| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,383,254 | A→T | 13.0% | L16Q (CTG→CAG) | PP_1204 ← | lipoprotein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,383,254 | 0 | A | T | 13.0% | 159.2 / 14.4 | 69 | L16Q (CTG→CAG) | PP_1204 | lipoprotein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (26/33); new base T (6/3); total (33/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.88e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.21e-01 | |||||||||||
ACACGTCGCTGCGGAAGCTCCATCACCTTCGGCTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAGCACTTCATTGAGCGGCAACGCCTGGGCGTCCTGCTCGGTGCGGTGCTTGTACTCC > NC_002947/1383107‑1383402 | acacGTCGCTGCGGAAGCTCCATCACCTTCGGCTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAg > 3:264813/1‑149 (MQ=255) cacGTCGCTGCTGAAGCTCCATCACCTTCGGCTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGt < 7:233015/149‑1 (MQ=255) cacGTCGCTGCGGAAGCTCCATCACCTTCGGCTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTTGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGt < 3:203015/149‑1 (MQ=255) acGTCGCTGCGGAAGCTCCATCACCTTCGGCTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTg > 6:81571/1‑149 (MQ=255) gTCGCTGCGGAAGCTCCATCACCTTCGGCTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTgcg > 2:135959/1‑149 (MQ=255) gCTGCGGAAGCTCCATCACCTTCGGCTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTgcggcg > 6:36932/1‑149 (MQ=255) cTGCGGAAGCTCCATCACCTTCGGCTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGgcgc < 6:202450/149‑1 (MQ=255) cGGAAGCTCCATCACCTTCGGCTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACTGTGCGGCGcc < 7:328364/147‑1 (MQ=255) aaGCTCCATCACCTTCGGCTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGGGGCGccccc > 3:224195/1‑147 (MQ=255) cTCCATCACCTTCGGCTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCCCAGTGCGGCGCCCCCAAggg > 5:202071/1‑149 (MQ=255) tCCATCACCTTCGGCTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAggg > 5:395384/1‑148 (MQ=255) aTCACCTTCGGCTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTaaa < 5:312800/149‑1 (MQ=255) aTCACCTTCGGCTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCCGCGCCCCCAAGGGTa > 5:292861/1‑147 (MQ=255) tCACCTTCGGCTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAg < 1:104270/149‑1 (MQ=255) aCCTTAGGCTCGCCGACATCGATCTGCAGTGTTTGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTTACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGt < 6:292861/149‑1 (MQ=255) ggCTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCg < 7:159311/149‑1 (MQ=255) gCTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGc < 1:135959/149‑1 (MQ=255) cTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCt < 3:47241/149‑1 (MQ=255) cTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCt < 2:227159/149‑1 (MQ=255) tCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCtt > 7:82531/1‑149 (MQ=255) cGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTg < 3:114246/149‑1 (MQ=255) gCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTg > 3:126117/1‑148 (MQ=255) cttCGATGTGCAGTGTTTGCTCGTGCTGTTGGCGCTCGACGCGCTCGTCTTGGTGGTGG‑CGCTGTTCCTTCTGGTGGGCTCTGCCTCTGAGGAGAAGGTCGGCGCACAGTGCGGCTCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGATTGTACAt < 8:38492/146‑1 (MQ=255) aTCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACTGTgcggc > 1:254412/1‑114 (MQ=255) aTCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACTGTgcggc < 2:254412/114‑1 (MQ=255) aTCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTAGCTTGTACATg > 4:343318/1‑148 (MQ=255) cGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATc > 4:360104/1‑149 (MQ=255) gCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACTGTGCGGCGccc < 1:21750/110‑1 (MQ=255) gCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACTGTGCGGCGccc > 2:21750/1‑110 (MQ=255) gCAGGGTATGCTAGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGTGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGt > 2:8528/1‑149 (MQ=255) cAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCAc < 5:126092/144‑1 (MQ=255) cAGGGTATGCTCGAGCAGGTTGCGCTCCACGCGCTCCTCATGGTCGCGG‑CGCGGGGACATCTGGTTGGCGCCGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGCAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTg < 8:362122/149‑1 (MQ=255) tATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTg < 6:395384/149‑1 (MQ=255) tATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTg < 4:126117/149‑1 (MQ=255) tccgcgcgCAGTTTGCGCGCGACGCGCCCCTCAGGGTCGCGG‑CGCTGGCACAGCGGGTGGGCGCAGCCGCTGACGAGCCGGGCGCCCCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTgg < 4:224195/141‑1 (MQ=255) tGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGt > 5:143843/1‑149 (MQ=255) cAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTGTCGGTGGGACATATGTTTGGCGCAGCCGATGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTAGTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGtt > 1:55365/1‑143 (MQ=255) cAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGtt < 2:55365/142‑1 (MQ=255) tGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACCGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGTTAACACGTGGAATGGTTATCAGCGGCGaa > 3:58209/1‑149 (MQ=255) cgcTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAACGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAAcg > 4:87333/1‑149 (MQ=255) tCGAAGCGCTCCTCATGGTCGCGG‑CGCTGGGACATCTGGGTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCgg < 6:202071/149‑1 (MQ=255) gACGCGCTCCTCATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCgg < 3:343318/147‑1 (MQ=255) ctcATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAgg > 3:87891/1‑147 (MQ=255) ctcATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAgg > 5:99200/1‑147 (MQ=255) ctcATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGaa < 3:87333/149‑1 (MQ=255) cATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACtt > 2:226203/1‑89 (MQ=255) cATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACtt < 1:226203/89‑1 (MQ=255) aTGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAg < 1:260125/147‑1 (MQ=255) ggTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGc < 1:377715/89‑1 (MQ=255) ggTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGc > 2:377715/1‑89 (MQ=255) gTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCa < 6:99200/148‑1 (MQ=255) cgctgGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAGCACtt < 5:81571/147‑1 (MQ=255) cgctgGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAGCACTTCa < 5:102576/149‑1 (MQ=255) cATCTGGGTGGCGCAGCCGCTGACTCGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTGCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAGCACTTCATTGAGCgg < 6:413039/149‑1 (MQ=255) gTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCa < 4:123333/88‑1 (MQ=255) gTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCa > 3:123333/1‑88 (MQ=255) gcgcAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAGCACTTCATTGAGCGGCAACGCCTgg < 8:82531/149‑1 (MQ=255) gAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATGACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAGCACTTCATTGAGCGGCAACGCCTGGGCGTCCTGCTcggt > 5:208067/1‑149 (MQ=255) gAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGTCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAGCACTTCATTGAGCGGCAACGCCTGGGc > 7:263730/1‑137 (MQ=255) gAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAGCACTTCATTGAGCGGCAACGCCTGGGc < 8:263730/137‑1 (MQ=255) gAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAGCACGTCATTTCGCGGCAACGCCTGGGCGTCCTGCTcggt > 4:339624/1‑149 (MQ=255) cAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAGCACTTCATTGAGCGGCAACGCCTGGGCGTCCTGCTcggtgcg > 2:363991/1‑149 (MQ=255) cAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCACCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATAACTCGTGGATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAGCACTTCATTGAGCGCCAACGCCTGCGCGTCCTGCTcggtgcg > 4:247785/1‑149 (MQ=255) gggCGCCGCACTGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAGCACTTCATTGAGCGGCAACGCCTGGGCGTCCTGCTcggtgcggt > 1:349290/1‑149 (MQ=255) ggCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAGCACTTCATTGAGCGGCAACGCCTGGGCGTCCTGCTcggtgcggtg < 4:264813/149‑1 (MQ=255) gcgcCGCACTGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAGCCCTTCATTGAGCGGCAACGCCTGGGCGGCCTGCTCggtgcggtgc > 7:309312/1‑149 (MQ=255) gcgcCGCACTGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAGCACTTCATTGAGCGGCAACGCCTGGGCGTCCTGCTCggtgcggtgc > 7:281883/1‑149 (MQ=255) gcgcCGCACTGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAGCACTTCATTGAGCGGCAACGCCTGGGCGTCCTGCTCggtgcggtgc > 7:315039/1‑149 (MQ=255) gccgcACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAGCACTTCATTGAGCGGCAACGCCTGGGCGTCCTGCTCGGTGCGGTGCtt < 2:20968/149‑1 (MQ=255) acaGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAGCACTTCATTGAGCGGCAACGCCTGGGCGTCCTGCTCGGTGCGGTGCTTGTACt > 2:75031/1‑149 (MQ=255) aGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAGCACTTCATTGAGCGGCAACGCCTGGGCGTCCTGCTcg < 6:309801/131‑1 (MQ=255) aGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAGCACTTCATTGAGCGGCAACGCCTGGGCGTCCTGCTcg > 5:309801/1‑131 (MQ=255) aGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAGCACTTCATTGAGCGGCAACGCCTGGGCGTCCTGCTCGGTGCGGTGCTTGTACTcc < 3:360104/149‑1 (MQ=255) | ACACGTCGCTGCGGAAGCTCCATCACCTTCGGCTCGCCGACATCGATCTGCAGGGTATGCTCGAGCAGTTTGCGCTCGACGCGCTCCTCATGGTCGCTG‑CGCTGGGACATCTGGTTGGCGCAGCCGCTGACGAGCAGGGCGCCGCACAGTGCGGCGCCCCCAAGGGTAAAGGTACTTCGCTTGTACATGATCACTCGTGCATTGGTTATCAGCGGCGAACGCGGGCCTGCAGGAAGGTCAGCACTTCATTGAGCGGCAACGCCTGGGCGTCCTGCTCGGTGCGGTGCTTGTACTCC > NC_002947/1383107‑1383402 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |