Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,060,961 | A→G | 6.4% | E56G (GAG→GGG) | PP_0918 → | 3‑beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,060,961 | 0 | A | G | 6.4% | 228.9 / 2.4 | 77 | E56G (GAG→GGG) | PP_0918 | 3‑beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (33/39); new base G (2/3); total (35/42) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GGCGCGAGTGGCTTCATTGGCGGGCGTTTTGCGCGTTTCGCCCTGGAGCAAGGCCTGGACGTGCGCGTCAGCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCATTGCGCTGGCGCGGTGGGTAACTGGGGGCGCTATCAGGATTTCTACCAAGGCAACGTGGTGGTGACCGAGAACGTGGTCGAGGGCTGCCTGAAAGAGCACG > NC_002947/1060813‑1061104 | ggCGCGAGTGGCTTCATTGGCGGGCGTTTTGCGCGTTTCGCCCTGGAGCAAGGCCTGGACGTGCGCGTCAGCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGa < 1:267201/149‑1 (MQ=255) cgcgAGTGGCTTCATTGGCGGGCGTTTTGCGCGTTTCGCCCTGGAGCAAGGCCTGGACGTGCGCGTCAGCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGc < 3:397713/149‑1 (MQ=255) ggCTTCATTGGCGGGCGTTTTGCGCGTTTCGCCCTGGAGCAAGGCCTGGACGTGCGCGTCAGCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCg > 6:104089/1‑149 (MQ=255) gCTTCATTGGCGGGCGTTTTGCGCGTTTCGCCCTGGAGCAAGGCCTGGACGTGCGCGTCAGCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGGCGCCGAGCTGGCCCgg > 2:50921/1‑149 (MQ=255) gCTTCATTGGCGGGCGTTTTGCGCGTTTCGCCCTGGAGCAAGGCCTGGACGTGCGCGTCAGCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCgg > 7:102634/1‑149 (MQ=255) gCTTCATTGGCGGGCGTTTTGCGCGTTTCGCCCTGGAGCAAGGCCTGGACGTGCGCGTCAGCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCgg > 1:404320/1‑149 (MQ=255) gCTTCATTGGCGGGCGTTTTGCGCGTTTCGCCCTGGAGCAAGGCCTGGACGTGCGCGTCAGCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCgg < 1:88073/149‑1 (MQ=255) ctgcATTGGCGGGCGTTTTGCGCGTTTCGCCCTGGAGCAAGGCCTGGACGTGCGCGTCAGCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGc < 7:340135/146‑1 (MQ=255) ttCATTGGCGGGCGTTTTGCGCGTTTCGCCCTGGAGCAAGGCCTGGACGTGCGCGTCAGCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCg > 3:161605/1‑149 (MQ=255) ttCATTGGCGGGCGTTTTGCGCGTTTCGCCCTGGAGCAAGGCCTGGACGTGCGCGTCAGCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCg > 4:228292/1‑149 (MQ=255) cATTGGCGGGCGTTTTGCGCGTTTCGCCCTGGAGCAAGGCCTGGACGTGCGCGTCAGCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGt < 3:162367/148‑1 (MQ=255) aTTGGCGGGCGTTTTGCGCGTTTCGCCCTGGAGCAAGGCCTGGACGTGCGCGTCAGCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGTCGATCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGttt > 7:262891/1‑149 (MQ=255) aTTGGCGGGCGTTTTGCGCGTTTCGCCCTGGAGCAAGGCCTGGACGTGCGCGTCAGCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGttt < 4:161605/149‑1 (MQ=255) ttGGCGGGCGTTTTGCGCGTTTCGCCCTGGAGCAAGGCCTGGACGTGCGCGTCAGCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGGGCCAGCTCGGCGtcac < 5:362491/149‑4 (MQ=255) gtGGCGGGCGTTTTGCGCGTTTCGCCCGGGAGCAAGGCCTGGACGTGCGCGTCAGCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGGCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGGGCCAGCTCGGCGtcac < 4:87224/148‑4 (MQ=255) ggcgggcgTTTTGCGCGTTTCGCCCTGGAGCAAGGCCTGGACGTGCGCGTCAGCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTtgt < 1:316678/148‑1 (MQ=255) gggcgTTTTGCGCGTTTCGCCCTGGAGCAAGGCCTGGACGTGCGCGTCAGCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGc > 3:58181/1‑147 (MQ=255) gggcgTTTTGCGCGTTTCGCCCTGGAGCAAGGCCTGGACGTGCGCGTCAGCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCa < 5:28459/149‑1 (MQ=255) gcgTTTTGCGCGTTTCGCCCTGGAGCAAGGCCTGGACGTGCGCGTCAGCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAgg < 5:53632/149‑1 (MQ=255) gcgTTTTGCGCGTTTCGCCCTGGAGCAAGGCCTGGACGTGCGCGTCAGCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAgg < 3:228292/149‑1 (MQ=255) gcgTTTTGCGCGTTTCGCCCTGGAGCAAGGCCTGGACGTGCGCGTCAGCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGGCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAgg < 2:227394/149‑1 (MQ=255) gagTTTTGCGCGTTTCGCACTGGAGAAAGGCCTGGACGTGCGCGTCAGCGGACGCCGTGCCGAAGGGGTAGAGCATCTGGTCAATCGTGGCGCACAGTTCATAACGGGTGATCTGGGTGACGCAGATCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAgt > 2:208327/3‑148 (MQ=255) ttttGCGCGTTTCGCCCTGGAGCAAGGCCTGGACGTGCGCGTCAGCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGgtg > 5:20279/1‑149 (MQ=255) cgcgTTTCGCCCTGGAGCAAGGCCTGGACGTGCGCGTCAGCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGaa < 2:82660/149‑1 (MQ=255) cgcgTTTCGCCCTGGAGCAAGGCCTGGACGTGCGCGTCAGCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGa < 2:131119/148‑1 (MQ=255) gcgTTTCGCCCTGGAGCAAGGCCTGGACGTGCGCGTCAGCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAg > 4:273281/1‑149 (MQ=255) tCGCCCTGGAGCAAGGCCTGGACGTGCGCGTCAGCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCgt < 6:111515/148‑1 (MQ=255) tCGCCCTGGAGCAAGGCCTGGACGTGCGCGTCAGCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCgt < 6:209926/148‑1 (MQ=255) gCCCTGGAGCAAGGCCTGGACGTGCGCGTCAGCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCgtggt < 6:174080/149‑1 (MQ=255) gCCCTGGAGCAAGGCCTGGACGTGCGCGTCAGCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCgtggt < 3:273281/149‑1 (MQ=255) gCCCTGGAGCAAGGCCTGGACGTGCGCGTCAGCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCgtgg < 6:289713/148‑1 (MQ=255) gCCCTGGAGCAAGGCCTGGACGTGCGCGTCAGCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCgtgg < 5:104089/148‑1 (MQ=255) cTGGAGCAAGGCCTGGACGTGCGCGTCAGCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCa > 1:23727/1‑149 (MQ=255) ggAGCAAGGCCTGGACGTGCGCGTCAGCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCAtt > 2:370560/1‑149 (MQ=255) cTGGACGTGCGCGTCAGCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCATTGCGCTGgcgc > 1:186111/1‑149 (MQ=255) gACGTGCGCGTCAGCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCATTGCGCTGGCGCGGt < 1:370560/149‑1 (MQ=255) gTCAGCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCATTGCGCTGGCGCGGTGGGTAACTg > 2:312023/1‑149 (MQ=255) cAGCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCATTGCGCTGGCGCGGTGGGTAACTggg > 2:207118/1‑149 (MQ=255) aGCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCGGTGGTGCATTGCGCTGGCGCGGTGGGTAACTggg < 8:102634/148‑1 (MQ=255) aGCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCATTGCGCTGGCGCGGTGGGTAACTggg < 2:404320/148‑1 (MQ=255) gCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCATTGCGCTGGCGCGGTGGGTAACTggggg < 8:175070/149‑1 (MQ=255) ccgccgTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCATTGCGCTGGCGCGGTGGGTAACTGGGGgcgc > 5:286989/1‑148 (MQ=255) ccgTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCATTGCGCTGGCGCGGTGGGTAACTGGGGGCGCTAt > 2:96831/1‑148 (MQ=255) ccGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGGGACGCCGAGCTTGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTTCATTGCGCTGGCGCGGTGGGTAACTGGGGGCGCTATCAGGAt < 5:288842/149‑1 (MQ=255) cGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCGTTGCGGTGGCGCGGTGGGTAACTGGGGGCGCTATCAGGAtg > 4:235523/1‑148 (MQ=255) ggggCGAGCATCTGGTCAAGCGGGGCGCACAGTTCATCCCGGGTTATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCATTGCGCTGGCGCGGTGGGTAACTGGGGGCGCTATCAGGATTTCTAc < 3:358774/149‑1 (MQ=255) gTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGTGTGACGCCGGGCTGGCACGGCGTTTGTGCCAGCGTGTCGAAGCCgt > 7:41686/1‑83 (MQ=255) gTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCGAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCATTGCGCTGGCGCGGTGGGTAACTGGGGGCGCTATCAGGATTTCTACCAAGGCAACgtg < 8:262891/147‑1 (MQ=255) gTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCATTGCGCTGGCGCGGTGGGTAACTGGGGGCGCTATCAGGATTTCTACCAAGGCAACgtggt > 2:355458/1‑149 (MQ=255) tCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGGCGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCATTGCGCTGGCGCGGTGGGTAACTGGGGGCGCTATCAGGATTTCTACCAAGGCAACgtggtg < 1:50921/149‑1 (MQ=255) gCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCATTGCGCTGGCGCGGTGGGTAACTGGGGGCGCTATCAGGATTTCTACCAAGGCAACGTGGTGGTGa < 4:58181/149‑1 (MQ=255) cgcACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCATTGCGCTGGCGCGGTGGGTAACTGGGGGCGCTATCAGGATTTGTACCAAGGCAACGTGGTGGTGACCgaga < 1:228958/149‑1 (MQ=255) cgcACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCATTGCGCTGGCGCGGTGGGTAACTGGGGGCGCTATCAGGATTTCTACCAAGGCAACGTGGTGGTGACCgaga < 1:355458/149‑1 (MQ=255) acaGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGTCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTTGGGCATTGCGCTGGCGCGGTGGGTAACTGGGTGCGCTATCAGGATTTCTACAAAGGCAACGTGGTGGTGACCGAGAACg < 1:208327/149‑1 (MQ=255) gTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCATTGCGCTGGCGCGGTGGGTAACTGGGGGCGCTATCAGGATTTCTACCAAGGCAACGTGGTGGTGACCGAGAACGTgg < 2:186111/149‑1 (MQ=255) gTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCATTGCGCTGGCGCGGTGGGTAACTGGGGGCGCTATCAGGATTTCTACCAAGGCAACGTGGTGGTGACCGAGAACGTgg > 3:120771/1‑149 (MQ=255) aTCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCATTGCGCTGGCGCGGTGGGTAACTgg > 5:11991/1‑93 (MQ=255) aTCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCATTGCGCTGGCGCGGTGGGTAACTgg < 6:11991/93‑1 (MQ=255) ccGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCATTGCGCTGGCGCGGTGGGTAACTGGGGGCGCTATCAGGATTTCTACCAAGGCAACGTGGTGGTGACCGAGAACGTGGTCGAgg < 6:286989/148‑1 (MQ=255) gggTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCATTGCGCTGGCGCGGTGGGTAACTGGGGGCGCTATCAGGATTTCTACCAAGGCAACGTGGTGGTGACCGAGAACGTGGTCGAGGGCt > 6:222845/1‑149 (MQ=255) gATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCATTGCGCTGGCGCGGTGGGTAACTGGGGGCGCTATCAGGATTTCTACCAAGGCAACGTGGTGGTGACCGAGAACGTGGTCGAgggacgtgc > 3:166081/1‑143 (MQ=255) aTCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCATTGCGCTGGCGCGGTGGGTAACTGGGGGCGCTATCAGGATTTCTACCAAGGCAACGTGGTGGTGACCGAGAACGTGGTCGAGGGCTGCCt < 1:96831/148‑1 (MQ=255) tCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCATTGCGCTGGCGCGGTGGGTAACTGGGGGCGCTATCAGGATTTCTACCAAGGCAACGTGGTGGTGACCGAGAACGTGGTCGAGGGCTGCCTg > 3:289539/1‑148 (MQ=255) cTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCATTGCGCTGGCGCGGTGGGTAACTGGGGGCGCTATCAGGATTTCTACCAAGGCAACGTGGTGGTGACCGAGAACGTGGTCGAGGGCTGCCTGa > 6:3556/1‑148 (MQ=255) cTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCATTGCGCTGGCGCGGTGGGTAACTGGGGGCGCTATCAGGATTTCTACCAAGGCAACGTGGTGGTGACCGAGAACGTGGTCGAGGGCTGCCTGa > 3:227395/1‑148 (MQ=255) tGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCATTGCGCTGGCGCGGTGGGTAACTGGGGGCGCTATCAGGATTTCTACCAAGGCAACGTGGTGGTGACCGAGAACGTGGTCGAGGGCTGCCTGa > 1:178626/1‑147 (MQ=255) gggTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCATTGCGCTGGCGCGGTGGGTAAc < 1:197796/76‑1 (MQ=255) gggTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCATTGCGCTGGCGCGGTGGGTAAc > 2:197796/1‑76 (MQ=255) gggTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCATTGCGCTGGCGCGGTGGGTAACTGGGGGCGCTATCAGGATTTCTACCAAGGCAACGTGGTGGTGACCGAGAACGTGGTCGAGGGCTGCCTGa > 8:382711/1‑146 (MQ=255) ggTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCATTGCGCTGGCGCGGTGGGTAACTGGGGGCGCTATCAGGATTTCTACCAAGGCAACGTGGTGGTGACCGAGAACGTGGTCGAGGGCTGCCTGAAaga < 5:222845/149‑1 (MQ=255) gTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCATTGCGCTGGCGCGGTGGGTAACTGGGGGCGCTATCAGGATTTCTACCAAGGCAACGTGGTGGTGACCGAGAACGTGGTCGAGGGCTGCCTGAAagag > 3:60493/1‑149 (MQ=255) tGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCATTGCGCTGGCGCGGTTGGTAACTGGGGGCGCTATCAGGATTTCTACCAAGGCAACGTGGTGGTGACCGAGAACGTGGTCGAGGGCTGCCTGAAAGAGc < 6:20279/149‑1 (MQ=255) tGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCATTGCGCTGGCGCGGTGGGTAACTGGGGGCGCTATCAGGATTTCTACCAAGGCAACGTGGTGGTGACCGAGAACGTGGTCGAGGGCTGCCTGAAAGAGc < 4:227395/149‑1 (MQ=255) tGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCATTGCGCTGGCGCGGTGGGTAACTGGGGGCGCTATCAGGATTTCTACCAAGGCAACGTGGTAGTGACCGAGAACGTGGTCGAGGGCTGCCTGAAagag > 7:73190/1‑148 (MQ=255) aCGCCGGGCCAGCTCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTTGTGCATTGCGCTGGCGCGGTGGGTAACTGGGGGCGCTATCAGGATTTCTACCAAg < 7:351879/99‑1 (MQ=255) aCGCCGGGCCAGCTCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCATTGCGCTGGCGCGGTGGGTAACTGGGGGCGCTATCAGGATTTCTACCAAg > 8:351879/1‑99 (MQ=255) aCGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCATTGCGCTGGCGCGGTGGGTAACTGGGGGCGCTATCAGGATTTCTACCAAGGCAACGTGGTGGTGACCGAGAACGTGGTCGAGGGCTGCCTGAAAGAGCAc < 1:207118/149‑1 (MQ=255) gCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCATTGCGCTGGCGCGGTGGGTAACTGGGGGCGCTATCAGGATTTCTACCAAGGCAACGTGGTGGTGACCGAGAACGTGGTCGAGGGCTGCCTGAAAGAGCACg > 2:121878/1‑148 (MQ=255) | GGCGCGAGTGGCTTCATTGGCGGGCGTTTTGCGCGTTTCGCCCTGGAGCAAGGCCTGGACGTGCGCGTCAGCGGCCGCCGTGCCGAAGGGGTCGAGCATCTGGTCAAGCGTGGCGCACAGTTCATCCCGGGTGATCTGGGTGACGCCGAGCTGGCCCGGCGTTTGTGCCAGGGTGTCGAAGCCGTGGTGCATTGCGCTGGCGCGGTGGGTAACTGGGGGCGCTATCAGGATTTCTACCAAGGCAACGTGGTGGTGACCGAGAACGTGGTCGAGGGCTGCCTGAAAGAGCACG > NC_002947/1060813‑1061104 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |