Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 233,834 | A→T | 13.1% | intergenic (+22/+41) | PP_0180 → / ← PP_0181 | cytochrome c family protein/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 233,834 | 0 | A | T | 13.1% | 148.4 / 14.1 | 68 | intergenic (+22/+41) | PP_0180/PP_0181 | cytochrome c family protein/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (25/33); new base T (5/4); total (31/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.00e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.47e-01 |
TTCGACTGGCTGGGGATTCATGCCGATGCCTACTCGCTGTCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAA‑GGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTCATGACCCAGGCTGGTCAGGTAGCCGCCATCCGGCTGATCGGT > NC_002947/233687‑233976 | ttCGACTGGCTGGGGATTCATGCCGATGCCTACTCGCTGTCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTTGCTGGCAGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGCCTGGAGCCTGCGCGGGCCCGCAg > 8:277008/1‑149 (MQ=255) ttCGACTGGCTGGGGATTCATGCCGATGCCTACTCGCTGTCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAg > 5:132321/1‑149 (MQ=255) cGACTGGCGGGGGATTCATGCCGATGCCTACTCGCTGTCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCGCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAgg < 4:316618/148‑1 (MQ=255) ctggctggGGATTCATGCCGATGCCTACTCGCTGTCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGAcc < 5:81297/149‑1 (MQ=255) ctggctggGGATTCATGCCGATGCCTACTCGCTGTCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGAcc < 6:132321/149‑1 (MQ=255) gctggGGATTCATGCCGATGCCTACTCGCTGTCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACcgc < 7:135349/148‑1 (MQ=255) gctggGGATTCATGCCGATGCCTACTCGCTGTCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACcg < 8:134768/147‑1 (MQ=255) tggGGATTCATGCCGATGCCTACTCGCTGTCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCgcgc > 1:228624/1‑148 (MQ=255) gggATTCATGCCGATGCCTACTCGCTGTCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCTGTGGGACCGCGCa < 4:303944/147‑1 (MQ=255) cggctacATGCCGATGCCTACTCGCTGTCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCaa < 5:49769/142‑1 (MQ=255) gATTCATGCCGATGCCTACTCGCTGTCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAA‑GGt < 2:234072/149‑1 (MQ=255) aTTCATGCCGATGCCTACTCGCTGTCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAA‑GGtc < 4:309666/149‑1 (MQ=255) aTTCATGCCGATGCCTACTCGCTGTCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAA‑GGt > 8:32780/1‑148 (MQ=255) ttCATGCCGATGCCTACTCGCTGTCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAA‑GGtct > 8:369783/1‑149 (MQ=255) cATGCCGATGCCTACTCGCTGTCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGGAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAA‑GGtct > 1:300726/1‑147 (MQ=255) tGCCTACTCGCTGTCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAA‑GGTCTCAGATCTTgc < 1:70226/149‑1 (MQ=255) tCGCTGTCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGTCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAA‑GGTCTCAGATCTTGCGCAAGc > 2:26332/1‑148 (MQ=255) tCGCTGTCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAA‑GGGCTCAGATCTTGCGCAAGcc > 8:247125/1‑149 (MQ=255) gCTGTCGGCACAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAA‑GGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTg < 1:196701/149‑1 (MQ=255) ggCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAA‑g < 6:112579/120‑1 (MQ=255) ggCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAA‑g > 5:112579/1‑120 (MQ=255) ggCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAA‑GGtctc < 1:17782/125‑1 (MQ=255) ggCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAA‑GGtctc > 2:17782/1‑125 (MQ=255) ggCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAA‑GGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTc < 7:363964/149‑1 (MQ=255) ggCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAA‑GGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTc < 7:358633/149‑1 (MQ=255) gcgcAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGCTGCCCCCGGGACCCCCCCA‑CGGCTCAAAGAGTGAGCAAGCCGGAAGCTc > 4:5726/1‑148 (MQ=255) gCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGGAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAA‑GGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGAGCATCAggcttg < 2:300726/149‑3 (MQ=255) ggCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAA‑GGTCTCAGATCTTGCGCCAGCCTGAGCATCAggcttccgcaa < 7:369783/149‑8 (MQ=255) gCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAA‑GGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTgg > 1:90939/1‑149 (MQ=255) ccTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAA‑GGTCTCAGATCTTg < 3:210783/119‑1 (MQ=255) ccTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAA‑GGTCTCAGATCTTGCGCaa > 1:340465/1‑124 (MQ=255) ccTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAA‑GGTCTCAGATCTTGCGCaa < 2:340465/124‑1 (MQ=255) gCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTTGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAA‑GGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGgcgc < 6:288983/147‑1 (MQ=255) gCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGTCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAA‑GGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTga < 1:26332/148‑1 (MQ=255) gCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAA‑GGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTga < 7:247125/148‑1 (MQ=255) gCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAA‑GGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTg < 2:90939/147‑1 (MQ=255) gCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCGCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCTGTGGGACCGCGCa < 3:69259/96‑1 (MQ=39) cATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCCCAGGGCCCGCGCCA‑GGTCTCAGATCTTTCGCAAGCCGGATGCGCAGGCTGGCAGTGGCGCCGTGAGaa > 7:168599/1‑149 (MQ=255) aTCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAA‑GGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAAt < 2:228624/149‑1 (MQ=255) aTCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCCCCGTCCCACAGGGACCCCGCAA‑GGTCACAGATCATGCGCAAGCCAGAAGCTCAAGCTGGCAGTGGCGCCATGAGTAt > 6:135715/1‑149 (MQ=255) gtTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCCGTGCCACAGGGACCGCGCAA‑GGTGTCAGATCATGCGCAAGCCAGATGCTCAGGCTGGCTGTGGGGGCGTGAGaaatttat > 1:327265/1‑143 (MQ=255) ccTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACACGGTCCCCGCAA‑GGTCTCAGATATTTCGCAACCCAGATGCTAAGGCTGGCTGTGGCGCCATGAGAATGTTCTg > 8:20202/1‑147 (MQ=255) ccTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGGCCCCCACGGGCCCCGCCA‑GGTGGCAGATATTTGGGAAACCAGATGGTAAGGGGGGCGGTGGGGGCGGGAGAATGTTGTGTa > 4:315025/1‑149 (MQ=255) tACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAA‑GGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGc < 7:32780/147‑1 (MQ=255) agggcGCTAGTGGCTGGCCGAAAAGGGGATTGCTGCGGCCAACTGTCTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGAACGCGCAA‑TGTGTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAAt < 7:277008/144‑1 (MQ=255) tggctggcCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAA‑GGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTc < 7:20202/149‑1 (MQ=255) gctggcCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAA‑GGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCaa < 3:315025/149‑1 (MQ=255) gcCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAA‑GGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTgg < 7:155681/107‑1 (MQ=255) gAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAA‑GGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTc < 1:4481/149‑1 (MQ=255) gAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAA‑GGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTc < 5:135715/149‑1 (MQ=255) ctgcGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAA‑GGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTCATGACCCAGGCt < 3:5726/148‑1 (MQ=255) ggCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAA‑GGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTCATGACCCAGGCTGGTCa < 8:168599/149‑1 (MQ=255) ctgactgGAGCCTGCGCGGGCCCACACGGACCGCCCAA‑AGTCGCAGATCTTGCGCAAGCCGGATGGTCACGCTGGCTGTGGCGCCGTGAGAAAGTTCTGTTTCAATTTGACACATTAAACGGCGTCATGACCCACGCGGGTCAGGTAga > 6:105759/1‑148 (MQ=255) actgGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAA‑GGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTCATGACCCAGGCTGGTCAGGTAgccg < 5:105759/148‑1 (MQ=255) ccTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAA‑GGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTCATGACCCAGGCTGGTCAGGTAGCCGCCATCCgg > 6:258248/1‑149 (MQ=255) ttGCGCGGTCCCTGTGGGACCGCGCAAGGGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTCATGACCCAGGCTGGTCAGGTAGCCGCCATCCgg > 1:24771/2‑149 (MQ=255) ttGCGCGGTCCCTGTGGGACCGCGCAA‑GGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTCATGACCCAGGCTGGTCAGGTAGCCGCCATCCGGc > 7:196100/2‑149 (MQ=255) cgcgGTCCCTGTGGGACCGCGCAG‑GGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTCATGACCCAGGCTGGTc > 4:44941/1‑128 (MQ=255) cgcgGTCCCTGTGGGACCGCGCAG‑GGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTCATGACCCAGGCTGGTc < 3:44941/128‑1 (MQ=255) gcgGTCCCTGTGGGACCGCGCAA‑GGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTCATGACCCAGGCTGGTCAGGTAGCCGCCATCCGGCTGAt > 6:266355/1‑149 (MQ=255) gcgGTCCCTGTGGGACCGCGCAA‑GGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTCATGACCCAGGCTGGTCAGGTAGCCGCCATCCGACTGAt > 2:230358/1‑149 (MQ=255) cgGTCCCTGTGGGACCGCGCAA‑GGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTCATGACCCAGGCTGGTCAGGTAGCCGCCATCCGGCTGATc < 8:196100/149‑1 (MQ=255) ggTCCCACAGGGACCGCGCAA‑GGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTCATGACCCAGGCTGGTCAGGTAGCCGCCATCCGGCTGATCg > 1:163953/1‑149 (MQ=255) tCCCACAGGGACCGCGCAA‑GGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCATGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTACTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTCATGACCCAGGCTGTTCAGGTAGACGCCATCCGGCTGaactgt > 8:262673/1‑144 (MQ=255) tCCCACAGGGACCGCGCAA‑GGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTCATGACCCAGGCTGGTCAGGTAGCCGCCATCCGGCTGATCGGt > 8:262670/1‑149 (MQ=255) ccACAGGGACCGCGCAA‑GGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTCATGACCCAGGCTGGTCAGGTAGCCGCCATCCGGCTGATCGGt > 3:270721/1‑147 (MQ=255) ccACAGGGACCGCGCAA‑GGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTCATGACCCAGGCTGGTCAGGTAGCCGCCATCCGGCTGATCGGt > 3:107584/1‑147 (MQ=255) ccACAGGGACCGCGCAA‑GGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTCATGACCCAGGCTGGTCAGGTAGCCGCCATCCGGCTGATCGGt > 4:24745/1‑147 (MQ=255) | TTCGACTGGCTGGGGATTCATGCCGATGCCTACTCGCTGTCGGCGCAAGCGGTGGCCTTGCTGGCCATCGTGTTCCTTTACGGCCGCTCGTGGCTGGCCGAAAAGCGCAGTGCTGCGGCCAACTGACTGGAGCCTGCGCGGTCCCACAGGGACCGCGCAA‑GGTCTCAGATCTTGCGCAAGCCTGATGCTCAGGCTGGCTGTGGCGCCTTGAGAATGTTCTGTAGCAATTGGACACTTTCAACGGCGTCATGACCCAGGCTGGTCAGGTAGCCGCCATCCGGCTGATCGGT > NC_002947/233687‑233976 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |