Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,183,329 | A→C | 6.0% | E330A (GAG→GCG) | PP_2793 → | acyl‑CoA dehydrogenase family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,183,329 | 0 | A | C | 6.0% | 203.2 / 3.4 | 67 | E330A (GAG→GCG) | PP_2793 | acyl‑CoA dehydrogenase family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (32/31); new base C (2/2); total (34/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.11e-01 |
GCGAGCACCAGGGCGTGGGTTTCATGCTGGCCGACAACATGATGGACCTGCACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTCGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGCCCGTTCCGCATCTATGACGGCCCGAGCGAAGTGCACCGCATGAGCCTG > NC_002947/3183182‑3183474 | gCGAGCACCAGGGCGTGGGTTTCATGCTGGCCGACAACATGATGGACCTGCACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTCGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAg > 4:161224/1‑149 (MQ=255) gAGCACCAGGGCGTGGGTTTCATGCTGGCCGACAACATGATGGACCTGCACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTCGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGgc > 8:117198/1‑149 (MQ=255) aGGGCGTGGGTTTCATGCTGGCCGACAACATGATGGACCTGCACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTCGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCTCGGCGCtgatc < 5:291059/149‑4 (MQ=255) gTGGGTTTCATGCTGGCCGACAACATGATGGACCTGCACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTCGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGggt < 2:217445/149‑1 (MQ=255) gTGGGTTTCATGCTGGCCGACAACATGATGGACCTGCACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTCGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGggt > 7:339525/1‑149 (MQ=255) tttCATGCTGGCCGACAACATGATGGACCTGCACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTCGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGggtggt > 2:226584/1‑147 (MQ=255) tttCATGCTGGCCGACAACATGATGGACCTGCACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTCGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGggtggt < 1:226584/147‑1 (MQ=255) tttCATGCTGGCCGACAACATGATGGACCTGCACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTCGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCg < 2:274979/149‑1 (MQ=255) aTGCTGGCCGACAACATGATGGACCTGCACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTCGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATc < 6:123416/148‑1 (MQ=255) aTGCTGGCCGACAACATGATGGACCTGCACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTCGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATc < 4:177359/148‑1 (MQ=255) cTGGCCGACAACATGATGGACCTGCACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTCGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGtt < 3:324803/148‑1 (MQ=255) ggCCGACACCATGATGGACCTGCACGTGGTGCGTCTGGCGGGCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTCGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCg < 5:299292/149‑1 (MQ=255) cGACAACATGATGGACCTGAACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTCGACCAGGGCAGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAACGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTAGATCGTTGCGTc > 3:217109/1‑148 (MQ=255) gACAACATGATGGACCTGCACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTCGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCa < 4:254579/149‑1 (MQ=255) aacaTGATGGACCTGCACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTCGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCgg < 4:78643/126‑1 (MQ=255) aacaTGATGGACCTGCACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTCGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCgg > 3:78643/1‑126 (MQ=255) aacaTGATGGACCTGCACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTCGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAgg > 2:297644/1‑148 (MQ=255) ggACCTGCACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTCGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTg > 4:320398/1‑149 (MQ=255) gACCTGCACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTCGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTg < 1:297644/148‑1 (MQ=255) gCACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTAGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGAcgcg > 3:253936/1‑149 (MQ=255) cACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTCGCCCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCgg > 1:77230/1‑149 (MQ=255) cACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTCGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCgg < 1:311808/149‑1 (MQ=255) aCGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTCGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTggg < 8:373406/139‑1 (MQ=255) aCGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTCGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTggg > 7:373406/1‑139 (MQ=255) gtggtgCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTCGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGt > 8:227648/1‑149 (MQ=255) tggtgCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTCGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGt > 2:165815/1‑148 (MQ=255) tgCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTCGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGAcc > 7:320541/1‑149 (MQ=255) cGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTCGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCggg > 2:322715/1‑141 (MQ=255) cGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTCGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCggg < 1:322715/141‑1 (MQ=255) gTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTCGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCggg < 3:320398/149‑1 (MQ=255) ggCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTCGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGaca > 7:328652/1‑149 (MQ=255) gCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTCGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCg > 7:178047/1‑142 (MQ=255) gCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTCGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCg < 8:178047/142‑1 (MQ=255) gCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTCGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGacac > 2:212388/1‑149 (MQ=255) gCACTGCGCCTGGGTGCTCGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCgtggt < 7:117198/147‑1 (MQ=255) cgcgTGGGTGCTCGAGCAGGGCGTGCGCGCCAATGTCGATTCTAGCATGGCCAAGGTGATGATCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATGGTTGCGTCCAGGTATTTGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGa < 4:217109/149‑1 (MQ=255) cgcCTGGGTGCTCGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGa < 4:138805/149‑1 (MQ=255) gcCTGGGTGCTCGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGAt > 3:4407/1‑149 (MQ=255) gcCTGGGTGCTCGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGAt < 1:409055/149‑1 (MQ=255) ccTGGGTGCTCGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACAGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATc > 3:316602/1‑149 (MQ=255) gggTGCTCGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTc > 6:306507/1‑149 (MQ=255) gTGCTCGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCcg < 1:165815/149‑1 (MQ=255) aGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGc > 3:92925/1‑149 (MQ=255) aGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTAGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGc < 2:77230/149‑1 (MQ=255) ggCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGccc > 3:329432/1‑149 (MQ=255) ggCGTGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGCCCGTTc > 1:194041/1‑149 (MQ=255) ggCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGGCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCgtggtg < 4:307282/119‑1 (MQ=255) gcCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGCCCGTTCCGCAt > 6:342441/1‑149 (MQ=255) gcCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGCCCGTTCCGCAt > 4:90973/1‑149 (MQ=255) acAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGCCCGTTCCGCATc < 8:339525/148‑1 (MQ=255) gATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGCCCGTTCCGCATCTATGACgg > 7:279813/1‑149 (MQ=255) aTTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCggg < 1:256679/92‑1 (MQ=255) gAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGCCCGTTCCg > 8:23228/1‑132 (MQ=255) gAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGCCCGTTCCg < 7:23228/132‑1 (MQ=255) cATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGCCCGTTCCGCATCTATGACGGCCCGAGCg < 4:329432/149‑1 (MQ=255) tGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGCCCGTTCCGCATCTATGACGGCCCGAGCGaa < 7:220695/149‑1 (MQ=255) tGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGCCCGTTCCGCATCTATGACGGCCCGAGCGaa < 8:320541/149‑1 (MQ=255) ccAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGCCCGTTCCGCATCTATGACGGCCCGAGCGaa > 6:134118/1‑146 (MQ=255) ccAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGCCCGTTCCGCATCTATGACGGCCCGAGCGaa < 5:134118/146‑1 (MQ=255) aaGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACAGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGCCCGTTCCGCATCTATGACGGCCCGAGCGAAGTGCa > 7:36779/1‑149 (MQ=255) ggTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGCCCGTTCCGCATCTATGACGGCCCGAGCGAAGTGCAcc < 1:212388/149‑1 (MQ=255) gccacAGCGCCTCGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGCCCGTTCCGCATCTATGACGGCCCGAGCGAAGTGCACCg > 3:376099/5‑148 (MQ=255) ccacAGCGCCTCGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGCCCGTTCCGCATCTATGACGGCCCGAGc > 2:188956/4‑136 (MQ=255) ccacAGCGCCTCGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGCCCGTTCCGCATCTATGACGGCCCGAGc < 1:188956/133‑1 (MQ=255) gcgcCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGCCCGTTCCGCATCTATGACGGc < 6:245381/125‑1 (MQ=255) gcgcCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGCCCGTTCCGCATCTATGACGGc > 5:245381/1‑125 (MQ=255) ccGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGCCCGTTCCGCATCTATGACGGCCCGAGCGAAGTGCACCGCATGAGCCTg > 5:343855/1‑149 (MQ=255) | GCGAGCACCAGGGCGTGGGTTTCATGCTGGCCGACAACATGATGGACCTGCACGTGGTGCGTCTGGCGGTCTGGCACTGCGCCTGGGTGCTCGACCAGGGCCGGCGCGCCAATGTCGATTCGAGCATGGCCAAGGTGATCAGCGCCGAGGCGCTGTGGCGGGTGGTCGATCGTTGCGTCCAGGTATTGGGTGGACGCGGGGTGACCGGGGACACCGTGGTGGAGCGGATCTTCCGCGACATTCGCCCGTTCCGCATCTATGACGGCCCGAGCGAAGTGCACCGCATGAGCCTG > NC_002947/3183182‑3183474 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |