| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,453,596 | G→A | 5.4% | A508V (GCC→GTC) | mfd ← | transcription‑repair coupling factor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,453,596 | 0 | G | A | 5.4% | 229.6 / 2.1 | 75 | A508V (GCC→GTC) | mfd | transcription‑repair coupling factor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (30/40); new base A (2/2); total (33/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.57e-01 | |||||||||||
GGCTTTCTGCCAGGCCTCCGAACCCAGCCGGTGCAGCGGTGCCAGGGCGTCGTCGCTGCCGGTGTAGCGGGCGATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGATGTGCACCACCGGCGCACCTTCGCGCAGCTCGGTGAGGTTCTTGATGACCGCGTCGTTGGCGGTTTCGCCGCGCTTGTCACGGC > NC_002947/2453454‑2453740 | ggCTTTCTGCCAGGCCTCCGAACCCAGCCGGTGCAGCGGTGCCAGGGCGTCGTCGCTGCCGGTGTAGCGGGCGATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑Cggcggc < 1:35259/147‑1 (MQ=255) gCTTTCTGCCAGGCCTCCGAACCCAGCCGGTGCAGCGGTGCCAGGGCGTCGTCGCTGCCGGTGTAGCGGGCGATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTg < 6:181910/149‑1 (MQ=255) tttCTGCCAGGCCTCCGAACCCAGCCGGTGCAGCGGTGCCAGGGCGTCGTCGCTGCCGGTGTAGCGGGCGATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGc > 6:47267/1‑149 (MQ=255) tttCTGCCAGGCCTCCGAACCCAGCCGGTGCAGCGGTGCCAGGGCGTCGTCGCTGCCGGTGTAGCGGGCGATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGc > 1:395970/1‑149 (MQ=255) cTGCCAGGCCTCCGAACCCAGCCGGTGCAGCGGTGCCAGGGCGTCGTCGCTGCCGGTGTAGCGGGCGATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGt > 5:90018/1‑149 (MQ=255) gCCAGGCCTCCGAACCCAGCCGGTGCAGCGGTGCCAGGGCGTCGTCGCTGCCGGTGTAGCGGGCGATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTc > 4:191305/1‑148 (MQ=255) ccAGGCCTCCGAACCCAGCCGGTGCAGCGGTGCCAGGTCGTCGTCGCTGCCGGTGTAGCGGGCGATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGt < 1:357661/146‑1 (MQ=255) ccAGGCCTCCGAACCCAGCCGGTGCAGCGGTGCCAGGGCGTCGTCGCTGCCGGTGTAGCGGGCGATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGa > 7:124970/1‑149 (MQ=255) ccAGGCCTCCGAACCCAGCCGGTGCAGCGGTGCCAGGGCGTCGTCGCTGCCGGTGTAGCGGGCGATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGa > 7:287170/1‑149 (MQ=255) cAGGCCTCCGAACCCAGCCGGTGCAGCGGTGCCAGGGCGTCGTCGCTGCCGGTGTAGCGGGCGATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGAt < 8:30112/149‑1 (MQ=255) aGGCCTCCGAACCCAGCCGGTGCAGCGGTGCCAGGGCGTCGTCGCTGCCGGTGTAGCGGGCGATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGACGGCCAGGCCGCCGaat < 4:199882/149‑3 (MQ=255) cTCCGAACCCAGCCGGTGCAGCGGTGCCAGGGCGTCGTCGCTGCCGGTGTAGCGGGCGATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTc > 4:145575/1‑147 (MQ=255) cTCCGAACCCAGCCGGTGCAGCGGTGCCAGGGCGTCGTCGCTGCCGGTGTAGCGGGCGATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCa < 7:140113/149‑1 (MQ=255) cGAACCCAGCCGGTGCAGCGGTGCCAGGGCGTCGTCGCTGCCGGTGTAGCGGGCGATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCg > 2:209967/1‑149 (MQ=255) cGAACCCAGCCGGTGCAGCGGTGCCAGGGCGTCGTCGCTGCCGGTGTAGCGGGCGATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCg > 2:216700/1‑149 (MQ=255) cccAGCCGGTGCAGCGGTGCCAGGGCGTCGTCGCTGCCGGTGTAGCGGGCGATCAGGTGCAGGGTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGc < 7:47542/149‑1 (MQ=255) ccAGCCGGTGCAGCGGTGCCAGGGCGTCGTCGCTGCCGGTGTAGCGGGCGATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGcc < 2:395970/149‑1 (MQ=255) cAGCCGGTGCAGCGGTGCCAGGGCGTCGTCGCTGCCGGTGTAGCGGGCGATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGc > 5:353254/1‑147 (MQ=255) aGCCGGTGCAGCGGTGCCAGGGCGTCGTCGCTGCCGGTGTAGCGGGCGATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAg < 1:209967/149‑1 (MQ=255) aGCCGGTGCAGCGGTGCCAGGGCGTCGTCGCTGCCGGTGTAGCGGGCGATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAg < 1:216700/149‑1 (MQ=255) ccGGTGCAGCGGTGCCAGGGCGTCGTCGCTGCCGGTGTAGCGGGCGATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑cggc < 8:101761/117‑1 (MQ=255) ccGGTGCAGCGGTGCCAGGGCGTCGTCGCTGCCGGTGTAGCGGGCGATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑cggc > 7:101761/1‑117 (MQ=255) cGGTGCAGCGGTGCCAGGGCGTCGTCGCTGCCGGTGTAGCGGGCGATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGcc > 2:25655/1‑149 (MQ=255) ggTGCAGCGGTGCCAGGGCGTCGTCGCTGCCGGTGTAGCGGGCGATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGccc < 3:55440/149‑1 (MQ=255) gTGCAGCGGTGCCAGGGCGTCGTCGCTGCCGGTGTAGCGGGCGATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCa < 4:374732/149‑1 (MQ=255) cAGCGGTGCCAGGGCGTCGTCGCTGCCGGTGTAGCGGGCGATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAgg < 5:33371/148‑1 (MQ=255) cGGTGCCAGGGCGTCGTCGCTGCCGGTGTAGCGGGCGATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGc > 7:300118/1‑130 (MQ=255) cGGTGCCAGGGCGTCGTCGCTGCCGGTGTAGCGGGCGATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGAACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGc < 8:300118/130‑1 (MQ=255) gTGCCAGGGCGTCGTCGCTGCCGGTGTAGCGGGCGATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CCGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCgg < 1:287405/149‑1 (MQ=255) cgtcgtCGCTGCCGGTGTAGCGGGCGATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCa < 8:124970/149‑1 (MQ=255) gtcgtcGCTGCCGGTGTAGCGGGCGATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCAt > 5:44146/1‑149 (MQ=255) tcgCTGCCGGTGTAGCGGGCGATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTc < 3:191305/149‑1 (MQ=255) gCTGCCGGTGTAGCGGGCGATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCg < 6:90018/148‑1 (MQ=255) cTGCCGGTGTAGCGGGCGATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGAt < 3:194772/149‑1 (MQ=255) cTGCCGGTGTAGCGGGCGATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGAt < 4:61679/149‑1 (MQ=255) cGGTGTAGCGGGCGATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGAtgtg > 7:68551/1‑148 (MQ=255) gtgtAGCGGGCGATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGATGTGcac < 8:287170/149‑1 (MQ=255) gCGGGCGATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGATGTGCACCACCg < 3:145575/149‑1 (MQ=255) cGGGCGATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGATGTGcactagta > 8:221339/1‑143 (MQ=255) cGATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGATGTGCACCACCGGCGCa < 6:353254/149‑1 (MQ=255) gATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTAGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGc > 1:377170/1‑99 (MQ=255) gATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTAGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGc < 2:377170/99‑1 (MQ=255) tCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGCTCGATGTGCACCACCGGCGCACCt > 4:307704/1‑149 (MQ=255) cAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCg > 4:58682/1‑115 (MQ=255) cAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCg < 3:58682/115‑1 (MQ=255) ggTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGATGTGCACCACCGGCGCACCTTcg < 1:25655/149‑1 (MQ=255) tGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGTGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGATGTGCACCACCGGCGCACCTTcgcg < 5:299645/149‑1 (MQ=255) tGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGATGTGCACCACCGGCGCACCTTcgcg > 8:239288/1‑149 (MQ=255) gCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGATGTGCACCACCGGCGCACCTTcgcg > 6:24452/1‑148 (MQ=255) ggCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGATGTGCACCACCGGCGCACCTTCGCGCAGCTCg < 5:47267/148‑1 (MQ=255) ccACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGATGTGCACCACCGGCGCACCTTCGCGCAGCTCGGt > 2:221285/1‑148 (MQ=255) ccGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGATGTGCACCACCGGCGCACCTTCGCGCAGCTCGGTGAgg < 4:57618/149‑1 (MQ=255) gCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGATGTGCACCACCGGCGCACCTTCGCGCAGCTCGGTGAGGTTc < 4:90428/149‑1 (MQ=255) gCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGATGTGCACCACCGGCGCACCTTCGCGCAGCTCGGTGAGGTTc > 3:90428/1‑149 (MQ=255) gCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGATGTGCACCACCGGCGCACCTTCGCGCAGCTCGGTGAGGTTc > 3:338152/1‑149 (MQ=255) cacaTACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCAAGCGTCAGAAATT‑CGGCGGCCTGTCCGTCGAATTCCAGAGTTGCCAGTCCCACGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGATCTGAACCACAGGCGCACCTTCGCGCTGCTCGGTGACGTTCt > 7:325821/1‑149 (MQ=255) aTACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGATGTGCACCACCGGCGCACCTTCGCGCAGCTCGGTGAGGTTCTtga < 3:307704/149‑1 (MQ=255) aCAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATTACGCCGGCATGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCAAGGTACCGGCCGACGCCATGGACGATGTGCACCACCGGCGCACCTACGCGCAGCTCGGTGAGGTTCTtgat > 1:277381/1‑149 (MQ=255) aGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGATGTGCACCACCGGCGCACCTTCGCGCAGCTCGGTGAGGTTCTTGATGAc < 6:44146/149‑1 (MQ=255) gCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGATGTGcaccac > 8:14051/1‑104 (MQ=255) gCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGATGTGcaccac < 7:14051/104‑1 (MQ=255) ggCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGATGTGCACCACCGGCGCACCTTCGCGCAGCTCGGTGAGGTTCTtga < 1:351828/131‑1 (MQ=255) ggCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGATGTGCACCACCGGCGCACCTTCGCGCAGCTCGGTGAGGTTCTtga > 2:351828/1‑131 (MQ=255) gCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCAGCCGACGCCATGGTCGATGTGCACCACCGGCGCACCTTCGCGCAGCTCGGTGAGGTTCTTGATGACCGCGTCGTTGGCGGt < 1:203876/149‑1 (MQ=255) aTTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGATGTGCACCACCGGCGCACCTTCGCGCAGCTCGGTGAgg > 1:112451/1‑119 (MQ=255) aTTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGATGTGCACCACCGGCGCACCTTCGCGCAGCTCGGTGAgg < 2:112451/119‑1 (MQ=255) cAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGATGTGCACCACCGGCGCACCTTCGCGCAGCTCGGTGAGGTTCTTGATGACCGcgtc < 2:282642/132‑1 (MQ=255) cAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGATGTGCACCACCGGCGCACCTTCGCGCAGCTCGGTGAGGTTCTTGATGACCGcgtc > 1:282642/1‑132 (MQ=255) cAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGATGTGCACCACCGGCGCACCTTCGCGCAGCTCGGTGAGGTTCTTGATGACCGCGTCGTTGGCGGTTTcg < 3:94465/145‑1 (MQ=255) cAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGATGTGCACCACCGGCGCACCTTCGCGCAGCTCGGTGAGGTTCTTGATGACCGCGTCGTTGGCGGTTTcg > 4:94465/1‑145 (MQ=255) gTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGATGTGCACCACCGGCGCACCTTCGCGCAGCTCGGTGAGGTTCTTGATGACCGCGTCGTTGGCGGTTTCGCCGCGCtt < 7:331412/149‑1 (MQ=255) gTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGATGTGCACCACCGGCGCACCTTCGCGCAGCTCGGTGAGGTTCTTGATGACCGCGTCGTTGGCGGTTTCGCCGCGCtt < 2:277381/149‑1 (MQ=255) ctggAAAT‑CGACGGCCAGGCCGCCGAATTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGATGTGCACCACCGGCGCACCTTCGCGCAGCTCGGTGAGGTTCTTGATGACCGCGTCGTTGGCGGTTTCGCCGCGCTTGt > 6:28702/3‑149 (MQ=255) ggAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGATGTGCACCACCGGCGCACCTTCGCGCAGCTCGGTGAGGTTCTTGATGACCGCGTCGTTGGCGGTTTCGCCGCGCTTGTCa > 6:183357/1‑149 (MQ=255) gAAAT‑CGACGGCCAGGCCGCCGAATTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGATGTGCACCACCGGCGCACCTTCGCGCAGCTCGGTGAg < 3:54396/105‑1 (MQ=38) gAAAT‑CGACGGCCAGGCCGCCGAATTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGATGTGCACCACCGGCGCACCTTCGCGCAGCTCGGTGAg > 4:54396/1‑105 (MQ=38) aaTT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGATGTGCACCACCGGCGCACCTTCGCGCAGCTCGGTGAGGTTCTTGATGACCGCGTCGTTGGCGGTTTCGCCGCGCTTGTCAcg < 7:239288/149‑1 (MQ=255) tt‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGATGTGCACCACCGGCGCACCTTCGCGCAGCTCGGTGAGGTTCTTGATGACCGCGTCGTTGGCGGTTTCGCCGCGCTTGTCAcggc < 4:338152/149‑1 (MQ=255) gcggcCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGATGTGCACCACCGGCGCACCTTCGCGCAGCTCGGTGAGGTTCTTGATGACCGCGTCGTTGGCGGTTTCGCCgcgc > 7:273976/1‑135 (MQ=255) gcggcCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGATGTGCACCACCGGCGCACCTTCGCGCAGCTCGGTGAGGTTCTTGATGACCGCGTCGTTGGCGGTTTCGCCgcgc < 8:273976/135‑1 (MQ=255) | GGCTTTCTGCCAGGCCTCCGAACCCAGCCGGTGCAGCGGTGCCAGGGCGTCGTCGCTGCCGGTGTAGCGGGCGATCAGGTGCAGGTTGGCCACCGGCACATACAGCTTGGCGTTCTCGGCGTATTCCAGCGTCAGGAATT‑CGGCGGCCTGGCCGTCGATTTCCAGCGTGGCCAGGCCCAGGTAGCGGCCGACGCCATGGTCGATGTGCACCACCGGCGCACCTTCGCGCAGCTCGGTGAGGTTCTTGATGACCGCGTCGTTGGCGGTTTCGCCGCGCTTGTCACGGC > NC_002947/2453454‑2453740 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |