Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,690,413 | T→C | 6.1% | T140A (ACG→GCG) ‡ | ydcS ← | polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine‑binding protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,690,413 | 0 | T | C | 6.1% | 190.6 / 2.3 | 65 | T140A (ACG→GCG) ‡ | ydcS | polyamine ABC transporter, periplasmic polyamine‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (32/29); new base C (2/2); total (34/31) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.35e-01 |
CGTCATAGGCTTGCACGCGGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATGCATCGCCC > NC_002947/1690272‑1690549 | cGTCATAGGCTTGCACGCGGCCCTTGTTGGGCTTGCCGGCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCACGCCGTac < 2:140425/149‑1 (MQ=255) tCATAGGCTTGCACGCGGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCACGCCGTacca < 1:155363/149‑3 (MQ=255) aTAGGCTTGCACGCGGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCt < 7:136093/149‑1 (MQ=255) aTAGGCTTGCACGCGGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGATCAAGCTGTTCGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGACGTacacat > 7:143198/1‑147 (MQ=255) gCTTGCACGCGGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCtt > 8:135214/1‑149 (MQ=255) cTTGCACGCGGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGGGCGTGGTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGCTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTg < 1:36546/149‑1 (MQ=255) gcgGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACca < 7:135214/149‑1 (MQ=255) gCCCTTTTTTGGCTTGCCTTCGGGCATGTTCTGCTGCTGGTTTACCACTCTCTAGCTGGTTGGCGCCTGCTTGTAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGGCGCCTCTTGTTCGGCGTTCCGTACACCTGCTTGTCGACcactt < 2:343521/149‑3 (MQ=255) ccTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACAtcc > 8:175948/1‑147 (MQ=255) ccTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATAc > 1:202229/1‑149 (MQ=255) ccTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATAc > 7:1727/1‑149 (MQ=255) ttGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCa > 4:1084/1‑149 (MQ=255) gTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCa < 3:88837/147‑1 (MQ=255) gTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCa < 3:378744/147‑1 (MQ=255) tttGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGc < 2:202229/148‑1 (MQ=255) tttGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGc > 2:69996/1‑148 (MQ=255) gCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGtt < 2:207580/147‑1 (MQ=255) gCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTc < 3:269083/148‑1 (MQ=255) gCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCt > 3:175502/1‑149 (MQ=255) tCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAg > 4:245520/1‑149 (MQ=255) gCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGAACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGACGACGACATACCAGCTACCGTTCTGAAGgcgc > 3:230528/1‑149 (MQ=255) aGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCgg < 7:154240/149‑1 (MQ=255) ggTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCggg < 1:69996/149‑1 (MQ=255) cGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATg < 3:1084/148‑1 (MQ=255) cGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTc > 6:201979/1‑149 (MQ=255) cGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTc < 3:245520/149‑1 (MQ=255) gAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGctct < 4:42218/146‑1 (MQ=255) gAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGctct > 3:42218/1‑146 (MQ=255) gAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTc > 7:379607/1‑148 (MQ=255) gAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTc < 8:379607/148‑1 (MQ=255) acacCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGAta > 1:192255/1‑139 (MQ=255) acacCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGAta < 2:192255/140‑2 (MQ=255) cacGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTgg > 3:54144/1‑149 (MQ=255) cacGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTgg < 5:201979/149‑1 (MQ=255) cacGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTgg > 5:65145/1‑149 (MQ=255) cacGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTT‑CAGTTggg > 3:359698/1‑149 (MQ=255) tCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGAt > 6:233597/1‑148 (MQ=255) aGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAgg > 4:380537/1‑149 (MQ=255) gCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAggg < 6:65145/149‑1 (MQ=255) gggCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAgtgt > 6:90525/1‑149 (MQ=255) ggggcCTGCTTGTCGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAgtgt < 4:230528/145‑1 (MQ=255) ggCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGtt < 4:175502/149‑1 (MQ=255) gcgcCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGtt > 2:114137/1‑148 (MQ=255) cTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCg > 4:113588/1‑149 (MQ=255) ttGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTg > 7:366607/1‑149 (MQ=255) aaGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTAc < 3:113588/149‑1 (MQ=255) ggTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTAcgc > 5:317947/1‑149 (MQ=255) gtgtTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGcc > 3:15657/1‑149 (MQ=255) ggttgtACAGCAGCACGTTTGGCCCACACTGGTACGGCGTGACGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATTCTCTTCCATTTGGGGATCAGGGAAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCtt < 8:143198/144‑1 (MQ=255) tACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTAcgc > 5:33843/1‑136 (MQ=255) tACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTAcgc < 6:33843/136‑1 (MQ=255) tACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTATTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCGGCAAt > 4:214550/1‑149 (MQ=255) agcagcACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATAAGGGCAGTGTTGa > 3:99038/1‑121 (MQ=255) agcagcACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATAAGGGCAGTGTTGa < 4:99038/121‑1 (MQ=255) cagcaCGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTT‑CAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCg < 4:359698/149‑1 (MQ=255) ggCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATg < 4:15657/148‑1 (MQ=255) gCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGATCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATGCa > 1:109574/1‑149 (MQ=255) ccccACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAgtgt > 1:99255/1‑103 (MQ=255) ccccACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAgtgt < 2:99255/103‑1 (MQ=255) ccccACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATGCATc < 8:1727/149‑1 (MQ=255) ccACTGGTACGGCGTGCCGTACGCATGATTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATGCATCGc > 7:61222/1‑149 (MQ=255) gtgTACGGCACGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATGCATCGccc > 2:347816/3‑147 (MQ=255) gtgTACGGCACGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATGCATCGccc > 2:105277/3‑147 (MQ=255) cGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGAt < 6:349386/133‑1 (MQ=255) cGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGAt > 5:349386/1‑133 (MQ=255) | CGTCATAGGCTTGCACGCGGCCCTTGTTTGGCTTGCCGTCGGGCAGGTTCTGCGGCTCGAACACCACGCTCCAGCTGGTGGGCGCCTGCTTGAAGGTATCGGTGTTGTACAGCAGCACGTTTGGCCCCCACTGGTACGGCGTGCCGTACACCTGCTTGTCGACCACATACCAGCTACCGTTCTGCAGGCGCGGGTCGATGCTCTTCCAGTTGGGGATCAGGGCAGTGTTGATCGGCTGTACGCGCTTGCCTGCAATCAGCCGCAGCGATGCATCGCCC > NC_002947/1690272‑1690549 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |