| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,730,148 | C→A | 5.1% | A314S (GCC→TCC) ‡ | dapE ← | succinyl‑diaminopimelate desuccinylase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,730,148 | 0 | C | A | 5.1% | 257.7 / 3.1 | 78 | A314S (GCC→TCC) ‡ | dapE | succinyl‑diaminopimelate desuccinylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (35/39); new base A (2/2); total (37/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.15e-01 | |||||||||||
CGTCAACCTGGTGGATGGTGGCGTTGACCGGGCCGAGTTCGACCACCTGAGTGCCCATGGTTGCGATGAAGCGGCCATCGGAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTCATGCTTGTCGAGAATCGCCGACACT‑CGGGCCTGCAGGCCTTCGACGGTGGACTCGGTAGAGAAGCG > NC_002947/1730010‑1730295 | cGTCAACCTGGTGGATGGTGGCGTTGACCGGGCCGAGTTCGACCACCTGAGTGCCCATGGTTGCGATGAAGCGGCCATCGGAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCg > 4:5255/1‑149 (MQ=255) tCAACCTGGTGGATGGTGGCGTTGACCGGGCCGAGTTCGACCACCTGAGTGCCCATGGTTGCGATGAAGCGGCCATCGGAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTc < 7:305206/149‑1 (MQ=255) aCCTGGTGGATGGTGGCGTTGACCGGGCCGAGTTCGACCACCTGAGTGCCCATGGTTGCGATGAAGCGGCCATCGGAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGag < 2:181356/149‑1 (MQ=255) ccTGGTGGATGGTGGCGTTGACCGGGCCGAGTTCGACCACCTGAGTGCCCATGGTTGCGATGAAGCGGCCATCGGAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGagc < 3:366846/149‑1 (MQ=255) ccTGGTGGATGGTGGCGTTGACCGGGCCGAGTTCGACCACCTGAGTGCCCATGGTTGCGATGAAGCGGCCATCGGAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGag > 7:327280/1‑148 (MQ=255) gATGGTGGCGTTGACCGGGCCGAGTTCGACCACCTGAGTGCCCATGGTTGCGATGAAGCGGCCATCGGCAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTCTCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTCGACGCCGTGGCGGCCagcatcaagg < 2:391061/149‑7 (MQ=255) ggtggCGTTGACCGGGCCGAGTTCGACCACCTGAGTGCCCATGGTTGCGATGAAGCGGCCATCGGAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCt < 2:229471/148‑1 (MQ=255) ttGACCGGGCCGAGTTCGACCACCTGAGTGCCCATGGTTGCGATGAAGCGGCCATCGGAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGt < 6:112831/149‑1 (MQ=255) ccGAGTTCGACCACCTGAGTGCCCATGGTTGCGATGAAGCGGCCATCGGAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACgg < 2:297604/149‑1 (MQ=255) cGAGTTCGACCACCTGAGTGCCCATGGTTGCGATGAAGCGGCCATCGGAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGc > 1:397098/1‑149 (MQ=255) aGTTCGACCACCTGAGTGCCCATGGTTGCGATGAAGCGGCCATCGGAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAg > 3:7196/1‑149 (MQ=255) ttCGACCACCTGAGTGCCCATGGTTGCGATGAAGCGGCCATCGGAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGCGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGc > 6:396665/1‑149 (MQ=255) ttCGACCACCTGAGTGCCCATGGTTGCGATGAAGCGGCCATCGGAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGc > 7:2746/1‑149 (MQ=255) ttCGACCACCTGAGTGCCCATGGTTGCGATGAAGCGGCCATCGGAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGc > 7:109426/1‑149 (MQ=255) ttCGACCACCTGAGTGCCCATGGTTGCGATGAAGCGGCCAGCGGAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGc > 6:390919/1‑149 (MQ=255) caccTGAGTGCCCATGGTTGCGATGAAGCGGCCATCGGAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAg > 7:150941/1‑132 (MQ=255) caccTGAGTGCCCATGGTTGCGATGAAGCGGCCATCGGAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAg < 8:150941/132‑1 (MQ=255) ccTGAGTGCCCATGGTTGCGATGAAGCGGCCATCGGAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGt < 5:294019/149‑1 (MQ=255) ccTGAGTGCCCATGGTTGCGATGAAGCGGCCATCGGAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGt < 3:5255/149‑1 (MQ=255) ccTGAGTGCCCATGGTTGCGATGAAGCGGCCATCGGAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGt < 8:327280/149‑1 (MQ=255) cTGAGTGCCCATGGTTGCGATGAAGCGGCCATCGGAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTg > 8:244085/1‑149 (MQ=255) cTGAGTGCCCATGGTTGCGATGAAGCGGCCATCGGAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTg < 8:51861/149‑1 (MQ=255) aGTGCCCATGGTTGCGATGAAGCGGCCATCGGAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGcc < 8:109426/148‑1 (MQ=255) gCCCATGGTTGCGATGAAGCGGCCATCGGAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTACGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGt > 1:310682/1‑149 (MQ=255) aTGGTTGCGATGAAGCGGCCATCGGAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTcgac > 5:79929/1‑149 (MQ=255) aTGGTTGCGATGAAGCGGCCATCGGAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTcgac > 3:341792/1‑149 (MQ=255) ttGCGATGAAGCGGCCATCGGAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTcgaccgac > 3:175682/1‑149 (MQ=255) cGATGAAGCGGCCATCGGAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGAcca < 6:356748/148‑1 (MQ=255) gATGAAGCGGCCATCGGAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGAccagt > 6:221412/1‑149 (MQ=255) gATGAAGCGGCCATCGGAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGAccagt > 3:203550/1‑149 (MQ=255) gATGAAGCGGCCATCGGAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGAccagt > 1:311839/1‑149 (MQ=255) aTGAAGCGGCCATCGGAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGAccagtc < 7:252596/149‑1 (MQ=255) aTGAAGCGGCCATCGGAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGAccagtc < 4:7196/149‑1 (MQ=255) aTGAAGCGGCCATCGGAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGAccagtc < 7:21224/149‑1 (MQ=255) gCGGCCATCGGAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGtt > 3:360734/1‑149 (MQ=255) aTCGGAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTCATGCt > 1:362825/1‑149 (MQ=255) tCGGAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTCATGCtt < 4:175682/149‑1 (MQ=255) tCGGAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTCATGCtt < 4:341792/149‑1 (MQ=255) ggAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTCATGCTTGt < 5:221412/149‑1 (MQ=255) gAAGTGCGGCCGCTGGTGGAGTGCTGTGTATCGGGACCGGTGACGCGCTTGATGCTGGCGGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCGTGGTTCTGTCAGGAACGGGAGGCCCGAGAGTGGCCAGTCGACCGAGGAGTCCAGTTc < 5:94523/140‑1 (MQ=255) gAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTc < 7:175875/140‑1 (MQ=255) gAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTc > 8:175875/1‑140 (MQ=255) gAAGTGCCGCCGCTAGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGCTGACGCCCTAGATGCTGGCCCCCACGGCGTCGAGCAGCACGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCCAccagtcaacatc > 6:94523/1‑134 (MQ=255) aGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTCATGCTTGTCga < 4:6942/149‑1 (MQ=255) aGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTCATGCTTGTCga < 2:397098/149‑1 (MQ=255) gccgccGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTCAt < 1:376602/137‑1 (MQ=255) gccgccGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTCAt > 2:376602/1‑137 (MQ=255) ccgccgCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTCATGCTTGTCGAGAAt > 6:268713/1‑149 (MQ=255) gccgcTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCg > 1:65624/1‑82 (MQ=255) gccgcTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCg < 2:65624/82‑1 (MQ=255) gccgcTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTCATGCTTGTCGAGAATCg > 8:16108/1‑149 (MQ=255) gcTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTCATGCTTGTCGAGAATCGCCg > 4:19299/1‑149 (MQ=255) tgtaGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTCATGCTTGTCGAGAATCGCCGACACt < 2:310682/146‑1 (MQ=255) gAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTCATGCTTGTCGAGAATCGCCGACACT‑c < 2:362825/148‑1 (MQ=255) gAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTACCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTCATGCTTGTCGAGAATCGCCGACACT‑Cg > 7:89543/1‑149 (MQ=255) aGGGCTGGGTCGCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGGCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGGCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGGCGACCGACCAGTCCAGTTCATGCTTGTCGAGAATCGCCGACACT‑Cgg < 5:396665/149‑1 (MQ=255) aGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTCATGCTTGTCGAGAATCGCCGACACT‑Cgg < 5:390919/149‑1 (MQ=255) ggTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTCATGCTTGTCGAGAATCGCCGACACT‑CGGGCCTg > 1:246982/1‑147 (MQ=255) gTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTCATGCTTGTCGAGAATCGcc > 1:53764/1‑132 (MQ=255) gTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTCATGCTTGTCGAGAATCGcc < 2:53764/132‑1 (MQ=255) gTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTCATGCTTGTCGAGAATCGCCGACACT‑CGGGCCTGCAg < 3:19299/149‑1 (MQ=255) aCCGGTGACGCCGTTGTTGCTGGCCGCCACGTCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGTCCAGTCCAGTTCATGCTTGTCGAGAATCGCCGACACT‑CGGGCCTGCAGGCCTTCGa < 8:89543/149‑1 (MQ=255) ccGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTCATGCTTGTCGAGAATCGCCGACACT‑CGGGCCTGCAGGCCTTCGAc < 2:246982/149‑1 (MQ=255) ggTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTCATGCTTGTCGAGAATCGCCGACACT‑CGGGCCTGCAGGCCTTCGACgg < 6:79929/149‑1 (MQ=255) gTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTCATGCTTGTCGAGAATCGCCGACACT‑CGGGCCTGCAGGCCTTCGACGGt < 7:244085/149‑1 (MQ=255) gTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTCATGCTTGTCGAGAATCGCCGACACT‑CGGGCCTGCAGGCCTTCGACGGt > 8:369470/1‑149 (MQ=255) aCGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTCATGCTTGTCGAGAATCGCCGACACT‑CGGGCCTGCAGGCCTTCGACGGTGGa < 4:360734/149‑1 (MQ=255) gCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTCATGCTTGTCGAGAATCGCCGACACT‑CGGGCCTGCAGGCCTTCGACGGTGGACt > 8:321301/1‑149 (MQ=255) cccTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTCATGCTTGTCGAGAATCGCCGACACT‑CGGGCCTGCAGGCCTTCGACGGTGGACTc < 5:268713/149‑1 (MQ=255) cccTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTCATGCTTGTCGAGAATCGCCGACACT‑CGGGCCTGCAGGCCTTCGACGGTGGACTc > 4:293350/1‑149 (MQ=255) ccTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTCATGCTTGTCGAGAATCGCCGACACT‑CGGGCCTGCAGGCCTTCGACGGTGGACTCg > 5:377335/1‑149 (MQ=255) cTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTCATGCTTGTCGAGAATCGCCGACACTCCGGGCCTGCAGGCCTTCGACGGTGGACTCg < 1:31193/149‑1 (MQ=255) ttGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTCATGCTTGTCGAGAATCGCCGACACT‑CGGGCCTGCAGGCCTTCGACGGTGGACTCgg > 2:6342/1‑148 (MQ=255) ttGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTCATGCTTGTCGAGAATCGCCGACACT‑CGGGCCTGCAGGCCTTCGACGGTGGACTCGGt > 5:248454/1‑149 (MQ=255) gagctGCTCGACGCCGTGGCGGCCAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTCATGCTTGTCGAGAATCGCCGACACT‑CGGGCCTGCAGGCCTTCGACGGTGGACTCgg > 6:147319/5‑148 (MQ=255) agctGCTCGACGCCGTGGCGGCCAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTCATGCTTGTCGAGAATCGCCGACACT‑CGGGCCTGCAGGCCTTCGACGGTGGACTCGGTa < 5:147319/146‑1 (MQ=255) gATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTCATGCTTGTCGAGAATCGCCGACACT‑CGGGCCTGCAGGCCTTCGACGGTGGACTCGGTa < 1:6342/148‑1 (MQ=255) ctGCTCGACGCCGTGGCGGCCAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTCATGCTTGTCGAGAATCGCCGACACT‑CGGGCCTGCAGGCCTTCGACGGTGGACTCGGTa > 6:165051/2‑147 (MQ=255) gccgccACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTCATGCTTGTCGAGAATCGCCGACACT‑CGGGCCTGCAGGCCTTCGACGGt < 2:285087/131‑1 (MQ=255) gccgccACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTCATGCTTGTCGAGAATCGCCGACACT‑CGGGCCTGCAGGCCTTCGACGGt > 1:285087/1‑131 (MQ=255) gccgccACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTCATGCTTGTCGAGAATCGCCGACACT‑CGGGCCTGCAGGCCTTCGACGGTGGACTCGGTAGAGAAGCg > 2:307333/1‑149 (MQ=255) | CGTCAACCTGGTGGATGGTGGCGTTGACCGGGCCGAGTTCGACCACCTGAGTGCCCATGGTTGCGATGAAGCGGCCATCGGAAGTGCCGCCGCTGGTGGAGGGCTGGGTATCGCGACCGGTGACGCCCTTGATGCTGGCCGCCACGGCGTCGAGCAGCTCGCCTGGTTCGGTCAGGAACGGCAGGCCCGACAGTGCCCAGTCGACCGACCAGTCCAGTTCATGCTTGTCGAGAATCGCCGACACT‑CGGGCCTGCAGGCCTTCGACGGTGGACTCGGTAGAGAAGCG > NC_002947/1730010‑1730295 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |