| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,572,891 | T→G | 7.5% | L338R (CTG→CGG) ‡ | pcaB → | 3‑carboxy‑cis,cis‑muconate cycloisomerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,572,891 | 0 | T | G | 7.5% | 204.9 / 7.3 | 67 | L338R (CTG→CGG) ‡ | pcaB | 3‑carboxy‑cis,cis‑muconate cycloisomerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (31/31); new base G (3/2); total (34/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.99e-01 | |||||||||||
CCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCCTGCTGTCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCTCAGGAGCACGAACGCAGCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCCGCGCGCATGCGCCGTAACCTCGACCTGACCCAAGGCCTGGTGCTGGCCGAAGCGGTGAGCATCGTCCTCGCCCAGCGTCTGGGTCGCGACCGTGCCCACCACCT > NC_002947/1572744‑1573038 | ccgTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCCTGCTGTCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCTCAGGAGCACGAACGCAGCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTg > 3:28304/1‑149 (MQ=255) cgTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCCTGCTGTCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCTCAGGAGCACGAACGCAGCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTgc > 3:40772/1‑149 (MQ=255) ttGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCCTGCTGTCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCTCAGGAGCACGAACGCAGCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTgcgc > 8:321090/1‑147 (MQ=255) ttGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCCTGCTGTCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCTCAGGAGCACGAACGCAGCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCa < 2:260547/149‑1 (MQ=255) gATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCCTGCTGTCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCTCAGGAGCACGAACGCAGCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAg < 6:27360/148‑1 (MQ=255) aTCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCCTGCTGTCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCTCAGGAGCACGAACGCAGCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAgg < 3:248953/148‑1 (MQ=255) aTCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCCTGCTGTCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCTCAGGAGCACGAACGCAGCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCAGGGCGCCAga < 5:165609/148‑2 (MQ=255) cGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCCTGCTGTCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCTCAGGAGGACGAACGCAGCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCAGGGCGCCAgaga < 5:240480/148‑4 (MQ=255) ggTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCCTGCTGTCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCTCAGGAGCACGAACGCAGCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTc > 4:309378/1‑148 (MQ=255) ggTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCCTGCTGTCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCTCAGGAGCACGAACGCAGCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTc > 8:238466/1‑148 (MQ=255) ggTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCCTGCTGTCGACGCTGGTCGCAGCCATGCCTCAGGAGCACGAACGCAGCCGGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATCTCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCt < 5:253357/147‑1 (MQ=255) gTGCCGCGACCCGCGTGTCGGGCCTGCTGTCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCTCAGGAGCACGAACGCAGCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCaa > 3:32862/1‑149 (MQ=255) tGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCCTGCTGTCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCTCAGGAGCACGAACGCAGCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAg < 2:97449/149‑1 (MQ=255) ccGCGACCCGCGTGCCGGGCCTGCTGTCGACACTGTTCGCAGCCATGCCTCAGGAGCACGAACGCAGCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCAGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGt > 1:43501/1‑148 (MQ=255) cgcgTGCCGGGCCTGCTGTCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCTCAGGAGCACGAACGCAGCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGcc > 1:11984/1‑147 (MQ=255) gcgTGCCGGGCCTGCTGTCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCTCAGGAGCACGAACGCAGCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAg < 4:55983/149‑1 (MQ=255) cGGGCCTGCTGTCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCTCAGGAGCACGAACGCAGCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATg > 4:155804/1‑149 (MQ=255) cGGGCCTGCTGTCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCTCAGGAGCACGAACGCAGCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATg < 7:137585/149‑1 (MQ=255) gCCTGCTGTCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCTCAGGAGCACGAACGCAGCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAg < 1:391194/149‑1 (MQ=255) ctgTCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCTCAGGAGCACGAACGCAGCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTgg < 1:381744/148‑1 (MQ=255) tCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCTCAGGAGCACGAACGCAGCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGc > 5:81081/1‑149 (MQ=255) gACGCTGTTCGCAGCCATGCCTCAGGAGCACGAACGCAGCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCcg > 2:181444/1‑149 (MQ=255) gCTGTTCGCAGCCATGCCTCAGGAGCACGAACGCAGCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCcgcgc < 7:321090/149‑1 (MQ=255) gCTGTTCGCAGCCATGCCTCACGAGCACGAACGCAGCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCcgcgc < 3:309378/149‑1 (MQ=255) tGTTCGCAGCCATGCCTCAGGAGCACGAACGCAGCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGcc < 7:85558/122‑1 (MQ=255) tGTTCGCAGCCATGCCTCAGGAGCACGAACGCAGCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGcc > 8:85558/1‑122 (MQ=255) aGCCATGCCTCAGGAGCACGAACGCAGCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGTTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCCGCGCGCATGCGcc > 7:81006/1‑149 (MQ=255) cATGCCTCAGGAGCACGAACGCAGCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCCGCGCGCATGCGCCGt > 3:249797/1‑148 (MQ=255) aTGCCTCAGGAGCACGAACGCAGCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCCGCGCGCATGCGCCGTaa < 4:40772/149‑1 (MQ=255) tGCCTCAGGAGCACGAACGCAGCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCCGCGCGCATGCGCCGTAAc < 6:6619/149‑1 (MQ=255) cTCAGGAGCACGAACGCAGCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCCGCGCGCATGCGCCGTAACCTc < 4:32862/149‑1 (MQ=255) tCAGGAGCACGAACGCAGCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCCGCGCGCATGCGCCGTAACCTc > 8:325854/1‑148 (MQ=255) cAGGAGCACGAACGCAGCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCCGCGCGCATGCGCCGTAACCTCGa > 1:250259/1‑149 (MQ=255) aGGAGCACGAACGCAGCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCCGCGCGCATGCGCCGTAACCTCGAc > 7:127478/1‑149 (MQ=255) aGGAGCACGAACGCAGCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCCGCGCGCATGCGCCGTAACCTCGAc < 3:357936/149‑1 (MQ=255) gCACGAACGCAGCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCCGCGCGCATGCGCCGTAACCTCGACCTGa > 2:298348/1‑149 (MQ=255) gCACGAACGCAGCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCCGCGCGCATGCGCCGTAACCTCGACCTGa < 7:238466/149‑1 (MQ=255) aCGAACGCAGCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCCGCGCGCATGCGCCGTAACCTCGACCTGAcc > 4:226730/1‑149 (MQ=255) aaCGCAGCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCCGCGCGCATGCGCCGTAACCTCGACCTGAccc > 5:180520/1‑147 (MQ=255) gCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCCGCGCGCATGCGCCGTAACCTCGACCTGACCCAAGGCCTg < 1:298348/149‑1 (MQ=255) gCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCCGCGCGCATGCGCCGTAACCTCGACCTGACCCAAGGCCTg < 6:81081/149‑1 (MQ=255) gCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCCGCGCGCATGCGCCGTAACCTCGACCTGACCCAAGGCCTg < 2:303005/149‑1 (MQ=255) ccTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCCGCGCGCATGCGCCGTAACCTCGACCTGACCCAAGGCCTgg < 5:318912/149‑1 (MQ=255) cTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGTTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCCGCGCGCATGCGCCGTAACCTCGACCTGACCCAAGGCCTGGt < 8:81006/149‑1 (MQ=255) gCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCCGCGCGCATGCGCCGTAACCTCGACCTGACCCAAGGCCTGGTGCTg > 4:76634/1‑149 (MQ=255) ccTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTTCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCCGCGCGCATGCGCCGTAACCTCGACCTGACCCAAGGCCTGGTGCTgg < 4:28304/149‑1 (MQ=255) gCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCCGCGCGCATGCGCCGTAACCTCGACCTGACCCAAGGCCTGGTGCTGGCCGaa < 1:181444/148‑1 (MQ=255) cGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCCGCGCGCATGCGCCGTAACCTCGACCTGACCCAAGGCCTGGTGCTGGCCGAAGCGGt > 8:143535/1‑147 (MQ=255) cGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCCGCGCGCATGCGCCGTAACCTCGACCTGACCCAAGGCCTGGTGCTGGCCGAAGCGGTGa < 7:325854/149‑1 (MQ=255) ggAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCCGCGCGCATGCGCCGTAACCTCGACCTGACCCAAGGCCTGGTGCTGGCCGAAGCGGTGAGCATc < 3:76634/148‑1 (MQ=255) ggAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCCGCGCGCATGCGCCGTAACCTCGACCTGACCCAAGGCCTGGTGCTGGCCGAAGCGGTGAGCATCg > 3:10350/1‑149 (MQ=255) aaaCCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCCGCGCGCATGCGCCGTAACCTCGACCTGACCCAAGGCCTGGTGCTGGCCGAAGCGGTGAGCATCGTc < 2:11984/149‑1 (MQ=255) ccTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCCGCGCGCATGCGCCGTAACCTCGACCTGACCCAAGGCCTGGTGCTGGCCGAAGCGGTGAGCATCGTCCTCg > 3:369721/1‑149 (MQ=255) ccTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCCGCGCGCATGCGCCGTAACCTCGACCTGACCCAAGGCCTGGTGCTGGCCGAAGCGGTGAGCATCGTCCTCg < 8:127478/149‑1 (MQ=255) tGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCCGCGCGCATGCGCCGTAACCTCGACCTGACCCAAGGCCTGGTGCTGGCCGAAGCGGTGAGCATCGTCCTCGcc > 6:17320/1‑149 (MQ=255) 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cTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCCGCGCGCATGCGCCGTAACCTCGACCTGACCCAAGGCCTGGTGCTGGCCGAAGCGGTGAGCATCGTCCTCGCCCAGCGTCTGGGTCGCGa > 4:139568/1‑149 (MQ=255) gTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCCGCGCGCATGCGCCGTAACCTCGACCTGACCCAAGGCCTGGTGCTGGCCGAAGCGGTGAGCATCGTCCTCGCCCAGCGTCTGGGTCGCGAc < 6:180520/147‑1 (MQ=255) cctGGCGCAGGGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCCGCGCGCATGCGCCGTAACCTCGACCTGACCCAAGGCCTGGTGCTGGCCGAAGCGGTGAGCATCGTCCTCGCCCAGCGTCTGGGTCGCGACCGTGc > 7:165244/2‑149 (MQ=255) cctGGCGCAGGGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCCGCGCGCATGCGCCGTAACCTCGACCTGACCCAAGGCCTGGTGCTGGCCGAAGCGGTGAGCATCGTCCTCGCCCAGCGTCTGGGTCGCGACCGTGc > 5:204048/2‑149 (MQ=255) cctGGCGCAGGGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCCGCGCGCATGCGCCGTAACCTCGACCTGACCCAAGGCCTGGTGCTGGCCGAAGCGGTGAGCATCGTCCTCGCCCAGCGTCTGCGTCGCCACCGTGc > 7:68501/2‑149 (MQ=255) tGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCCGCGCGCATGCGCCGTAACCTCGACCTGACCCAAGGCCTGGTGCTGGCCGAAGCGGTGAGCATCGTCCTCGCCCAGCGTCTGGGTCGCGACCGTg < 2:250259/146‑1 (MQ=255) cTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCCGCGCGCATGCGCCGTAACCTCGACCTGACCCAAGGCCTGGTGCTGGCCGAAGCGGTGAGCATCGTCCTCGCCCAGCGTCTGGGTCGCGACCGTGCCCACCACct > 6:400115/1‑149 (MQ=255) tGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCCGCGCGCATGCGCCGTAACCTCGACCTGACCCAAGGCCTGGTGCTGGCCGAAGCGGTGAGCATCGTCCTCGCCCAGCGTCTGGGTcgc < 3:240092/131‑1 (MQ=255) tGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCCGCGCCCATGCGCCGTAACCTCGACCTGACCCAAGGCCTGGTGCTGGCCGAAGCGGTGAGCATCGTCCTCGCCCAGCGTCTGGGTcgc > 4:240092/1‑131 (MQ=255) | CCGTGTTGATCGGTGCCGCGACCCGCGTGCCGGGCCTGCTGTCGACGCTGTTCGCAGCCATGCCTCAGGAGCACGAACGCAGCCTGGGCCTATGGCATGCCGAGTGGGAAACCCTGCCGGATATCTGCTGCCTGGTCTCTGGCGCCCTGCGCCAGGCTCAAGTGATTGCCGAGGGCATGGAGGTGGATGCCGCGCGCATGCGCCGTAACCTCGACCTGACCCAAGGCCTGGTGCTGGCCGAAGCGGTGAGCATCGTCCTCGCCCAGCGTCTGGGTCGCGACCGTGCCCACCACCT > NC_002947/1572744‑1573038 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |