| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,394,820 | C→G | 5.8% | H107Q (CAC→CAG) | PP_2998 → | 2‑dehydropantoate 2‑reductase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,394,820 | 0 | C | G | 5.8% | 242.0 / 4.2 | 76 | H107Q (CAC→CAG) | PP_2998 | 2‑dehydropantoate 2‑reductase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (33/38); new base G (2/2); total (35/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.91e-01 | |||||||||||
GCGGCCATCGAAGCCGTAGACGTTGGCGTGACCGATTTGGTGGTGGTGCTGGTGAAGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCAAACAGACTTTCATCGGCGAGCTCGACGGC > NC_002947/3394674‑3394958 | gcggcCATCGAAGCCGTAGACGTTGGCGTGACCGATTTGGTGGTGGTGCTGGTGAAGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGa < 6:378184/149‑1 (MQ=255) gAAGCCGTAGACGTTGGCGTGACCGATTTGGTGGTGGTGCTGGTGAAGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGAGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGCCGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCt > 4:66286/1‑149 (MQ=255) aaGCCGTAGACGTTGGCGTGACCGATTTGGTGGTGGTGCTGGTGAAGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTg > 2:313952/1‑149 (MQ=255) aaGCCGTAGACGTTGGCGTGACCGATTTGGTGGTGGTGCTGGTGAAGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTg > 1:264613/1‑149 (MQ=255) ccGTAGACGTTGGCGTGACCGATTTGGTGGTGGTGCTGGTGAAGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGcc > 4:47811/1‑149 (MQ=255) cGTAGACGTTGGCGTGACCGATTTGGTGGTGGTGCTGGTGAAGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGAc < 5:104856/139‑1 (MQ=255) cGTAGACGTTGGCGTGACCGATTTGGTGGTGGTGCTGGTGAAGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGAc > 6:104856/1‑139 (MQ=255) cGTAGACGTTGGCGTGACCGATTTGGTGGTGGTGCTGGTGAAGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGcc > 6:7642/1‑148 (MQ=255) tAGACGTTGGCGTGACCGATTTGGTGGTGGTGCTGGTGAAGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCAGGATGTCCTCGTGGCCGag < 5:227575/149‑2 (MQ=255) gTTGGCGTGACCGATTTGGTGGTGGTGCTGGTGAAGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAgtggt < 6:137000/149‑1 (MQ=255) gTTGGCGTGACCGATTTGGTGGTGGTGCTGGTGAAGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAgtggt < 2:264613/149‑1 (MQ=255) ttGGCGTGACCGATTTGGTGGTGGTGCTGGTGAAGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAgtggtg < 4:377672/149‑1 (MQ=255) aCCGATTTGGTGGTGGTGCTGGTGAAGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTcgc > 3:392320/1‑147 (MQ=255) ccGATTTGGTGGTGGTGCTGGTGAAGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAg > 3:107915/1‑149 (MQ=255) cGATTTGGTGGTGGTGCTGTTGAAGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCAACATAAGCTGGTTCTGTAGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGACGAAGTGCTGGGTCGCGAGc > 7:169068/1‑149 (MQ=255) cGATTTGGTGGTGGTGCTGGTGAAGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGc > 7:234635/1‑149 (MQ=255) tttGGTGGTGGTGCTGGTGAAGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCggg < 1:82059/149‑1 (MQ=255) tttGGGTGTGGTGCTGGTGAAGTCGTTTCACACTTGCTAGGCGATCGACGGTGCCCACGGGCTGATATGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTTCAGAACGGGCTCTGCCATGAGGAGATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCtgg < 8:169068/149‑1 (MQ=255) ggtggtgCTGGTGAAGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTgctgg > 1:398267/1‑149 (MQ=255) ggtggtgCTGGTGAAGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTgctgg > 1:178867/1‑149 (MQ=255) ttgtgCTGGTGAAGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTgctggct < 5:124435/147‑1 (MQ=255) ggtgCTGGTGAAGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCgg > 6:146629/1‑139 (MQ=255) ggtgCTGGTGAAGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCgg < 5:146629/139‑1 (MQ=255) gtgCTGGTGAAGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTgctggctg < 3:197650/148‑1 (MQ=255) cTGGTGAAGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCaa < 2:404802/149‑1 (MQ=255) gTGAAGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCgg < 2:37226/132‑1 (MQ=255) gTGAAGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGAc < 1:306784/149‑1 (MQ=255) aGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTAt < 2:170464/149‑1 (MQ=255) aGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTAt > 4:301712/1‑149 (MQ=255) gTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATg > 3:253759/1‑149 (MQ=255) tttCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAg > 8:23855/1‑138 (MQ=255) tttCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAg < 7:23855/138‑1 (MQ=255) tatCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCGCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTcgg < 7:91289/147‑1 (MQ=255) acacTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTcggcgg < 3:93615/148‑1 (MQ=255) acacTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGAGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCggcggc > 7:384740/1‑149 (MQ=255) acacTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCGGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTcggcgg < 6:72/148‑1 (MQ=255) cacTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGgcggcg > 5:140166/1‑149 (MQ=255) cTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGTCGTg < 5:284894/149‑1 (MQ=255) cTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTg < 6:140166/149‑1 (MQ=255) ccGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTTGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGc < 8:384740/147‑1 (MQ=255) cGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGctcc < 4:392320/149‑1 (MQ=255) gAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGctcct < 4:107915/149‑1 (MQ=255) ccGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTGGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGc > 2:177950/1‑149 (MQ=255) ccGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGc < 5:314935/149‑1 (MQ=255) ggTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTc < 6:234843/149‑1 (MQ=255) tGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGa < 2:178867/149‑1 (MQ=255) ggCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGATGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGcc > 1:69190/1‑149 (MQ=255) gCTGATCGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGTTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCg < 1:313952/149‑1 (MQ=255) tGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGgt > 7:134673/1‑149 (MQ=255) gATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGgtg > 2:266806/1‑149 (MQ=255) aTAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATGCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGgtg < 8:134673/148‑1 (MQ=255) ccACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCgg < 4:253759/149‑1 (MQ=255) aGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCaaa < 3:301712/149‑1 (MQ=255) gCTGGTGCTGTGGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCAAACAGa < 1:177950/149‑1 (MQ=255) gCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCaaa < 5:55677/145‑1 (MQ=255) gCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCaaa > 6:55677/1‑145 (MQ=255) gTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCAAACAGACTTTCATCg > 7:165126/1‑149 (MQ=255) gTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCAAACAGACTTTCATCg > 7:170499/1‑149 (MQ=255) gCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCAAACAGACTTTCATCGGc < 8:234635/148‑1 (MQ=255) cTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCAAACAGACTTTCATCGGc > 1:5368/1‑147 (MQ=255) tGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCcgc > 1:149657/1‑113 (MQ=255) tGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCcgc > 1:155657/1‑113 (MQ=255) tGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCcgc < 2:149657/113‑1 (MQ=255) tGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCcgc < 2:155657/113‑1 (MQ=255) cAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCAAACAGACTTTCATCGGCGAGCt > 5:201653/1‑149 (MQ=255) cAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCAGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCAAACAGa > 6:39556/1‑133 (MQ=255) cAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCAGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCAAACAGa < 5:39556/133‑1 (MQ=255) gAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCAAACAGACTTTCATCg > 7:371952/1‑140 (MQ=255) gAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCAAACAGACTTTCATCg < 8:371952/140‑1 (MQ=255) aaCGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGgtg > 2:198560/1‑115 (MQ=255) aaCGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGgtg < 1:198560/115‑1 (MQ=255) aCGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGGGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCAAACAGACTTTCATCGGCGAGCTCGAc < 3:47811/149‑1 (MQ=255) gCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCAAACAGACTTTCATCGGCGAGCTCGACGGc > 5:121396/1‑148 (MQ=255) ttCGGCCAGGATGTCCTCGTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCAAACAGACTTTCAt < 7:295580/130‑1 (MQ=255) ttCGGCCAGGATGTCCTCGTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCAAACAGACTTTCAt > 8:295580/2‑131 (MQ=255) ttCGGCCAGGATGTCCTCGTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCAAACAGACTTTCATCGGCGAGCTCGACGGc > 4:1326/2‑147 (MQ=255) | GCGGCCATCGAAGCCGTAGACGTTGGCGTGACCGATTTGGTGGTGGTGCTGGTGAAGTCGTTTCACACTGCCGAGGCCATCGCCGGTGCCCACGGGCTGATAGGCCCACAGACGCTGGTGCTGTCGCTGCAGAACGGGCTCGGCCACGAGGACATCCTGGCCGAAGTGGTGGGTCGCGAGCGGGTGCTGGCTGGCAAGACCTATGTCGGCGGCGTGCTCCTCGCGCCGGGCTCGATCCGCGCCGGTGTGGCCGGCAAACAGACTTTCATCGGCGAGCTCGACGGC > NC_002947/3394674‑3394958 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |