| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,419,540 | C→T | 6.0% | P231S (CCG→TCG) | ctpH → | methyl‑accepting chemotaxis protein CtpH |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,419,540 | 0 | C | T | 6.0% | 205.3 / 2.6 | 67 | P231S (CCG→TCG) | ctpH | methyl‑accepting chemotaxis protein CtpH |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (26/37); new base T (2/2); total (28/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.54e-01 | |||||||||||
GCAACTGCGCGCCGATGCTCGCCAGCGTGCAGCCAGCATCAATGCCAGTGCCGAGCGCACGGTATGGTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAGCTTTGCTGCCCGGGTCGACAGCCGTCGGGAGGATGAGCTGGGGCGCCTGGCGCGGGCGGCCAACACCCTGCGTGACTTCCTTGCCGATACCGTCGGCCGG > NC_002947/2419392‑2419686 | gCAACTGCGCGCCGATGCTCGCCAGCGTGCAGCCAGCATCAATGCCAGTGCCGAGCGCACGGTATGGTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGc > 8:61646/1‑149 (MQ=255)gCAACTGCGCGCCGATGCTCGCCAGCGTGCAGCCAGCATCAATGCCAGTGCCGAGCGCACGGTATGGTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGc < 1:255485/149‑1 (MQ=255)gCAACTGCGCGCCGATGCTCGCCAGCGTGCAGCCAGCATCAATGCCAGTGCCGAGCGCACGGTATGGTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGc > 2:207676/1‑149 (MQ=255)gCAACTGCGCGCCGATGCTCGCCAGCGTGCAGCCAGCATCAATGCCAGTGCCGAGCACACGGTATGGTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGc < 2:336496/149‑1 (MQ=255) cgcgcCGATGCTCGCCAGCGTGCAGCCAGCATCAATGCCAGTGCCGAGCGCACGGTATGGTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGTCGATCCg > 7:228661/1‑149 (MQ=255) cgcgcCGATGCTCGCCAGCGTGCAGCCAGCATCAATGCCAGTGCCGAGCGCACGGTATGGTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGTCGATCCg > 7:222727/1‑149 (MQ=255) gcCGATGCTCGCCAGCGTGCAGCCAGCATCAATGCCAGTGCCGAGCGCACGGTATGGTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCa < 6:259301/149‑1 (MQ=255) cGATGCTCGCCAGCGTGCAGCCAGCATCAATGCCAGTGCCGAGCGCACGGTATGGTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGt > 7:372771/1‑149 (MQ=255) aTGCTCGCCAGCGTGCAGCCAGCATCAATGCCAGTGCCGAGCGCACGGTATGGTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGc < 4:334001/143‑1 (MQ=255) aTGCTCGCCAGCGTGCAGCCAGCATCAATGCCAGTGCCGAGCGCACGGTATGGTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGc > 3:334001/1‑143 (MQ=255) gCTCGCCAGCGTGCAGCCAGCATCAATGCCAGTGCCGAGCGCACGGTATGGTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGAt > 5:301170/1‑149 (MQ=255) cTCGCCAGCGTGCAGCCAGCATCAATGCCAGTGCCGAGCGCACGGTATGGTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGTGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGTCGATCCGCCAGTTGATc < 8:222727/149‑1 (MQ=255) cTCGCCAGCGTGCAGCCAGCATCAATGCCAGTGCCGAGCGCACGGTATGGTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGTCGATCCGCCAGTTGATc < 8:228661/149‑1 (MQ=255) cTCGCCAGCGTGCAGCCAGCATCAATGCCAGTGCCGAGCGCACGGTATGGTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATc < 7:366810/149‑1 (MQ=255) cTCGCCAGCGTGCAGCCAGCATCAATGCCAGTGCCGAGCGCACGGTATGGTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATc < 6:301170/149‑1 (MQ=255) cTCGCCAGCGTGCAGCCAGCATCAATGCCAGTGCCGAGCGCACGGTATGGTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATc < 3:156372/149‑1 (MQ=255) tCGCCAGCGTGCAGCCAGCATCAATGCCAGTGCCGAGCGCACGGTATGGTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGa > 5:213704/1‑146 (MQ=255) gCCAGCGTGCAGCCAGCATCAATGCCAGTGCCGAGCGCACGGTATGGTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGa < 8:56005/148‑1 (MQ=255) aGCGTGCAGCCAGCATCAATGCCAGTGCCGAGCGCACGGTATGGTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTAc < 1:209657/149‑1 (MQ=255) tGCAGCCAGCATCAATGCCAGTGCCGAGCGCACGGTATGGTTGGGCCTGCTGGTGTTGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTcg < 6:213704/149‑1 (MQ=255) tGCAGCCAGCATCAATGCCAGTGCCGAGCGCACGGTATGGTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTcg < 8:347108/149‑1 (MQ=255) gccagcATCAATGCCAGTGCCGAGCGCACGGTATGGTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCa < 7:302661/149‑1 (MQ=255) cATCAATGCCAGTGCCGAGCGCACGGTATGGTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCATTTCATCGAGTACGTCGCGCAGCTCa < 7:61646/149‑1 (MQ=255) tCAATGCCAGTGCCGAGCGCACGGTATGGTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGTGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGc > 2:352315/1‑149 (MQ=255) cAATGCCAGTGCCGAGCGCACGGTATGGTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCACCCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGc > 4:334662/1‑148 (MQ=255) cAGTGCCGAGCGCACGGTATGGTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCgcgc < 2:365410/134‑1 (MQ=255) cAGTGCCGAGCGCACGGTATGGTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCgcgc > 1:365410/1‑134 (MQ=255) aGTGCCGAGCGCACGGTATGGTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAg < 3:90030/149‑1 (MQ=255) ccGAGCGCACGGTATGGTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAGCttt > 2:29101/1‑149 (MQ=255) aGCGCACGGTATGGTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAGCTTtgct > 5:2213/1‑149 (MQ=255) aGCGCACGGTATGGTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAGCTTtgcg > 8:159162/1‑148 (MQ=255) gcgcACGGTATGGTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGTGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAGCTTtgctg < 1:352315/149‑1 (MQ=255) gcgcACGGTATGGTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAGCTTtgctg > 1:42419/1‑149 (MQ=255) cACGGTATGGTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAGCTTTGCTGccc < 4:150368/149‑1 (MQ=255) ggTATGGTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAGCTTTGCTGCCCggg < 5:406768/149‑1 (MQ=255) gTATGGTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAGCTTTGCTGCCCGGGt < 6:134148/149‑1 (MQ=255) tATGGTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAGCTTTGCTGCCCGGGTc < 3:267646/149‑1 (MQ=255) gTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGTGGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAGCTTTGCTGCCCGGGTCGACa < 4:287365/149‑1 (MQ=255) gTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAGCTTTGCTGCCCGGGTCGa > 3:260223/1‑147 (MQ=255) gTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAGCTTTGCTGCCCGGGTCGACa < 6:2213/149‑1 (MQ=255) gTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAGCTTTGCTGCCCGGGTCGACa < 1:207676/149‑1 (MQ=255) ggCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAGCTTTGCTGCCCGGGTCGACAGcc < 8:372771/148‑1 (MQ=255) ccTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTc < 8:276196/112‑1 (MQ=255) ccTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTc > 7:276196/1‑112 (MQ=255) ctgGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAGCTTTGCTGCCCGGGTCGACAGCCGTCgg > 3:346120/1‑147 (MQ=255) ctgGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAGCTTTGCTGCCCGGGTCGACAGCCGTCGgga < 2:42419/149‑1 (MQ=255) ctgGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAGCTTTGCTGCCCGGGTCGACAGCCGTCGgga < 6:150254/149‑1 (MQ=255) gTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAGCTTTGCTGCCCGGGTCGACAGCCGTCGggagga > 8:225970/1‑149 (MQ=255) gCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAgg > 8:247479/1‑108 (MQ=255) gCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAgg < 7:247479/108‑1 (MQ=255) tGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAGCTTTGCTGCCCGGGTCGACAGCCGTCGGGAGGATGAGCTg > 7:113469/1‑149 (MQ=255) tGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAGCTTTGCTGCCCGGGTCGACAGCCGTCGGGAGGATGAGCTg > 4:147600/1‑149 (MQ=255) gCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAGCTTTGCTGCCCGGGTCGACAGCCGTCGGGAGGATGAGCTg < 4:346120/147‑1 (MQ=255) cTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAGCTTTGCTGCCCGGGTCGACAGCCGTCGGGAGGATGAGCTgggg > 6:126130/1‑149 (MQ=255) gCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAGCTTTGCTGCCCGGGTCGACAGCCGTCGGGAGGATGAGCTg > 8:239098/1‑141 (MQ=255) gCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAGCTTTGCTGCCCGGGTCGACAGCCGTCGGGAGGATGAGCTg < 7:239098/141‑1 (MQ=255) gCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAGCTTTGCTGCCCGGGTCGACAGCCGTCGGGAGGATGAGCTGGGGCGCCt > 5:246126/1‑149 (MQ=255) cGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAGCTTTGCTGCCCGGGTCGACAGCCGTCGGGAGGATGAGCTGGGGCGCCTg < 1:29101/149‑1 (MQ=255) gtggGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAGCGTTGCTGCCCGGGTCGACAGCCGTCGGGAGGATGAGCTGGGGCGCCTGGCgcgg < 3:227952/147‑1 (MQ=255) gggCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAGCTTTGCTGCCCGGGTCGACAGCCGTCGGGAGGATGAGCTGGGGCGCCTGGCGCGggcggc > 7:376267/1‑149 (MQ=255) gggCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAGCTTTGCTGCCCGGGTCGACAGCCGTCGGGAGGATGAGCTGGGGCGCCTGGCGCGggcggc < 7:225970/149‑1 (MQ=255) tgtgGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAGCTTTGCTGCCCGGGTCGACAGCCGTCGGGAGGATGAGCTGGGGCGCCTGGCGCGGGCGGCCAACACCCTGCGt < 4:260223/149‑1 (MQ=255) tgGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAGCTTTGCTGCCCGGGTCGACAGCCGTCGGGAGGATGAGCTGGGGCGCCTGGCgcgggc < 5:176680/131‑1 (MQ=255) tgGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAGCTTTGCTGCCCGGGTCGACAGCCGTCGGGAGGATGAGCTGGGGCGCCTGGCgcgggc > 6:176680/1‑131 (MQ=255) tgGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAGCTTTGCTGCCCGGGTCGACAGCCGTCGGGAGGATGAGCTGGGGCGCCTGGCGCGGGCGGCCAACACCCTGCGt < 6:246126/147‑1 (MQ=255) ggCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAGCTTTGCTGCCCGGGTCGACAGCCGTCGGGAGGATGAGCTGGGGCGCCTGGCGCGGGCGGCCAACACCCTGCGTGAc > 3:383608/1‑149 (MQ=255) gCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAGCTTTGCTGCCCGGGTCGACAGCCGTCGGGAGGATGAGCTGGGGCGCCTGGCGCGGGCGGCCAACACCCTGCGTGACt < 8:113469/149‑1 (MQ=255) tCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAGCTTTGCTGCCCGGGTCGACAGCCGTCGGGAGGATGAGCTGGGGCGCCTGGCGCGGGCGGCCAACACCCTGCGTGACTTCCtt < 3:334662/149‑1 (MQ=255) tGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAGCTTTGCTGCCCGGGTCGACAGCCGTCGGGAGGATGAGCTGGGGCGCCTGGCGCGGGCGGCCAACACCCTGCGTGACTTCCTTGCCGATACCGTc > 3:341793/1‑149 (MQ=255) aTCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAGCTTTGCTGCCCGGGTCGACAGCCGTCGGGAGGATGAGCTGGGGCGCCTGGCGCGGGCGGCCAACACCCTGCGTGACTTCCTTGCCGATACCGTcg < 5:126130/148‑1 (MQ=255) aGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAGCTTTGCTGCCCGGGTCGACAGCCGTCGGGAGGATGAGCTGGGGCGCCTGGCGCGGGCGGCCAACACCCTGCGTGACTTCCTTGCCGATACCGTcggccgg > 2:33142/1‑149 (MQ=255) | GCAACTGCGCGCCGATGCTCGCCAGCGTGCAGCCAGCATCAATGCCAGTGCCGAGCGCACGGTATGGTTGGGCCTGCTGGTGATGCTGGCTTCAGCGGTGCTGGTGGGGCTGCTCAGCCTGTGGCTGGTCAACCGTAGCCTGATCGAGCCGATCCGCCAGTTGATCGAGTACGTCGCGCAGCTCAGCCAAGGCAGCTTTGCTGCCCGGGTCGACAGCCGTCGGGAGGATGAGCTGGGGCGCCTGGCGCGGGCGGCCAACACCCTGCGTGACTTCCTTGCCGATACCGTCGGCCGG > NC_002947/2419392‑2419686 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |