| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,202,857 | G→T | 6.2% | R229L (CGG→CTG) | xcpY → | type II secretion pathway protein XcpY |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,202,857 | 0 | G | T | 6.2% | 202.8 / 3.5 | 64 | R229L (CGG→CTG) | xcpY | type II secretion pathway protein XcpY |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (32/28); new base T (2/2); total (34/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.32e-01 | |||||||||||
TGCCGCAGCCACCGTGGGCAGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCGGCACGCGGCACAGGCCCT > NC_002947/1202710‑1203001 | tGCCGCAGCCACCGTGGGCAGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGTCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCgg < 6:133687/149‑1 (MQ=255) ccGCAGCCACCGTGGGCAGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACTCACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGgct > 1:114239/1‑149 (MQ=255) ccGCAGCCACCGTGGGCAGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGgct > 5:248930/1‑149 (MQ=255) aGCCACCGTGGGCAGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGctgctg < 3:219772/149‑1 (MQ=255) gCCACCGTGGGCAGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCCGCTGCTGCTgg < 1:118286/149‑1 (MQ=255) gCCACCGTGGGCAGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTgg < 2:114239/149‑1 (MQ=255) ccACCGTGGGCAGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCgg < 7:135878/141‑1 (MQ=255) ccACCGTGGGCAGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCgg > 8:135878/1‑141 (MQ=255) tGGGCAGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACGGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGAGCCCGCAAGGTGAGCTCGTTGCCGGCCGCCTACCGCAAGCAGAAGCGGCTGCAGGCAGCATg > 3:255959/1‑149 (MQ=255) tGGGCAGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTg < 5:407286/149‑1 (MQ=255) gggCAGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGc < 8:203398/149‑1 (MQ=255) ggCAGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGc < 4:5878/148‑1 (MQ=255) cAGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTg > 4:3447/1‑149 (MQ=255) tgctgcACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTg > 8:27750/1‑149 (MQ=255) tgcACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTg < 3:50771/149‑1 (MQ=255) tgcACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTg > 3:368468/1‑149 (MQ=255) cacaGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGc > 7:163043/1‑149 (MQ=255) cacaGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGc > 6:132955/1‑149 (MQ=255) cacaGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGc < 3:3447/149‑1 (MQ=255) caGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTa > 3:88330/1‑149 (MQ=255) tCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTg < 4:368468/149‑1 (MQ=255) gCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTgg < 7:27750/148‑1 (MQ=255) aGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTg < 6:248930/148‑1 (MQ=255) gCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGc < 7:59369/149‑1 (MQ=255) aaTTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCtgtg < 8:163043/149‑1 (MQ=255) aaTTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCtgtg < 4:88330/149‑1 (MQ=255) gCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGa < 5:132955/149‑1 (MQ=255) aaCCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGt > 1:86589/1‑148 (MQ=255) aCCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGt > 3:180265/1‑147 (MQ=255) tATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGtt > 8:319608/1‑139 (MQ=255) tATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGtt < 7:319608/139‑1 (MQ=255) tGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGc < 2:98598/127‑1 (MQ=255) tGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGc > 1:98598/1‑127 (MQ=255) cacacTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAAc > 6:177277/1‑149 (MQ=255) acTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCAGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAActct > 2:309449/1‑149 (MQ=255) cTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTg > 3:181905/1‑149 (MQ=255) gCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGgc > 8:209295/1‑149 (MQ=255) cccGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGgc < 4:180265/148‑1 (MQ=255) gCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATg > 1:149450/1‑124 (MQ=255) gCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATg < 2:149450/124‑1 (MQ=255) gCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTAAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGc > 1:301975/1‑149 (MQ=255) tGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAg > 7:142166/1‑149 (MQ=255) ttCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGTCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGt > 2:248810/1‑149 (MQ=255) ttCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAg < 7:209295/147‑1 (MQ=255) cGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCa > 3:93290/1‑149 (MQ=255) gACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCAt > 2:255482/1‑149 (MQ=255) gACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCAt > 2:283367/1‑149 (MQ=255) ccGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTg > 2:335243/1‑149 (MQ=255) cgcgCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGc > 1:358616/1‑149 (MQ=255) aaGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGCCCgg > 5:11439/1‑149 (MQ=255) aGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCggg > 8:65900/1‑149 (MQ=255) gTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGa < 2:358616/149‑1 (MQ=255) cggccgCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCt > 8:43451/1‑149 (MQ=255) cggccgCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCt > 3:105589/1‑149 (MQ=255) tccgccTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCg < 4:181905/148‑1 (MQ=255) gccgccTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCg < 4:93290/149‑1 (MQ=255) ccgccTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTAAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCgg < 2:301975/149‑1 (MQ=255) cTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCa < 6:249742/137‑1 (MQ=255) cTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCa > 5:249742/1‑137 (MQ=255) tgCCAGCAGACGCTGCTGCTGGCGGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCGGCACGCGGc > 6:52058/2‑149 (MQ=255) agcagcagcGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGTCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCTGGGAGCAGGCCAGCCCTCGGCACGCGGCACAg < 1:248810/149‑1 (MQ=255) gcagccgcTGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCggg > 2:43739/1‑118 (MQ=255) gcagccgcTGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCggg < 1:43739/118‑1 (MQ=255) cagcagcGGCTGCTGGCAGCTTGCCTTGTGCTGGCTACGGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGTCCAGCCCTCGGCACGCGGCACAGGc < 3:193485/149‑1 (MQ=255) cagcagcGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCCGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGACGTGGCAGGGGAGAATGACAGCCCTCGTCACGAGGCAAAGGc > 8:257498/1‑149 (MQ=255) cagcGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCGGCACGCGGCACAGGCCCt < 7:43451/149‑1 (MQ=255) cagcGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCGGCACGCGGCACAGGCCCt < 8:142166/149‑1 (MQ=255) ggCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCa > 7:261416/1‑115 (MQ=255) ggCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCa < 8:261416/115‑1 (MQ=255) | TGCCGCAGCCACCGTGGGCAGTGCTGCACAGGACGTCGCTGAGCGGCAATTGGCCAACCGTATTTGCGCCGCTCGACACACTGCCCGGCCTGTTCGACCGCGCCCGCAAGGTGCGCTCGTTGCCGGCCGCCTCCCGCCAGCAGCAGCGGCTGCTGGCAGCTTGCCTGGTGCTGGCTACCGTTTGGGGTGGCCTGTGGTTGAGTCAGCAATGGCGTCAGGCGCAACTCTGGCGCAGCCAGGTCATTGCCGTGACCGGGGAGCAGGCCAGCCCTCGGCACGCGGCACAGGCCCT > NC_002947/1202710‑1203001 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |