Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,710,935 | T→C | 5.7% | L518L (CTT→CTC) | ppc → | phosphoenolpyruvate carboxylase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,710,935 | 0 | T | C | 5.7% | 206.6 / 2.2 | 70 | L518L (CTT→CTC) | ppc | phosphoenolpyruvate carboxylase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/32); new base C (2/2); total (36/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.11e-01 |
ATCTCCATGGCCGGTGCCGCCTCGGATGTACTGGCGGTGCAACTGTTGCTCAAGGAAGCCGGCCTGACCCGCCCCATGCGCGTGGTGCCACTGTTCGAGACCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTCCGATTCGGCCAAGGACGCCGGCACCACCGCTGCTGCCTGGGCGCAGTACCGGGCTCAGGAAAACCTGGTGCGTATCTGTGCCGAGCA > NC_002947/1710789‑1711081 | aTCTCCATGGCCGGTGCCGCCTCGGATGTACTGGCGGTGCAACTGTTGCTCAAGGAAGCCGGCCTGACCCGCCCCATGCGCGTGGTGCCACTGTTCGAGACCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTgg < 8:219528/149‑1 (MQ=255) ccATGGCCGGTGCCGCCTCGGATGTACTGGCGGTGCAACTGTTGCTCAAGGAAGCCGGCCTGACCCGCCCCATGCGCGTGGTGCCACTGTTCGAGACCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTg > 5:261300/1‑149 (MQ=255) tGGCCGGTGCCGCCTCGGATGTACTGGCGGTGCAACTGTTGCTCAAGGAAGCCGGCCTGACCCGCCCCATGCGCGTGGTGCCACTGTTCGAGACCCTGGCCGACCTCGCCAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGCCCTGCCg > 8:302034/1‑149 (MQ=255) cGGTGCCGCCTCGGATGTTCTGGCGGTGCAACTGTTGCTCAAGGAAGCCGGCCTGACCCGCCCCATGAGCGTGGTGCCACTGTTCGAGACCCTGGCCTACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGATTGTCATGCCggtc > 4:16981/1‑146 (MQ=255) cGGTGCCGCCTCGGATGTACTGGCGGTTCAACTGTTGCTCAAGGAAGCCGGCCTGACCCGCCCCATGCGCGTGGTGCCACTGTTCGAGACCCTGGCCGACCTCGACAACGACTGCCAGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCTGGc > 4:11391/1‑148 (MQ=255) gccTCGGATGTACTGGCGGTGCAACTGTTGCTCAAGGAAGCCGGCCTGACCCGCCCCATGCGCGTGGTGCCACTGTTCGAGACCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACcgcgc < 8:216712/149‑1 (MQ=255) gccTCGGATGTACTGGCGGTGCAACTGTTGCTCAAGGAAGCCGGCCTGACCCGCCCCATGCGCGTGGTGCCACTGTTCGAGACCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACcgcgc < 2:350056/149‑1 (MQ=255) gccTCGGATGTACTGGCGGTGCAACTGTTGCTCAAGGAAGCCGGCCTGACCCGCCCCATGCGCGTGGTGCCACTGTTCGAGACCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACcgcgc > 2:27084/1‑149 (MQ=255) ccTCGGATGTACTGGCGGTGCAACTGTTGCTCAAGGAAGCCGGCCTGACCCGCCCCATGCGCGTGGTGCCACTGTTCGAGACCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACcgcgcg < 6:261300/149‑1 (MQ=255) aCTGGCGGTGCAACTGTTGCTCAAGGAAGCCGGCCTGACCCGCCCCATGCGCGTGGTGCCACTGTTCGAGACCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTCCTTGGCCTGCCGGTCTACCGCGCGGGCCTGcgcg > 6:124333/1‑149 (MQ=255) gCGGTGTAACTGTTGCTCAAGGAAGCCGGCCTGACCCGCCCCATGCGCGTGGTGCCACTGTTCGAGACCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTg < 2:145241/141‑1 (MQ=255) gCGGTGTAACTGTTGCTCAAGGAAGCCGGCCTGACCCGCCCCATGCGCGTGGTGCCACTGTTCGAGACCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTg > 1:145241/1‑141 (MQ=255) gCGGTGCAACTGTTGCTCAAGGAAGCCGGCCTGACCCGCCCCATGCGCGTGGTGCCACTGTTCGAGACCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGTGCGGccc < 2:89005/149‑1 (MQ=255) aaCTGTTGCTCAAGGAAGCCGGCCTGACCCGCCCCATGCGCGTGGTGCCACTGTTCGAGACCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAgg > 1:299973/1‑147 (MQ=255) aCTGTTGCTCAAGGAAGCCGGCCTGACCCGCCCCATGCGCGTGGTGCCACTGTTCGAGACCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCGTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAg < 6:298419/149‑1 (MQ=255) ttGCTCAAGGAAGCCGGCCTGACCCGCCCCATGCGCGTGGTGCCACTGTTCGAGACCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGtga < 6:389202/148‑1 (MQ=255) cTCAAGGAAGCCGGCCTGACCCGCCCCATGCGCGTGGTGCCACTGTTCGAGACCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTCGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTgatgat > 3:76364/1‑149 (MQ=255) cAAGGAAGCCGGCCTGACCAGCCCCATGCGCGTGGTGCCACTGTTCGAGACCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCg > 4:250220/1‑149 (MQ=255) aaGGAAGCCGGCCTGACCCGCCCCATGCGCGTGGTGCCACTGTTCGAGACCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAgg > 4:136816/1‑136 (MQ=255) aaGGAAGCCGGCCTGACCCGCCCCATGCGCGTGGTGCCACTGTTCGAGACCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAgg < 3:136816/136‑1 (MQ=255) aaGGAAGCCGGCCTGACCCGCCCCATGCGCGTGGTGCCACTGTTCGAGACCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCgg > 2:287588/1‑149 (MQ=255) aaGGAAGCCGGCCTGACCCGCCCCATGCGCGTGGTGCCACTGTTCGAGACCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCgg < 2:299973/149‑1 (MQ=255) aaGGAAGCCGGCCTGACCCGCCCCATGCGCGTGGTGCCACTGTTCGAGACCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTCGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCgg < 4:76364/149‑1 (MQ=255) ggAAGCCGGCCTGACCCGCCCCATGCGCGTGGTGCCACTGTTCGAGACCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGc > 3:124203/1‑148 (MQ=255) aaGCCGGCCTGACCCGCCCCATGCGCGTGGTGCCACTGTTCGAGACCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTAc > 5:65614/1‑149 (MQ=255) gCCGGCCTGACCCGCCCCATGCGCGTGGTGCCACTGTTCGAGACCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTc < 1:287588/149‑1 (MQ=255) ccGGCCTGACCCGCCCCATGCGCGTGGTGCCACTGTTCGAGACCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTcc > 2:377745/1‑149 (MQ=255) ccGGCCTGACCCGCCCCATGCGCGTGGTGCCACTGTTCGAGACCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTcc > 4:23544/1‑149 (MQ=255) cGGCCTGACCCGCCCCATGCGCGTGGTGCCACTGTTCGAGACCCTGACCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTcc > 1:89803/1‑148 (MQ=255) ggCCTGACCCGCCCCATGCGCGTGGTGCCACTGTTCGAGACCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTCCGa > 7:99782/1‑149 (MQ=255) gCCCCATGCGCGTGGTGCCACTGTTCGAGACCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTCCGATTCGGCCAAg > 5:142350/1‑149 (MQ=255) gCCCCATGCGCGTGGTGCCACTGTTCGAGACCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTCCGATTCGGCCAAg < 6:66713/149‑1 (MQ=255) cATGCGCGTGGTGCCACTGTTCGAGACCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTCCGATTCGGCCAAGGACg > 7:268474/1‑149 (MQ=255) gcgTGGTGCCACTGTTCGAGACCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGTTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTCCGATTCGGCCAAGGACGCCGGc < 5:124333/149‑1 (MQ=255) gcgTGGTGCCACTGTTCGAGACCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTCGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTCCGATTc > 8:260693/1‑133 (MQ=255) gcgTGGTGCCACTGTTCGAGACCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTCGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTCCGATTc < 7:260693/133‑1 (MQ=255) gtgCCACTGTTCGAGACCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTCCGATTCGGCCAAGGACGCCGGcaccac < 6:65614/149‑1 (MQ=255) ccACTGTTCGAGACCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTCCGATTCGGCCAAGGACGCCGGCACCACCgc < 3:250220/149‑1 (MQ=255) cACTGTTCGAGACCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTCCGATTCGGCCAAGGACGCCGGCACCACCgct > 2:241451/1‑149 (MQ=255) cTGTTCGAGACCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTCCGATTCGGCCAAGGACGCCGGCACCACCgctgc < 1:241451/149‑1 (MQ=255) ttCGAGACCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTCCGATTCGGCCAAGGACGCCGGCACCACCGCtgctgc < 8:268474/149‑1 (MQ=255) ttCGACACCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTCCGATTCGGCCAAGGACGCCGGCACCACCgctgct < 8:343475/147‑1 (MQ=255) cGAGACCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTCCGATTCGGCCAAGGACGCCGGCACCACCGCTGCTGcc < 1:377745/148‑1 (MQ=255) gagaCCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGCTCGGCTACTCCGATTCGGCCAAGGACGCCGGCACCACCGCTGCTGCCTg > 6:392650/1‑149 (MQ=255) agaCCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTCCGATTCGGCCAAGGACGCCGGCACCACCGCTGCTGCCTgg > 7:249592/1‑149 (MQ=255) agaCCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTCCGATTCGGCCAAGGACGCCGGCACCACCGCTGCTGCCTgg > 6:78359/1‑149 (MQ=255) gaCCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGGGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTCCGATTCGGGCAAg < 1:392200/121‑1 (MQ=255) gaCCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCATGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAACAGATGATCGGCTACTCCGATTCGGCCAAg > 2:392200/1‑121 (MQ=255) ccTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTCCGATTCGGCCAAGGACGCCGGcaccac > 8:243640/1‑132 (MQ=255) ccTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTCCGATTCGGCCAAGGACGCCGGcaccac < 7:243640/132‑1 (MQ=255) ccTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTCCGATTCGGCCAAGGACGCCGGCACCACCGCTGCTGCCTGGgcgc > 4:78913/1‑149 (MQ=255) ccTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTCCGATTCGGCCAAGGACGCCGGCACCACCGCTGCTGCCTGGgcgc > 4:173502/1‑149 (MQ=255) ccTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTCCGATTCGGCCAAGGACGCCGGCACCACCGCTGCTGCCTGGgcg > 3:383442/1‑148 (MQ=255) cTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTCCGATTCGGCCAAGGACGCCGGCACCACCGCTGCTGCCTGGGCGCAGTACCGGGc > 6:207887/1‑149 (MQ=255) gACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTCCGATTCGGCCAAGGACGCCGGCACCACCGCTGCTGCCTGGGCGCAGTACCGGGCTc < 8:99782/148‑1 (MQ=255) aaCGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTCCGATTCGGCCAAGGACGCCGGc > 7:194668/1‑111 (MQ=255) aaCGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTCCGATTCGGCCAAGGACGCCGGc < 8:194668/111‑1 (MQ=255) gCCCGGTCATGCAGCGCCTCCTTGGCCTGCCGGGCTACAGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTAGTCGGATTCGGCCAAGGACGCCGGCACCACCGCTGCTGCCTGGGCGCAGTACCGGGCTCAGGaaagcgtg > 8:298170/1‑144 (MQ=255) cccGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTCCGATTCGGCCAAGGACGCCGGCACCACCGCTGCTGCCTGGGCGCGGTACCGGGCTCAGGAAAACCTgg < 3:78913/149‑1 (MQ=255) cccGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTCCGATTCGGCCAAGGACGCCGGCACCACCGCTGCTGCCTGGGCGCGGTACCGGGCTCAGGAAAACCTgg < 3:173502/149‑1 (MQ=255) ggTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTCCGATTCGGCCAAGGACGCCGGCACCACCGCTGCTGCCTGGGCGCAGTACCGGGCTCAGGAAAACCTGGTGc < 4:383442/149‑1 (MQ=255) gTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTCCGATTCGGCCAAGGACGCCGGCACCACCGCTGCTGCCTGGGCGCAGTACCGGGCTCAGGAAAACCTGGTGCg > 4:186071/1‑149 (MQ=255) tCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTCCGATTCGGCCAAGGACGCCGGCACCACCGCTGCTGCCTGGGCGCAGTACCGGGCTCAGGAAAACCTGGTGCGt < 2:89803/149‑1 (MQ=255) cAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTCCGATTCGGCCAAGGACGCCGGCACCACCGCTGCTGCCTGGGCGCAGTACCGGGCTCAGGAAAACCTGGTGCGTATCt < 4:352413/148‑1 (MQ=255) cAGCGCCTGCGTTGCCGGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGTCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTCCGATTCGGCAAAGGACGCCGGCACCACCGCTGCTGCCTGGGCGCAGTACCGGGCTCAGGAAAACCTGGTGCGTATCt < 3:11391/148‑1 (MQ=255) cAGAGCCTGCTTGGCCGGACGGTCTACCGCTCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCTGCTACTCCGATTCGGCCAAGGACGCCGGCACCACCGCTGCTGCCTGGGCGCAGTACCGGGCTCAGGAAAACCTGGTGCGTATCt < 3:16981/148‑1 (MQ=255) gcgcCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTCCGATTCGGCCAAGGACGCCGGCACCACCGCTGCTGCCTGGGCGCAGTACCGGGCTCAGGAAAACCTGGTGCGTATCtgtg > 7:270735/1‑149 (MQ=255) gcCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTCCGATTCGGCCAAGGACGCCGGCACCACCGCTGCTGCCTGGGCGCAGTACCGGGCTCAGGAAAACCTGGTGCGTATCTGTGcc < 7:302034/149‑1 (MQ=255) cTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTCCGATTCGGCCAAGGACGCCGGCACCACCGCTGCTGCCTGGGCGCAGTACCGGGCTCAGGAAAACCTGGTGCGTATCTGTGCCGa < 4:124203/149‑1 (MQ=255) cTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTCCGATTCGGCCAAGGACGCCGGCACCACCGCTGCTGCCTGGGCGCAGTACCGGGCTCAGGAAAACCTGGTGCGTATCTGTGCCCAGCa > 5:129018/1‑149 (MQ=255) | ATCTCCATGGCCGGTGCCGCCTCGGATGTACTGGCGGTGCAACTGTTGCTCAAGGAAGCCGGCCTGACCCGCCCCATGCGCGTGGTGCCACTGTTCGAGACCCTGGCCGACCTCGACAACGCCGGCCCGGTCATGCAGCGCCTGCTTGGCCTGCCGGGCTACCGCGCGGGCCTGCGCGGCCCGCAGGAAGTGATGATCGGCTACTCCGATTCGGCCAAGGACGCCGGCACCACCGCTGCTGCCTGGGCGCAGTACCGGGCTCAGGAAAACCTGGTGCGTATCTGTGCCGAGCA > NC_002947/1710789‑1711081 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |