| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,914,237 | C→G | 5.0% | P202A (CCG→GCG) | pcaQ → | transcriptional regulator PcaQ |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,914,237 | 0 | C | G | 5.0% | 257.9 / 2.2 | 78 | P202A (CCG→GCG) | pcaQ | transcriptional regulator PcaQ |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (37/37); new base G (2/2); total (39/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
ATGACCGACAGCCCACAGATCCAGGGCCTGTCGTTCGAGCACCTGTACAGCGAGTCGATGAGCCTGGTGGTGCGCCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCTGTGGGTGGCGCCGCG > NC_002947/1914090‑1914382 | aTGACCGACAGCCCACAGATCCAGGGCCTGTCGTTCGAGCACCTGTACAGCGAGTCGATGAGCCTGGTGGTGCGCCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTgccgcc > 3:33124/1‑149 (MQ=255)aTGACCGACAGCCCACAGATCCAGGGCCTGTCGTTCGAGCACCTGTACAGCGAGTCGATGAGCCTGGTGGTGCGCCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTgccgcc > 8:6279/1‑149 (MQ=255) gACCGACAGCCCACAGATCCAGGGCCTGTCGTTCGAGCACCTGTACAGCGAGTCGATGAGCCTGGTGGTGCGCCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCgccgg > 2:116028/1‑149 (MQ=255) aCCGACAGCCCACAGATCCAGGGCCTGTCGTTCGAGCACCTGTACAGCGAGTCGATGAGCCTGGTGGTGCGCCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCgccggc < 3:330952/149‑1 (MQ=255) ccGACAGCCCACAGATCCAGGGCCTGTCGTTCGAGCACCTGTACAGCGAGTCGATGAGCCTGGTGGTGCGCCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCgccggcc > 4:25376/1‑149 (MQ=255) aGCCCACAGATCCAGGGCCTGTCGTTGGAGCACCTGTTCAGCGAGTCGATGCGCCTGGTGGTGCGCCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGcac < 1:312214/149‑1 (MQ=255) cccACAGATCCAGGGCCTGTCGTTCGAGCACCTGTACAGCGAGTCGATGAGCCTGGTGGTGCGCCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGcacca > 1:85223/1‑149 (MQ=255) cccACAGATCCAGGGCCTGTCGTTCGAGCACCTGTACAGCGAGTCGATGAGCCTGGTGGTGCGCCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGGGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGcacca < 1:382736/149‑1 (MQ=255) acaGATCCAGGGCCTGTCGTTCGAGCACCTGTACAGCGAGTCGATGAGCCTGGTGGTGCGCCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCAccacca > 1:248891/1‑149 (MQ=255) ccAGGGCCTGTCGTTCGAGCACCTGTACAGCGAGTCGATGAGCCTGGTGGTGCGCCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGt > 6:194305/1‑148 (MQ=255) cAGGGCCTGTCGTTCGAGCACCTGTACAGCGAGTCGATGAGCCTGGTGGTGCGCCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGt > 6:396265/1‑147 (MQ=255) cAGGGCCTGTCGTTCGAGCACCTGTACAGCGAGTCGATGAGCCTGGTGGTGCGCCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCa < 7:6279/149‑1 (MQ=255) cAGGGCCTGTCGTTCGAGCACCTGTACAGCGAGTCGATGAGCCTGGTGGTGCGCCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCa < 5:239108/149‑1 (MQ=255) ggCCTGTCGTTCGAGCACCTGTACAGCGAGTCGATGAGCCTGGTGGTGCGCCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCa > 1:48943/1‑149 (MQ=255) ggCCTGTCGTTCGAGCACCTGTACAGCGAGTCGATGAGCCTGGTGGTGCGCCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCa > 1:48944/1‑149 (MQ=255) gTTCGAGCACCTGTACAGCGAGTCGATGAGCCTGGTGGTGCGCCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGGCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGa > 3:176351/1‑147 (MQ=255) aCCTGTACAGCGAGTCGATGAGCCTGGTGGTGCGCCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGa > 7:88999/1‑139 (MQ=255) aCCTGTACAGCGAGTCGATGAGCCTGGTGGTGCGCCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGa < 8:88999/139‑1 (MQ=255) aCCTGTACAGCGAGTCGATGAGCCTGGTGGTGCGCCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGttt < 2:277874/149‑1 (MQ=255) aCCTGTACAGCGAGTCGATGAGCCTGGTGGTGCGCCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGttt > 6:139759/1‑149 (MQ=255) aCCTGTACAGCGAGTCGATGAGCCTGGTGGTGCGCCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGttt > 8:25448/1‑149 (MQ=255) cTGTACAGCGAGTCGATGAGCCTGGTGGTGCGCCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTtgt < 7:24739/149‑1 (MQ=255) gTACAGCGAGTCGATGAGCCTGGTGGTGCGCCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGt < 5:154997/124‑1 (MQ=255) tACAGCGAGTCGATGAGCCTGGTGGTGCGCCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTATCCCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTtgt < 1:116028/148‑1 (MQ=255) gCGAGTCGATGAGCCTGGTGGTGCGCCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACTGCGTGTTTGTGCAATGc > 5:344480/1‑149 (MQ=255) tCGATGAGCCTGGTGGTGCGCCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCg > 7:176736/1‑145 (MQ=255) tCGATGAGCCTGGTGGTGCGCCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCg < 8:176736/145‑1 (MQ=255) aGCCTGGTGGTGCGCCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGGCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGAt < 4:176351/149‑1 (MQ=255) cTGGTGGTGCGCCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGGTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGcc < 2:344065/149‑1 (MQ=255) ggtggtGCGCCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCgg > 1:354284/1‑149 (MQ=255) ggtggtGCGCCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCgg > 4:5209/1‑149 (MQ=255) ggtggtGCGCCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCgg < 4:33124/149‑1 (MQ=255) tggtgCGCCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCAAGATGCCggac > 5:248311/1‑147 (MQ=255) gtgCGCCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGccc < 2:85223/148‑1 (MQ=255) gtgCGCCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGcc > 2:205624/1‑147 (MQ=255) ccGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCt < 1:196394/149‑1 (MQ=255) gggTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTgg < 2:354284/149‑1 (MQ=255) gggTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATACCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTg > 7:303016/1‑148 (MQ=255) cACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAAc > 8:154606/1‑149 (MQ=255) aCCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAAcc < 5:396265/149‑1 (MQ=255) aCCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAAcc > 3:44603/1‑149 (MQ=255) ccGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACCCt > 7:386677/1‑149 (MQ=255) ccGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACCCt > 8:251881/1‑149 (MQ=255) cGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACCCTg > 7:319997/1‑149 (MQ=255) gctgctGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGGGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACCCTGt < 5:304825/149‑1 (MQ=255) ctgGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACCCTGTCGc < 5:262378/148‑1 (MQ=255) ctgGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACCCTGTCGCt > 5:86315/1‑149 (MQ=255) gCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCAACATACGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACCCTGTCGCTgg < 6:41536/148‑1 (MQ=255) ccAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACCCTGTCGCTGGcc < 3:25376/149‑1 (MQ=255) cACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACCCTGTCGCTGGCCCTGa > 3:59942/1‑149 (MQ=255) cGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACCCTGTCGCTGGCCCTGAGc < 8:386677/149‑1 (MQ=255) gCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACCCTGTCGCTGGCCCTGAGcc < 5:194305/149‑1 (MQ=255) gCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACCCTGTCGCTGGCCCTGAGcc > 5:74566/1‑149 (MQ=255) gCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACCCTGTCGCTGGCCCTGAGcc < 7:154606/149‑1 (MQ=255) gCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACCCTGTCGCTGGCCCTGAGcc > 6:212407/1‑149 (MQ=255) gCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATACGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACCCTGTCGCTGGCCCTGAGcc > 4:349340/1‑149 (MQ=255) tGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGgcgc < 6:86315/149‑1 (MQ=255) tGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGgcgc < 3:5209/149‑1 (MQ=255) cGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACct < 5:139759/149‑1 (MQ=255) gACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACctgctg < 2:248891/149‑1 (MQ=255) gACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACctgctg > 4:362820/1‑149 (MQ=255) ggTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTa < 2:48944/149‑1 (MQ=255) ggTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTa < 2:48943/149‑1 (MQ=255) ggTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATACCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGGATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTa < 8:303016/149‑1 (MQ=255) gTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCAGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACACTGTAGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAg > 5:140274/1‑149 (MQ=255) tGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGc > 1:97479/1‑149 (MQ=255) ggCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGAt > 7:113014/1‑149 (MQ=255) ggCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGAt < 7:25448/149‑1 (MQ=255) gCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACCCt < 3:246762/108‑1 (MQ=255) gCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACCCt > 4:246762/1‑108 (MQ=255) gCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATg < 1:205624/149‑1 (MQ=255) gCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCACGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATg > 6:293391/1‑149 (MQ=255) cGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATgg < 6:74566/149‑1 (MQ=255) gTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCgg < 2:41135/73‑1 (MQ=255) gTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCgg > 1:41135/1‑73 (MQ=255) cGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCTgtgg > 7:103575/1‑149 (MQ=255) cTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCACGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCTgtgggt < 5:293391/149‑1 (MQ=255) tggtggtgCCGGCCGGCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTAc < 7:170642/120‑1 (MQ=255) tggtggtgCCGGCCGGCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTAc > 8:170642/3‑122 (MQ=255) gtgCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCTGTGGGTGgc > 7:26277/1‑149 (MQ=255) gctgcCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGaaa < 2:50599/89‑1 (MQ=255) gctgcCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGaaa > 1:50599/1‑89 (MQ=255) tgcCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCTGTGGGTGGcgccg > 3:262426/1‑149 (MQ=255) ccgccgGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCTGTGGGTGGcgccgc < 4:44603/148‑1 (MQ=255) ccgccgGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCTGTGGGTGGCGCcgcg > 7:260529/1‑149 (MQ=255) | ATGACCGACAGCCCACAGATCCAGGGCCTGTCGTTCGAGCACCTGTACAGCGAGTCGATGAGCCTGGTGGTGCGCCCGGGTCACCCGCTGCTGGCCAGCACGCCCGTGGAGCGAGGACAGGTGGGGCGTTA‑‑CCCGCTTGTGCTGCCGCCGGCCGGCACCACCATCCGTCAGCATGCCGACAGCCTGTTTGTGCAATGCGGCATCCAGATGCCGGCCCAGCGCCTGGAAACCCTGTCGCTGGCCCTGAGCCGGCGCTACCTGCTGGGTAGCGATGGCCTGTGGGTGGCGCCGCG > NC_002947/1914090‑1914382 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |