| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,230,583 | G→T | 7.0% | V1255F (GTC→TTC) | PP_1072 → | leucine‑rich repeat‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,230,583 | 0 | G | T | 7.0% | 254.4 / 5.7 | 83 | V1255F (GTC→TTC) | PP_1072 | leucine‑rich repeat‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (39/38); new base T (4/2); total (43/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.77e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.06e-01 | |||||||||||
CGAATCTGGCGAATTCTGGAAACGTGTGAGCAGCACGAGCAGTTGCGTCACCAGTTGTTTCTCGAGGCGTCTGGTCCACGCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTGGTTTGTTTCGCCTGGACGAGGTTGACCGCCACGCGACGTTGCACGTGCAACGCATGCATGCCGAGCACGCCCCACATATCGATGAAATTGAGA > NC_002947/1230436‑1230730 | cGAATCTGGCGAATTCTGGAAACGTGTGAGCAGCACGAGCAGTTGCGTCACAAGTTGTTTCTCGAGGCGTCTGGTCCACGCAGTTGTGAAGACCGCCTGATGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGt > 3:67474/1‑149 (MQ=255) aTCTGGCGAATTCTCGAAACGTGTGTGCATCACGAGCTGTTGCGTCTCCAGTTGTTTCTCGTGGCGTCTGGTCCACGCAGTTGTGAATACCGGCTGCTGCTGTTTCTGGAGCAGATTGATATTGGGTTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCgt < 4:134459/149‑2 (MQ=255) tGGCGAATTCTGGAAACGTGTGAGCAGCACGAGCAGTTGCGTCACCAGTTGTTTCTCGAGGCGTCTGGTCCACGCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGCTGTTG‑CGCGCAGGCGAAGa > 8:88149/1‑149 (MQ=255) gCGAATTCTGGAAACGTGTGAGCAGCACGAGCAGTTGCGTCACCAGTTGTTTCTCGAGGCGTCTGGTCCACGCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGa < 4:69525/147‑1 (MQ=255) cGAATTCTGGAAACGTGTGAGCAGCACGAGCAGTTGCGTCACCAGTTGTTTCTCGAGGCGTCTGGTCCACGCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGAcgc < 2:90608/149‑1 (MQ=255) tCTGGAAACGTGTGAGCAGCACGAGCAGTTGCGTCACCAGTTGTTTCTCGAGGCGTCTGGTCCACGCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATg > 8:95082/1‑149 (MQ=255) gAAACGTGTGAGCAGCACGAGCAGTTGCGTCACCAGTTGTTTCTCGAGGCGTCTGGTCCACGCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCTAAGACGCGCATgg < 3:370273/146‑1 (MQ=255) aaCGTGTGAGCAGCACGAGCAGTTGCGTCACCAGTTGTTTCTCGAGGCGTCTGGTCCACGCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTc > 5:119270/1‑149 (MQ=255) gtgAGCAGCACGAGCAGTTGCGTCACCAGTTGTTTCTCGAGGCGTCTGGTCCACGCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATg > 2:304959/1‑149 (MQ=255) gAGCAGCACGAGCAGTTGCGTCACCAGTTGTTTCTCGAGGCGTCTGGTCCACGCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATgg > 3:350357/1‑148 (MQ=255) gcaCGAGCAGTTGCGTCACCAGTTGTTTCTCGAGGCGTCTGGTCCACGCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCGTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTc > 2:402877/1‑149 (MQ=255) caCGAGCAGTTGCGTCACCAGTTGTTTCTCGAGGCGTCTGGTCCACGCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCg > 6:70010/1‑149 (MQ=255) aCGAGCAGTTGCGTCACCAGTTGTTTCTCGAGGCGTCTGGTCCACGCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAg > 4:352639/1‑133 (MQ=255) aCGAGCAGTTGCGTCACCAGTTGTTTCTCGAGGCGTCTGGTCCACGCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAg < 3:352639/133‑1 (MQ=255) cGAGCAGTTGCGTCACCAGGTGTTTCTCGAGGCGTCTGGTCCACGCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCt > 7:167430/1‑149 (MQ=255) aGCAGTTGCGTCACCAGTTGTTTCTCGAGGCGTCTGGTCCACGCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTg < 6:119270/149‑1 (MQ=255) aGTTGCGTCACCAGTTGTTTCTCGAGGCGTCTGGTCCACGCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCt > 5:87522/1‑148 (MQ=255) gTTGCGTCACCAGTTGTTTCTCGAGGCGTCTGGTCCACGCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTaa < 1:235570/149‑1 (MQ=255) 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tCACCAGTTGTGTCTCGAGGCGTCTGGTCCACGCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGGTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTgg < 8:382446/149‑1 (MQ=255) gttgttTCTCGAGGCGTCTGGTCCACGCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATgg > 1:90910/1‑111 (MQ=255) gttgttTCTCGAGGCGTCTGGTCCACGCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATgg < 2:90910/111‑1 (MQ=255) gttgttTCTCGAGGCGTCTGGTCCACGCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTg < 3:204214/149‑1 (MQ=255) tttCTCGAGGCGTCTGGACCACGCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGAGTGgttt > 6:132404/1‑149 (MQ=255) tctcGATGCGTCTGGTCAAAGCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCTTCGAAGAAGCGAATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAATCCTGGAGCGTGgtttgt > 5:409131/1‑149 (MQ=255) tctcGAGGCGTCTGGTCCACGCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTGgtttgt > 7:245492/1‑149 (MQ=255) tcGAGGCGTCTGGTCCACGCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTGgtttgttt > 8:275413/1‑149 (MQ=255) gAGGCGTCTGGTCCACGCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTGgtttgttt < 8:167430/147‑1 (MQ=255) gCGTCTGGTCCACGCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTGGTTTGTTTCGCCt < 7:185208/149‑1 (MQ=255) gTCTGGTCCACGCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTGGTTTGTTTCGCCTg > 7:88435/1‑148 (MQ=255) tCTGGTCCACGCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTGGTTTGTTTCGCCTGGa > 2:189795/1‑149 (MQ=255) tCTGGTCCACGCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAACCTGGCGCGTGGTTTGTTTCGCCTGGa > 3:309231/1‑149 (MQ=255) tGGTCCACGCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGAAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGAAGCGCATGGAAGTCGGATGGAAGCTAGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTGGTTAGTTTCGCCTgg > 7:184008/1‑146 (MQ=255) gTCCACGCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTg > 5:6515/1‑129 (MQ=255) gTCCACGCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTg < 6:6515/129‑1 (MQ=255) gTCCACGCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTGTTACTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTGGTTTGTTTCGCCTGGACGAg > 1:53217/1‑149 (MQ=255) tacaggCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTCTTGCTGGAGCAGATGGAGATTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCTTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAACCTGGCGCGTGGTTTGTTTCGCCTGGACGAgg < 4:309231/144‑1 (MQ=255) ccACGCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGAt > 4:312819/1‑98 (MQ=255) ccACGCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGAt < 3:312819/98‑1 (MQ=255) cACGCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTGGTTTGTTTCGCCTg < 5:127917/140‑1 (MQ=255) cACGCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTGGTTTGTTTCGCCTg > 6:127917/1‑140 (MQ=255) cACGCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTGGTTTGTTTCGCCTGGACGAGGtt > 3:64264/1‑149 (MQ=255) cACGCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTGGTTTGTTTCGCCTGGACGAGGtt < 6:87522/149‑1 (MQ=255) aCGCAGTTGTGAAGACCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTGGTTTGTTTCGCCTGGACGAGGtt > 2:382027/1‑148 (MQ=255) tgAAGACCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTGGTTTGTTTCGCCTGGACGAGGTTGACCGCCAc < 5:70010/148‑1 (MQ=255) aCCGCCTGCTGCTGTTGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTGGTTTGTTTCGCCTGGACGAGGTTGACCGCCACGCGACg > 8:122654/1‑149 (MQ=255) cGCCTGCTGCTGTTGCTTGAGCAGATGGAGGTTGTGGTTCTGGTGTTG‑AGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTGGTTTGTTTCGCCTGGACGAGGTTGACCGCCACGCGACGtt < 8:184008/149‑1 (MQ=255) ttGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTGGTTTGTTTCGCCTGGACGAGGTTGACCGCCACGCGACGTTGCACGTg < 1:300644/144‑1 (MQ=255) ttGCTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTGGTTTGTTTCGCCTGGACGAGGTTGACCGCCACGCGACGTTGCACGTg > 2:300644/1‑144 (MQ=255) cTGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTTCTAAGCCTGGCGCGTGGTTTGTTTCGCCTGGACGAGGTTGACCGCCACGCGACGTCGCACGTGCAACgca < 8:103155/148‑1 (MQ=255) tGGAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTGGTTTGTTTCGCCTGGACGAGGTTGACCGCCACGCGACGTTGCACGTGCAACgcatg > 2:383847/1‑149 (MQ=255) gAGCAGATGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTGGTTTGTTTCGCCTGGACGAGGTTGACCGCCACGCGACGTTGCACGTGCAACgtcgc < 4:64264/147‑5 (MQ=255) 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aTGGAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTGGTTTGTTTCGCCTGGACGAGGTTGACCGCCACGCGACGTTGCACGTGCAACGCATGCATGCCGa < 1:402877/149‑1 (MQ=255) gAGCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTGGTTTGTTTCGCCTGGACGAGGTTGACCGCCACGCGACGTTGCACGTGCAACGCATGCATGCCGAGc < 7:122654/148‑1 (MQ=255) gCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTGGTTTGTTTCGCCTGGACGAGGTTGACCGCCACGCGACGTTGCACGTGCAACGCATGCATGCCGAGc < 3:212514/146‑1 (MQ=255) gCTTGGGGTTCTGGTGTTG‑CGAGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTGGTTTGTTTCGCCTGGACGAGGTTGACCGCCACGCGACGTTGCACGTGCAACGCATGCATGCCGAGc > 4:212514/1‑146 (MQ=255) ttGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTGGTTTGTTTCGCCTGGACGAGGTTGACCGCCACGCGACGTTGCACGTGCAACGCATGCATGCCGAGCACGcc > 1:116646/1‑149 (MQ=255) tGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTGGTTTGTTTCGCCTGGACGAGGTTGACCGCCACGCGACGTTGCAc < 6:252906/121‑1 (MQ=255) tGGGGTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTGGTTTGTTTCGCCTGGACGAGGTTGACCGCCACGCGACGTTGCAc > 5:252906/1‑121 (MQ=255) ggggTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCtt < 2:30728/59‑1 (MQ=255) tgTTCGGGTGTTG‑CTAGCAGTAGAAGTCGCGATTGGCAGTGTGATGGAAGATATCTTGCTAAGCCTGGCGCGTTGTTTGTTTTTCCTGGAAGAGGTTGACCGCCAAGCGACGTTGCACGTGAAACGCATGCATGCAGAGCACGCCCaac < 4:67474/148‑1 (MQ=255) ggTTCTGGTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTGGTTTGTTTCGCCTGGACGAGGTTGACCGCCACGCGACGTTGCACGTGCAACGCATGCATGCCGAGCACGCCCcac < 7:95082/149‑1 (MQ=255) ggTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTGGTTTGTTTCGCCTGGACGAGGTTGACCGCCACGCGACGTTGCACGTGCAACGCATGCATGCCGAGCACGCCCCACATATc > 6:221451/1‑148 (MQ=255) ggTGTTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTGGTTTGTTTCGCCTGGACGAGGTTGACCGCCACGCGACGTTGCACGTGCAACGCATGCATGCCGAGCACGCCCCACATATc > 3:41741/1‑148 (MQ=255) gtgtTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTGGTTTGTTTCGCCTGGACGAGGTTGACCGCCACGCGACGTTGCACGTGCAACGCATGCATGCCGAGCACGCCCCACatat < 2:237247/146‑1 (MQ=255) tgtTG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTGGTTTGTTTCGCCTGGACGAGGTTGACCGCCACGCGACGTTGCACGTGCAACGCATGCATGCCGAGCACGCCCCACATATCGAt < 1:189795/149‑1 (MQ=255) catG‑CGCGTCTTCGACGGCGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTGGTTTGTTTCGCCTGGACGAGGTTGACCGCCACGCGACGTTGCACGTGCAACgcatgcat < 6:259321/122‑1 (MQ=255) catG‑CGCGTCTTCGACGGCGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTGGTTTGTTTCGCCTGGACGAGGTTGACCGCCACGCGACGTTGCACGTGCAACgcatgcat > 5:259321/3‑124 (MQ=255) ttG‑CGCGCCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTGGTTTGTTTCGCCTGGACGAGGTTGACCGCCACGCGACGTTGCACGTGCAACGCATGCATGCCGAGCACGCCCCACATATCGATg < 4:350357/148‑1 (MQ=255) atG‑CGCGTCTTCGACGGCGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTGGTTTGTTTCGCCTGGACGAGGTTGACCGCCACGCGACGTTGCACGTGCAACGCATGCATGCCGAGCACGCCCCACATATCGATg > 7:264056/2‑148 (MQ=255) atG‑CGCGTCTTCGACGGCGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGATAAGCCTGGCGCGTGGTTTGTTTCGCCTGGACGAGGTTGACCGCCACGCGACGTTGCACGTGCAACGCATGCATGCCGAGCACGCCCCACATATCGATg > 1:93632/2‑148 (MQ=255) g‑cgcgcCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTGGTTTGTTTCGCCTGGACGAGGTTGACCGCCACGCGACGTTGCACGTGCAACGCATGCATGCCGAGCACGCCCCACATATCGATGaaa > 4:291506/1‑149 (MQ=255) gcCGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTGGTTTGTTTCGCCTGGACGAGGTTGACCGCCACGCGACGTTGCACGTGCAACGCATGCATGCCGAGCACGCCCCACATATCGATGAAATTga < 8:20708/149‑1 (MQ=255) cGTCGAAGACGCGCATGGCAGTCGGATGGAAGCTCGCTTGCTAAGCCTGGCGCGTGGTTTGTTTCGCCTGGACGAGGTTGACCGCCACGCGACGTTGCACGTGCAACGCATGCATGCCGAGCACGCCCCACATATCGATGAAATTgaga > 6:80748/1‑149 (MQ=255) | 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |