| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,450,049 | G→A | 7.6% | R7C (CGC→TGC) | PP_1268 ← | HtrA suppressor protein SohA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,450,049 | 0 | G | A | 7.6% | 232.3 / 6.2 | 79 | R7C (CGC→TGC) | PP_1268 | HtrA suppressor protein SohA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/38); new base A (4/2); total (39/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.32e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.33e-01 | |||||||||||
TCTTGTCACGTTTTTTCAAGCCCAAGGCGCGCCGCACCGTTTCGGGAACAGTGGTTTGATAGCGATCGGTCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCAGAGCCCACCAACACTGGCATGTCTACCCGGTCAATCACCTTCGCGCTGATTGACGGGTCCAGCAACCGCCCCAACCGCGACAGGTGGCGGTGGC > NC_002947/1449902‑1450197 | tCTTGTCACGTTTTTTCAAGCCCAAGGCGCGCCGCACCGTTTCGGGAACAGTGGTTTGATAGCGATCGGTCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGa > 4:390818/1‑149 (MQ=255) gTCACGTTTTTTCAAGCCCAAGGCGCGCCGCACCGTTTCGGGAACAGTGGTTTGATAGCGATCGGTCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGatt < 2:235125/147‑1 (MQ=255) aCGTTTTTTCAAGCCCAAGGCGCGCCGCACCGTTTCGGGAACAGTGGTTTGATAGCGATCGGTCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGattgcatt > 6:143962/1‑149 (MQ=255) gTTTTTTCAAGCCCAAGGCGCGCCGCACCGTTTCGGGAACAGTGGTTTGATAGCGATCGGTCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGattgcattgc > 8:236695/1‑149 (MQ=255) gTTTTTTCAAGCCCAAGGCGCGCCGCACCGTTTCGGGAACAGTGGTTTGATAGCGATCGGTCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGattgcattgc < 6:227258/149‑1 (MQ=255) gTTTTTTCAAGCACAAGGCGCGCCGCACCGTTTGGGGAACAGTGGTTTGATAGCGATCGGTCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTTGCATCCATGATTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGattgcattgc < 5:193363/149‑1 (MQ=255) ttttttCAAGCCCATGGCGCGCCGCACCGTTTCGGGAACAGTGGTTTGATAGCGATCGGTCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATTCAACTGAAGGTAATGCGATTGCATTGcc < 3:299385/149‑1 (MQ=255) tttCAAGCCCAAGGCGCGCCGCACCGTTTCGGGAACAGTGGTTTGATAGCGATCGGTCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCtt < 4:3823/148‑1 (MQ=255) tttCAAGCCCAAGGCGCGCCGCACCGTTTCGGGAACAGTGGTTTGATAGCGATCGGTCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCtt < 3:312706/148‑1 (MQ=255) cAAGCCCACGGCGCCCCGAACGGTTTCGGGAACTGTGGTTTGATAGCGATGGTTCAGCGTGGACTCGACGTGGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATTTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTc < 1:308871/148‑1 (MQ=255) gCCCAAGGCGCGCCGCACCGTTTCGGGAACAGTGGTTTGATAGCGATCGGTCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGCAATGCAATCGCATTACCTTgagagat > 7:374099/1‑143 (MQ=255) gCCCAAGGCGCGCCGCACCGTTTCGGGAACAGTGGTTTGATAGCGATCGGTCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGCAATGCAATCGCATTACCTTga < 8:374099/144‑2 (MQ=255) cccAAGGCGCGCCGCACCGTTTCGGGAACAGTGGTTTGATAGCGATCGGTCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGc < 3:390818/149‑1 (MQ=255) ccAAGGCGCGCCGCACCGTTTCGGGAACAGTGGTTTGATAGCGATCGGTCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGattgcattg > 7:140402/1‑136 (MQ=255) ccAAGGCGCGCCGCACCGTTTCGGGAACAGTGGTTTGATAGCGATCGGTCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGattgcattg < 8:140402/136‑1 (MQ=255) cAAGGCGCGCCGCACCGTTTCGGGAACAGTGGTTTGATAGCGATCGGTCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAg > 5:361378/1‑149 (MQ=255) aGGCGCGCCGCAGCGTTTCGGGAAAAGTGGTTTGATAGCGATCGGTCAGCGTGTACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGt < 8:340032/149‑1 (MQ=255) cgccgcACCGTTTCGGGAACAGTGGTTTGATAGCGATCGGTCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCAtt < 1:221690/149‑1 (MQ=255) cACCGTTTCGGGAACAGTGGTTTGATAGCGATCGGTCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCACCTGCATTGACAAGGCAATGCAATCGCATTAcctt < 3:301808/149‑3 (MQ=37) ccGTTTCGGGAACAGTGGTTTGATAGCGATCGGTCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACgg > 8:283486/1‑149 (MQ=255) cGTTTCGGGAACAGTGGTTTGATAGCGATCGGTCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGt < 2:323621/149‑1 (MQ=255) tttCGGGAACAGTGGTTTGATAGCGATCGGTCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGtga < 7:236695/149‑1 (MQ=255) tCGGGAACAGTGGTTTGATAGCGATCGGTCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGtgat < 4:32397/148‑1 (MQ=255) gggAACAGTTGTTTGATAGCGATCGGTCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCaa < 1:301960/123‑1 (MQ=255) gggAACAGTTGTTTGATAGCGATCGGTCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCaa > 2:301960/1‑123 (MQ=255) gggAACAGTGGTTTCATAGCGATCGGTCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAg > 8:281049/1‑149 (MQ=255) ggAACAGTGGTTTGATAGCGATCGGTCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGc < 6:361378/149‑1 (MQ=255) ggAACAGTGGTTTGATAGCGATCGGTCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGc > 4:1912/1‑149 (MQ=255) aaCAGTGGTTTGATAGCGATCGGTCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCgg > 8:204620/1‑149 (MQ=255) aaCAGTGGTTTGATAGCGATCGGTCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCgg < 2:282343/149‑1 (MQ=255) aCAGTGGTTTGATAGCGATCGGTCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGt > 2:250535/1‑149 (MQ=255) aCAGTGGTTTGATAGCGATCGGTCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGt < 1:225314/149‑1 (MQ=255) gTGGTTTGATAGCGATCGGTCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAg < 6:351683/149‑1 (MQ=255) tGGTTTGATAGCGATCGGTCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAgg < 1:250535/149‑1 (MQ=255) gTTTGATAGCGATCGGTCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAgg > 7:282762/1‑147 (MQ=255) gTTTGATAGCGATCGGTCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGc < 7:281049/148‑1 (MQ=255) tGATAGCGATCGGTCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCaga < 5:143962/148‑1 (MQ=255) gCGATCGGTCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCAGAGCccac > 8:203249/1‑149 (MQ=255) aTCGGTCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCAGAGCCCACCaa < 4:386523/149‑1 (MQ=255) aTCGGTCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCAGAGCCCACCaa < 8:282762/149‑1 (MQ=255) ggTCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCAGAGCCCACCAaca < 7:204620/148‑1 (MQ=255) tCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCAGAGCCCACCAACACTg > 1:209185/1‑149 (MQ=255) aGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCAGAGCCCACCAACACTgg < 6:178117/148‑1 (MQ=255) ggACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCAGAGCCCACCAACACTGGCATGTc > 8:225165/1‑149 (MQ=255) aCTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCAGTGCGCACCACGACTGGGATGTCt > 6:282966/1‑148 (MQ=255) cGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCAGAGCCCACCAACACTGGCATGTCTAccc > 8:91169/1‑149 (MQ=255) gACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATCCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCAGAGCCCACCAACACTGGCATGTCTACCCg > 2:169305/1‑149 (MQ=255) gTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCAGAGCCCACCAACACTGGCATGTCTACCCGGt > 2:340338/1‑148 (MQ=255) cGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGtga > 4:341266/1‑101 (MQ=255) cGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGtga < 3:341266/101‑1 (MQ=255) gAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGTTTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCAGAGCCCACCAACACTGGCATGTCTACCCGGTCAAt > 1:92904/1‑149 (MQ=255) tGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCAGAGCCCACCAACACTGGCATGTCTACCCGGTCAATCACCt < 2:92904/149‑1 (MQ=255) gCAGCCATGAGTAATGACCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCAGTGCCCAGCAACACTGGCATGTCCGCCCGGTCAATCACCTTc > 4:252260/1‑149 (MQ=255) gCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCAGAGCCCACCAACACTGGCATGTCTACCCGGTCAATCACCTTcgcg < 2:209185/149‑1 (MQ=255) cTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCAGAGCCCACCAACACTGGCATGTCTACCCGGTCAATCACCTTCGCGCTGATTGACGGGTc < 7:225165/148‑1 (MQ=255) tgGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCAGAGCCCACCAACACTGGc > 7:38347/1‑104 (MQ=255) tgGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCAGAGCCCACCAACACTGGc < 8:38347/104‑1 (MQ=255) tgGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCAGAGCCCACCAACACTGGCATGTCTACCCGGTCAATCACCTTCGCGCTGATTGACGGGTCCa < 1:340338/147‑1 (MQ=255) tgGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCAGAGCCCACCAACACTGGCATGTCTACCCGGTCAATCACCTTCGCGCTGATTGACGGGTCCa < 7:91169/147‑1 (MQ=255) gCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCAGAGCCCACCAACACTGGCATGTCTACCCGGTCAATCACCTTCGCGCTGATTGACGGGTCCAGCAACCGcccc < 7:203249/149‑1 (MQ=255) aaCTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCCGGCAGAGCCCACCAACACTGGCATGTCTACCCGGTCAATCACCTTCGCGCTGATTGACGGGTCCAGCAACCGCCCCAACcgcg > 8:316762/1‑149 (MQ=255) aaCTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCAGAGCCCACCAACACTGGCATGTCTACCCGGTCAATCACCTTCGCGCTGATTGACGGGTCCAGCAACCGCCCCAACcgcg > 2:361058/1‑149 (MQ=255) aaCTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCAGAGCCCACCAACACTGGCATGTCTACCCGGTCAATCACCTTCGCGCTGATTGACGGGTCCAGCAACCGCCCCAACcgcg > 5:17637/1‑149 (MQ=255) aaCTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCAGAGCCCACCAACACTGGCAAGTCTACCCGGTCAATCACCTTCGCGCTGATTGACGGGTCCAGCAACCGCCCCAAcc > 2:3354/1‑146 (MQ=255) aCTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCAGAGCCCACCAACACTGGCATGTCTACCCGGTc > 3:160464/1‑101 (MQ=255) aCTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCAGAGCCCACCAACACTGGCATGTCTACCCGGTc < 4:160464/101‑1 (MQ=255) aCTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCAGAGCCCACCAACACTGGCATGTCTACCCGGTCAATCACCTTCGCGCTGATTGACGGGTCCAGCAACCGCCCCAACcgcg > 7:131744/1‑148 (MQ=255) aCTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCAGAGCCCACCAACACTGGCATGTCTACCCGGTCAATCACCTTCGCGCTGATTGACGGGTCCAGCAACCGCCCCAACCGCGa > 1:30957/1‑149 (MQ=255) aaGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCAGAGCCCACCAACACTGGCATGTCTACCCGGTCAATCACCTTCGCGCTGATTGACGGGTCCAGCAACCGCCCCAACCGCGACAgg > 6:38824/1‑149 (MQ=255) aaGGCAATGCAATCGCATTACCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCAGAGCCCACCAACACTGGCATGTCTACCCGGTCAATCACCTTCGCGCTGATTGACGGGTCCAGCACCCGCCCCAACCGCGACAgg > 8:113800/1‑149 (MQ=255) tggTAATGCACCTGCATTGACAAGGCAATGCAATCGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCAGAGCCCACCAACACTGGCATGTCTACCCGGTCAATCACCTTCGCGCTGATTGACGGGTCCAGCAACCGCCCCAACCGCGACAggt > 7:83166/2‑149 (MQ=37) tggTAATGCACCTGCATTGACAAGGCAATGCAATCGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCAGAGCCCACCAACACTGGCATGTCTACCCGGTCAATCACCTTCGCGCTGATTGACGGGTCCAGCAACCGCCCCAACCGCGACAggt > 2:398908/2‑149 (MQ=37) gTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCAGAGCCCACCAACACTGGCATGTCTACCCGGTCAATCACCTTCGCGCTGATTGACGGGTCCAGCAACCGCCCCAACCGCGACAggtgg < 3:1912/149‑1 (MQ=255) gTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCAGAGCCCACCAACACTGGCATGTCTACCCGGTCAATCACCTTCGCGCTGATTGACGGGTCCAGCAACCGCCCCAACCGCGACAggtg < 8:131744/148‑1 (MQ=255) aaTGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCAGAGCCCACCAACACTGGCATGTCTACACGGTCAATCACCTTCGCGCTGATTGACGGGTCCAGCAACCGCCCCAACAGCGACAggtggcg > 7:69157/1‑149 (MQ=255) aTGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCAGTCAGGCAGAGCCCACCAACACTGGCATGTCTACCCGGTCAATCACCTTCGCGCTGATTGACGGGTACAGCAACCGCCCCAACAGCGACAggtggcgg > 2:95124/1‑149 (MQ=255) tGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCAGAGCCCACCAACACTGGCATGTCTACCCGGTCAATCACCTTCGCGCTGATTGACGGGTCCAGCAACCGCCCCAACCGCGACAggtggcggt > 7:332141/1‑149 (MQ=255) cGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCAGAGCCCACCAACACTGGCATGTCTACCCGGTCAATCACCTTCGCGCTGATTGACGGGTCCAGCAACCGCCCCAACCGCGACAggtggcggtgg < 2:30957/149‑1 (MQ=255) cGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCAGAGCCCACCAACACTGGCATGTCTACCCGGTCAATCACCTTCGCGCTGATTGACGGGTCCAGCAACCGCCCCAACCGCGACAggtggcggtgg > 1:49277/1‑149 (MQ=255) gATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCAGAGCCCACCAACACTGGCATGTCTACCCGGTCAATCACCTTCGCGCTGATTGACGGGTCCAGCAACCGCCCCAACCGCGACAggtggcggtggc > 5:185548/1‑149 (MQ=255) gATGGCATTGCCTTGTCAATGCAGGGGCATTACCACGGTGATGAGCGGGCAGGCAGAGCCCACCAACACTGGCATGTCTAACCGGTCAATCACCTTCGCGCTGATTGACGGGTCCAGCAACCGCCCCAACCGCGACAggtggcggtggc < 5:282966/149‑1 (MQ=255) | TCTTGTCACGTTTTTTCAAGCCCAAGGCGCGCCGCACCGTTTCGGGAACAGTGGTTTGATAGCGATCGGTCAGCGTGGACTCGACGTCGAAGGTGGCAGCCATGAGTAATGTCCTGTGGGTGACAGCGATACAACTCAAGGTAATGCGATTGCATTGCCTTGTCAATGCAGGTGCATTACCACGGTGATGAGCGGTCAGGCAGAGCCCACCAACACTGGCATGTCTACCCGGTCAATCACCTTCGCGCTGATTGACGGGTCCAGCAACCGCCCCAACCGCGACAGGTGGCGGTGGC > NC_002947/1449902‑1450197 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |