| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,350,525 | T→C | 6.0% | L911P (CTG→CCG) | PP_2065 → | multidrug RND transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,350,525 | 0 | T | C | 6.0% | 196.2 / 2.5 | 67 | L911P (CTG→CCG) | PP_2065 | multidrug RND transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (32/31); new base C (2/2); total (34/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.41e-01 | |||||||||||
CTGGCGGCGCAGTACGAAAGCCTGGTCGACCCCCTGATCATTCTGGTGACCGTGCCGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGACTTTTGGCGTG > NC_002947/2350377‑2350673 | cTGGCGGCGCAGTACGAAAGCCTGGTCGACCCCCTGATCATTCTGGTGACCGTGCCGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCt < 7:186980/149‑1 (MQ=255)cTGGCGGCGCAGCACGAAAGCCTGCTCGACCCCCTGATCATTCTGGTGACCGTGCCGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCt < 2:305171/149‑1 (MQ=255) ggcgCAGTACGAAAGCCTGGTCGACCCCCTGATCATTCTGGTGACCGTGCCGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGAt > 2:61587/1‑147 (MQ=255) cgcAGTACGAAAGCCTGGTCGACCCCCTGATCATTCTGGTGACCGTGCCGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCAGGCCGATCagc < 5:262670/149‑1 (MQ=255) gCCTGGTCGACCCCCTGATCATTCTGGTGACCGTGCCGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATc < 7:7978/149‑1 (MQ=255) gCCTGGTCGACCCCCTGATCATTCTGGTGACCGTGCCGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATc < 7:2111/149‑1 (MQ=255) gTCGACCCCCTGATCATTCTGGTGACCGTGCCGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGAt > 3:206453/1‑149 (MQ=255) gACCCCCTGATCATTCTGGTGACCGTGCCGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGAtgg < 8:116832/148‑1 (MQ=255) gACCCCCTGATCATTCTGGTGACCGTGCCGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGAtgg < 4:206453/148‑1 (MQ=255) acccTGATCATTCTGGTGAACGTGCCGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCATGATGGTGGc > 8:291695/2‑149 (MQ=255) ccTGATCATTCTGGTGACCGTGCCGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGAGCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGt > 8:103291/1‑149 (MQ=255) aTTCTGGTGACCGTGCCGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCaa > 6:207811/1‑149 (MQ=255) aTTCTGGTGACCGTGCCGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCaa > 5:62674/1‑149 (MQ=255) ttCTGGTGACCGTGCCGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAAc < 5:376864/149‑1 (MQ=255) ttCTGGTGACCGTGCCGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAAc > 5:202580/1‑149 (MQ=255) ttCTGGTGACCGTGCCGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAAc > 5:16433/1‑149 (MQ=255) tGGTGACCGTGCCGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCagcaag > 8:287975/1‑116 (MQ=255) tGGTGACCGTGCCGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCagcaag < 7:287975/116‑1 (MQ=255) gTGACCGTGCCGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACgaga < 6:16433/148‑1 (MQ=255) gTGACCGTGCCGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGAt > 1:11873/1‑149 (MQ=255) aCCGTGCCGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCa < 1:336242/149‑1 (MQ=255) aCCGTGCCGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACACTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGAtt > 1:154690/1‑147 (MQ=255) tGCCGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACgaga < 7:270277/141‑1 (MQ=255) tGCCGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACgaga > 8:270277/1‑141 (MQ=255) cGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTgcgc < 5:292115/149‑1 (MQ=255) gCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGcgcg < 1:211159/149‑1 (MQ=255) cTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGa > 6:259323/1‑149 (MQ=255) tCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCTTTTGTTTATGGTTTGGGCCACGATGAAGATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCg < 2:15485/124‑1 (MQ=25) tCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCg > 1:15485/1‑124 (MQ=255) gATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAAcc > 4:132387/1‑149 (MQ=255) tGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCt > 5:6999/1‑146 (MQ=255) tGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCt < 6:6999/146‑1 (MQ=255) cGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATc < 5:207811/149‑1 (MQ=255) gTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGt > 4:364118/1‑149 (MQ=255) gctgcCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTgccg > 1:260915/1‑149 (MQ=255) ctgcCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTgccgc > 4:94209/1‑149 (MQ=255) ccGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCATGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCAt < 6:62674/149‑1 (MQ=255) cgctggcgctggGCTGGGCCACGCTGACCATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCAtt < 4:55285/149‑1 (MQ=255) ggcgctggGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTc < 5:259323/149‑1 (MQ=255) cgctggGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGt < 3:364118/149‑1 (MQ=255) gctgggctggGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTg > 4:44853/1‑149 (MQ=255) cttggctgggcGACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTgc < 8:236445/146‑1 (MQ=255) ggctgggcCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTgcggc < 2:260915/149‑1 (MQ=255) gggcCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCa > 2:253282/1‑148 (MQ=255) gcCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCaaa > 8:20009/1‑148 (MQ=255) gcCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAAt < 1:61587/149‑1 (MQ=255) ccgacTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATAc < 2:319777/145‑1 (MQ=255) aaCATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTg < 3:132387/147‑1 (MQ=255) aCATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGt < 2:65452/124‑1 (MQ=255) aCATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGt > 1:65452/1‑124 (MQ=255) acacacAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCa < 1:403991/146‑1 (MQ=255) acacacAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCa > 2:403991/1‑146 (MQ=255) cacacaGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCa < 6:202580/145‑1 (MQ=255) acacaGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCt > 5:235004/1‑149 (MQ=255) acaGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCtga > 3:59832/1‑149 (MQ=255) acaGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGGGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCtga < 8:287769/149‑1 (MQ=255) aTTGGCCAGGTCACGCTGAACCGCCTGATCACCAAGCACGCTAACCTGATCGTGCCCATCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATAGTTCGTGCGGCGCAAATCACCAGGCGGCCAGTGCTGAAGAc > 4:272205/1‑149 (MQ=255) ccTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACGAcgg > 4:87437/1‑149 (MQ=255) tGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGTTGATGACCAcggcg > 8:385926/1‑149 (MQ=255) gcttgCTGATCAGGCCGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACggcggc > 8:70645/5‑148 (MQ=255) aCGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGAt < 3:94209/149‑1 (MQ=255) gCTGATCAGGCCGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCt < 2:123311/75‑1 (MQ=37) gCTGATCAGGCCGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCt > 1:123311/1‑75 (MQ=37) cTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGAc > 6:42184/1‑149 (MQ=255) tCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGACtttt > 2:208130/1‑149 (MQ=255) ggCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGACTTTTg < 3:44853/148‑1 (MQ=255) ggCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGACTTTTg < 3:256194/148‑1 (MQ=255) ccTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTg > 6:321249/1‑118 (MQ=255) ccTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTg < 5:321249/118‑1 (MQ=255) tGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTCCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGACTTTTGGCGtg > 5:184128/1‑149 (MQ=255) | CTGGCGGCGCAGTACGAAAGCCTGGTCGACCCCCTGATCATTCTGGTGACCGTGCCGCTGTCGATCTGCGGTGCGCTGCTGCCGCTGGCGCTGGGCTGGGCCACGCTGAACATCTACACACAGATTGGCCTGGTGACGCTGATCGGCCTGATCAGCAAGCACGGTATCCTGATGGTGGCGTTCGCCAACGAGATTCAGGTGCGCGACAACCTCGATCGTGCTGCCGCCATTGTTCGTGCGGCGCAAATACGCTTGCGGCCAGTGCTGATGACCACGGCGGCGATGACTTTTGGCGTG > NC_002947/2350377‑2350673 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |