| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 288,015 | G→C | 5.1% | Y31* (TAC→TAG) ‡ | tauA ← | taurine ABC transporter substrate‑binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 288,015 | 0 | G | C | 5.1% | 254.1 / 3.5 | 79 | Y31* (TAC→TAG) ‡ | tauA | taurine ABC transporter substrate‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/39); new base C (2/2); total (37/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.34e-01 | |||||||||||
CAAGTAGCCGATCTGCACGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACGAGAAGGCTAAAT > NC_002947/287868‑288157 | cAAGTAGCCGATCTGCACGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTgg > 1:189434/1‑148 (MQ=255) aaGTAGCCGATCTGCACGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTa < 5:3106/149‑1 (MQ=255) gTAGCCGATCTGCACGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAgg < 2:189434/149‑1 (MQ=255) gATCTGCACGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAgg > 1:167086/1‑143 (MQ=255) gATCTGCACGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAgg < 2:167086/143‑1 (MQ=255) cTGCACGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTc < 2:283435/148‑1 (MQ=255) gCACGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAgg > 1:389639/1‑149 (MQ=255) aCGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTc < 7:284841/149‑1 (MQ=255) cGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGc < 6:176625/136‑1 (MQ=255) cGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGc > 5:176625/1‑136 (MQ=255) tCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGc > 4:253332/1‑149 (MQ=255) tCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGc > 2:1891/1‑149 (MQ=255) gCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTgg < 2:292643/147‑1 (MQ=255) gCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGc < 3:395606/149‑1 (MQ=255) gCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGc > 4:281071/1‑149 (MQ=255) ccACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAg < 5:86741/133‑1 (MQ=255) ccACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAg > 6:86741/1‑133 (MQ=255) ccACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTg > 6:382386/1‑145 (MQ=255) ccACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTg < 5:382386/145‑1 (MQ=255) cACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGcc > 6:122376/1‑148 (MQ=255) aCGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCaa > 3:358251/1‑149 (MQ=255) cGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTTGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCt < 6:53992/137‑1 (MQ=255) cGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCt > 5:53992/1‑137 (MQ=255) cGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCt > 5:75338/1‑137 (MQ=255) cGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCt < 6:75338/137‑1 (MQ=255) cGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAAc < 2:65243/149‑1 (MQ=255) aTCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGt < 2:68725/149‑1 (MQ=255) tCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGt > 4:386698/1‑108 (MQ=255) tCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGt < 3:386698/108‑1 (MQ=255) cGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTg < 4:358251/149‑1 (MQ=255) tCATATTTTCGGCAGTGGATGCTGGAGTTGCTGGCTTTTTAGTTGTCGGCATCGTCCTGCGACTCTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGTTAGGGGACTGTCAGGGCGGCTGCCTGTTCCAAGCATCTTGTGCTTGCGAGGGTAAgtt < 8:337435/148‑3 (MQ=255) tCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTTGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCACCCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGggc > 8:294175/1‑149 (MQ=255) tCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAggg < 7:95236/148‑1 (MQ=255) aaaTTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGggcgg < 5:111221/149‑1 (MQ=255) aaaTTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCAGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGggcgg > 5:51689/1‑149 (MQ=255) aTTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGgcggcg < 1:281705/149‑1 (MQ=255) cgcCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAg < 6:3285/149‑1 (MQ=255) gcCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAgg > 6:360933/1‑149 (MQ=255) cAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGgcg < 3:253332/149‑1 (MQ=255) cAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGgcg < 1:1891/149‑1 (MQ=255) aGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGgcg > 7:290302/1‑148 (MQ=255) tGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGa < 2:389639/149‑1 (MQ=255) tGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGa < 5:122376/149‑1 (MQ=255) ggCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGTGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGa < 2:262218/145‑1 (MQ=255) ggCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGa > 1:262218/1‑145 (MQ=255) ttGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCgg > 2:327796/1‑149 (MQ=255) gacTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGgcgc > 7:113442/3‑130 (MQ=255) gacTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGgcgc < 8:113442/128‑1 (MQ=255) gCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCa < 1:215761/148‑1 (MQ=255) cTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATg < 8:290302/149‑1 (MQ=255) tttCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGt < 5:360933/148‑1 (MQ=255) tCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCg < 3:102994/130‑1 (MQ=255) tCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCg > 4:102994/1‑130 (MQ=255) gCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCtctc < 3:205572/148‑1 (MQ=255) cATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGt > 5:39284/1‑148 (MQ=255) cATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCGGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGCCCAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTc > 7:162529/1‑149 (MQ=255) aTCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTTCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGt > 7:107048/1‑147 (MQ=255) aTCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTGTCGt > 2:344936/1‑147 (MQ=255) aTCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGt > 5:49562/1‑147 (MQ=255) gACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAgg < 3:281071/148‑1 (MQ=255) aCCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGc > 2:275581/1‑148 (MQ=255) cTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAg > 2:34789/1‑149 (MQ=255) cTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAg < 1:2445/149‑1 (MQ=255) tGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGt > 1:26104/1‑149 (MQ=255) tGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTATGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCATGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCACGCAAGt > 2:133629/1‑149 (MQ=255) aCTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCGACTGTCAGGTCGTCTGCCTGGTCCAACGAGCTGGTGCTGGGGAGTGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCTTGATCATGGTTGAACCTGTCGTCAGGCAAGTCGTGtt < 1:133629/149‑1 (MQ=255) tttGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTg > 5:166314/1‑148 (MQ=255) ccGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGTTCATGGTTGAACctc > 5:354772/1‑123 (MQ=255) ccGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACctc < 6:354772/123‑1 (MQ=255) ccGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAAc < 1:327796/149‑1 (MQ=255) cctgACAGTGGCCTACCAGACCACTGTCGGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCa < 6:213938/122‑1 (MQ=255) cctgACAGTGGCCTACCAGACCACTGTCGGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCa > 5:213938/4‑125 (MQ=255) gACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACGAGAAgg < 6:166314/149‑1 (MQ=255) gACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACGAGAAgg > 3:306800/1‑149 (MQ=255) gACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCCTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACGAGAAgg < 1:34789/149‑1 (MQ=255) aCAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACGAGAAGGc < 6:39284/149‑1 (MQ=255) aCAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACGAGAAGGc > 5:361629/1‑149 (MQ=255) aCAGTGGCCTACCAGACCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACga > 6:210070/1‑143 (MQ=255) aCAGTGGCCTACCAGACCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACga < 5:210070/143‑1 (MQ=255) gTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACGAGAAGGCTAAAt > 5:19856/1‑148 (MQ=255) | CAAGTAGCCGATCTGCACGTCGCCGCTGGCCACGGCAGTGATCACGTCTGCGCCGTTATCAAATTTGCGCCAGTCGATGCTGGCCTTGCTGGCTTTTTCGTAGTCGCCATCGACCTGCGCCACTTTGGCCGGGTCGACAGTGGTCTGGTAGGCCACTGTCAGGTCGGCTGCCTGGGCCAACCAGCTGGTGCTGGCGAGGGTCAGGGCGGCGAACAGGCGCAGCGGAGCGTGCGGGATCATGGTTGAACCTCTCGTCAGGCAAGTCGTGTTGGATAACGAGAAGGCTAAAT > NC_002947/287868‑288157 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |