGGCC‑TTCAAGGGTGAAACGGTTGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCGATGGACAccctcg < 8:32718/146‑4 (MQ=255) gttCAGCCAGCCGGGGTTGTCGCGGTAAGGCCGTTCAACCTGGGCGATCACCTTGTAACTGCGGCC‑TTCAAGGGTGAAACGGTTGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCGATGGACAccctcg > 7:32718/1‑143 (MQ=255) gttCAGCCAGCCGGGGTTGTCGCGGTAAGGCCGTTCAACCTGGGCGATCACCTTGTAACTGCGGCC‑TTCAAGGGTGAAACGGTTGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCt > 3:297258/1‑149 (MQ=255) gttCAGCCAGCCGGGGTTGTCGCGGTAAGGCCGTTCAACCTGGGCGATCAACTTGTAACTGCGGCC‑TTCAAGGGTGAAACGGTTGATTTCAGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCAGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCAt > 2:388728/1‑147 (MQ=255) agccGGGGTTGTCGCGGTAAGGCCGTTCAACCTGGGCGATCACCTTGTAACTGCGGCC‑TTCAAGGGTGAAACGGTTGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCgccgcc < 8:143846/149‑1 (MQ=255) gccGGGGTTGTCGCGGTAAGGCCGTTCAACCTGGCCGATCACCTTTTAACTGCGGCC‑TTCAAGGGTGAAACGGTTGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCt > 7:265375/1‑149 (MQ=255) ccGGGGTTGTCGCGGTAAGTCCGTTCAACCTGGGCGATCACCTTGTAACTGCGGCC‑TTCAAGGGTGAAACGGTTGATTTCCGCCTCGCCAAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCtt < 6:94611/149‑1 (MQ=255) tGTCGCGGTAAGGCCGTTCAACCTGGGCGATCACCTTGTAACTGCGGCC‑TTCAAGGGTGAAACGGTTGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCgg > 7:154430/1‑149 (MQ=255) cgGTAAGGCCGTTCAACCTGGTCGATCACCTTGTAACTGCGGCC‑TTCAAGGGTGAAACGTTTGATTTCCTCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGATGGTGTCCATAGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGAt < 1:388728/149‑1 (MQ=255) cgGTAAGGCCGTTCAACCTGGGCGATCACCTTGTAACTGCGGCCGTTCAAGGGTGAAACGGTTGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGa > 1:288316/1‑149 (MQ=255) ggTAAGGCCGTTCAACCTGGGCGATCACCTTGTAACTGCGGCC‑TTCAAGGGTGAAACGGTTGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATg < 5:275471/149‑1 (MQ=255) ggTAAGGCCGTTCAACCTGGGCGATCACCTTGTAACTGCGGCC‑TTCAAGGGTGAAACGGTGGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTTCCCGTTCGATg < 4:107539/149‑1 (MQ=255) tAAGGCCGTTCAACCTGGGCGATCACCTTGTAACTGCGGCC‑TTCAAGGGTGAAACGGTTGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTc < 1:174658/149‑1 (MQ=255) aGGCCGTTCAACCTGGGCGATCACCTTGTAACTGCGGCC‑TTCAAGGGTGAAACGGTTGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTcc < 8:298938/148‑1 (MQ=255) ggCCGTTCAACCTGGGCGATCACCTTGTAACTGCGGCC‑TTCAAGGGTGAAACGGTTGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTccac > 6:138077/1‑149 (MQ=255) gCCGTTCAACCTGGGCGATCACCTTGTAACTGCGGCC‑TTCAAGGGTGAAACGGTTGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTccacc < 2:24208/149‑1 (MQ=255) cGTTCAACCTGGGCGATCACCTTGTAACTGCGGCC‑TTCAAGGGTGAAACGGTTGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTccaccac > 3:44708/1‑149 (MQ=255) aCCTGGGCGATCACCTTGTAACTGCGGCC‑TTCAAGGGTGAAACGGTTGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTc > 7:168280/1‑149 (MQ=255) cTGGGCGATCACCTTGTAACTGCGGCC‑TTCAAGGGTGAAACGGTTGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTCgg > 8:21483/1‑149 (MQ=255) gCGATCACCTTGTAACTGCGGCC‑TTCAAGGGTGAAATGGTTGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTCGGGttt < 4:292379/149‑1 (MQ=255) tCACCTTGTAACTGCGGCC‑TTCAAGGGTGAAACGGTTGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTCGGGTTTGTCg < 8:154430/149‑1 (MQ=255) cTTGTAACTGCGGCC‑TTCAAGGGTGAAACGGTTGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTCGGGTTTGTCGAAgg < 3:38418/149‑1 (MQ=255) ttGTAACTGCGGCC‑TTCAAGGGTGAAACGGTTGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTc < 2:282120/116‑1 (MQ=255) ttGTAACTGCGGCC‑TTCAAGGGTGAAACGGTTGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTc > 1:282120/1‑116 (MQ=255) ttGTAACTGCGGCC‑TTCAAGGGTGAAACGGTTGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTCGGGTTTGTCGAAgg > 3:215741/1‑148 (MQ=255) gCGGCC‑TTCAAGGGTGAAACGGTTGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTCGGGTTTGTCGAAGGCAAGATCGa > 1:42802/1‑149 (MQ=255) ttCAAGGGTGAAACGGTTGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTCGGGTTTGTCGaa > 2:219029/1‑132 (MQ=255) aaGGGTGAAACGGTTGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCCCTTCGGGTTTGTCGAAGGCAAGATCGATATCGAgg > 6:407303/1‑148 (MQ=255) aaGGGTGAAACGGTTGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTCGGGTTTGTCGAAGGCAAGATCGATATCGAGGa < 4:73284/149‑1 (MQ=255) gggTGAAACGGTTGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGGTGTCCACCACCACTTCGGGTTTGTCGAAGGCAAGATCGATATCGAGGAAg > 2:27017/1‑149 (MQ=255) gTGAAACGGTTGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTCGGGTTTGTCGAAGGCAAGATCGATATCGAGGaa > 7:175254/1‑146 (MQ=255) gTGAAACGGTTGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTCGGGTTTGTCGAAGGCAAGATCGATATCGAGGaa < 8:175254/146‑1 (MQ=255) gTGAAACGGTTGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTCGGGTTTGTCGAAGGCAAGATCGATATCGAGGAAGGc > 4:67908/1‑149 (MQ=255) aaaCGGTTGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTCGGGTTTGTCGAAGGCAAGATCGATATCGAGGAAGGCGaa < 5:138077/149‑1 (MQ=255) aaaCGGTTGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTCGGGTTTGTCGAAGGCAAGATCGATATCGAGGAAGGCGa < 8:21109/148‑1 (MQ=255) aCGGTTGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTCGGGTTTGTCGAAGGCAAGATCGATATCGAGGAAGGCGAACt > 2:272632/1‑149 (MQ=255) ggTTGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAACGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGACCCCTTTGCCCGCACGATGTCCAACACCACTTCCGGATTGTCGAAGGCAACATAGATATCGAGCAAGTCGAAATTg > 4:217060/1‑149 (MQ=255) aTTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTCGGGTTTGTCGAAGGCAAGATCGATATCGAGGAAGGCGAACTTGCCCGa < 3:313518/149‑1 (MQ=255) cGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCAACTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTCGGGTTTGTCGAAGGCAAGATCGATATCGAGGAAGGCGAACTTGCCCGATTCCt > 5:223780/1‑149 (MQ=255) gCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTCGGGTTTGTCGAAGGCAAGATCGATATCGAGGAAGGCGAACTTGCCCGa > 6:191331/1‑143 (MQ=255) gCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTCGGGTTTGTCGAAGGCAAGATCGATATCGAGGAAGGCGAACTTGCCCGa < 5:191331/143‑1 (MQ=255) ccTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTCGGGTTTGTCGAAGGCAAGATCGATATCGAGGAAGGCGAACTTGCCCGATTCCTGa < 2:42802/149‑1 (MQ=255) ccAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGCCACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTCGGGTTTGTCGAAGGCAAAGTCGATATCGAGGAAGGCGAACTTTGCCGATTCCAGAgcgcgc > 1:339034/1‑149 (MQ=255) ggTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGGTGTCCACCACCACTTCGGGTTTGTCGAAGGCAAGATCGATATCGAGGAAGGCGAACTTGCCCGATTCCTGAGCGCGCGTCTTGa < 1:27017/149‑1 (MQ=255) ggTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTCGGGTTTGTCGAAGGCAAGATCGATATCGAGGAAGGCGAACTTGCCCGATTCCt > 3:313720/1‑134 (MQ=255) ggTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTCGGGTTTGTCGAAGGCAAGATCGATATCGAGGAAGGCGAACTTGCCCGATTCCt < 4:313720/134‑1 (MQ=255) gTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGTGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTCGGGTTTGTCGAAGGCAAGATCGATATCGAGGAAGGCGAACTTGCCCGATTCCTGAGCGCGCGTCTTGAt < 4:297258/149‑1 (MQ=255) gTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTCGGGTTTGTCGAAGGCAAGATCGATATCGAGGAAGGCGAACTTGCCCGATTCCTGAGCGCGCGTCTTGAt < 8:168280/149‑1 (MQ=255) gCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTCGGGTTTGTCGAAGGCAAGATCGATATCGAGGAAGGCGAACTTGCCCGATTCCTGAGCGCGCGTCTTGATGCg > 2:167911/1‑149 (MQ=255) ggTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTCGGGTTGGTCGAAGGCAAGATCGATATCGCGGAAGGCGAACTTGCCCGATTCCTGAGCGCGCGTCTTGATGCGTTggg < 5:407303/149‑1 (MQ=255) gTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTCGGGTTTGTCGAAGGCAAGATCGATATCGAGGAAGGCGAACTTGCCCGATTCCTGAGCGCGCGTCTTGATGCGGTGTGc < 4:44708/149‑1 (MQ=255) tGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTCGGGTTTGTCGAAGGCAAGATCGATATCGAGGAAGGCGAACTTGCCCGATTCCTGAGCGCGCGTCTTGATGCGTTGGGcc < 1:167911/149‑1 (MQ=255) cgccgAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTCGGGTTTGTCGAAGGCAAGATCGATATCGAGGAAGGCGAACTTGCCCGATTCCTGAGCGCGCGTCTTGATGCGTTGGGCCACg > 2:389321/1‑149 (MQ=255) ccgAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTCGGGTTTGTCGAAGGCAAGATCGATATCGAGGAAGGCGAACTTGCCCGATTCCTGAGCGCGCGTCTTGATGCGTTGGGCCACGTc > 3:228331/1‑149 (MQ=255) tgggggTGTCGATGGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTCGGGTATGTCGAAGGCAAGATCGATATCGAGGAAGGCGAACTTGCCCGATTCCTGAGCGCGCGTCTTGATCCGTTGGGCCACGTcc > 6:273588/4‑149 (MQ=255) gAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTCGGGTTTGTCGAAGGCAAGATCGATATCGAGGAAGGCGAACTTGCCCGATTCCTGAGCGCGCGTCTTGATGCGTTGGGCCACGTCca < 8:265375/149‑1 (MQ=255) gAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTCGGGTTTGTCGAAGGCAAGATCGATATCGAGGAAGGCGAACTTGCCCGATTCCTGAGCGCGCGTCTTGATGCGTTGGGCCACGTCca < 5:351429/149‑1 (MQ=255) gggTGTCGATGGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTCGGGTTTGTCGAAGGCAAGATCGATATCGAGGAAGGCGAACTTGCCCGATTCCTGAGCGCGCGTCTTGATGCGTTGGGCCACGTCcag > 6:135190/1‑148 (MQ=255) ggTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTCGGGTTTGTCGAAGGCAAGATCGATATCGAGGAAGGCGAACTTGCCCGATTCCTGAGCGCGCGTCTTGATGCGTTGGGCCACGTCcagca < 2:288316/149‑1 (MQ=255) tgtCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTCGGGTTTGTCGAAGGCAAGATCGATATCGAGGAAGGCGAACTTGCCCGATTCCTGAGCGCGCGTCTTGATGCGTTGGGCCACGTCCAGCAGt > 6:311838/1‑149 (MQ=255) tgtCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTCGGGTTTGTCGAAGGCAAGATCGATATCGAGGAAGGCGAACTTGCCCGATTCCTGAGCGCGCGTCTTGATGCGTTGGGCCACGTCCAGCAGt > 8:332052/1‑149 (MQ=255) cGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTCGGGTTTGTCGAAGGCAAGATCGATATCGAGGAAGGCGAACTTGcc < 8:208277/96‑1 (MQ=255) cGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTCGGGTTTGTCGAAGGCAAGATCGATATCGAGGAAGGCGAACTTGcc > 7:208277/1‑96 (MQ=255) | CACGTAGTAGTTGTTCAGCCAGCCGGGGTTGTCGCGGTAAGGCCGTTCAACCTGGGCGATCACCTTGTAACTGCGGCC‑TTCAAGGGTGAAACGGTTGATTTCCGCCTCGCCCAGCAGGGTCGCCAAGGTGCCGCCGAGGGTGTCCATCGACACCCCCATCTGCGCCGCCTTTGCCCGGTCGATGTCCACCACCACTTCGGGTTTGTCGAAGGCAAGATCGATATCGAGGAAGGCGAACTTGCCCGATTCCTGAGCGCGCGTCTTGATGCGTTGGGCCACGTCCAGCAGT > NC_002947/1046083‑1046371 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |