| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,553,796 | A→G | 7.8% | S155G (AGC→GGC) | PP_3138 → | VirK domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,553,796 | 0 | A | G | 7.8% | 181.7 / 4.7 | 64 | S155G (AGC→GGC) | PP_3138 | VirK domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (29/30); new base G (2/3); total (31/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.76e-01 | |||||||||||
TGTGTGACCTGTCCAGCCACTCGCCGGGCTGTTGCCTGGTGCTGGACCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTCGAAGGGCTGCGGCCACGCAGCCTGTTGCTCGAAGCGTTGAAATG > NC_002947/3553656‑3553944 | tgtgtgACCTGTCCAGCCACTCGCCGGGCTGTTGCCTGGTGCTGGACCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGt > 1:366203/1‑149 (MQ=255)tgtgtgACCTGTCCAGCCACTCGCCGGGCTGTTGCCTGGTGCTGGACCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGt < 8:237025/149‑1 (MQ=255) tgACCTGTCCAGCCACTCGCCGGGCTGTTGCCTGGTGCTGGACCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCT‑GGCTGCGGCCCAGGGTGaa < 7:337321/148‑1 (MQ=255) cAGCCACTCGCCGGGCTGTTGCCTGGTGCTGGACCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGt < 3:174139/149‑1 (MQ=255) cAGCCACTCGCCGGGCTGTTGCCTGGTGCTGGACCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAACGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGCCATGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCGGCgtgt > 2:225302/1‑149 (MQ=255) aGCCACGCGCCGGGCTGTTGCCTGGTGCTGGACCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGTCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGtt < 1:372189/149‑1 (MQ=255) aCTCGCCGGGCTGTTGCCTGGTGCTGGACCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCAtt > 6:246173/1‑149 (MQ=255) aCTCGCCGGGCTGTTGCCTGGTGCTGGACCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCAtt < 4:143620/149‑1 (MQ=255) cGCCGGGCTGTTGCCTGGTGCTGGACCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTggt < 2:89292/149‑1 (MQ=255) ccGGGCTGTTGCCTGGTGCTGGACCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTggtgc < 8:313821/149‑1 (MQ=255) gggCTGTTGCCTGGTGCTGGACCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTggtgcgg > 3:75032/1‑149 (MQ=255) tGTTGCCTGGTGCTGGACCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGTCCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCa < 5:100/149‑1 (MQ=255) ttGCCTGGTGCTGGACCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAgg > 8:73207/1‑149 (MQ=255) ttGCCTGGTGCTGGACCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCATCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTggt > 4:246886/1‑139 (MQ=255) ttGCCTGGTGCTGGACCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCATCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTggt < 3:246886/139‑1 (MQ=255) gTGCTGGACCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATc < 7:73207/147‑1 (MQ=255) tGGACCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCcaca > 7:258293/1‑147 (MQ=255) aCCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCT‑GGCTGCGGCCCAGGGTGaa < 8:76273/107‑1 (MQ=38) aCCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCT‑GGCTGCGGCCCAGGGTGaa > 7:76273/1‑107 (MQ=38) ccGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTa > 4:289078/1‑149 (MQ=255) ccGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTa < 4:75032/149‑1 (MQ=255) gCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTATc > 8:81014/1‑148 (MQ=255) ccAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAgg > 2:235002/1‑130 (MQ=255) ccAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAgg < 1:235002/130‑1 (MQ=255) aTCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTATCGACAg < 7:81014/149‑1 (MQ=255) aaGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTATCGACAGCGAAACCTc > 3:329547/1‑149 (MQ=255) cgcgAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTATCGACAGCGAAACCTCGCt > 5:214529/1‑149 (MQ=255) gcgAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTATCGACAGCGAAACCTCGCTg > 5:201486/1‑149 (MQ=255) gAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTATCGACAGCGAAACCTCGCTGGc > 7:154467/1‑149 (MQ=255) gtcGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCTCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCAt < 1:225302/147‑1 (MQ=255) gCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAAcctgc > 2:373156/1‑86 (MQ=255) gCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAAcctgc < 1:373156/86‑1 (MQ=255) aGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTAc < 2:213937/149‑1 (MQ=255) tGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGt > 5:242233/1‑149 (MQ=255) gTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGtga < 6:201486/149‑1 (MQ=255) gTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGtg < 8:154467/148‑1 (MQ=255) tGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGtgac < 6:107563/149‑1 (MQ=255) tGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGtgac < 5:246173/149‑1 (MQ=255) aaCCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGtgacctgac < 6:214529/149‑1 (MQ=255) ccTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTATCGACAGCGAAACCTCGCTg > 6:120643/1‑127 (MQ=255) ccTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTATCGACAGCGAAACCTCGCTg < 5:120643/127‑1 (MQ=255) cTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCaa < 8:258293/149‑1 (MQ=255) gTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACACTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAgg > 4:297165/1‑149 (MQ=255) tCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGa < 6:408976/148‑1 (MQ=255) ccAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGAc < 2:366203/148‑1 (MQ=255) cAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACtt > 4:145450/1‑149 (MQ=255) gCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTCg > 8:240851/1‑148 (MQ=255) catGCGTGTGGAATCCCTTGCCTTCACCATGGGACGCAG‑CCACGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATACACAAAGGTATCGACAGCGAAACCTAGCTGGGCATCTACCGTGACCTGACCAAGTACTTCGaattgc > 7:333879/3‑145 (MQ=255) tgtgGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTCGAAGGGCTGCGGc > 5:31593/1‑149 (MQ=255) gtgGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTCGAAGGGCTGCGGc > 6:47979/1‑148 (MQ=255) cTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTATCGACAGCGAAACCTCGCTgg < 6:93291/97‑1 (MQ=255) cTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTATCGACAGCGAAACCTCGCTgg > 5:93291/1‑97 (MQ=255) gCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTCGAAGGGCTGCGGCCACGCAGCCTGtt > 1:145209/1‑149 (MQ=255) cTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTCGAAGGGCTGCGGCCACGCAGCCTGTTGc > 3:399699/1‑149 (MQ=255) cTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTCGAAGGGCTGCGGCCACGCAGCCTGTTGc > 8:151965/1‑149 (MQ=255) ttCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTAGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTCGAAGGGCTGCGGCCACGCAGCCTGTTGCt > 1:77137/1‑149 (MQ=255) ttCACCCT‑GGCTGCGGCCCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATc < 3:298594/96‑1 (MQ=38) ttCACCCT‑GGCTGCGGCCCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATc > 4:298594/1‑96 (MQ=38) cTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTCGAAGGGCTGCGGCCACGCAGCCTGTTGCTCGAAGc < 4:329547/149‑1 (MQ=255) cTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTCGAAGGGCTGCGGCCACGCAGCCTGTTGCTCGAAGc < 6:242233/149‑1 (MQ=255) gggCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTCGAAGGGCTGCGGCCACGCAGCCTGTTGCTCGAAGCGt > 1:66866/1‑149 (MQ=255) ggCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTCGAAGGGCTGCGGCCACGCAGCCTGTTGCTCGAAGCGtt < 7:240851/149‑1 (MQ=255) ggCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTCGAAGGGCTGCGGCCACGCAGCCTGTTGCTCGAAGCGtt < 5:47979/149‑1 (MQ=255) ggCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTCGAAGGGCTGCGGCCACGCAGCCTGTTGCTCGAAGCGt < 3:289078/148‑1 (MQ=255) aG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTCGAAGGGCTGCGGCCACGCAGCCTGTTGCTCGAAGCGTTGAAATg > 2:149941/1‑149 (MQ=255) | TGTGTGACCTGTCCAGCCACTCGCCGGGCTGTTGCCTGGTGCTGGACCGGCCAATCTGGTTCAAGCGCGAAGGCGAGCTGGTGCTGAACCTGTTCCAGGCCGACCTGCGTGTGGCATCCCTTGCCTTCACCCTGGGCCGCAG‑CCAGGGTGAAACCTGCCTGTTCATTGGTGCGGTGCAGGGCATCCACAAAGGTATCGACAGCGAAACCTCGCTGGCCATCTACCGTGACCTGACCAAGGACTTCGAAGGGCTGCGGCCACGCAGCCTGTTGCTCGAAGCGTTGAAATG > NC_002947/3553656‑3553944 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |