Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,445,045 | T→A | 7.3% | E156V (GAA→GTA) ‡ | lexA‑I ← | transcriptional repressor |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,445,045 | 0 | T | A | 7.3% | 244.2 / 7.7 | 84 | E156V (GAA→GTA) ‡ | lexA‑I | transcriptional repressor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (39/38); new base A (3/3); total (42/42) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.87e-01 |
CTGGATCAGCGGCGAATGACGCCGACGCTCAAGCCCTCGATCACCAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTTCATGCTCATGCCGTGTACGCGCAGCAAATAGTCGGCTTGGGGGTGGAAGAA > NC_002947/2444898‑2445190 | ctGGATCAGCGGCGAATGACGCCGACGCTCAAGCCCTCGATCACCAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTc > 8:338170/1‑149 (MQ=255) gcgAATGACGCCGACGCTCAAGCCCTCGATCACCAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACGCAGTCACCgtcaa < 5:148476/149‑5 (MQ=255) gcgAATGACGCCGACGCTCAAGCCCTCGATCACCAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACGAAGTCACCgtcaa < 4:10325/149‑5 (MQ=255) gcgAATGACGCCGACGCTCAAGCCCTCGATCACCAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGGGACGAAGTCACCgtcaa < 3:75417/149‑5 (MQ=255) gCCGACGCTCAAGCCCTCGATCACCAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCACGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGGCTTCGTCACCGATGCGCGCCACaa > 1:294601/1‑149 (MQ=255) gCCGACGCTCAAGCCCTCGATCACCAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCACGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACaa > 2:382343/1‑149 (MQ=255) cGACGCTCAAGCCCTCGATCACCAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCca < 4:160335/144‑1 (MQ=255) cGACGCTCAAGCCCTCGATCACCAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCca > 3:160335/1‑144 (MQ=255) tCAAGCCCTCGATCACCAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTgg > 8:71391/1‑149 (MQ=255) aGCCCTCGATCACCAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCg > 7:298451/1‑149 (MQ=255) cccTCGATCACCAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGtt < 7:338170/149‑1 (MQ=255) ccTCGATCACCAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAATGATCTGGCCGTTg > 4:41141/1‑149 (MQ=255) ccTCGATCACCAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGATGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTg > 8:299690/1‑149 (MQ=255) tCACCAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCt > 4:17715/1‑149 (MQ=255) aCCAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCtt < 7:41317/148‑1 (MQ=255) ccAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGTCCGTTGCGGGCTTCa > 6:280366/1‑149 (MQ=255) ccAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCa > 2:250880/1‑149 (MQ=255) ccAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCa < 7:71391/149‑1 (MQ=255) ccAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCa < 3:187818/149‑1 (MQ=255) cAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCAc < 7:237651/149‑1 (MQ=255) tCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACgg > 7:2304/1‑147 (MQ=255) cTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAgg > 2:26694/1‑149 (MQ=255) cTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAg < 7:299690/148‑1 (MQ=255) tGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGgt > 3:322921/1‑149 (MQ=255) ttCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGgtgt < 1:250880/149‑1 (MQ=255) cTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGtgtg > 6:131033/1‑148 (MQ=255) tCATGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGTGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCAc < 2:296154/148‑1 (MQ=255) tCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGc < 3:374701/146‑1 (MQ=255) tCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCAc < 1:306920/148‑1 (MQ=255) tCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCACGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCAc < 1:382343/148‑1 (MQ=255) gTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACTGCAGGTTTGCACAGCca > 6:337399/1‑149 (MQ=255) gTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGc > 6:252936/1‑147 (MQ=255) tCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCcag < 4:144682/149‑1 (MQ=255) gACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAATGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCcagc < 3:41141/148‑1 (MQ=255) gACTGCGATGGGGGAGAATTCGGGGTTGTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGACGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCcagc < 6:321050/148‑1 (MQ=255) aCTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCcagcag < 5:131033/149‑1 (MQ=255) cTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAgg > 2:64660/1‑149 (MQ=255) gATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGc > 6:63302/1‑149 (MQ=255) ggCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGa < 1:26694/149‑1 (MQ=255) gCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGaa < 5:146304/149‑1 (MQ=255) gAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCATTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCg > 6:346661/1‑145 (MQ=255) aTTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATg < 6:213558/149‑1 (MQ=255) aTTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATg < 1:64660/149‑1 (MQ=255) aTTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATg < 5:280366/149‑1 (MQ=255) ttCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGc > 5:311915/1‑149 (MQ=255) cGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGcc < 3:392081/148‑1 (MQ=255) ttttCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGt > 7:153305/1‑148 (MQ=255) tttCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTcc > 8:271333/1‑149 (MQ=255) cGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCtt > 6:67989/1‑148 (MQ=255) ggCAAGCTGCTAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGTGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTtca < 5:337399/149‑1 (MQ=255) cAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTtcatg < 6:311915/149‑1 (MQ=255) cAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTtcatg < 8:298451/149‑1 (MQ=255) cAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTtcatg > 7:241940/1‑149 (MQ=255) agcCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTtcatgctcat > 5:180613/1‑149 (MQ=255) gACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTTCATGCTCATGCCgt > 3:18428/1‑149 (MQ=255) tgcCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTTCATGCTCATGCCGTGTAcgcg > 2:151756/1‑148 (MQ=255) tgcCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTTCATGCTCATGCCGTGTAcgcg > 3:338754/1‑148 (MQ=255) gcCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTTCATGCTCATGCCGTGTAcgcg > 2:169028/1‑147 (MQ=255) ccTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTTCATGCTCATGCCGTGTACgcgc < 8:241940/147‑1 (MQ=255) cTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTTCATGCTCATGCCGTGTACGCgcagc < 5:252936/149‑1 (MQ=255) ttCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTTCATGCTCATGCCGTGTACGCgcagc > 6:69527/1‑148 (MQ=255) cgcgCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTTCATGCTCATGCCGTGTACGCGCAGCaa < 1:190003/148‑1 (MQ=255) gcTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTTCATGCTCATGCCGTGTACGCGCAGCAAATAg > 4:327957/1‑149 (MQ=255) gcTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTTCATGCTCATGCCGTGTACGCGCAGCAAATAg < 3:327957/149‑1 (MQ=255) 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aaGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTTCATGCTCATGCCGTGTACGCGCAGCAAATAGTCgg < 7:271333/148‑1 (MQ=255) gcTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTTCATGCTCATGCCGTGTACGCGCAGCAAATAGTCGGCTTgg < 4:322921/149‑1 (MQ=255) gcatcGGTGACGAAGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTTCATGCTCATGCCGTGTACGCGCAGCAAATAGTCGGCTTgggg > 8:88442/5‑149 (MQ=255) atcGGTGACGAAGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGgt > 2:81299/3‑63 (MQ=38) atcGGTGACGAAGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGgt < 1:81299/61‑1 (MQ=38) tcGGTGACGAAGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTTCATGCTCATGCCGTGTACGCGCAGCAAATAGTCGGCTTGGGGGTg > 3:44727/2‑149 (MQ=255) 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(MQ=255) gACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTTCATGCTCATGCCGTGTACGCGCAGCAAATAGTc < 3:393829/132‑1 (MQ=255) aCTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTTCATGCTCATGCCGTGTACGCGCAGCAAATAGTCGGCTTGGGGGTGgaagaa < 8:2304/149‑1 (MQ=255) aCTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTTCATGCTCATGCCGTGTACGCGCAGCAAATAGTCGGCTTGGGGGTGgaagaa < 1:162520/149‑1 (MQ=255) | CTGGATCAGCGGCGAATGACGCCGACGCTCAAGCCCTCGATCACCAGCTCCTGTTCTTTCAGGTCGACTTCGATGGGGGCGAATTCGGGGTTTTCGGCAAGCAGCCAGACTTTGCTGCCTTCGCGCTTGAAGCGCTTGACGGTGACTTCGTCACCGATGCGCGCCACAACGATCTGGCCGTTGCGGGCTTCACGGCAGGTGTGCACCGCCAGCAGGTCGCCGTCGAAGATGCCGACGTCCTTCATGCTCATGCCGTGTACGCGCAGCAAATAGTCGGCTTGGGGGTGGAAGAA > NC_002947/2444898‑2445190 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |