Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,481,515 | T→C | 6.2% | S75G (AGC→GGC) | rhlB ← | ATP‑dependent RNA helicase RhlB |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,481,515 | 0 | T | C | 6.2% | 182.0 / 2.8 | 64 | S75G (AGC→GGC) | rhlB | ATP‑dependent RNA helicase RhlB |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (30/30); new base C (2/2); total (32/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.99e-01 |
CCCAGGACCTGCGCCTGGATCGGCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGCGGGCCGGGCTTCCGGCGTC > NC_002947/1481370‑1481663 | cccAGGACCTGCGCCTGGATTGGCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGc > 7:47908/1‑149 (MQ=255) cccAGGACCTGCGCCTGGATCGGCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGTATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTGTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGc < 6:133429/149‑1 (MQ=255) aCCTGCGCCTGGATCGGCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTgg < 3:168430/149‑1 (MQ=255) cgcCTGGATCGGCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCCAGCCTGTggaagcc < 4:338760/149‑6 (MQ=255) gATCGGCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTggcttgggctt < 2:378966/147‑1 (MQ=255) aTCGGCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCg < 6:241776/149‑1 (MQ=255) gTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTcgcggcgcg < 3:236951/149‑1 (MQ=255) tACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTATTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTTCGTTcgcggcgagg > 6:135701/1‑149 (MQ=255) cGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGTTTCTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGt < 7:258249/148‑1 (MQ=255) cGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGt < 8:164524/148‑1 (MQ=255) gAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACCAACTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGATTGt > 7:278979/1‑149 (MQ=255) aGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTcc > 6:34151/1‑149 (MQ=255) cccAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCtt < 2:68518/149‑1 (MQ=255) cccAGGTCCTGCATGGCGTGCATCAGCTCGTAGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCCGCTCCACCCCGAAGTCTTCGGGCATACACAGCCTGGCCAGTCGCTTGGGCATGCGTACGCGGCGGGGTTTGTCCtt > 2:153224/1‑149 (MQ=255) ccAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAATCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGATCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCtt < 8:18602/148‑1 (MQ=255) aGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGc < 3:98165/149‑1 (MQ=255) gTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGtt > 6:23471/1‑149 (MQ=255) gCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGc < 5:34151/149‑1 (MQ=255) gTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCGTTGGCCGGTGGATCGGCAg > 4:302082/1‑149 (MQ=255) gTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCgg > 2:113360/1‑146 (MQ=255) gTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCa < 1:113360/148‑1 (MQ=255) cATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTg > 3:23715/1‑149 (MQ=255) aTCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTTTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTgg > 7:376985/1‑149 (MQ=255) gCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGc < 7:329225/102‑1 (MQ=255) gCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGc > 8:329225/1‑102 (MQ=255) gCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTc > 4:361650/1‑149 (MQ=255) cTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTGTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGGAGATCGGCAGGTGGCGTcg > 6:331212/1‑149 (MQ=255) tCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGATGCGGGTTTTGCCTTCGTGCGGGTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGt < 4:382880/114‑1 (MQ=255) ttGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCgcggc < 3:270397/149‑1 (MQ=255) gACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCAACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCggcggc < 6:144277/149‑1 (MQ=255) cTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGtt > 7:105579/1‑149 (MQ=255) gAAGTCGTGGATTCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTGCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGTCGTCGCGGCGGCAGGTTGc < 8:278979/148‑1 (MQ=255) aaGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTc < 4:23715/149‑1 (MQ=255) tgTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCGTGCGGCGCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGACTGTGGCTTGGTCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCa < 1:312102/148‑1 (MQ=255) aGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCGGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCa < 4:222330/149‑1 (MQ=255) aGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTgggg > 7:277164/1‑149 (MQ=255) ggTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCgg < 5:23471/149‑1 (MQ=255) gTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCggg > 3:112140/1‑149 (MQ=255) gCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTgg > 1:234406/1‑149 (MQ=255) gCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTg < 3:361650/148‑1 (MQ=255) cTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATggg > 3:22054/1‑149 (MQ=255) cGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGGGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTg < 5:135701/149‑1 (MQ=255) cTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCgg > 2:226246/1‑149 (MQ=255) tCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGc > 8:245949/1‑149 (MQ=255) tCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGc > 8:239676/1‑149 (MQ=255) gACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTgg < 6:168391/122‑1 (MQ=255) gACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTgg > 5:168391/1‑122 (MQ=255) gACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCg > 1:345213/1‑149 (MQ=255) cACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGtt > 4:154259/1‑149 (MQ=255) cGAAGTCTTCGGGGTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGtttt < 6:217997/149‑1 (MQ=255) cGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGtttt < 7:239676/149‑1 (MQ=255) cGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGtttt < 7:245949/149‑1 (MQ=255) aaGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGc < 5:175545/149‑1 (MQ=255) ttCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGcgg > 3:336348/1‑149 (MQ=255) ttCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGcgg > 8:228571/1‑149 (MQ=255) tCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGcggg > 5:83367/1‑149 (MQ=255) cTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTGGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGcgggccggg < 3:320986/149‑1 (MQ=255) aagccACAGGCCAGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGAGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGcgggccggg > 1:70702/4‑149 (MQ=255) ttCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGcgggccgggc > 8:105699/1‑149 (MQ=255) gccACAGGCCAGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCg > 7:325279/2‑107 (MQ=255) gccACAGGCCAGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCg < 8:325279/106‑1 (MQ=255) cacaGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGCGGGCCGGGCTTc > 4:26196/1‑149 (MQ=255) acaGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGCGGGCCGGGCTTcc > 5:199103/1‑149 (MQ=255) ggCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGGGTGGGCGGGGCGGTTTGTCGTTGGCCGGTTGATGGGCTGGTGGCGTGGCGGCGGCAGGTTGCTCTGCGTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGCGGGCCGGGCTTCCGGc < 1:153224/149‑1 (MQ=255) tGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGCTTTTGCCGCGGGCCGGGCTTCCGGCGTc < 1:226246/149‑1 (MQ=255) | CCCAGGACCTGCGCCTGGATCGGCGTGCAGTACGGGAAGCCCAGGTCGTGGATGGCGTGCATCAGCTCGTTGGACAGCTTGAAGTCGTGGAAGCGGGTTTTGCCTTCCTGCGGCTCGACCACGAAGTCTTCGGGCTTCCACAGGCTGGCCTGTGGCTTGGGCTTGCGTTCGCGGCGCGGTTTGTCCTTGGCCGGTTGATCGGCAGGTGGCGTCGCGGCGGCAGGTTGCTCAGCCTTGGGGGCGGGGTTGGCATGGGGTGCGGCCGGTTTTGCCGCGGGCCGGGCTTCCGGCGTC > NC_002947/1481370‑1481663 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |