| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,572,249 | T→A | 5.6% | L124* (TTG→TAG) ‡ | pcaB → | 3‑carboxy‑cis,cis‑muconate cycloisomerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,572,249 | 0 | T | A | 5.6% | 218.8 / 2.8 | 71 | L124* (TTG→TAG) ‡ | pcaB | 3‑carboxy‑cis,cis‑muconate cycloisomerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (28/39); new base A (2/2); total (30/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.19e-01 | |||||||||||
GCAACTCGGCCATTCCGCTGGTGAAAGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGACCCTGGGCATGAAACTGGCCGGTGTACTGGGTGCTT > NC_002947/1572102‑1572395 | gCAACTCGGCCATTCCGCTGGTGAAAGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGAttt > 2:315171/1‑148 (MQ=255)gCAACTCGGCCATTCCGCTGGTGAAAGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTg < 4:65794/149‑1 (MQ=255)gCAACTCGGCCATTCCGCTGGTGAAAGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATCTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGAttt > 5:29051/1‑148 (MQ=255) aaCTCGGCCATTCCGCTGGTGAAAGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCCATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGAt > 3:116604/1‑149 (MQ=255) cTCGGCCATTCCGCTCGTGAAAGCGTTGGCCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGTCTGAGCGCTATGTGCAACTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATc > 4:249485/1‑148 (MQ=255) tCGGCCATTCCGCTGGTGAAAGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATc > 1:72962/1‑147 (MQ=255) ggCCATTCCGCTGGTGAAAGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAg < 1:305648/148‑1 (MQ=255) ggCCATTCCGCTGGTGAAAGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATCAAATCGAgg < 3:17667/149‑1 (MQ=255) gCCATTCCGCTGGTGAAAGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGc > 5:82552/1‑149 (MQ=255) ccATTCCGCTGGTGAAAGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGcc > 8:17064/1‑149 (MQ=255) ctttCCGCTGGTGAATGCTTTTGTCAAGGTGAGAGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCg < 6:29051/147‑1 (MQ=255) cATTCCGCTGGTGAAAGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGcc > 8:305215/1‑148 (MQ=255) ttCCGCTGGTGAAAGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGAc > 5:104731/1‑149 (MQ=255) ttCCGCTGGTGAAAGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATCAAATCGAgggcatc < 3:98719/149‑6 (MQ=255) gCTGGTGAAAGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCg < 1:234994/149‑1 (MQ=255) gAAAGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGc > 8:295963/1‑149 (MQ=255) aaaGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGc < 2:77866/148‑1 (MQ=255) aaGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTg < 6:51812/149‑1 (MQ=255) cGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGcc < 6:104731/149‑1 (MQ=255) ggCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATAc > 1:147533/1‑149 (MQ=255) ggCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCCATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATAc < 4:116604/149‑1 (MQ=255) aaGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCt < 7:295963/149‑1 (MQ=255) aGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTg > 8:55895/1‑149 (MQ=255) ggTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGt < 2:72962/149‑1 (MQ=255) gTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGTc < 7:17064/149‑1 (MQ=255) gcgaCCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGTCgcagc < 8:347313/145‑1 (MQ=255) cACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAgg < 7:55895/149‑1 (MQ=255) cACCCGCGTGCCACCCGCTGACCGCTATGTTGACCTTGGGGGCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAgg < 4:285931/149‑1 (MQ=255) ccGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGcc > 2:68152/1‑149 (MQ=255) gCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCtt > 5:74898/1‑148 (MQ=255) gTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGaa < 1:313328/149‑1 (MQ=255) gTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGaa < 4:282002/149‑1 (MQ=255) gTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGaa < 3:389396/149‑1 (MQ=255) agGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCt < 4:341721/103‑1 (MQ=255) agGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCt > 3:341721/1‑103 (MQ=255) cTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGAt < 2:147533/149‑1 (MQ=255) aGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATa < 3:249485/147‑1 (MQ=255) gtgCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTtggt > 7:155099/1‑149 (MQ=255) tgCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTtggt < 7:305215/148‑1 (MQ=255) gCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTtggtgg > 6:212974/1‑149 (MQ=255) caacTTGGGGCCAACATCCATGTTGCGTAGGTAACCGGTCTTGTTCTGGATGTTCGGGATGGCCTTGTTTTTATCGATGCCGTACTCGGGACTGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTtggtg < 1:315171/145‑1 (MQ=255) cACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTggg < 2:134509/149‑1 (MQ=255) aCCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGt > 5:149045/1‑149 (MQ=255) aCCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGt > 1:275080/1‑149 (MQ=255) ccTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTc < 2:275080/149‑1 (MQ=255) cTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATAc < 4:382909/101‑1 (MQ=255) cTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATAc > 3:382909/1‑101 (MQ=255) ttGGGGCAACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCg > 5:290755/1‑148 (MQ=255) tGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGTCgcagca > 6:81366/1‑111 (MQ=255) tGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGTCgcagca < 5:81366/111‑1 (MQ=255) ccaccaGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTgg < 3:313785/149‑1 (MQ=255) accaGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGtt < 3:8878/149‑1 (MQ=255) ccagGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCaa > 6:371912/1‑148 (MQ=255) ggATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACg < 6:74898/149‑1 (MQ=255) gATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGc > 4:171883/1‑149 (MQ=255) aTGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGcc < 6:82552/149‑1 (MQ=255) aTGCGATGGATACCGGGCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGcc < 5:212974/149‑1 (MQ=255) ccGGTCTTGTTGTGCAGCTGCGCGATGCGCTCGATTTGATCGAGGCCGAACTCGGGA‑AGCTGGCCGATACCCTGTGGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCGCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCGACCCCGGTGAcc < 1:190377/149‑1 (MQ=255) ccGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGAcc < 5:137635/149‑1 (MQ=255) cGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGAccc > 2:409218/1‑149 (MQ=255) tCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGACCCTgg < 6:149045/149‑1 (MQ=255) ggTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGACCCTGGGCa > 6:174048/1‑149 (MQ=255) 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cggccTCGATCAAATCGAGGGCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGAGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGACCCTGGGCATGAAACTGGCCGGTGTAc > 5:140306/4‑149 (MQ=255) ccTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGACCCTGGGCATGAAACTGGCCGGTGTACTgg > 7:104272/1‑149 (MQ=255) ccTCGATCAAATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGACCCTGGGCATGAAACTGACCGGTGTACTgg > 7:301884/1‑149 (MQ=255) tCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGACCCTGGGCATGAAACTGGCCGGTGTACTGGGt > 4:87196/1‑149 (MQ=255) tCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGACCCTGGGCATGAAACTGGCCGGTGTACTGGGt > 3:39345/1‑149 (MQ=255) gATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGACCCTGGGCATGAAACTGGCCGGTGTACTGGGt < 6:290755/147‑1 (MQ=255) ttGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGACCCTGGGCATGAAACTGGCCGGTGTACTGGGTGCtt < 8:104272/148‑1 (MQ=255) | GCAACTCGGCCATTCCGCTGGTGAAAGCGTTGGGCAAGGTGATCGCCACCGGCGTGCCAGAGGCTGAGCGCTATGTGCACCTTGGGGCCACCAGCCAGGATGCGATGGATACCGGTCTGGTTCTGCAGCTGCGCGATGCCCTCGATTTGATCGAGGCCGACCTCGGCA‑AGCTGGCCGATACCCTGTCGCAGCAGGCCTTGAAGCACGCCGATACGCCCTTGGTGGGTCGTACCTGGTTGCAACACGCCACCCCGGTGACCCTGGGCATGAAACTGGCCGGTGTACTGGGTGCTT > NC_002947/1572102‑1572395 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |