| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,475,286 | T→G | 8.3% | intergenic (‑85/+72) | tal ← / ← dusA | transaldolase/tRNA dihydrouridine synthase DusA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,475,286 | 0 | T | G | 8.3% | 252.2 / 12.3 | 84 | intergenic (‑85/+72) | tal/dusA | transaldolase/tRNA dihydrouridine synthase DusA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (37/40); new base G (5/2); total (42/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.33e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.66e-01 | |||||||||||
CCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTCCACGGCCTGGTCAAACACCGCCAAGGGTTCAGCCGCCTTGTGAATGTCTG > NC_002947/2475144‑2475428 | ccccGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCg > 4:286882/1‑149 (MQ=255) cccGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCg > 4:141545/1‑148 (MQ=255) ggTGTCGGCGACCACGGTGGGGAACTGCTGGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGcaca < 8:356438/149‑1 (MQ=255) gtgtCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAg < 2:167262/149‑1 (MQ=255) gtCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAggg < 3:286882/149‑1 (MQ=255) tgCGACCACGGTGGTTAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAATCCCTGCGGGCCAGCGGGTCCGcagg < 6:223424/142‑3 (MQ=255) ggCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCt < 5:220950/148‑1 (MQ=255) ggCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGATGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGGCCAGCGCGTCCGcagg > 5:223424/1‑141 (MQ=255) gagACCCCGGGGGTGCACGGCTTGAGTTGAGCCATCTTGCAGGTCAGGGGCTGGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCGAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGt < 8:152275/147‑1 (MQ=255) cGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGCTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTa < 5:350096/149‑1 (MQ=255) ggtggtGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAgg < 3:141545/149‑1 (MQ=255) tGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCATGTGCATTTACTCGCCATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGA‑GAAGATTc > 6:54973/1‑148 (MQ=255) gCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTc > 8:7120/1‑147 (MQ=255) ttGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAggg > 2:50425/1‑124 (MQ=255) ttGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAggg < 1:50425/124‑1 (MQ=255) ttGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCACCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGA‑GAAGATTCGAGt > 8:379976/1‑149 (MQ=255) gttgttCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCgc > 4:20147/1‑148 (MQ=255) ttCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCgcaagc > 6:181553/1‑148 (MQ=255) ccAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCgcaagcaa < 8:387141/148‑1 (MQ=255) ttGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGTATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAggg > 8:247561/1‑109 (MQ=255) ttGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGTATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAggg < 7:247561/109‑1 (MQ=255) ggAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAg < 6:146847/148‑1 (MQ=255) gCGTGCGCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCcctccctc < 5:242168/149‑1 (MQ=255) gCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAg < 5:181553/149‑1 (MQ=255) tctGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGt > 3:276867/1‑149 (MQ=255) tctGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGGACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCACGCCCGCGGTTAcctccctcgtcggc > 4:210418/1‑143 (MQ=255) tctGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCGGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAg < 3:210418/147‑1 (MQ=255) tGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTtccct < 7:174377/136‑1 (MQ=255) tGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTtccct > 8:174377/1‑136 (MQ=255) tCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCAc < 5:316611/148‑1 (MQ=255) cTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑Ga > 6:239445/1‑99 (MQ=255) cTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑Ga < 5:239445/99‑1 (MQ=255) cTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCg < 3:349063/148‑1 (MQ=255) tgtgCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGa > 8:12759/1‑123 (MQ=255) tgtgCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGa < 7:12759/123‑1 (MQ=255) cATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTg < 7:7120/149‑1 (MQ=255) tttACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGc > 4:323897/1‑148 (MQ=255) tttACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGc > 2:364243/1‑148 (MQ=255) tttACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGc > 8:311776/1‑148 (MQ=255) tttACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGCTCACATCACCTGc > 6:283543/1‑148 (MQ=255) tACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGcaa < 4:276867/148‑1 (MQ=255) aCTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGcaac > 7:223793/1‑148 (MQ=255) tCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGcaacaa > 2:89000/1‑148 (MQ=255) gACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTc > 2:80493/1‑149 (MQ=255) cATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTcc > 3:225278/1‑148 (MQ=255) cATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTcc < 4:225278/148‑1 (MQ=255) cGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGTACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACTAAAGGT‑TAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTCCACGGCCTg < 7:379976/149‑1 (MQ=255) gAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTCCACGGCCTgg < 8:223793/149‑1 (MQ=255) ccGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGa < 2:29538/78‑1 (MQ=255) ccGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGa > 3:239080/1‑78 (MQ=255) ccGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGa < 4:239080/78‑1 (MQ=255) ccGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGa > 1:29538/1‑78 (MQ=255) ccGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCATCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTCCACGGCCTGGACaaa > 2:363718/1‑149 (MQ=255) cGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTCCACgg > 7:274193/1‑131 (MQ=255) cGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTCCACgg < 8:274193/131‑1 (MQ=255) cGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTCCACGGCCTGGTCAAACACCGcc > 3:72582/1‑148 (MQ=255) gCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTCCACGGCCTGGTCAAACACCGcc > 8:154935/1‑147 (MQ=255) gCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTCCACGGCCTGGTCAAACACCGcc > 8:160335/1‑147 (MQ=255) gagcggCTGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTCCACGGCCTGGTCAAACACCGCCAAgg < 2:125996/144‑1 (MQ=255) cAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGTGGAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTCCACGGCCTGGTCAAACACCGCCAAgg > 1:314890/1‑149 (MQ=255) aaGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCCACAACTCCACGGCCTGGTCAAACACCGCCAAGGGt > 6:343117/1‑149 (MQ=255) aGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTCCACGGCCTGGTCAAACACCGCCAAGGGtt < 3:323897/149‑1 (MQ=255) ggCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTCCACGGCCTGGTCAAACACCGCCAAGGGTTCa < 7:160335/149‑1 (MQ=255) ggCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTCCACGGCCTGGTCAAACACCGCCAAGGGTTCa < 7:154935/149‑1 (MQ=255) ggCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTCCACGGCCTGGTCAAACACCGCCAAGGGTTCa < 1:364243/149‑1 (MQ=255) ggCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTCCACGGCCTGGTCAAACACCGCCAAGGGTTCa > 8:13502/1‑149 (MQ=255) ccgccgAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCACGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTCCACGGCCTGGTCAAACACCGCCAAGGGTTCAgc > 8:65652/1‑149 (MQ=255) cgccgAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGCGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGAAACAACTCCACGGCCTGGTCAAACACCGCCAAGGGTTCAgcc > 8:270855/1‑149 (MQ=255) gccgAACCCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGccc < 2:350362/102‑1 (MQ=255) gccgAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGccc > 1:350362/1‑102 (MQ=255) gccgAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTCCACGGCCTGGTCAAACACCGCCAAGGGTTCAgccg < 7:54777/149‑1 (MQ=255) aaCCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTCCACGGCCTGGTCAAACACCGCCAAGGGTTCAGCCGCCTtg < 7:13502/149‑1 (MQ=255) 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cTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTCCACGGCCTGGTCAAACACCGCCAAGGGTTCAGCCGCCTTGTGaa < 2:314890/149‑1 (MQ=255) cTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCACCCCTGCAACAACTCCACGGCCTGGTCAAACACCGCCAAGGGTTCAGCCGCCTTGTGaa > 7:129903/1‑149 (MQ=255) cGGACCCGCTGGCCCGCACAGGTCTTTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTCCACGGCCTGGTCAAACACCGCCAAGGGTTCAGCCGCCTTGTGAATGt < 4:278393/149‑1 (MQ=255) cGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGTTCACCGCCCCTGCAACAACTCCACGGCCTGGTCAAACAGCGCCAAGGGTTCAGCCGCCTTGTGAAt < 5:54973/147‑1 (MQ=255) ggACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTCCACGGCCTGGTCAAACACCGCCAAGGGTTCAGCCGCCTTGTGAATGTc > 5:79742/1‑149 (MQ=255) aCCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTCCACGGCCTGGTCAAACACCGCCAAGGGTTCAGCCGCCTTGTGAATGTCTg < 1:80493/149‑1 (MQ=255) | CCCCGGTGTCGGCGACCACGGTGGTGAACTGCTTGAGTTGTTCCAGCTTGGAGGTCATGGGCGTGCTCTGTCCTGTGCATTTACTCGACATTACCCGAGCCCCGGCAGCCGCTCAAGGGCCGCCGAAACCCTGCGGACCCGCTGGCCCGCACAGGGCTGTACGAAAGGT‑GAAGATTCGAGTCGCAAGCAAGCCCGAGGTTCCCTCCCTCTGAGGTCACCGCCCCTGCAACAACTCCACGGCCTGGTCAAACACCGCCAAGGGTTCAGCCGCCTTGTGAATGTCTG > NC_002947/2475144‑2475428 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |