| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,273,052 | A→G | 10.3% | intergenic (+17/+274) | PP_2003 → / ← PP_2004 | hypothetical protein/AraC family transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,273,052 | 0 | A | G | 10.3% | 174.5 / 10.4 | 69 | intergenic (+17/+274) | PP_2003/PP_2004 | hypothetical protein/AraC family transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (27/34); new base G (2/5); total (30/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.90e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.77e-01 | |||||||||||
AGCGAGGCGCCAGCGGCGCCGGTGGTGGATGACAGCCAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCTGTAAACATCCCCTGTTACAGACGCCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGTCATCATCCCTTCATCCCACCTGCTTAGGCTGAAGG > NC_002947/2272904‑2273200 | aGCGAGGCGCCAGCGGCGCCGGTGGTGGATGACAGCCAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGa < 4:339726/149‑1 (MQ=255) gCGAGGCGCCAGCGGCGCCGGTGGTGGATGACAGCCAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCTGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGAc < 1:89805/149‑1 (MQ=255) gCGAGGCGCCAGCGGCGCCGGTGGTGGATGACAGCCAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGAc < 8:39695/149‑1 (MQ=255) cGAGGCGCCAGCGGCGCCGGTGGTGGATGACAGCCAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGAcc > 5:255148/1‑149 (MQ=255) gAGGCGCCAGCGGCGCCGGTGGTGGATGACAGCCAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGGcc > 4:581/1‑148 (MQ=255) ccAGCGGCGCCGGTGGTGGATGACAGCCAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGc > 8:18536/1‑149 (MQ=255) cAGCGGCGCCGGTGGTGGATGACAGCCAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGAGCCTTTCGcc < 4:374859/149‑1 (MQ=255) cAGCGGCGCCGGTGGTGGATGACAGCCAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCATCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGcc > 5:412030/1‑149 (MQ=255) aGCGGCGCCGGTGGTGGATGACAGCCAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCg < 3:113269/146‑1 (MQ=255) aGCGGCGCCGGTGGTGGATGACAGCCAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCg > 4:113269/1‑146 (MQ=255) gcggcgCCGGTGGTGGATGACAGCCAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCgg < 6:273914/149‑1 (MQ=255) gcggcgCCGGTGGTGGATGACAGCCAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCgg < 7:280894/149‑1 (MQ=255) gtggtgGATGACAGCCAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCcgcg < 6:255148/149‑1 (MQ=255) tggtggATGACAGCCAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCcgcg > 6:138397/1‑148 (MQ=255) gtggATGACAGCCAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGGCCCTTTCGCGGGCTGCCGGCGaaa < 2:382986/149‑1 (MQ=255) gtggATGACAGCCAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGaaa < 1:394918/149‑1 (MQ=255) tggATGACAGCCAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGGCCCTTTCGCGGGCTGCCGGCGAAAg < 2:119182/149‑1 (MQ=255) aTGACAGCCAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGc < 3:370332/149‑1 (MQ=255) tGACAGCCAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGGCCCTTTCGCGGGCTGCCGGCGAAAgggtc < 3:581/149‑3 (MQ=255) tGACAGCCAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGcc > 1:166985/1‑149 (MQ=255) gACAGCCAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCg > 6:401334/1‑149 (MQ=255) aCAGCCAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCg < 5:138397/148‑1 (MQ=255) aGCCAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCGGCa > 3:262791/1‑130 (MQ=255) aGCCAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCGGCa < 4:262791/130‑1 (MQ=255) aGCCAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGtt > 3:57539/1‑149 (MQ=255) aGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCCACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGttaacg > 2:63213/1‑145 (MQ=255) gggTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGTTTACAGCCTGAACCGGCCCTTTCGCGGGCTGCCGGCGAAAGGGTCGGTTCAg < 3:249758/149‑1 (MQ=25) ggctCGCAGCCTGCGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCt < 4:231644/146‑1 (MQ=255) tgGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCTGTAAACATccc < 3:105192/147‑1 (MQ=255) cccGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCTGTAAACATCCCCTGTTa < 5:69871/149‑1 (MQ=255) gccgAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCAGAACCCACCCATTAGCCCGCACCCCCCGAAAAGGCCCGTTCAGGGGGTTAACAAACCCAGTTAAAGAccc > 2:143825/1‑147 (MQ=255) cgAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGCCCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCTGTAAACATCCCCTGTTACAGACGccc > 5:117788/1‑149 (MQ=255) cACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCCACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCTGTAAACATCCCCTGTTACAGACGCCCCGCGATa > 8:383165/1‑148 (MQ=255) ccATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGACCCATTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCTGTAAACATGCCCGGTTACCGACGCCCCGCGATAACtt > 3:347249/1‑149 (MQ=255) ccATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAAACCACCCATTAGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTGAGGCTGTAAACATCCCCGGTTACAGACGCCCCGCGATAAAtt > 1:153100/1‑149 (MQ=255) aTTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCTGTAAACATCCCCTGTTACAGACGCCCCGCGATAACTTTc > 1:108363/1‑149 (MQ=255) ttCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCTGTAAACATCCCCTGTTACAGACGCCCCGCGATAACTTTCt < 3:301992/149‑1 (MQ=255) cAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCTGTAAACATCCCCTGTTACAGACGCCCCGCGATAACTTTCTg < 7:18536/148‑1 (MQ=255) ggTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCTGTAAACATCCCCTGTTACAGACGCCCCGCGATAACTTTCTGAac < 5:401334/149‑1 (MQ=255) gTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCTGTAAACATCACCTGTTACAGACGCCCCGCGATAACTTTCTGAaca < 2:166985/149‑1 (MQ=255) tGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCTGTAAACATCCCCTGTTACAGACGCCCCGCGATAACTTTCTGAACTCCTGCTACGt < 6:117788/148‑1 (MQ=255) cccAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCACTTTGATGTGT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCGTCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCTGTAAACATCCCCTGTTACAGACGCCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGttt < 3:280881/148‑1 (MQ=255) ccAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGGCCCTTTCGCGGGCTGCCGGCGaaa > 4:292433/1‑75 (MQ=25) ccAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGGCCCTTTCGCGGGCTGCCGGCGaaa < 3:292433/75‑1 (MQ=25) ccAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCTGTAAACATCCCCTGTTACAGACGCCCCGCGATAACttt < 7:75347/128‑1 (MQ=255) cggccgAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCTGTAAACATCCCCTGTTACAGACGCCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTc < 7:383165/149‑1 (MQ=255) gccgAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCTGTAAACATCCCCTGTTACAGACGCCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCAt < 1:143825/149‑1 (MQ=255) gccgccgccCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCTGTAAACATCCCCTGTTACAGACGCCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCtt < 4:57539/149‑1 (MQ=255) cgccgccCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCTGTAAACATCCCCTGTTa < 5:16924/92‑1 (MQ=255) gccgccCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCTGTAAACATCCCCTGTTACAGACGCCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTTCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGtc < 6:412030/149‑1 (MQ=255) gccgccCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCTGTAAACATCCCCTGTTACAGACGCCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGtc < 2:153100/149‑1 (MQ=255) cccccTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCTGTAAACATCCCCTGTTACAGACGCCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGtcatca > 8:321343/1‑149 (MQ=255) cccccTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAAACGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAATGGCCGGTTCAGCCTGTAAACATCCCCTGTTACAGACGCCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGtcatca < 7:104129/149‑1 (MQ=255) gccgttGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCTGTAAACATCCCCTGTTACAGACGCACCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTAAGTTTACCACTCATAAGCTTGTCATCATCCCt < 1:349847/144‑1 (MQ=255) cctTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAACGGCCGGTTCAGGCTGTAAACATCCCCTGTTACAGACGCCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGTCATCATCCCtt > 2:881/1‑148 (MQ=255) ctTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCTGTAAACATCCCCTGTTACAGACGCTCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGTCATCATCCCTTCa > 3:161743/1‑149 (MQ=255) ctTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCTGTAAACATCCCCTGTTACAGACGCCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGt < 7:294174/136‑1 (MQ=255) gATGGGT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCTGTAAACATCCCCTGTTACAGACGCCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGTCATCATCCCTTCATccc > 2:121134/1‑149 (MQ=255) ggT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGTGCCGGTTCAGGCTGTAAACATCCCCTGTTACAGACGCCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGTCATCATCCCTTCATCCCACCt < 1:63213/149‑1 (MQ=255) t‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCTGTAAACATCCCCTGTTACAGACGCCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTa < 8:95269/110‑1 (MQ=255) t‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCTGTAAACATCCCCTGTTACAGACGCCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTa > 7:95269/1‑110 (MQ=255) t‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCTGTAAACATCCCCTGTTACAGACGCCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGTCATCATACCTTCATCCCACCTGc > 8:363060/1‑149 (MQ=255) t‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCTGTAAACATCCCCTGTTACAGACGCCCCGCGATAACTTTCTGAACACATGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGTCATCATCCCTTCATCCCACCTGc > 6:210681/1‑149 (MQ=255) t‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCTGTAAACAGCCCCTGTTACAGACGCCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGATTACCACTCATAAGCTTGTCATCATCCCTTCATCCCCCCTGc > 7:182961/1‑149 (MQ=255) ccTGAACCGACCCTTTCTCCGTCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTAAGGCTGTAAAAATCACCTGTTACAGACGCAACGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACTTTTACCACTCATAAGCTTGTCATCATCCCTTCATCCCACCTGCtt < 3:43878/148‑1 (MQ=255) ccTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGTCCGGTTCAGGCTGTAAAAATCCCCTTTTACAGACGCCCAGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGTAATCATCACTTCATACCACATGCtt > 4:43878/1‑148 (MQ=255) cTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCTGTAAACATCCCCTGTTACAGACGCCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGTCATCATCCCTTCATc > 3:56355/1‑137 (MQ=255) cTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCTGTAAACATCCCCTGTTACAGACGCCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGTCATCATCCCTTCATc < 4:56355/137‑1 (MQ=255) cTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCTGTAAACATCCCCTGTTACAGACGCCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGTCATCATCCCTTCATCCCACCTGCTTAg > 8:245744/1‑149 (MQ=255) cGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCTGTAAACATCCCCTGTTACAGACGCCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGTCATCATCCCTTCATCCCACCTGCTTAGGCTg > 5:199236/1‑147 (MQ=255) aCCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCTGTAAACATCCCCTGTTACAGACGCCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGTCATCATCCCTTCATCCCACCTGCTTAGGCTGAAgg > 2:15496/1‑149 (MQ=255) aCCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCTGTAAACATCCCCTGTTACAGACGCCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGTCATCATCCCTTCATCCCACCTGCTTAGGCTGAAgg > 2:366647/1‑149 (MQ=255) | AGCGAGGCGCCAGCGGCGCCGGTGGTGGATGACAGCCAGGGTTCGCAGCCTGTGGCCCCGCCGGCCGAAGCTGCACCCATTCAGGTGCAGCAGGATGCCCAGCCGGCCGAGGCCGCCGCCCCCTCCCTTTGATGGGT‑C‑GCCTGAACCGACCCTTTCGCCGGCAGCCCGCGAAAGGGCCGGTTCAGGCTGTAAACATCCCCTGTTACAGACGCCCCGCGATAACTTTCTGAACACCTGCTACGTTTACCACTCATAAGCTTGTCATCATCCCTTCATCCCACCTGCTTAGGCTGAAGG > NC_002947/2272904‑2273200 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |