| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,376,708 | T→C | 5.6% | intergenic (+69/‑136) | PP_2083 → / → PP_2084 | lipase/ribonuclease activity regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,376,708 | 0 | T | C | 5.6% | 209.9 / 2.4 | 71 | intergenic (+69/‑136) | PP_2083/PP_2084 | lipase/ribonuclease activity regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (33/34); new base C (2/2); total (35/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.45e-01 | |||||||||||
GTGGAGCGCTGGCTGCACAACCCGCTGCTGCCGGTGCATGCGTCCACTGTCGTTGCGGAACCTGTGCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGAATACAAATGACTGC‑CCGGTCCCGGATGACTACGACAGCCTCCAAGGTGTAGCCTTGGCCGATACCCGCTTTCGTTGTGACTGACAGGAGCTTCCCATGCAGCATTACG > NC_002947/2376562‑2376856 | gtggAGCGCTGGCTGCACAACCCGCTGCTGCCGGTGCATGCGTCCACTGTCGTTGCGGAACCTGTGCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCTGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGc < 2:197081/149‑1 (MQ=255)gtggAGCGCTGGCTGCACAACCCGCTGCTGCCGGTGCATGCGTCCACTGTCGTTGCGGAACCTGTGCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCtgtg > 1:197081/1‑148 (MQ=255)gtggAGCGCTGGCTGCACAACCCGCTGCTGCCGGTGCATGCGTCCACTGTCGTTGCGGAACCTGTGCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCtgt < 8:106000/147‑1 (MQ=255) ctggctgCACAACCCGCTGCTGCCGGTGCATGCGTCCACTGTCGTTGCGGAACCTGTGCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACgg < 4:196626/149‑1 (MQ=255) tggctgCACAACCCGCTGCTGCCGGTGCATGCGTCCACTGTCGTTGCGGAACCTGTGCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACggg > 2:61904/1‑149 (MQ=255) gctgCACAACCCGCTGCTGCCGGTGCATGCGTCCACTGTCGTTGCGGAACCTGTGCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGt > 2:49622/1‑148 (MQ=255) gctgCACAACCCGCTGCTGCCGGTGCATGCGTCCACTGTCGTTGCGGAACCTGTGCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGCACAGGA‑ACgc > 5:340333/1‑145 (MQ=255) gctgCACAACCCGCTGCTGCCGGTGCATGCGTCCACTGTCGTTGCGGAACCTGTGCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGCACAGGA‑ACgc < 6:340333/146‑2 (MQ=255) gctgCACAACCCGCTGCTGCCGGTGCATGCGTCCACTGTCGTTGCGGAACCTGTGCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCCCGTTCCTGCACAGGA‑ACgcg < 6:407592/147‑3 (MQ=255) ctgCACAACCCGCTGCTGCCGGTGCATGCGTCCACTGTCGTTGCGGAACCTGTGCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTca > 1:351829/1‑149 (MQ=255) gCACAACCCGCTGCTGCCGGTGCATGCGTCCACTGTCGTTGCGGAACCTGTGCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTcatg > 5:343325/1‑149 (MQ=255) gCACAACCCGCTGCTGCCGGTGCATGCGTCCACTGTCGTTGCGGAACCTGTGCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTcatg > 7:81779/1‑149 (MQ=255) acaACCCGCTACTGCCGGTGCATGCGTCCACTGTCGTTGCGGAACCTGTGCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTcatg > 5:397820/1‑147 (MQ=255) acaACCCGCTACTGCCGGTGCATGCGTCCACTGTCGTTGCGGAACCTGTGCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTcatg < 6:397820/147‑1 (MQ=255) aaCCCGCTGCTGCCGGTGCATGCGTCCACTGTCGTTGCGGAACCTGTGCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTcatgcatg < 8:81779/149‑1 (MQ=255) aaCCCGCTGCTGCCGGTGCATGCGTCCACTGTCGTTGCGGAACCTGTGCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTcatgcatg < 5:174753/149‑1 (MQ=255) cccGCTGCTGCCGGTGCATGCGTCCACTGTCGTTGCGGAACCTGTGCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATgg > 8:298071/1‑148 (MQ=255) ccGCTGCTGCCGGTGCATGCGTCCACTGTCGTTGCGGAACCTGTGCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATgg > 2:323574/1‑147 (MQ=255) cGCTGCTGCCGGTGCATGCGTCCACTGTCGTTGCGGAACCTGTGCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAg > 8:260985/1‑149 (MQ=255) ctgctgCCGGTGCATGCGTCCACTGTCGTTGCGGAACCTGTGCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAggg < 7:260985/149‑1 (MQ=255) ctgcCGGTGCATGCGTCCACTGTCGTTGCGGAACCTGTGCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGc < 6:290219/147‑1 (MQ=255) tgcCGGTGCATGCGTCCACTGTCGTTGCGGAACCTGTGCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGcc > 5:81997/1‑147 (MQ=255) gcCGGTGCATGCGTCCACTGTCGTTGCGGAACCTGTGCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCg > 4:266071/1‑147 (MQ=255) gcCGGTGCATGCGTCCACTGTCGTTGCGGAACCTGTGCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCg < 3:266071/147‑1 (MQ=255) ccGGTGCATGCGTCCACTGTCGTTGCGGAACCTGTGCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCga < 3:97133/147‑1 (MQ=255) tGCATGCGTCCACTGTCGTTGCGGAACCTGTGCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAgg < 4:344689/149‑1 (MQ=255) gCGTCCACTGTCGTTGCGGAACCTGTGCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGaa > 8:118964/1‑149 (MQ=255) gTCCACTGGCGTTGCGGAACCTGTGCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGACTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGAAt < 6:304777/148‑1 (MQ=255) tCCACTGTCGTTGCGGAACCTGTGCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGAATAc < 6:81997/149‑1 (MQ=255) ccACTGTCGTTGCGGAACCTGTGCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGAATAc > 4:293030/1‑148 (MQ=255) aCTGTCGTTGCGGAACCTGTGCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGAATACaaa < 3:293030/149‑1 (MQ=255) tCGTTGCGGAACCTGTGCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGAATACAAATGAc < 1:122694/149‑1 (MQ=255) ttGCGGAACCTGTGCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑Ac < 3:271824/103‑1 (MQ=255) ttGCGGAACCTGTGCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑Ac > 4:271824/1‑103 (MQ=255) ttGCGGAACCTGTGCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGAATACAAATGACTGc < 5:172371/149‑1 (MQ=255) gAACCTGTGCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGAATACAAATGACTGC‑CCgg > 8:377001/1‑148 (MQ=255) aCCTGTGCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGAATACAAATGACTGC‑CCGGTcc > 4:141804/1‑149 (MQ=255) cTGTGCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGAATACAAATGACTGC‑CCGGTCCCg < 4:26066/149‑1 (MQ=255) cTGTGCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGAATACAAATGACTGC‑CCGGTCCCg < 6:343325/149‑1 (MQ=255) gtgCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGTA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGAATACAAATGACTGC‑CCGGTCCCGGa > 4:338623/1‑149 (MQ=255) tgcctgccAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGAATACAAATGACTGC‑CCGGTCCCGGAt < 1:61904/149‑1 (MQ=255) cctgccAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGAATACAAATGACTGC‑CCGGTCCCGGATg < 2:351829/148‑1 (MQ=255) ctgccAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGAATACAAATGACTGC‑CCGGTCCCGGATGAc > 2:36904/1‑149 (MQ=255) ctgccAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGAATACAAATGACTGC‑CCGGTCCCGGATGAc < 1:49622/149‑1 (MQ=255) gCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGAATACAAATGACTGC‑CCGGTCCCGGATGACTACGa > 4:268257/1‑148 (MQ=255) tGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGAATACAAATGACTGC‑CCGGTCCCGGATGACTACGACAg > 1:103633/1‑149 (MQ=255) tttGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGAATACAAATGACTGC‑CCGGTCCCGGATGACTACGACAGCCTc < 7:298071/149‑1 (MQ=255) tGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCATGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGAATACAAATGACTGCACCGGTCCCGGATGACTACGACAGCCTCCAAg < 1:36904/149‑1 (MQ=255) tACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGAATACAAATGACTGC‑CCGGTCCCGGATGACTACGACAGCCTCCAAGgtg > 2:122882/1‑149 (MQ=255) 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ctctTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGAGACGGGTCATGCATGGAAGGCCCGAGCCAGGAGGAATACAAATGAGTGC‑CGGGGCCCGGATGAGTACGACTGCATCCAAGGTGTAGCCTTGGcc > 1:104755/1‑148 (MQ=255) tctTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGAATACAAATGACTGC‑CCGGTCCCGGATGACTACGACAGCCTCCAAGGTGTAGCCTTGGCCGa > 1:10190/1‑148 (MQ=255) ttCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGAATACAAATGACTGC‑CCGGTCCCGGATGACTACGACAGCCTCCAAGGTGTAGCCTTGGCCGAt < 3:141804/147‑1 (MQ=255) ttCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGAATACAAATGACTGC‑CCGGTCCCGGATGACTACGACAGCCTCCAAGGTGTAGCCTTGGCCGATAc > 1:370927/1‑149 (MQ=255) cgcgGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGAATACAAATGACTGC‑CCGGTCCCGGATGACTACGACAGCCTCCAAGGTGTAGCCTTGGCCGATAccc > 7:39266/1‑149 (MQ=255) cgGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGAATACAAATGACTGC‑CCGGTCCCGGATGACTACGACAGCCTCCAAGGTGTAGCCTTGGCCGATAcgcg > 1:143791/1‑148 (MQ=255) tGAAGCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGAATACAAATGACTGG‑CCGGTCCCGTATGACTACGACAGCCTCCAAGGTGTAGCCTTGGCCGATACCCGCTTTc < 6:54235/149‑1 (MQ=255) aCCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGAATACAAATGACTGC‑CCGGTCCCGGATGACTACGACAGCCTCCAAGGTGTAGCCTTGGCCGATACCCGCTTTCGtt < 4:330147/149‑1 (MQ=255) ccGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGAATACAAATGACTGC‑CCGGTCCCGGATGACTACGACAGCCTCCAAGGTGTAGCCTTGGCCGATACCCGCTTTCGTtgt < 2:10190/149‑1 (MQ=255) cTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCAGGGAAGGGCCGAGACAGGATGAATACAAATGACTGC‑CCGGTCCCGGATGACTACGACAGCCTCCAAGGTGTAGCCTTGGCCGATACCCGCTTTCGTTGtgac < 6:373734/149‑1 (MQ=255) acTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGAATACAAATGACTGC‑CCGGTCCCGGATGACTACGACAGCCTCCAAGGTGTAGCCTTGGCCGATACCCGCTTTCGTTGTGACTGACAg > 3:218429/1‑148 (MQ=255) tGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGAATACAAATGACTGC‑CCGGTCCCGGATGACTACGACAGCCTCCAAGGTGTAGCCTTGGCCGATACCCGCTTTCGTTGTGACTGACAGGAg > 2:185209/1‑149 (MQ=255) gATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGAATACAAATGACTGC‑CCGGACCCGGATGACTACGACAGCCTCCAAGGTCTAGCCATGGCCGATACCCGCTTTCGtt > 3:104771/1‑133 (MQ=255) aTAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGAATACAAATGACTGC‑CCGGTCCCGGATGACTACGACAGCCTCCAAGGTGTAGCCTTGGCCGATACCCGCTTTCg > 7:288828/1‑130 (MQ=255) aTAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGAATACAAATGACTGC‑CCGGTCCCGGATGACTACGACAGCCTCCAAGGTGTAGCCTTGGCCGATACCCGCTTTCg < 8:288828/130‑1 (MQ=255) gcgcgTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGAATACAAATGACTGC‑CCGGTCCCGGATGACTACGACAGCCTCCAAGGTGTAGCCTTGGCCGATACCCGCTTTCGTTGTGACTGACAGGAGCTTCCCAt < 4:218429/149‑1 (MQ=255) ccgTTCCTGCACAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGAATACAAATGACTGC‑CCGGTCCCGGATGACTACGACAGCCTCCAAGGTGTAGCCTTGGCCGATACCCGCTTTCGTTGTGACTGACAGGAGCTTCCGATg > 8:108571/2‑148 (MQ=255) cTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGAATACAAATGACTGC‑CCGGTCCCGGATGACTACGACAGCCTCCAAGGTGTAGCCTTGGCCGATACCCGCTTTCGTTGTGACTGACAGGAGCTTCCCATGCAGCAtt < 2:103633/149‑1 (MQ=255) cTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGAATACAAATGACTGC‑CCGGTCCCGGATGACTACGACAGCCTCCAAGGTGTAGCCTTGGCCGATACCCGCTTTCGTTGTGACTGACAGGAGCTTCCCATGCAGCAtt < 2:370927/149‑1 (MQ=255) tgtgCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGAATACAAATGACTGC‑CCGGTCCCGGATGACTACGACAGCCTCCAAGGTGTAGCCTTGGCCGATACCCGCTTTCGTTGTGACTGACAGGAGCTTCCCATGCAGCATTa > 4:191967/1‑149 (MQ=255) tgCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGAATACAAATGACTGC‑CCGGTCCCGGATGACTACGACAGCCTCCAAGGTGTAGCCTTGGCCGATACCCGCTTTCGTTGTGACTGACAGGAGCTTCCCATGCAGCATTACg > 5:141056/1‑149 (MQ=255) | GTGGAGCGCTGGCTGCACAACCCGCTGCTGCCGGTGCATGCGTCCACTGTCGTTGCGGAACCTGTGCCTGCCAGCTGAGTTTGCTGTACCTGTCATGGCCTCTTCGCGGGTGAACCCGCTCCTACACTGGATAACGCGCGTTCCTGTGCAGGA‑ACGGGTCATGCATGGAAGGGCCGAGACAGGATGAATACAAATGACTGC‑CCGGTCCCGGATGACTACGACAGCCTCCAAGGTGTAGCCTTGGCCGATACCCGCTTTCGTTGTGACTGACAGGAGCTTCCCATGCAGCATTACG > NC_002947/2376562‑2376856 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |