Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 158,997 | G→T | 6.1% | Y464* (TAC→TAA) | PP_0149 ← | hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 158,997 | 0 | G | T | 6.1% | 212.6 / 3.3 | 66 | Y464* (TAC→TAA) | PP_0149 | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/27); new base T (2/2); total (37/29) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.89e-01 |
GTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCTCAGCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTT > NC_002947/158851‑159143 | gTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCTCAGCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCgg < 3:371134/147‑1 (MQ=255) gTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCTCAGCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCgg < 4:229305/147‑1 (MQ=255) gcgcAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCTCAGCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGc > 6:310451/1‑149 (MQ=255) cAGGGCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCTCAGCACCTTGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCa < 1:294523/149‑1 (MQ=255) ggTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCTCAGCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAgg < 2:134743/149‑1 (MQ=255) cTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCTCAGCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACg > 6:186310/1‑149 (MQ=255) gCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCTCAGCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTc < 5:144502/149‑1 (MQ=255) cGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCTCAGCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGTTACGCCTGGGCTACCGCTTcg < 4:399324/149‑1 (MQ=255) ggCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCTCAGCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATc > 3:113531/1‑148 (MQ=255) gctgctCGGCATTGAGGTCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCTGAGCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCTCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGc < 5:285208/149‑1 (MQ=255) tgctCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCTCAGCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGTTACGCCTGGGCTACCGCTTcga > 6:69347/1‑132 (MQ=255) tgctCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCTCAGCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGTTACGCCTGGGCTACCGCTTcga < 5:69347/133‑2 (MQ=255) gctCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCTCAGCACCTCGAACATGGCCTGGTAACGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCAc > 3:240617/1‑148 (MQ=255) ggCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCTCAGCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTg < 3:268835/148‑1 (MQ=255) tGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCTCAGCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAg > 5:110165/1‑109 (MQ=255) tGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCTCAGCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAg < 6:110165/109‑1 (MQ=255) ggCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCTCAGCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGc > 1:118532/1‑147 (MQ=255) ggCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCTCAGCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCa < 8:8304/149‑1 (MQ=255) gccagccaGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCTCAGCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCt > 8:369444/1‑137 (MQ=255) gccagccaGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCTCAGCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCt < 7:369444/137‑1 (MQ=255) ccagTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCTCAGCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTcccc > 5:63925/1‑149 (MQ=255) agTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCTCAGCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTg < 6:63925/149‑1 (MQ=255) tCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCTCAGCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGcc < 5:310451/149‑1 (MQ=255) ttCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCTCAGCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCt > 4:109439/1‑149 (MQ=255) aaCCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCTCAGCAGCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGa < 4:369247/149‑1 (MQ=255) aaCCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCTCAGCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGa < 3:109439/149‑1 (MQ=255) cAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCTCAGCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCa > 3:24187/1‑149 (MQ=255) agagCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCTCAGCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCAc < 4:113531/149‑1 (MQ=255) agCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCTCAGCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACgg > 5:402625/1‑149 (MQ=255) cttgcttgATTGGTAACTGCTTTCTCAGCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGc > 6:313701/1‑148 (MQ=255) ttgATTGGTAACTGCTTTCTCAGCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTg < 1:55562/118‑1 (MQ=255) ttgATTGGTAACTGCTTTCTCAGCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTg > 2:55562/1‑118 (MQ=255) ttgATTGGTAACTGCTTTCTCAGCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAAACGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCa > 1:116675/1‑148 (MQ=255) ttGGTAACTGCTTTCTCAGCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGTAAACCg > 6:146712/1‑149 (MQ=255) ggaaCTGCCTTCTCCCCCCCTCGCACATGGCCGGGTACCGGTCCCCGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTg < 3:26047/147‑1 (MQ=255) gTAACTGCTTTCTCAGCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTg > 5:154628/1‑149 (MQ=255) tGCTTTCTCAGCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCat > 7:100006/1‑149 (MQ=255) cTTTCTCAGCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCatga < 8:57030/149‑1 (MQ=255) cTTTCTCAGCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCatga > 6:390155/1‑149 (MQ=255) cTTTCTCAGCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCatg < 6:402625/148‑1 (MQ=255) ctcAGCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGcc < 1:21323/126‑1 (MQ=255) ctcAGCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGcc > 2:21323/1‑126 (MQ=255) ctcAGCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCt > 5:411446/1‑149 (MQ=255) gCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTc > 6:92395/1‑148 (MQ=255) cTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGt > 1:156265/1‑149 (MQ=255) aaCATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGa > 8:161209/1‑106 (MQ=255) aaCATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGa < 7:161209/106‑1 (MQ=255) aaCATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGtt < 2:306710/149‑1 (MQ=255) aTGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAg > 2:289802/1‑149 (MQ=255) aTGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAg < 8:100006/149‑1 (MQ=255) cTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTg > 7:165348/1‑149 (MQ=255) gTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTgg < 5:186310/147‑1 (MQ=255) aCCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAg < 7:328177/130‑1 (MQ=255) aCCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAg > 8:328177/1‑130 (MQ=255) ccGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTg < 2:156265/148‑1 (MQ=255) gTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGt > 6:2553/1‑131 (MQ=255) gcgGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGc < 6:154628/149‑1 (MQ=255) gTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGc < 4:90244/52‑1 (MQ=255) gTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGc > 3:90244/1‑52 (MQ=255) tAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCt > 5:57731/1‑149 (MQ=255) aaGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTg > 1:373355/1‑149 (MQ=255) gAATCGAAGCGGTAGACCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATTATGATGTCCAGGTCGTTGAGGAGTTGATTGGCGGTTCCGCt > 6:286808/1‑146 (MQ=255) aaTCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTgcg > 2:66090/1‑148 (MQ=255) aaTCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTgcg > 3:312269/1‑148 (MQ=255) cgcGAAGCGTTACGCCTGGGCTACCGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTgcg > 4:37869/3‑147 (MQ=255) tCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCgcag > 4:258914/1‑149 (MQ=255) cGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCgcag > 8:47666/1‑148 (MQ=255) cGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCtt < 5:313701/149‑1 (MQ=255) | GTGCGCAGGTCAGCCTTGGCGAACCAGCTACGGCGCTGCTCGGCATTGAGGGCCAGCCAGTCTTCAACCAGAGCTTGCTTGATTGGTAACTGCTTTCTCAGCACCTCGAACATGGCCTGGTACCGGTCGCGGTAAGAATCGAAGCGGTAGCCCAGGCGTAACGCTTCGCGCGGGTTATCAAGCACGCTGGTATCTGCCAGTCCCCTGCCCTTGAGCACGGCCAGCAAACCGTTGGGCATGATGCTGTCCAGGTCGTTGAGGCGTGGATTGGCGGTGCCGCTGCGCAGCAGCTT > NC_002947/158851‑159143 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |