| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,865,284 | C→G | 8.4% | E121Q (GAG→CAG) | PP_3414 ← | methyl‑accepting chemotaxis transducer/sensory box protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,865,284 | 0 | C | G | 8.4% | 219.7 / 10.0 | 71 | E121Q (GAG→CAG) | PP_3414 | methyl‑accepting chemotaxis transducer/sensory box protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (29/36); new base G (2/4); total (31/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.90e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.64e-01 | |||||||||||
CTTGATCACCCGGCCTTGGGGGGTGAACTCGATCACCGCCATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGTTGCTGGTACTCGGCGCTTTTTGCATAGTCCGGCTCA > NC_002947/3865138‑3865429 | cTTGATCACCCGGCCTTGGGGGGTGAACTCGATCACCGCCATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGAACCAACCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCGTGTGACTTTCCGGTGCTCGt > 3:384305/1‑149 (MQ=255) tGATCACCCGGCCTTGGGGGGTGAACTCGATCACCGCCATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTc > 5:296454/1‑148 (MQ=255) gATCACCCGGCCTTGGGGGGTGAACTCGATCACCGCCATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTc > 5:10125/1‑147 (MQ=255) gATCACCCGGCCTTGGGGGGTGAACTCGATCACCGCCATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTc < 8:206262/147‑1 (MQ=255) gATCACCCGGCCTTGGGGGGTGAACTCGATCACCGCCATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTc > 6:244338/1‑147 (MQ=255) cgcgtccTTGGGGGGTGAACTCGATCACCGCAATGTAGCTGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACTCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCTTTGCTCGTCCAGCAc < 7:27683/143‑1 (MQ=255) cccGGCCTTGGGGGGTGAACTCGATCACCGCCATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAg > 6:320809/1‑145 (MQ=255) cccGGCCTTGGGGGGTGAACTCGATCACCGCCATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAg < 5:320809/145‑1 (MQ=255) ccGGCCTTGGGGGGTGAACTCGATCACCGCCATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACgg < 6:296454/149‑1 (MQ=255) ggCCTTGGGGGGTGAACTCGATCACCGCCATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCCGTGCTGGACGAGCACcgg > 6:139215/1‑148 (MQ=255) ccTTGGGGGGTGAACTCGATCACCGCCATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCCGTGCTGGACGAGCACCGGCaa < 1:74126/149‑2 (MQ=255) ccTTGGGGGGTGAACTCGATCACCGCCATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCCGTGCTGGACGAGCACCGGCaa < 6:268651/149‑2 (MQ=255) ccTTGGGGGGTGAACTCGATCACCGCCATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCCGTGCTGGACGAGCACCGGCaa < 5:139215/149‑2 (MQ=255) cTTGGGGGGTGAACTCGATCACCGCCATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATg < 2:320395/149‑1 (MQ=255) ggggggTGAACTCGATCACCGCCATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTa < 2:24899/148‑1 (MQ=255) ggggTGAACTCGATCACCGCCATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCCCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCt < 4:54807/149‑1 (MQ=255) gggTGAACTCGATCACCGCCATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTg > 1:374851/1‑149 (MQ=255) aaCTCGATCACCGCCATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTc < 2:374851/149‑1 (MQ=255) cTCGATCACCGCCATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTcca < 3:133694/149‑1 (MQ=255) gATCACCGCCATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTccagc > 8:203436/1‑148 (MQ=255) aTCACCGCCATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTccagcca < 2:171383/149‑1 (MQ=255) cGCCATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCt > 2:272545/1‑149 (MQ=255) cGCCATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCt > 7:8201/1‑149 (MQ=255) cGCCATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCt > 3:99243/1‑149 (MQ=255) ccATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTcc > 2:181716/1‑137 (MQ=255) ccATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTcc < 1:181716/137‑1 (MQ=255) ccATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTcg > 2:259748/1‑149 (MQ=255) cATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTcgc < 2:90/149‑1 (MQ=255) cGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGc < 4:55982/149‑1 (MQ=255) cTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCtt < 1:272545/149‑1 (MQ=255) tGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTg > 1:213570/1‑149 (MQ=255) aTGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTc < 1:259748/149‑1 (MQ=255) tGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCg < 4:280890/149‑1 (MQ=255) gCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGAt < 1:81735/149‑1 (MQ=255) aGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGaa > 2:94908/1‑149 (MQ=255) ggCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAAc < 6:267397/149‑1 (MQ=255) gCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACg < 8:8201/149‑1 (MQ=255) cTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGt > 8:248646/1‑133 (MQ=255) tttCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTgg < 4:228707/102‑1 (MQ=255) tttCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTgg > 3:228707/1‑102 (MQ=255) ttCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTAc > 7:94227/1‑149 (MQ=255) gCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTg < 5:292285/97‑1 (MQ=255) gCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTg > 6:292285/1‑97 (MQ=255) tctcGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCt > 2:283199/1‑148 (MQ=255) ctcGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGa > 5:319415/1‑149 (MQ=255) tCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCtt > 4:198239/1‑149 (MQ=255) caccacCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTtgcc < 2:213570/147‑1 (MQ=255) ccaccCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTtgccctgc < 6:10125/149‑1 (MQ=255) caccCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTtgccctgcc > 8:178248/1‑149 (MQ=255) tGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCcac < 4:99011/149‑1 (MQ=255) gACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGTTg < 7:203436/149‑1 (MQ=255) ccACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCGAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGTTGCTgg < 5:72611/149‑1 (MQ=255) ccACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGTTGCTgg < 1:283199/149‑1 (MQ=255) ccACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGTTGCTgg < 6:288692/149‑1 (MQ=255) aCCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGTTGCTGGt > 8:175852/1‑148 (MQ=255) ccTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGTTGCTGGTAc > 6:326849/1‑149 (MQ=255) cTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGTTGCTGGTACt > 6:410930/1‑149 (MQ=255) ttGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTtgccctgcc > 4:150013/1‑121 (MQ=255) ttGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTtgccctgcc < 3:150013/121‑1 (MQ=255) gATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGTTGCTGGTACTCg < 8:170714/148‑1 (MQ=255) cGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGTTGCTGGTACTCGGCGCtt < 6:319415/149‑1 (MQ=255) gTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGTGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGTTGCTGGTACTCGGCGCTTTTTg < 4:99243/148‑1 (MQ=255) gTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACTGTTGCTGGTACTCGGCGCttttt < 8:316732/147‑1 (MQ=255) gTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGTTGCTGGTACTCGGCGCttttt < 1:94908/147‑1 (MQ=255) gTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGTTGCTGGTACTCGGCGCTTTTTGc < 7:175852/149‑1 (MQ=255) tGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGTTGCTGGTACTCGGCGCTTTTTGCa > 4:141761/1‑149 (MQ=255) ctacatGCCCGTGCTGGACGAGCACCGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGTTGCTGGTACTCGGCGCttttt < 7:192755/141‑1 (MQ=255) ctacatGCCCGTGCTGGACGAGCACCGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGTTGCTGGTACTCGGCGCttttt > 8:192755/6‑146 (MQ=255) aCTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGTTGCTGGTACTCGGCGCTTTTTGCATa > 4:31765/1‑149 (MQ=255) ttGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGTTGCTGGTACTCGGCGCTTTTTGCATAGt > 1:63205/1‑149 (MQ=255) cTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGTTGCTGGTACTCGGCGCTTTTTGCATAGTCCGGCTca < 3:198239/148‑1 (MQ=255) | CTTGATCACCCGGCCTTGGGGGGTGAACTCGATCACCGCCATGGAGCGGCTGATGGCCTTGAGCAGGCTTTCGCTCTCGTGCTCCTGCACCACCCGCTGGGTGATGTCCGACGCCACCTTGATTACGCTGGTGACTTGCCGGTGCTCGTCCAGCACGGGCATGTAGCTGGCTTCCAGCCAGACCTCGCGCCCCGCCTTGTCGATACGCTCGAACGTACCGCTGATAGCCTTGCCCTGCCCCAACTCGCGCCACAGTTGCTGGTACTCGGCGCTTTTTGCATAGTCCGGCTCA > NC_002947/3865138‑3865429 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |