| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,171,668 | G→A | 6.4% | intergenic (+203/+200) | PP_5484 → / ← PP_1924 | hypothetical protein/phosphinothricin N‑acetyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,171,668 | 0 | G | A | 6.4% | 186.3 / 2.0 | 62 | intergenic (+203/+200) | PP_5484/PP_1924 | hypothetical protein/phosphinothricin N‑acetyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (29/29); new base A (2/2); total (31/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.67e-01 | |||||||||||
GTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGG > NC_002947/2171520‑2171811 | gggggggTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCtgg < 8:271374/147‑1 (MQ=255) ggggTAGGGCGGGGTAACGACTTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCtggtg < 4:298508/148‑1 (MQ=255) gTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCACCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGATGGTag < 5:405601/149‑2 (MQ=255) ggggTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGa < 2:255122/149‑1 (MQ=255) ggTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCTCGTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGAc < 1:5254/149‑1 (MQ=255) ggTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGAcc > 2:297901/1‑149 (MQ=255) ggTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGAcc < 2:97487/149‑1 (MQ=255) gacgTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCAGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGATACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGTTTGAACGTAAcc > 4:53821/1‑149 (MQ=255) gacgTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGAATGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAcc < 5:351635/149‑1 (MQ=255) acgTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCg < 7:91624/149‑1 (MQ=255) ccGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAg < 1:395671/149‑1 (MQ=255) ccGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAg > 5:354275/1‑149 (MQ=255) ccGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGGCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAg < 3:124199/149‑1 (MQ=255) aggTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAgg < 3:53821/148‑1 (MQ=255) cGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCTAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGttt < 7:273973/148‑1 (MQ=255) tctTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAc > 6:342426/1‑130 (MQ=255) tctTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAAc < 5:342426/130‑1 (MQ=255) tATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTaa < 1:297901/146‑1 (MQ=255) aTGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGa > 7:120509/1‑149 (MQ=255) tCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACgg > 8:367468/1‑149 (MQ=255) tCAGCAACACCCGGATTGAGCATCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACgg < 8:348142/149‑1 (MQ=255) acCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCgg > 8:42989/1‑131 (MQ=255) acCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCgg < 7:42989/131‑1 (MQ=255) ccGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCg < 3:293093/114‑1 (MQ=255) ccGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCg > 4:293093/1‑114 (MQ=255) ccGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCACGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCaaa > 4:282195/1‑149 (MQ=255) cGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTCGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCAAACCGGCTGCATAgc < 6:235222/149‑1 (MQ=255) gCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCAAACCGGCTGCATAgc < 6:354275/148‑1 (MQ=255) aTGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCAt > 5:3982/1‑149 (MQ=255) aTGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCAt > 5:207716/1‑149 (MQ=255) aaTAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAg > 5:408165/1‑149 (MQ=255) aaTAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAg > 8:158134/1‑149 (MQ=255) aaTAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAg > 4:236572/1‑149 (MQ=255) tAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAggg > 1:344808/1‑149 (MQ=255) gACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTtggt < 6:408165/149‑1 (MQ=255) ctctCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTggtggt > 1:4461/1‑147 (MQ=255) ctctCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTggtggt > 1:73480/1‑147 (MQ=255) tcCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCT‑GTCGACGAGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAgc > 1:99867/1‑149 (MQ=255) cAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATc < 8:249508/149‑1 (MQ=255) ccccACTTGGCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCtt > 3:272934/1‑149 (MQ=255) cACTTGGCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTgg < 2:344808/149‑1 (MQ=255) cTTGGCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGt < 8:120509/149‑1 (MQ=255) aaccggtACCACCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGATGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGt > 1:150972/7‑149 (MQ=255) ttGGCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTc > 3:43551/1‑149 (MQ=255) gCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGa < 3:282195/148‑1 (MQ=255) cTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGAtt < 2:4461/149‑1 (MQ=255) cTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGAtt > 4:298074/1‑149 (MQ=255) tACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTg > 8:161280/1‑149 (MQ=255) accaccAGCT‑GTCGAC‑AGCTGATGGTACCGGTTGGCCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTg > 7:1174/1‑148 (MQ=255) ccATCAGCT‑GTCGAC‑AGCGGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTg < 3:39919/147‑1 (MQ=255) aTCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCttt < 3:356655/135‑1 (MQ=255) aTCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCttt > 4:356655/1‑135 (MQ=255) aGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACggg < 6:83351/125‑1 (MQ=255) aGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACggg > 5:83351/1‑125 (MQ=255) aGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCa < 7:110334/144‑1 (MQ=255) aGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCa > 8:110334/1‑144 (MQ=255) gTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGGGTTTGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCAAACCGGCTTCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTc < 3:173205/147‑1 (MQ=255) gTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCAACACGGCCACATTTGGGGCGATTCAAGCCGGTCa > 4:173205/1‑148 (MQ=255) tCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGcc < 3:227427/142‑1 (MQ=255) tCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGcc > 4:227427/1‑142 (MQ=255) tCGAC‑AGCTGATGGTACCGGTTGGCCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCAc < 8:1174/148‑1 (MQ=255) gAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGGCCCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTATGGGTCGAATGCGGCCTGTcgtga > 3:267546/1‑145 (MQ=255) gAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGa > 2:246894/1‑148 (MQ=255) aGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAgg < 6:207716/149‑1 (MQ=255) gtggtACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGa < 4:216502/124‑1 (MQ=255) gtggtACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGa > 3:216502/1‑124 (MQ=255) | GTGGGGGTAGGGCGGGGTAACGACGTGCCGGTTACGTGCTCTTTATGTCAGCAACACCCGGATTGAGCGTCGCCATGCAATAGCCGACAGCTCTCCCGCCGAGACAGCTGGCTATCCCCACTTGGCTACCATCAGCT‑GTCGAC‑AGCTGGTGGTACCGGTTGACCGTAACCGGTCAGGCGTTTGCGGTAAGGGACGG‑CCCCCCCAAACCGGCTGCATAGCGCATCCAGGGTTGGTGGTTAGCCGCCCCCCCATCACGGGCAGCTTTGGGTCGATTGCAGCCGGTCACGACAGG > NC_002947/2171520‑2171811 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |