Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,069,781 | A→G | 7.0% | S315G (AGC→GGC) | aroP‑I → | aromatic amino acid transport protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,069,781 | 0 | A | G | 7.0% | 206.4 / 4.8 | 72 | S315G (AGC→GGC) | aroP‑I | aromatic amino acid transport protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (32/34); new base G (3/2); total (36/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.74e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.97e-01 |
GGGCGGCAGCCCGTTCGTGATGATCTTCCACGAACTGGACAGCGACCTGGTGGCGACCATCCTCAATATCGTGGTGCTGACGGCTGCGCTGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGT > NC_002947/1069636‑1069928 | gggCGGCAGCCCGTTCGTGATGATCTTCCACGAACTGGACAGCGACCTGGTGGCGACCATCCTCAATATCGTGGTGCTGACGGCTGCGCTGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTCCGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGgccagc > 1:193439/1‑148 (MQ=255) gCCCGTTCGTGATGATCTTCCACGAACTGGACAGCGACCTGGTGGCGACCATCCTCAATATCGTGGTGCTGACGGCTGCGCTGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGAt < 4:50809/149‑1 (MQ=255) cccGTTCGTGATGATCTTCCACGAACTGGACAGCGACCTGGTGGCGACCATCCTCAATATCGTGGTGCTGACGGATGCGCTGTCGGTGTACAAAATCTGTGTGTACGACAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAgcgcagg > 6:235035/1‑145 (MQ=255) tgatgaTCTTCCACGAACTGGACAGCGACCTGGTGGCGACCATCCTCAATATCGTGGTGCTGACGGCTGCGCTGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGt < 5:345166/149‑1 (MQ=255) tgatCTTCCACGAACTGGACAGCGACCTGGTGGCGACCATCCTCAATATCGTGGTGCTGACGGCTGCGCTGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGTCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAg > 7:340940/1‑149 (MQ=255) gatCTTCCACGAACTGGACAGCGACCTGGTGGCGACCATCCTCAATATCGTGGTGCTGACGGCTGCGCTGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGt > 4:318486/1‑149 (MQ=255) ccACGAACTGGACAGCGACCTGGTGGCGACCATCCTCAATATCGTGGTGCTGACGGCTGCGCTGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCGAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTg > 5:395750/1‑148 (MQ=255) cACGAACTGGACAGCGACCTGGTGGCGACCATCCTCAATATCGTGGTGCTGACGGCTGCGCTGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGaa < 3:318486/149‑1 (MQ=255) aCGAACTGGACAGCGACCTGGTGGCGACCATCCTCAATATCGTGGTGCTGACGGCTGCGCTGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAg < 3:166835/149‑1 (MQ=255) aCGAACTGGACAGCGACCTGGTGGCGACCATCCTCAATATCGTGGTGCTGACGGCTGCGCTGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAg > 5:150558/1‑149 (MQ=255) gAACTGGACATCGACCTGGTGGCTACCATCCTCAATATCGTGGTGATGACTGCTGCGCTGTCGGTGTACAACATCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGTGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGt < 8:218499/149‑1 (MQ=255) gACAGCGACCTGGTGGCGACCATCCTCAATATCGTGGTGCTGACGGCTGCGCTGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAACCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCCTCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGACg > 3:257209/1‑149 (MQ=255) gACGTGGTGGCGACCATCCTCATTATCGTGGTGCTGACGGCTGCGCTGTCGGTGTACAACAGCTGGGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCAAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAgcgg < 5:383653/149‑1 (MQ=255) aCCTGGTGGCGACCATCCTCAATATCGTGGTGCTGACGGCTGCGCTGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAgcggc > 6:215035/1‑149 (MQ=255) gACCATCCTCAATATCGTGGTGCTGACGGCTGCGCTGTCGGTGTAGAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGa > 6:280265/1‑149 (MQ=255) cTCAATATCGTGGTGCTGACGGCTGCGCTGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAggg > 7:49752/1‑92 (MQ=255) cTCAATATCGTGGTGCTGACGGCTGCGCTGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAggg < 8:49752/92‑1 (MQ=255) cTCAATATCGTGGTGCTGACGGCTGCGCTGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGcgccgc < 1:88033/103‑1 (MQ=255) cTCAATATCGTGGTGCTGACGGCTGCGCTGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGcgccgc > 2:88033/1‑103 (MQ=255) aaTATCGTGGTGCTGACGGCTGCGCTGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGc > 8:342189/1‑149 (MQ=255) aCGGCTGCGCTGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCGAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTg < 6:395750/148‑1 (MQ=255) tGCGCTGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGc < 8:72013/138‑1 (MQ=255) tGCGCTGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGc > 7:72013/1‑138 (MQ=255) cgcTGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCg < 8:43315/134‑1 (MQ=255) cgcTGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCg > 7:43315/1‑134 (MQ=255) tGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCtg > 3:181381/1‑149 (MQ=255) tGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCtg > 4:291495/1‑149 (MQ=255) tCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCtgt < 1:405631/148‑1 (MQ=255) tCGGTGTAAAACTGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGGTGGTTGGCCTGGCCAGCCCTGGCGATGCTCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACGGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCtgt < 5:401547/148‑1 (MQ=255) ggTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGTGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTgtgc < 3:403677/148‑1 (MQ=255) ggTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTgtgcg > 5:388723/1‑149 (MQ=255) gtgtACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTgtgcgt > 5:114625/1‑149 (MQ=255) tgtACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTgtgcgtg > 3:57293/1‑149 (MQ=255) tACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTGTGCGTGCt < 4:41825/149‑1 (MQ=255) caacaGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCAGTAGCGGAGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTGTGCGTGCTGa > 6:390882/1‑149 (MQ=255) aacaGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTGTGCGTGCTGAt < 5:215035/149‑1 (MQ=255) acaGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTGTGCGTGCTGATc < 7:342189/149‑1 (MQ=255) tgtgtACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGc > 2:328774/1‑127 (MQ=255) tgtgtACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGc < 1:328774/127‑1 (MQ=255) gtgtACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGGTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGcc < 4:241354/105‑1 (MQ=255) gtgtACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGcc > 3:241354/1‑105 (MQ=255) tgtACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCt > 1:69850/1‑148 (MQ=255) tACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTg > 4:301075/1‑115 (MQ=255) tACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTg > 4:295681/1‑115 (MQ=255) tACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGAt > 8:82340/1‑149 (MQ=255) gCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGcc > 5:57118/1‑149 (MQ=255) cAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCttt < 8:65672/109‑1 (MQ=255) cAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCttt > 7:65672/1‑109 (MQ=255) cAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTGTGCGTGCTg < 1:167367/130‑1 (MQ=255) cAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTGTGCGTGCTg > 2:167367/1‑130 (MQ=255) cAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCcgg > 2:77942/1‑149 (MQ=255) gCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCcgggcggg < 3:291495/149‑1 (MQ=255) cGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGc < 5:280265/149‑1 (MQ=255) tGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCttt < 5:390882/149‑1 (MQ=255) gtGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTgg < 5:98631/148‑1 (MQ=255) cTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTgg < 6:388723/149‑1 (MQ=255) cTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTg < 6:57118/148‑1 (MQ=255) cTGTGTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGGCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCGTTTGCGACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCGTTg < 4:307980/148‑1 (MQ=255) tGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCcg < 4:93447/134‑1 (MQ=255) tGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCcg > 3:93447/1‑134 (MQ=255) tttGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGttt < 2:69850/149‑1 (MQ=255) tttGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGttt > 1:232146/1‑149 (MQ=255) atcgccctggctGGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCcgggcggg > 1:191700/6‑138 (MQ=255) atcgccctggctGGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCcgggcggg < 2:191700/133‑1 (MQ=255) atcgccctggctGGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTg < 7:26115/140‑1 (MQ=255) atcgccctggctGGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTg > 8:26115/6‑145 (MQ=255) tggcctgtccAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTg < 8:340940/148‑1 (MQ=255) tggcctggcgAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCGGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTg < 2:104655/148‑1 (MQ=255) ggcctggccAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGc < 7:82340/148‑1 (MQ=255) gcctggccAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCt > 7:339179/1‑148 (MQ=255) ccctggctGGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTg > 7:288642/2‑149 (MQ=255) cctggccAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACTGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGa > 3:103209/1‑149 (MQ=255) cctggccAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGa < 2:232146/149‑1 (MQ=255) gccagccaGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTGTGCGTGTTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGtt < 6:263061/139‑1 (MQ=255) gccagccaGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTGTGCGTGGTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGtt > 5:263061/1‑139 (MQ=255) cagccagGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCTGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGt > 1:88465/1‑149 (MQ=255) | GGGCGGCAGCCCGTTCGTGATGATCTTCCACGAACTGGACAGCGACCTGGTGGCGACCATCCTCAATATCGTGGTGCTGACGGCTGCGCTGTCGGTGTACAACAGCTGTGTGTACGCCAATAGCCGTATGCTGTTTGGCCTGGCCAGCCAGGGCGATGCGCCGCGTCAGTTGCTGAAGGTGAGCCGTAGCGGCGTGCCGCTGACCGCGCTGGCCGTGTCGGCCTTTGCGACCGGCCTGTGCGTGCTGATCAATTACCTGATGCCGGGCGGGGCCTTTGGTTTGCTGATGGCGT > NC_002947/1069636‑1069928 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |