| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,561,514 | T→C | 5.2% | N193D (AAC→GAC) ‡ | pctA ← | methyl‑accepting chemotaxis protein PctA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,561,514 | 0 | T | C | 5.2% | 229.4 / 2.3 | 76 | N193D (AAC→GAC) ‡ | pctA | methyl‑accepting chemotaxis protein PctA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (35/37); new base C (2/2); total (37/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.11e-01 | |||||||||||
GGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCTTGTTGGTGGTCATGTC > NC_002947/1561366‑1561661 | gggCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGtt < 6:55262/149‑1 (MQ=255)gggCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTGCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGtt < 3:96429/149‑1 (MQ=255) gAAGGGCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCATTGCACTTCGGTCAGCTCGGCGCTCAGTTTCGGCGTCTGGTGCGGGAACAGGTCCGACAGCTCCTTCATGAGCAGATACA‑TATCCGGGAGCAACAGGATCTAGCCCTGGTCGTTGAcct > 5:288955/1‑148 (MQ=255) aaGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAg > 1:352214/1‑149 (MQ=255) aGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCAACGACCAgg < 3:61914/149‑1 (MQ=255) gTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAgg > 4:282326/1‑147 (MQ=255) agcagTCGTGTCTGGCCATCGCTTTGCAATTCGTTCAGCTCGCCGGTCAGTTTAGGCGTGTGCGGCGTTAACAGGTCCGACAGCGACTTCCTGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCATGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGc < 5:271726/149‑1 (MQ=255) agcagGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGc > 8:205371/1‑149 (MQ=255) gcagGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCg < 1:385093/149‑1 (MQ=255) ggCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTAt < 4:312523/149‑1 (MQ=255) gCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATc > 5:23535/1‑149 (MQ=255) gCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATc < 6:371561/149‑1 (MQ=255) gggTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCTCTATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCg < 1:293249/144‑1 (MQ=255) gggTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTACGACAGCGACTTAATGACCATATCCT‑TAAACGGGTGCACCAGGAACTTGCCCAGGTCGTTGACCAGGAAcgcg > 2:293249/1‑143 (MQ=255) tCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGATCTGGTCCGAAAGCGACTTCATGACCAGATCGT‑TATCCGGGTGCACCTGTATCTTGCCCTGGTCTTTGACCTGGAAGGGGTATCCCATg < 6:257145/149‑1 (MQ=255) tCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCAACGACCAgggc < 8:203090/136‑3 (MQ=255) tCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCAACGACCAgggc > 7:203090/1‑134 (MQ=255) cATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATgccgcc > 7:256028/1‑148 (MQ=255) cATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATgccgcc > 5:260865/1‑148 (MQ=255) cATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGccgccg < 7:205371/149‑1 (MQ=255) ttGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGtt > 7:30946/1‑147 (MQ=255) tGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTc < 3:282326/147‑1 (MQ=255) tGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTc < 7:174171/147‑1 (MQ=255) gCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGTCGTGTGCTGCGTGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAg < 4:151596/148‑1 (MQ=255) aCTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCGGCGa > 1:219850/1‑149 (MQ=255) aCTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGc > 3:365789/1‑147 (MQ=255) aCTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGa < 8:256028/149‑1 (MQ=255) aCTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGa < 2:265944/149‑1 (MQ=255) cTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGTCGCCGAAGTTCAGCGAg < 2:352214/149‑1 (MQ=255) tCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTtgat > 8:39548/1‑148 (MQ=255) aGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTgatgat < 6:23535/149‑1 (MQ=255) aGCTCGCCGATCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTgatgat > 2:329950/1‑149 (MQ=255) aGCTCGCCGATCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTgatgat > 2:334663/1‑149 (MQ=255) cGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCGGCGAGTTGATGATCTGCAcc < 2:219850/149‑1 (MQ=255) cGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCAc > 5:380798/1‑148 (MQ=255) gTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAg > 7:204332/1‑149 (MQ=255) gggtgtGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGAGCCT‑TATCCGGGTCCACCAGGATCTTGCCCTGTGCGTTGACCATGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTCAAGCGAGTTGATGATCTCCACCAGGCCTTCCAgg < 6:288955/147‑1 (MQ=255) gCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAgg < 8:204332/149‑1 (MQ=255) gCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAgg < 1:371201/149‑1 (MQ=255) ctgcGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGt > 6:411188/1‑149 (MQ=255) tgcGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTc > 3:189310/1‑149 (MQ=255) gggAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTcgcc > 2:29563/1‑149 (MQ=255) gggAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGAAGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTcgcc > 5:157829/1‑149 (MQ=255) gAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAgg < 3:23948/142‑1 (MQ=255) gAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAgg > 4:23948/1‑142 (MQ=255) aCAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCTAGGGCCAGGTCGccgccg < 8:30946/149‑1 (MQ=255) cAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGCTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGa < 1:251233/149‑1 (MQ=255) cGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACg < 1:29563/148‑1 (MQ=255) cTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTcgccgc > 8:108497/1‑131 (MQ=255) cTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTcgccgc < 7:108497/131‑1 (MQ=255) aTGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGga < 5:411188/149‑1 (MQ=255) aCCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGAc < 7:39548/149‑1 (MQ=255) aTCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGACCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGc > 1:27345/1‑149 (MQ=255) ccT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTg > 8:371837/1‑149 (MQ=255) aTCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGa > 6:140293/1‑149 (MQ=255) cGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATg < 4:189310/148‑1 (MQ=255) gggTGCACCAGGATCTTGTCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGc > 2:333481/1‑148 (MQ=255) gggTGCACCAGGATCTTGTCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGc < 1:333481/148‑1 (MQ=255) aCCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGAc > 4:191829/1‑149 (MQ=255) gaccTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCt < 2:27345/146‑1 (MQ=255) gATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGc < 8:273258/107‑1 (MQ=255) gATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGc > 7:273258/1‑107 (MQ=255) gATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGAc < 5:324598/144‑1 (MQ=255) gATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGAc > 6:324598/1‑144 (MQ=255) gATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCt < 6:380798/149‑1 (MQ=255) ttGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCttgtt > 5:117954/1‑149 (MQ=255) tGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCttgttg > 7:119824/1‑149 (MQ=255) cttccTGGTCAACGACCAGGGAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCttgttg > 7:123081/4‑149 (MQ=255) gCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCttgt < 3:69838/146‑1 (MQ=255) cccTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCTTGTtggt > 1:366622/1‑149 (MQ=255) ccTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAgg > 4:400567/1‑77 (MQ=255) ccTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAgg < 3:400567/77‑1 (MQ=255) ccTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAg < 2:173081/124‑1 (MQ=255) ccTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCTTGTtggtg < 6:260865/149‑1 (MQ=255) cTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCTTGTtggtgg < 7:371837/149‑1 (MQ=255) cTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCTTGTtggtgg > 5:366577/1‑149 (MQ=255) tGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCTTGTTggtggt > 6:15790/1‑149 (MQ=255) gTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCTTGTTGGTGGTCATGt < 6:117954/149‑1 (MQ=255) ttGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCTTGTTGGTGGTCATGTc > 8:176116/1‑149 (MQ=255) | GGGCTGAAGGTCAGCAGGCGGGTCTGGCCATCGCTTTGCACTTCGGTCAGCTCGCCGGTCAGTTTCGGCGTGTGCTGCGGGAACAGGTCCGACAGCGACTTCATGACCAGATCCT‑TATCCGGGTGCACCAGGATCTTGCCCTGGTCGTTGACCAGGAAGGCGTATCCCATGCCGCCGAAGTTCAGCGAGTTGATGATCTGCACCAGGCCGTCCAGGGCCAGGTCGCCGCCGACCACGCCAACGCTGCTGGAGACCTTGCTGAGGATGCCGATGACCATCTTGTTGGTGGTCATGTC > NC_002947/1561366‑1561661 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |