Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,657,538 | T→A | 7.6% | D319V (GAC→GTC) | PP_1450 ← | TPS family activation/secretion protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,657,538 | 0 | T | A | 7.6% | 163.2 / 3.3 | 61 | D319V (GAC→GTC) | PP_1450 | TPS family activation/secretion protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (28/28); new base A (2/3); total (30/31) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.82e-01 |
CGTCGGGCTCTGCTGGACGATAACCGCGCCAGCGCTGCGGTTGATCAGCTGCTTGCGGTCCAGACGGGCGCTGGCGCTGAGCATGCCTTGCTGGTTGCGCCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGATAGCTTAGCTGGCTGGCGCTGAGGGCAAAGGTCCAGGCGCCGTAGGGGATGCTGTAGTACAACGATATCCCTTGGCTTTGGCCGGGCGTATCGAGCACCGTGCGGGCCAACGA > NC_002947/1657393‑1657686 | cGTCGGGCTCTGCGGGACGATAACCGCGCCAGCGCTGCGGTTGATCAGCTGCTTGCGGTCCAGACGGGCGCTGGCGCTGAGCATGCCTTGCTGGTTGCGCCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCgg < 1:105310/149‑1 (MQ=255) gTCGGGCTCTGCTGGACGATAACCGCGCCAGCGCTGCGGTTGATCAGCTGCTTGCGGTCCAGACGGGCGCTGGCGCTGAGCATGCCTTGCTGGTTGCGCCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCgg > 6:374170/1‑148 (MQ=255) ctctGCTGGACGATAACCGCGCCAGCGCTGCGGTTGATCAGCTGCTTGCGGTCCAGACGGGCGCTGGCGCTGAGCATGCCTTGCTGGTTGCGCCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGACGGCAGcagc < 4:187188/149‑4 (MQ=255) ctgctgGACGATAACCGCGCCAGCGCTGCGGTTGATCAGCTGCTTGCGGTCCAGACGGGCGCTGGCGCTGAGCATGCCTTGCTGGTTGCGCCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGACGGCAGcagcag < 7:240010/149‑6 (MQ=255) ctgGACGATAACCGCGCCAGCGCTGCGGTTGATCAGCTGCTTGCGGTCCAGACGGGCGCTGGCGCTGAGCATGCCTTGCTGGTTGCGCCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTc < 8:106115/147‑1 (MQ=255) aCGATAACCGCGCCAGCGCTGCGGTTGATCAGCTGCTTGCGGTCCAGACGGGCGCTGGCGCTGAGCATGCCTTGCTGGTTGCGCCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGGTg > 8:299141/1‑147 (MQ=255) aCGATAACCGCGCCAGCGCTGCGGTTGATCAGCTGCTTGCGGTCCAGACGGGCGCTGGCGCTGAGCATGCCTTGCTGGTTGCGCCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTg > 7:22801/1‑147 (MQ=255) gATAACCGCGCCAGCGCTGCGGTTGATCAGCTGCTTGCGGTCCAGACGGGCGCTGGCGCTGAGCATGCCTTGCTGGTTGCGCCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTagg > 7:289348/1‑149 (MQ=255) tAACCGCGCCAGCGCTGCGGTTGATCAGCTGCTTGCGGTCCAGACGGGCGCTGGCGCTGAGCATGCCTTGCTGGTTGCGCCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTaggg > 7:245633/1‑148 (MQ=255) ccGCGCCAGCGCTGCGGTTGATCAGCTGCTTGCGGTCCAGACGGGCGCTGGCGCTGAGCATGCCTTGCTGGTTGCGCCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTaggggagg > 2:189042/1‑149 (MQ=255) ccGCGCCAGCGCTGCGGTTGATCAGCTGCTTGCGGTCCAGACGGGCGCTGGCGCTGAGCATGCCTTGCTGGTTGCGCCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTaggggagg > 6:171973/1‑149 (MQ=255) cgcgCCAGCGCTGCGGTTGATCAGCTGCTTGCGGTCCAGACGGGCGCTGGCGCTGAGCATGCCTTGCTGGTTGCGCCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTaggggaggg < 8:245633/149‑1 (MQ=255) cgcgCCAGCGCTGCGGTTGATCAGCTGCTTGCGGTCCAGACGGGCGCTGGCGCTGAGCATGCCTTGCTGGTTGCGCCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTaggggaggg > 1:84635/1‑149 (MQ=255) gcCAGCGCTGCGGTTGATCAGCTGCTTGCGGTCCAGACGGGCGCTGGCGCTGAGCATGCCTTGCTGGTTGCGCCACATTACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAgggggg > 1:128223/1‑149 (MQ=255) cAGCGCTGCGGTTGATCAGCTGCTTGCGGTCCAGACGGGCGCTGGCGCTGAGCATGCCTTGCTGGTTGCGCCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCt < 2:242164/149‑1 (MQ=255) cAGCGCTGCGGTTGATCAGCTGCTTGCGGTCCAGACGGGCGCTGGCGCTGAGCATGCCTTGCTGGTTGCGCCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCt < 5:374170/149‑1 (MQ=255) gcgcTGCGGTTGATCAGCTGCTTGCGGTCCAGACGGGCGCTGGCGCTGAGCATGCCTTGCTGGTTGCGCCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCtt > 7:222784/1‑148 (MQ=255) gagcTGCGGTTGATCAGCTGCTTGCGGTCCAGACGGGCGCTGGCGCTGAGCATGCCTTGCTGGTTGCGCCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTg < 2:84635/147‑1 (MQ=255) cTGCGGTTGATCAGCTGCTTGCGGTCCAGACGGGCGCTGGCGCTGAGCATGCCTTGCTGGTTGCGCCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGAta < 2:1914/149‑1 (MQ=255) gTTGATCAGCTGCTTGCGGTCCAGACGGGCGCTGGCGCTGAGCATGCCTTGCTGGTTGCGCCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGAtagctta < 8:289348/149‑1 (MQ=255) tCAGCTGCTTGCGGTCCAGACGGGCGCTGGCGCTGAGCATGCCTTGCTGGTTGCGCCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGa > 8:222466/1‑137 (MQ=255) tCAGCTGCTTGCGGTCCAGACGGGCGCTGGCGCTGAGCATGCCTTGCTGGTTGCGCCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGa < 7:222466/137‑1 (MQ=255) tCAGCTGCTTGCGGTCCAGACGGGCGCTGGCGCTGAGCATGCCTTGCTGGTTGCGCCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTAGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGATAGCTTAgctgg > 4:96398/1‑149 (MQ=255) gctgctTGCGGTCCAGACGGGCGCTGGCGCTGAGCATGCCTTGCTGGTTGCGCCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGATAGCTTAgctggctg < 2:128223/149‑1 (MQ=255) ctgctTGCGGTCCAGACGGGCGCTGGCGCTGAGCATGCCTTGCTGGTTGCGCCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCt > 6:316333/1‑130 (MQ=255) ctgctTGCGGTCCAGACGGGCGCTGGCGCTGAGCATGCCTTGCTGGTTGCGCCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCt < 5:316333/130‑1 (MQ=255) ctTGCGGTCCAGACGGGCGCTGGCGCTGAGCATGCCTTGCTGGTTGCGCCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGAt > 7:331438/1‑131 (MQ=255) ctTGCGGTCCAGACGGGCGCTGGCGCTGAGCATGCCTTGCTGGTTGCGCCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGAt < 8:331438/131‑1 (MQ=255) ctTGCGGTCCAGACGGGCGCTGGCGCTGAGCATGCCTTGCTGGTTGCGCCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGATAGCTTAGCTGGCTGgcgc < 8:16151/149‑1 (MQ=255) cGGTCCAGACGGGGGCTGGCGCTGAGCATGCCTTGCTGGTTGCGCCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGATAGCTTAGCTGGCTGGCGCTGa < 2:276000/148‑1 (MQ=255) cGGTCCAGACGGGCGCTGGCGCTGAGCATGCCTTGCTGGTTGCGCCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGATAGCTTAGCTGGCTGGCGCTGa < 8:22801/148‑1 (MQ=255) cGGTCCAGACGGGCGCTGGCGCTGAGCATGCCTTGCTGGTTGCGCCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGATAGCTTAGCTGGCTGGCGCTGa < 8:222784/148‑1 (MQ=255) ctggcgctgAGCATGCCTTGCTGGTTGCGCCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGATAGCTTAGCTGGCTGGCGCTGAGGGCAAAGGTCCAGgc > 4:186691/1‑149 (MQ=255) gcgctgAGCATGCCTTGCTGGTTGCGCCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGATGGGGGCTTGATAGCTTAGCTGGCTGGCGCTGAGGGCAAAGGTCCAGGCGcc < 2:13310/149‑1 (MQ=255) gCCTTGCTGGTTGCGCCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGATAGCTTAGCTGGCTGGCGCTGAGGGCAAAGGTCCAGGCGCCGTAGGGGATGc > 8:320107/1‑149 (MQ=255) cTTGCTGGTTGCGCCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGATAGCTTAGCTGGCTGGCGCTGAGGGCAAAGGTCCAGGCGCCGTAGGGGATGCTg > 4:163740/1‑149 (MQ=255) gCTGGTTGCGCCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGATAGCTTAGCTGGCTGGCGCTGAGGGCAAAGGTCCAGGCGCCGTAGGGGATGCTgta < 1:189042/148‑1 (MQ=255) cTGGTTGCGCCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGATAGCTTAGCTGGCTGGCGCTGAGGGCAAAGGTCCAGGCGCCGTAGGGGATGCTgtag < 3:163740/148‑1 (MQ=255) tGGTTGCGCCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGATAGCTTAGCTGGCTGGCGCTGAGGGCAAAGGTCCAGGCGCCGTAGGGGATGCTgtagta > 3:234183/1‑149 (MQ=255) tGGTTGCGCCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGATAGCTTAGCTGGCTGGCGCTGAGGGCAAAGGTCCAGGCGCCGTAGGGGATGCTgtagt > 3:239152/1‑148 (MQ=255) gcgcCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCGTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGATAGCTTAGCTGGCTGGCGCTGAGGGCAAAGGTCCAGGCGCCGTAGGGGATGCTGTAGTACAAc < 1:389109/148‑1 (MQ=255) aCCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGATAGCTTAGCTGGCTGGCGCTGAGGGCAAAGGTCCAGGCGCCGTAGGGGATGCTGTAGTACAACGATATCCCTTg < 2:53558/149‑1 (MQ=255) cccGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGATAGCTTAGCTGGCTGGCGCTGAGGGCAAAGGTCCAGGCGCCGTAGGGGATGCTGTAGTACAACGATATCCCTTgg > 7:132034/1‑149 (MQ=255) ccGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGATAGCTTAGCTGGCTGGCGCTGAGGGCAAAGGTCCAGGCGCCGTAGGGGATGCTGTAGTACAACGATATCCCTTGGc > 8:308655/1‑149 (MQ=255) gACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGATAGCTTAGCTGGCTGGCGCTGAGGGCAAAGGTCCAGGCGCCGTAGGGGATGCTGTAGTACAACGATATCCCTTGGCTTTgg < 7:320107/148‑1 (MQ=255) acTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCGGTAGGGGAGGGGGGCTTGATAGCTTAGCTGGCTGGCGCTGAGGGCAAAGGTCCAGGCGCCGTAGGGGATGCTGTAGTACAACGATATCCCTTGGCTTTGGCCgg > 6:69449/1‑149 (MQ=255) tCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGATAGCTTAGCTGGCTGGCGCTGAGGGCAAAGGTACAGGCGCCGTAGGGGATGCTGTAGTACAACGATATCCCTTGGCTTTGCCCGGGc > 2:324779/1‑149 (MQ=255) cTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGATAGCTTAGCTGGCTGGCGCTGAGGGCAAAGGTCCAGGCGCCGTAGGGGATGCTGTAGTACAACGATATCCCTTGGCTTTGGCCGGGCGTATc < 1:55063/147‑1 (MQ=255) cTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGATAGCTTAGCTGGCTGGCGCTGAGGGCAAAGGTCCAGGCGCCGTAGGGGATGCTGTAGTACAACGATATCCCTTGGCTTTGGCCGGGCGTATc > 2:55063/1‑147 (MQ=255) gATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGATAGCTTAGCTGGCTGGCGCTGAGGGCAAAGGTCCAGGCGCCGTAGGGGATGCTGTAGTACAACGATATCCCTTGGCTTTGGCCGGGCGTATCGAg > 2:154010/1‑148 (MQ=255) aGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGATAGCTTAGCTGGCTGGCGCTGAGGGCAAAGGTCCAGGCGCCGTAGGGGATGCTGTAGTACAACGATATCCCTTGGCTTTGGCCGGGCGTATCGAGCAcc > 2:262452/1‑149 (MQ=255) gctgctgctGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGATAGCTTAGCTGGCTGGCGCTGAGGGCAAAGGTCCAGGCGCCGTAGGGGATGCTGTAGTACAACGATATCCCTTGGCTTTGGCCGGGCGTATCGAGCAcc < 8:132034/148‑1 (MQ=255) gacaaggctgcCGACGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGATAGCTTAGCTGGCTGGCGCTGAGGGCAAAGGTCCAGGCGCCGTAGGGGATGCTGTAGTACAACGATATCCCTTGGCTTTGGCCGGGCGTATCGAGCACCg > 8:278000/7‑149 (MQ=255) ctgctgctgCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGATAGCTTAGCTGGCTGGCGCTGAGGGCAAAGGTCCAGGCGCCGTAGGGGATGCTGTAGTACAACGATATCCCTTGGCTTTGGCCGGGCGTATCGAGCACCGt < 3:96398/149‑1 (MQ=255) acaaggctgcCGACGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGATAGCTTAGCTGGCTGGCGCTGAGGGCAAAGGTCCAGGCGCCGTAGGGGATGCTGTAGTACAACGATATCCCTTGGCTTTGGCCGGGc > 7:170521/6‑135 (MQ=255) acaaggctgcCGACGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGATAGCTTAGCTGGCTGGCGCTGAGGGCAAAGGTCCAGGCGCCGTAGGGGATGCTGTAGTACAACGATATCCCTTGGCTTTGGCCGGGc < 8:170521/130‑1 (MQ=255) gctgcCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGATAGCTTAGCTGGCTGGCGCTGAGGGCAAAGGTCCAGGCGCCGTAGGGGATGCTGTAGTACAACGATATCCCTTGGCTTTGGCCGGGCGTATCGAGCACCGTGCggg < 5:69449/149‑1 (MQ=255) ctgcCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGATAGCTTAGCTGGCTGGCGCTGAGGGCAAAGGTCCAGGCGCCGTAGGGGATGCTGTAGTACAACGATATCCCTTGGCTTTGGCCGGGCGTATCGAGCACCGTGCgg < 1:154010/147‑1 (MQ=255) gcCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGATAGCTTAGCTGGCTGGCGCTGAGGGCAAAGGTCCAGGCGCCGTAGGGGATGCTGTAGTACAACGATATCCCTTGGCTTTGGCCGGGCGTATCGAGCACCGTGCgg > 8:30311/1‑145 (MQ=255) gcCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGATAGCTTAGCTGGCTGGCGCTGAGGGCAAAGGTCCAGGCGCCGTAGGGGATGCTGTAGTACAACGATATCCCTTGGCTTTGGCCGGGCGTATCGAGCACCGTGCgg < 7:30311/145‑1 (MQ=255) ccGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGATAGCTTAGCTGGCTGGCGCTGAGGGCAAAGGTCCAGGCGCCGTAGGGGATGCTGTAGTACAACGATATCCCTTGGCTTTGGCCGGGCGTATCGAGCACCGTGCGGGCCaa > 7:335721/1‑149 (MQ=255) tCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGATAGCTTAGCTGGCTGGCGCTGAGGGCAAAGGTCCAGGCGCCGTAGGGGATGCTGTAGTACAACGATATCCCTTGGCTTTGGCCGGGCGTATCGAGCACCGTGCGGGCCAACGa > 7:4611/1‑149 (MQ=255) | CGTCGGGCTCTGCTGGACGATAACCGCGCCAGCGCTGCGGTTGATCAGCTGCTTGCGGTCCAGACGGGCGCTGGCGCTGAGCATGCCTTGCTGGTTGCGCCACAATACCCGCTCGACACTCAGGCCCTGATAGCTGCTGCTGCCGTCGGCAGCCTTGTCGCTGTAGGGGAGGGGGGCTTGATAGCTTAGCTGGCTGGCGCTGAGGGCAAAGGTCCAGGCGCCGTAGGGGATGCTGTAGTACAACGATATCCCTTGGCTTTGGCCGGGCGTATCGAGCACCGTGCGGGCCAACGA > NC_002947/1657393‑1657686 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |