| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,242,983 | G→A | 8.3% | intergenic (‑99/‑126) | PP_1083 ← / → tsaA | (2Fe‑2S)‑binding protein/peroxiredoxin |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,242,983 | 0 | G | A | 8.3% | 199.5 / 4.8 | 71 | intergenic (‑99/‑126) | PP_1083/tsaA | (2Fe‑2S)‑binding protein/peroxiredoxin |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (28/37); new base A (4/2); total (32/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.99e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 | |||||||||||
GCATCGCGGATCTGTCCGTCGGTAACGCCGACACAAAGACACACATACATAAGGGCTGACCATCGCTGGTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCTTTGTTGGATGTCGGGCAAGCCCGTCTGGCCCGGCAAACGGTTTTTCACCCTCATCAGGAGATTACAATGAGCGTACTCGTT > NC_002947/1242835‑1243123 | gcatcgcGGATCTGTCCGTCGGTAACGCCGACACAAAGACACACATACATAAGGGCTGACCATCGCTGGTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCg > 1:256396/1‑149 (MQ=255) tcgcGGATCTGTCCGTCGGTAACGCCGACACAAAGACACACATACATAAGGGCTGACCATCGCTGGTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCggtg > 7:163394/1‑149 (MQ=255) tcgcGGATCTGTCCGTCGGTAACGCCGACACAAAGACACACATACATAAGGGCTGACCATCGCTGGGTGGGGCGAGGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCggtg > 8:95175/1‑149 (MQ=255) gcgGATCTGTCCGTCGGTAACGCCGACACAAAGACACACATACATAAGGGCTGACCATCGCTGGTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCggtggt < 8:79635/149‑1 (MQ=255) cgGATCTGTCCGTCGGTAACGCCGACACAAAGACACACATACATAAGGGCTGACCATCGCTGGTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTc < 5:196295/149‑1 (MQ=255) tCCGTCGGTAACGCCGACACAAAGACACTCATACATAAGGGCTGACGATCGCTGGTTGGGTCGATGGTTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATGTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCttt < 7:48806/146‑1 (MQ=255) tCCGTCGGTAACGCCGACACAAAGACACACATACATAAGGGCTGACCATCGCTGGGTGGGGCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCttt < 7:95175/146‑1 (MQ=255) gTAACGCCGACACAAAGACACACATACATAAGGGCTGACCATCGCTGGTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTACTGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAg > 5:285925/1‑149 (MQ=255) gTAACGCCGACACAAAGACACACATACATAAGGGCTGACCATCGCTGGTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGc < 1:307739/136‑1 (MQ=255) gTAACGCCGACACAAAGACACACATACATAAGGGCTGACCATCGCTGGTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGc > 2:307739/1‑136 (MQ=255) aCGCCGACACAAAGACACACATACATAAGGGCTGACCATCGCTGGTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCg < 7:286633/149‑1 (MQ=255) caAAGACACACATACATCAGGGCTGACCATCGCTGGTTGGGGCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCAt < 8:333582/149‑1 (MQ=255) caAAGACACACATACATAAGGGCTGACCATCGCTGGTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTctt < 5:351564/149‑3 (MQ=255) aaaGACACACATACATAAGGGCTGACCATCGCTGGTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCAt > 4:178694/1‑148 (MQ=255) acacacATACATAAGGGCTGACCATCGCTGGTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGaa < 2:256396/149‑1 (MQ=255) acacaTACATAAGGGCTGACCATCGCTGGTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGc > 3:380072/1‑149 (MQ=255) acacaTACATAAGGGCTGACCATCGCTGGTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCAGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGc < 8:50571/149‑1 (MQ=255) cacaTACATAAGGGCTGACCATCGCTGGTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGcc < 2:127544/149‑1 (MQ=255) acatacatAAGGGCTGACCATCGCTGGTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGc > 2:370677/1‑147 (MQ=255) acatacatAAGGGCTGACCATCGCTGGTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGc < 1:370677/147‑1 (MQ=255) acatacatAAGGGCTGACCATCGCTGGTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCg > 1:352880/1‑149 (MQ=255) catacataAGGGCTGACCATCGCTGGTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCgt > 3:104496/1‑149 (MQ=255) catacataAGGGCTGACCATCGCTGGTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCgt < 4:104496/149‑1 (MQ=255) tacataAGGGCTGACCATCGCTGGTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACAGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCgtgt < 6:357270/149‑1 (MQ=255) acataAGGGCTGACCATCGCTGGTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTa > 5:153068/1‑149 (MQ=255) ggCTGACCATCGCTGGTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGt < 6:379495/149‑1 (MQ=255) ggCTGACCATCGCTGGTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGt > 1:226315/1‑149 (MQ=255) cTGACCATCGCTGGTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAGTGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCg < 2:10693/149‑1 (MQ=255) aCCATCGCTGGTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTATGTCGACGGAGTCGGCCTGTGATGAGAAGCAGTGTATGATGGTCGGc > 8:284326/1‑148 (MQ=255) ccATCGCTGGTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCt < 3:178694/149‑1 (MQ=255) cATCGCTGGTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCtt > 8:167979/1‑149 (MQ=255) aTCGCTGGTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCttt < 6:392501/149‑1 (MQ=255) tCGCTGGTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCTttg > 6:311563/1‑149 (MQ=255) cTGGTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCTttgttg < 4:380072/149‑1 (MQ=255) cTGGTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCTttgttg < 8:363789/149‑1 (MQ=255) cTGGTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCTttgttg < 6:162816/149‑1 (MQ=255) gTTTGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTGATGAGAAGCCGTGTATGGTGGTCGGCCTTTGTTgg < 5:11113/147‑1 (MQ=255) gTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTc > 4:267213/1‑95 (MQ=255) gTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTc < 3:267213/95‑1 (MQ=255) gTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCTTTGTTGGAt < 2:352880/149‑1 (MQ=255) gTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGAAGGAGTCGGCCTGTCATGATAAGCCGTGTatgat > 5:404809/1‑131 (MQ=255) gTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCTTTGTTGGATGTCgg < 3:126317/149‑1 (MQ=255) gTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCTTTGTTGGATGTCgg < 2:226315/149‑1 (MQ=255) gTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGATTGAGCTAACATTTGTCTATTTGTCGAAGTAGTAGGCCTGTCATGAGAAGCGGTGTATGATGGTCGGACTTTGTTGGATgaagg > 7:151887/1‑145 (MQ=255) tCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATg < 4:377508/109‑1 (MQ=255) ttGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCTTTGTTGGATGTCGGGCAAGccc > 8:139225/1‑148 (MQ=255) gAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCTTTGTTGGATGTCGGGCAAGCCCGTCt > 1:81906/1‑149 (MQ=255) gCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCTTTGTTGGATGTCGGGCAAGCCCGTCTgg < 1:201048/149‑1 (MQ=255) atgttaatgAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTATGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCTTTCTTGGATGTCGGGCAAGCCCGTCTGGACCgg > 6:59538/1‑149 (MQ=255) gttaatgAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCTTTGTTGGATGTCGGGCAAGCCCGTCTGGCCCGGc > 8:336171/1‑148 (MQ=255) gttaatgAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCAGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCTTTGTTGGATGTCGGGCAAGCCCGTCTGGCCCGGc > 7:261701/1‑148 (MQ=255) ttaatgAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGTGGCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCTTTGTTGGATGTCGGGCAAGCCCGTCTGGCCCGGc > 1:277096/1‑148 (MQ=255) atgAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCttt > 8:359663/1‑112 (MQ=255) atgAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCttt < 7:359663/112‑1 (MQ=255) cTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCTTTGTTGGATGTCGGGCAAGCCCGTCTGGCCCGGCAAACGGTTTTTCa < 2:81906/148‑1 (MQ=255) cTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCTTTGTTGGATGTCGGGCAAGCCCGTCTGGCCCGGCAAACGGTTTTTCAc < 7:167979/149‑1 (MQ=255) ttGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCTTTGTTGGATGTCGGGCAAGCCCGTCTGGCCCGGCAAACGGTTTTTCAcc > 8:371408/1‑149 (MQ=255) ttGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCTTTGTTGGATGTCGGGCAAGCCCGTCTGGCCCGGCAAACGGTTTTTCAc > 5:77969/1‑148 (MQ=255) tCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCTTTGTTGGATGTCGGGCAAGCCCGTCTGGCCCGGCAAACGGTTTTTCACCCtc < 7:371408/149‑1 (MQ=255) aaaGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACGGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCTTTGTTGGATGTCGGGCAAGCCCGTCTGGCCCGGCAAACGGTTTTTCACCCtca < 8:151887/148‑1 (MQ=255) gATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCTTTGTTGGATGTCGGGCAAGCCCGTCTGGCCCGGCAAACGGTTTTTCACCCTCATCAg < 7:336171/149‑1 (MQ=255) ggT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCTTTGTTGGATGTCGGGCAAGCCCGTCTGGCCCGGCAAACGGTTTTTCACCCTCATCAGga > 4:7358/1‑139 (MQ=255) ggT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCTTTGTTGGATGTCGGGCAAGCCCGTCTGGCCCGGCAAACGGTTTTTCACCCTCATCAGga < 3:7358/139‑1 (MQ=255) ggT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCTTTGTTGGATGTCGGGCAAGCCCGTCTGGCCCGGCAAACGGTTTTTCACCCTCATCAGGAGATTACAAt < 2:277096/148‑1 (MQ=255) gt‑gctgtgctTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCTTTGTTGGATGTCGGGCAAGCCCGTCTGGCCCGGCAAACGGTTTTTCACCCTCATCAGGAGATTACAATGa < 7:300129/149‑1 (MQ=255) gt‑gctgtgctTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCTTTGTTGGATGTCGGGCAAGCCCGTCTGGCCCGGCAAACGGTTTTTCACCCTCATCAGGAGATTACAATGa < 6:77969/149‑1 (MQ=255) gctgtgctTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCTTTGTTGGATGTCGGGCAAGCCCGTCTGGCCCGGCAAACGGTTTTTCACCCTCATCAGGAGATTACAATGAGc > 4:244020/1‑149 (MQ=255) gctgtgctTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCTTTGTTGGATGTCGGGCAAGCCCGTCTGGCCCGGCAAACGGTTTTACACCCTCATCAGGAGATTACAATGAGc > 8:353509/1‑149 (MQ=255) ttGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCTTTGTTGGATGTCGGGCAAGCCCGTCTGGCCCGGCAAACGGTTTTTCACCCTCATCAGGAGATTACAATGAGCGTACTCg > 1:8542/1‑149 (MQ=255) ttGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCTTTGTTGGATGTCGGGCAAGCCCGTCTGGCCCGGCAAACGGTTTTTCACCCTCATCAGGAGATTACAATGAGCGTACTCg > 2:187301/1‑149 (MQ=255) caaaGCGACCACCGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCTTTGTTGGATGTCGGGCAAGCCCGTCTGGCCCGGCAAACGGTTTTTCACCCTCATCAGGAGATTACAATGAGCGTACTCg > 7:207236/4‑149 (MQ=255) aaaGCGACCACCGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCTTTGTTGGATGTCGGGCAAGCCCGTCTGGCCCGGCAAACGGTTTTTCACCCTCATCAGGAGATTACAATGAGc > 5:277822/3‑141 (MQ=255) aaaGCGACCACCGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCTTTGTTGGATGTCGGGCAAGCCCGTCTGGCCCGGCAAACGGTTTTTCACCCTCATCAGGAGATTACAATGAGc < 6:277822/139‑1 (MQ=255) aaGCGACCACCGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCTTTGTTGGATGTCGGGCAAGCCCGTCTGGCCCGGCAAACGGTTTTTCACCCTCATCAGGAGATTACAATGAGCGTACTCGtt > 2:141779/2‑149 (MQ=255) aGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCTTTGTTGGATGTCGGGCAAGCCCGTCTGGCCCGGCAAACGGTTTTTCACCCTCATCAGGAGATTACAATGAGCGTACTCGtt < 7:284326/148‑1 (MQ=255) | GCATCGCGGATCTGTCCGTCGGTAACGCCGACACAAAGACACACATACATAAGGGCTGACCATCGCTGGTTGGGTCGATGGGTTGGAGCTTAATGTTAATGAGAATGCTTGTCAAAGATCTTTCTGAGGGT‑GCTGTGCTTGAGCGACCGGTGGTCGCTTTGTCGACGGAGTCGGCCTGTCATGAGAAGCCGTGTATGATGGTCGGCCTTTGTTGGATGTCGGGCAAGCCCGTCTGGCCCGGCAAACGGTTTTTCACCCTCATCAGGAGATTACAATGAGCGTACTCGTT > NC_002947/1242835‑1243123 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |