Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,900,119 | T→G | 5.8% | L176R (CTG→CGG) | PP_3443 → | glyceraldehyde‑3‑phosphate dehydrogenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,900,119 | 0 | T | G | 5.8% | 201.4 / 2.8 | 68 | L176R (CTG→CGG) | PP_3443 | glyceraldehyde‑3‑phosphate dehydrogenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (32/32); new base G (2/2); total (34/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.14e-01 |
CAAGAACCTGAAGGATTCGGAAAAGGAATTCGACCGCACCTGCGACTACATCGTCGACACCATCAACGCCCTCAAGGACCTGGACCGCCGCTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACGAGACCTTCACCACGCTCATCCCGGCGCTGATCATGGGCAACACGGTGGTGTTCAAGCCGGCCAAGTTCGGCGTACTGCTGATCCGACCCTTGCTCG > NC_002947/3899973‑3900259 | cAAGAACCTGAAGGATTCGGAAAAGGAATTCGACCGCACCTGCGACTACATCGTCGACACCATCAACGCCCTCAAGGACCTGGACCGCCGCTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTgg > 4:161753/1‑149 (MQ=255) aGAACCTGAAGGATTCGGAAAAGGAATTCGACCGCACCTGCGACTACATCGTCGACACCATCAACGCCCTCAAGGACCTGGACCGCCGCTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGc < 4:319636/149‑1 (MQ=255) aCCTGAAGGATTCGGAAAAGGAATTCGACCGCACCTGCGACTACATCGTCGACACCATCAACGCCCTCAAGGACCTGGACCGCCGCTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTg < 5:42052/149‑1 (MQ=255) ccTGAAGGATTCGGAAAAGGAATTCGACCGCACCTGCGACTACATCGTCGACACCATCAACGCCCTCAAGGACCTGGACCGCCGCTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTgg < 1:122989/149‑1 (MQ=255) ccTGAAGGATTCGGAAAAGGAATTCGACCGCACCTGCGACTACATCGTCGACACCATCAACGCCCTCAAGGACCTGGACCGCCGCTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTgg > 3:183869/1‑149 (MQ=255) tGAAGGATTCGGAAAAGGAATTCGACCGCACCTGCGACTACATCGTCGACACCATCAACGCCCTCAAGGACCTGGACCGCCGCTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGCTCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGcc > 7:386955/1‑149 (MQ=255) gAAGGATTCGGAAAAGGAATTCGACCGCACCTGCGACTACATCGTCGACACCATCAACGCCCTCAAGGACCTGGACCGCCGCTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGccc > 7:145581/1‑149 (MQ=255) aTTCGGAAAAGGAATTCGACCGCACCTGCGACTACATCGTCGACACCATCAACGCCCTCAAGGACCTGGACCGCCGCTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCtgtg > 6:329237/1‑148 (MQ=255) ttCGGAAAAGGAATTCGACCGCACCTGCGACTACATCGTCGACACCATCAACGCCCTCAAGGACCTGGACCGCCGCTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCa > 4:92783/1‑149 (MQ=255) ggAAAAGGAATTCGACCGCACCTGCGACTACATCGTCGACACCATCAACGCCCTCAAGGACCTGGACCGCCGCTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATgg > 5:324862/1‑149 (MQ=255) ggAAAAGGAATTCGACCGCACCTGCGACTACATCGTCGACACCATCAACGCCCTCAAGGACCTGGACCGCCGCTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCACGCCCAGCGGGGCGCGGc > 1:255962/1‑138 (MQ=255) ggAAAAGGAATTCGACCGCACCTGCGACTACATCGTCGACACCATCAACGCCCTCAAGGACCTGGACCGCCGATCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCACGCCCAGCGGGGCGCGGc < 2:255962/138‑1 (MQ=255) gAAAAGGAATTCGACCGCACCTGCGACTACATCGTCGACACCATCAACGCCCTCAAGGACCTGGACCGCCGCTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATgg‑‑g > 5:196842/1‑149 (MQ=255) gAAAAGGAATTCGACCGCACCTGCGACTACATCGTCGACACCATCAACGCCCTCAAGGACCTGGACCGCCGCTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATgg‑‑g > 4:139882/1‑149 (MQ=255) gAAAAGGAATTCGACCGCACCTGCGACTACATCGTCGACACCATCAACGCCCTCAAGGACCTGGACCGCCGCTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATgg‑‑g > 4:145765/1‑149 (MQ=255) aaTTCGACCGCACCTGCGACTACATCGTCGACACCATCAACGCCCTCAAGGACCTGGACCGCCGCTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTa > 7:147113/1‑148 (MQ=255) aaTTCGACCGCACCTGCGACTACATCGTCGACACCATCAACGCCCTCAAGGACCTGGACCGCCGCTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTAc < 6:97139/149‑1 (MQ=255) aaTTCGACCGCACCTGCGACTACATCGTCGACACCATCAACGCCCTCAAGGACCTGGACCGCCGCTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTAc < 3:92783/149‑1 (MQ=255) gACCGCACCTGCGACTACATCGTCGACACCATCAACGCCCTCAAGGACCTGGACCGCCGCTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTa > 6:48405/1‑149 (MQ=255) ccTGCGACTACATCGTCGACACCATCAACGCCCTCAAGGACCTGGACCGCCGCTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACt < 5:52270/141‑1 (MQ=255) ccTGCGACTACATCGTCGACACCATCAACGCCCTCAAGGACCTGGACCGCCGCTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACt > 6:52270/1‑141 (MQ=255) gACTACATCGTCGACACCATCAACGCCCTCAAGGACCTGGACCGCCGCTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAAc > 2:99373/1‑147 (MQ=255) gACTACATCGTCGACACCATCAACGCCCTCAAGGACCTGGACCGCCGCTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACga < 5:48405/149‑1 (MQ=255) aCTACATCGTCGACACCATCAACGCCCTCAAGGACCTGGACCGCCGCTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACgag < 7:223812/149‑1 (MQ=255) tACATCGTCGACACCATCAACGCCCTCAAGGACCTGGACGGCCGCTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGTGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GTCC‑CTACAACTACCCGCTGAACGAGAc < 1:287058/149‑1 (MQ=255) cATCGTCGACACCATCAACGCCCTCAAGGACCTGGACCGCCGCTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACGAGACCt > 1:222387/1‑149 (MQ=255) gACACCATCAACGCCCTCAAGGACCTGGACCGCCGCTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACGAGACCTTcaccac < 8:147113/149‑1 (MQ=255) acCATCAACGCCCTCAAGGACCTGGACCGCCGCTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACGAGACCTTCACCACGCt > 7:222862/1‑149 (MQ=255) tCAACGCCCTCAAGGACCTGGACCGCCGCTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACGAGACCTTCACCACGCTCATc < 3:161753/149‑1 (MQ=255) cAACGCCCTCAAGGACCTGGACCGCCGCTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACGAGACCTTCACCACGCTCATcc > 8:147886/1‑149 (MQ=255) aaCGCCCTCAAGGACCTGGACCGCCGCTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACGAGACCTTCACCACGCTCATccc < 4:183869/149‑1 (MQ=255) ccTCAAGGACCTGGACCGCCGCTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACGAGACCTTCACCACGCTCATCCCGgcgc > 6:258517/1‑149 (MQ=255) ccTCAAGGACCTGGACCGCCGCTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACGAGACCTTCACCACGCTCATCCCGgcgc > 3:30001/1‑149 (MQ=255) cTCAAGGACCTGGACCGCCGCTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACGAGACCTTCACCACGCTCATCCCGGCGCt > 5:328995/1‑149 (MQ=255) aGGACCTGGACCGCCGCTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCACGCCCAGCGGGGCGCgg > 4:258791/1‑81 (MQ=255) aGGACCTGGACCGCCGCTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCACGCCCAGCGGGGCGCgg < 3:258791/81‑1 (MQ=255) gcctcTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACACTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACCAGACCTTCACAACGCTCATACCGGCGCTGATCATGGGCAACACg > 6:413611/1‑149 (MQ=255) gccgcTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACGAGACCTTCACCACGCTCATCCCGGCGCTGATCATGGGCAACACg > 2:337483/1‑149 (MQ=255) gccgcTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACGAGACCTTCACCACGCTCATCCCGGCGCTGATCATGGGCAACACg < 5:258517/149‑1 (MQ=255) ccgcTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACGAGACCTTCACCACGCTCATCCCGGCGCTGATCATGGGCAACACgg > 3:369545/1‑149 (MQ=255) ggtgcAGGCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGGACCCTCGGCAAGATGCGGCGGGCCCAGCTGGGCGTGGCTCTGTGCATGG‑‑GGGC‑CTACAACTACCCGGTGAACGAGACCTTCACCACGCTCATCCCGGCGCTGATCATGGGCAACACggtg < 6:328995/145‑1 (MQ=255) gcTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACGAGACCTTCACCACGCTCATCCCGGCGCTGATCATGGGCAACACggtg < 8:145581/149‑1 (MQ=255) gcTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACGAGACCTTCACCACGCTCATCCCGGCGCTGATCATGGGCAACACggtg < 7:147886/149‑1 (MQ=255) gcTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACGAGACCTTCACCACGCTCATCCCGGCGCTGATCATGGGCAACACggtg < 1:337483/149‑1 (MQ=255) cTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACGAGACCTTCACCACGCTCATCCCGgcgc > 8:148504/1‑128 (MQ=255) cTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACGAGACCTTCACCACGCTCATCCCGgcgc < 7:148504/128‑1 (MQ=255) aGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACGAGACCTTCACCACGCTCATCCCGGCGCTGATCATGGGCAACACGGTGgtgt > 2:184942/1‑148 (MQ=255) cTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACGAGACCTTCACCACGCTCATCCCGGCGCTGATCATGGGCAACACGGTGGTGTTCAAGc < 8:71742/149‑1 (MQ=255) gAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACGAGACCTTCACCACGCTCATCCCGGCGCTGATCATGGGCAACACGGTGGTGTTCAAGCCgg < 2:344172/148‑1 (MQ=255) aGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACGAGACCTTCACCACGCTCATCCCGGCGCTGATCATGGGCAACACGGTGGTGTTCAAGCCGGcc < 6:324862/149‑1 (MQ=255) cTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGGGCGGCC‑CTACAAATACCCGCTGAACGCG‑CCATCCCCACGCTCATCCCGGCGATGATAATGGGCACCACGGGGGTGTTCAAGCCGGcaa > 1:120755/1‑147 (MQ=255) cTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACGAGACCTTCACCACGCTCATCCCGGCGCTGATCATGGGCAACACggt < 3:221806/131‑1 (MQ=255) cTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACGAGACCTTCACCACGCTCATCCCGGCGCTGATCATGGGCAACACggt > 4:221806/1‑131 (MQ=255) gAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACGAGACCTTCACCACGCTCATCCCGGCGCTGATCATGGGCACCACGGTGGTGTTCAAGCCGGCCAAGtt > 8:163512/1‑149 (MQ=255) gCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACGAGACCTTCACCACGCTCATCCCGGCGCTGATCATGGGCAACACGGTGGTGTTCAAGCCGGCCAAGTTCg < 8:386955/149‑1 (MQ=255) aaGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACGAGACCTTCACCACGCTCATCCCGGCGCTGATCATGGGCAACACGGTGGTGTTCAAGCCGGCCAAGTTCGGc < 6:196842/149‑1 (MQ=255) gCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACGAGACCTTCACCACGCTCATCCCGGCGCTGATCATGGGCAACACGGTGGTGTTCAAGCCGGCCAAGTTCGGCGTa < 3:145765/149‑1 (MQ=255) gCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACGAGACCTTCACCACGCTCATCCCGGCGCTGATCATGGGCAACACGGTGGTGTTCAAGCCGGCCAAGTTCGGCGTa < 3:139882/149‑1 (MQ=255) cACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACGAGACCTTCACCACGCTCATCCCGGCGCTGATCATGGGCAACACggtg > 4:23903/1‑121 (MQ=255) cACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACGAGACCTTCACCACGCTCATCCCGGCGCTGATCATGGGCAACACggtg < 3:23903/121‑1 (MQ=255) cTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACGAGACCTTCACCACGCTCATCCCGGCGCTGATCATGGGCAACACGGTGGTGTTCACGCCGGCCAAGTTCGGCGTActgct > 8:128913/1‑149 (MQ=255) ggCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACGAGACCTTCACCACGCTCATCCCGGCGCTGATCATGGGCAACACGGTGGTGTTCAAGCCGGCCAAGTTCGGCGTACTGCTGAt < 5:329237/149‑1 (MQ=255) ccAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCCGCTACAACTACCCGCTGAACGAGACCTTCACCACGCTCATCCCGGCGCTGATCATGGGCAACACGGTGGTGTTCAAGCCGGCCAAGTTCGGCGTACTGCTGATc > 1:288805/1‑149 (MQ=255) ccAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACGAGACCTTCACCACGCTCATCCCGGCGCTGATCATGGGCAACACGGTGGTGTTCAAGCCGGCCAAGTTCGGCGTACTGCTGATcc < 4:9268/149‑1 (MQ=255) gATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACGAGACCTTCACCACGCTCATCCCGGCGCTGATCATGGGCAACACGGTGGTGTTCAAGCCGGCCAAGTTCGGCGTACTGCTGATCCGAc < 4:30001/149‑1 (MQ=255) tCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACGAGACCTTCACCACGCTCATCCCGGCGCTGATCATGGGCAACACGGTGGTGTTCAAGCCGGCCAAGTTCGGCGTACTGCTGATCCGAccc > 3:167336/1‑149 (MQ=255) gcgcCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACGAGACCTTCACCACGCTCATCCCGGCGCTGATCATGGGCAACACGGTGGTGTTCAAGCCGGCCAAGTTCGGCGTACTGCTGATCCGACCCTTGCTc < 1:184942/149‑1 (MQ=255) cgcCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACGAGACCTTCACCACGCTCATCCCGGCGCTGATCATGGGCAACACGGTGGTGTTCAAGCCGGCCAAGTTCGGCGTACTGCTGATCCGACCCTTGCTCg < 8:222862/149‑1 (MQ=255) | CAAGAACCTGAAGGATTCGGAAAAGGAATTCGACCGCACCTGCGACTACATCGTCGACACCATCAACGCCCTCAAGGACCTGGACCGCCGCTCCAGCCGCTTCGAGCTGGAGCAAGGCACCCTCGGCCAGATCCGCCGCGCCCCGCTGGGCGTGGCCCTGTGCATGG‑‑GGCC‑CTACAACTACCCGCTGAACGAGACCTTCACCACGCTCATCCCGGCGCTGATCATGGGCAACACGGTGGTGTTCAAGCCGGCCAAGTTCGGCGTACTGCTGATCCGACCCTTGCTCG > NC_002947/3899973‑3900259 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |