| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,226,707 | T→A | 10.7% | intergenic (‑217/‑114) | gltI ← / → PP_1072 | glutamate/aspartate ABC transporter substrate‑binding protein/leucine‑rich repeat‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,226,707 | 0 | T | A | 10.7% | 190.6 / 12.7 | 75 | intergenic (‑217/‑114) | gltI/PP_1072 | glutamate/aspartate ABC transporter substrate‑binding protein/leucine‑rich repeat‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (32/33); new base A (3/5); total (37/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.12e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.61e-01 | |||||||||||
AAGCGGGTGCATTCGGCTACCAAGTGTAGAGCATGACTCGTGCCAAGCCCTGCTGTCGACCTTAAACCACTGGTATTGCTCGTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCGGCAAGGGCTCAGACGTAGTGAGCTTTGCTCTTTGCCTGGAGAGTTCCACAGATGTCACCGCACCGGCTCCCGAACGATTCCATCGA > NC_002947/1226560‑1226855 | aagCGGGTGCATTCGGCTACCAAGTGTAGAGCATGACTCGTGCCAAGCCCTGCTGTCGACCTTAAACCACTGGTATTGCTCGTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGtt < 4:363978/149‑1 (MQ=255) cGGGTGCATTCGGCTACCAAGTGTAGAGCATGACTCGTGCCAAGCCCTGCTGTCGACCTTAAACCACTGGTATTGCTCGTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATc < 4:389874/149‑1 (MQ=255) gggTGCATTCGGCTACCAAGTGTAGAGCATGACTCGTGCCAAGCCCTGCTGTCGACCTTAAACCACTGGTATTGCTCGTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATcc < 5:272628/149‑1 (MQ=255) gggTGCATTCGGCTACCAAGTGTAGAGCATGACTCGTGCCAAGCCCTGCTGTCGACCTTAAACCACTGGTATTGCTCGTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATcc < 5:266633/149‑1 (MQ=255) gggTGCATTCGGCTACCAAGTGTAGAGCATGACTCGTGCCAAGCCCTGCTGTCGACCTTAAACCACTGGTATTGCTCGTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATcc > 8:53720/1‑149 (MQ=255) cATTCGGCTACCAAGTGTAGAGCATGACTCGTGCCAAGCCCTGCTGTCGACCTTAAACCACTGGTATTGCTCGTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGATAACCGAAc < 2:11407/148‑1 (MQ=255) aTTCGGCTACCAAGTGTAGAGCATGACTCGTGCCAAGCCCTGCTGTCGACCTTAAACCACTGGTATTGCTCGTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGATAACCGAACga < 8:368854/149‑2 (MQ=255) ttCGGCTACCAAGTGTAGAGCATGACTCGTGCCAAGCCCTGCTGTCGACCTTAAACCACTGGTATTGCTCGTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCGCGTTCGGATAACCGAACgag < 3:374837/149‑3 (MQ=255) ggCTACCAAGTGTAGAGCATGACTCGTGCCAAGCCCTGCTGTCGACCTTAAACCACTGGTATTGCTCGTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATg < 7:53720/148‑1 (MQ=255) gCTACCAAGTGTAGAGCATGACTCGTGCCAAGCCCTGCTGTCGACCTTAAACCACTGGTATTGCTCGTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATggg > 6:415462/1‑149 (MQ=255) gCTACCAAGTGTAGAGCATGACTCGTGCCAAGCCCTGCTGTCGACCTTAAACCACTGGTATTGCTCGTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGATAACCGAACgagcaat < 1:31271/149‑7 (MQ=255) tACCAAGTGTAGAGCATGACTCGTGCCAAGCCCTGCTGTCGACCTTAAACCACTGGTATTGCTCGTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGATAACCGAACga > 2:279392/1‑141 (MQ=255) tACCAAGTGTAGAGCATGACTCGTGCCAAGCCCTGCTGTCGACCTTAAACCACTGGTATTGCTCGTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGATAACCGAACga < 1:279392/142‑2 (MQ=255) ccAAGTGTAGAGCATGACTCGTGCCAAGCCCTGCTGTCGACCTTAAACCACTGGTATTGCTCGTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCt < 5:415462/147‑1 (MQ=255) cAAGTGTAGAGCATGACTCGTGCCAAGCCCTGCTGTCGACCTTAAACCACTGGTATTGCTCGTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGc > 2:36644/1‑148 (MQ=255) aaGTGTAGAGCATGACTCGTGCCAAGCCCTGCTGTCGACCTTAAACCACTGGTATTGCTCGTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGcc > 6:64921/1‑148 (MQ=255) gtgtAGAGCATGACTCGTGCCAAGCCCTGCTGTCGACCTTAAACCACTGGTATTGCTCGTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAAc < 5:128628/149‑1 (MQ=255) tgtAGAGCATGACTCGTGCCAAGCCCTGCTGTCGACCTTAAACCACTGGTATTGCTCGTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAAcc < 3:163582/149‑1 (MQ=255) tAGAGCATGACTCGTGCCAAGCCCTGCTGTCGACCTTAAACCACTGGTATTGCTCGTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGaa > 4:135326/1‑130 (MQ=255) tAGAGCATGACTCGTGCCAAGCCCTGCTGTCGACCTTAAACCACTGGTATTGCTCGTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGaa < 3:135326/130‑1 (MQ=255) tGACTCGTGCCAAGCCCTGCTGTCGACCTTAAACCACTGGTATTGCTCGTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGt < 2:38284/149‑1 (MQ=255) aCTCGTGCCAAGCCCTGCTGTCGACCTTAAACCACTGGTATTGCTCGTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTAt > 1:95873/1‑149 (MQ=255) gCCAAGCCCTGCTGTCGACCTTAAACCACTGGTATTGCTCGTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTg < 5:104667/149‑1 (MQ=255) ccAAGCCCTGCTGTCGACCTTAAACCACTGGTATTGCTCGTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCttcc > 8:192577/1‑147 (MQ=255) ccAAGCCCTGCTGTCGACCTTAAACCACTGGTATTGCTCGTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTg < 8:175988/148‑1 (MQ=255) gctgTCGACCTTAAACCACTGGTATTGCTCGTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTAt > 5:72699/1‑149 (MQ=255) ctgTCGACCTTAAACCACTGGTATTGCTCGTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTaa > 3:248394/1‑144 (MQ=255) ctgTCGACCTTAAACCACTGGTATTGCTCGTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTaa < 4:248394/144‑1 (MQ=255) ctgTCGACCTTAAACCACTGGTATTGCTCGTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATg > 6:35087/1‑149 (MQ=255) ttAAACCACTGGTATTGCTCGTGCTTGACAGTCTCGATCTCTCCTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGTGGTAACTATGCAGTgcgc > 1:78044/1‑149 (MQ=255) ttAAACCACTGGTATTGCTCGTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGcgcg > 3:51449/1‑149 (MQ=255) aaaCCACTGGTATTGCTCGTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATACGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCgg > 6:390185/1‑148 (MQ=255) aCCACTGGTATTGCTCGTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGATCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCGGc > 4:7766/1‑147 (MQ=255) ccACTGGTATTGCTCGTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACAGGCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCGGc > 1:120891/1‑147 (MQ=255) cACTGGTATTGCTCGTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCGGCAAgg > 6:112456/1‑149 (MQ=255) cACTGGTATTGCTCGTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCGGCAAgg > 2:395621/1‑149 (MQ=255) tGGTATTGCTCGTGCTTGACAGTCTCGCCCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGATCGTTCGGGAATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTAACCCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCGGCAAGGGc > 8:240877/1‑148 (MQ=255) ttGCTCGTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCGGCAAGGGCTCAGAc < 1:395621/149‑1 (MQ=255) cTCGTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCGGCAAGGGCTCAGACg > 1:3494/1‑147 (MQ=255) gTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCGGCAAGGGCTCAGACGTa > 6:382252/1‑146 (MQ=255) gTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCGGCAAGGGCTCAGACGTa < 5:382252/146‑1 (MQ=255) gTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCGGCAAGGGCTCAGACGTAg < 5:35087/147‑1 (MQ=255) gTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCGGCAAGGGCTCAGACGTAGt < 4:51449/148‑1 (MQ=255) gCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCGGCAAGGGCTCAGACGTAGTGAg > 3:311316/1‑149 (MQ=255) cTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGTAGTGCGCGGCAAGGGCTCAGACGTAGTGAg < 1:36644/148‑1 (MQ=255) tGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCGGCAAGGGCTCAGACGTAGTGAGCtt > 3:40935/1‑149 (MQ=255) gACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCt < 1:273766/79‑1 (MQ=255) gACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCt > 2:273766/1‑79 (MQ=255) gACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCGGCAAGGGCTCAGACGTAGTGAGCtt < 4:311316/148‑1 (MQ=255) aCAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCGGCAAGGGCTCAGACGTAGTGAGCTTTg > 5:218389/1‑149 (MQ=255) aCAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCGGCAAGGGCTCAGACGTAGTGAGCTTTg < 7:192577/149‑1 (MQ=255) aCAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCGGCAAGGGCTCAGACGTAGTGAGCTTTg < 5:81447/149‑1 (MQ=255) gTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCGGCAAGGGCTCAGACGTAGTGAGCTTTGctc < 6:72699/149‑1 (MQ=255) tcGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATg > 8:70116/1‑107 (MQ=255) tcGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATg < 7:70116/107‑1 (MQ=255) tcCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCGGCAAGGGCTCAGACGTAGTGAGCTTTGCTCTTTGCCTGga < 5:112456/146‑1 (MQ=255) tcCGGGGATCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCGGCAAGGGCTCAGACGTAGTGAGCTTTGCTCTTTGCCTGga < 3:7766/146‑1 (MQ=255) cGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCGGCAAGGGCTCAGACGTAGTGAGCTTTGCTCTTTGCCTGGAGAGtt < 6:218389/149‑1 (MQ=255) tgcGCCAGGCCGAATATACA‑GCGATTGGTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCGGCAAGGGCTCAGAAGTAGTGAGCTTTGCTCTTTGCCTGGAGAGTTCcaca < 6:181449/147‑1 (MQ=255) ccAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGGTATACGAAAGCATGGGCTCCCAACCTAACCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCGGCAAGGGCTCAGACGTAGTGAGAATTGCTCTTTGCCTGGAGAGTTCCACAGATg > 3:87678/1‑149 (MQ=255) gAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCGGCAAGGGCTCAGACGTAGTGAGCTTTGCTCTTTGCCTGGAGAGTTCCACAGATGTcaccg > 3:226503/1‑148 (MQ=255) aaaGA‑GCGATTGCTGGTTGGGTTATCCTAACGCTTGGGCTTCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCGGCATGGGCTCAGACGTAGTTATGTTTGCTCTTTGCCTGGTGTTTTCCACAGTTGTctcctcacc < 4:87678/148‑1 (MQ=255) aaCA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCGGCAAGGGCTCAGACGTAGTGAGCTTTGCTCTTTGCCTGGAGAGTTCCACAGATGTCACCGCACCgg > 3:382754/1‑149 (MQ=255) aCA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCATGCGGAAACTATCCAGTGCCCGGCAAGGGCTCAGACGAAGTGAGCATTGCTCTTTGCCTGCAGAGTACCACAGATGTcaccgaaccgc > 2:139085/1‑147 (MQ=255) a‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCGGCAAGGGCTCAGACGTAGTGAGCTTTGCTCTTTGCCTGGAGAGTTCCACAGATGTCACCGCACCGGCTc > 2:383446/1‑149 (MQ=255) cccatgcGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCGGCAGGGGCTCAGACGTAGTGAGCTTTGCTCTTTGCCTGGAGAGTTCCACAGATGTCACCGCACCGGCTCCCg > 6:286471/7‑148 (MQ=255) ttGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCGGCAAGGGCTCAGACGTAGTGAGCTTTGCTCTTTGCCTGGAGAGTTGCACAGATGTCACCGCACCGGCTCCCGaa > 7:166307/1‑149 (MQ=255) ccatgcGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCGGCAGGGGCTCAGACGTAGTGAGCTTTGCTCTTTGCCTGGAGAGTTCCACAGATGTCACCGCACCGGCTCCCGaa < 5:286471/144‑1 (MQ=255) ccatgcGTTCGGATAACCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCGGCAAGGGCTCAGACGTAGTGAGCTTTGCTCTTTGCCTGGAGAGTTCCACAGATGTCACCGCACCGGCTCCCGaa > 7:341854/6‑149 (MQ=255) tgcGTTCGGATAACCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCGGCAAGGGCTCAGACGTAGTGAGCTTTGCTCTTTGCCTGGAGAGTTCCACAGATGTCCCCGCACCGGCTCCCGAACGa > 4:85352/3‑149 (MQ=255) gTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCGGCAAGGGCTCAGACGTAGTGAGCTTTGCTCTTTGCCTGGAGAGTTCCACAGATGTCACCGCACCGGCTCCCGAACGAtt < 5:64921/148‑1 (MQ=255) gTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCGGCAAGGGCTCAGACGTAGTGAGCTTTGCTCTTTGCCTGGAGAGTTCCACAGATGTCACCGCACCGGCTCCCGAACGATTc > 7:39357/1‑149 (MQ=255) ggTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCGGCAAGGGCTCAGACGTAGTGAGCTTTGCTCTTTGCCTGGAGAGTTCCACAGATGTCACCGCACCGGCTCCCGAACGATTCCAt < 4:226503/148‑1 (MQ=255) ggTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCGGCAAGGGCTCAGACGTAGTGAGCTTTGCTCTTTGCCTGGAGAGTTCCACAGATGTCACCGCACCGGCTCCCGAACGATTCCATc < 2:120891/149‑1 (MQ=255) ggTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCGGCAACGGCTCAGACGTAGTGAGCTTTGCTCTTTTCCTGGAGAGTTCCACAGATGTCACCGCACCGGCTCCCGAACGATTCCAt < 5:390185/148‑1 (MQ=255) gTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCGGCAAGGGCTCAGACGTAGTGAGCTTTGCTCTTTGCCTGGAGAGTTCCACAGATGTCACCGCACCGGCTCCCGAACGATTCCATc > 2:298420/1‑148 (MQ=255) ttATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCGGCAAGGGCTCAGACGTAGTGAGCTTTGCTCTTTGCCTGGAGAGTTCCACAGATGTCACCGCACCGGCTCCCGAACGATTCCATCGa < 4:382754/149‑1 (MQ=255) | AAGCGGGTGCATTCGGCTACCAAGTGTAGAGCATGACTCGTGCCAAGCCCTGCTGTCGACCTTAAACCACTGGTATTGCTCGTGCTTGACAGTCTCGACCTCT‑CTCCGGGGTTCGCCAGGCCGAATAAACA‑GCGATTGCTCGTTCGGTTATCCGAACGCATGGGCTGCCAACCTATCCCGGTATCGCTTGCGGTAACTATGCAGTGCGCGGCAAGGGCTCAGACGTAGTGAGCTTTGCTCTTTGCCTGGAGAGTTCCACAGATGTCACCGCACCGGCTCCCGAACGATTCCATCGA > NC_002947/1226560‑1226855 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |