| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,935,077 | T→A | 6.1% | E112D (GAA→GAT) | PP_3467 ← | sigma‑54 dependent transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,935,077 | 0 | T | A | 6.1% | 196.4 / 2.7 | 66 | E112D (GAA→GAT) | PP_3467 | sigma‑54 dependent transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (28/34); new base A (2/2); total (30/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.54e-01 | |||||||||||
CGAGGTAATGTTCGCCGCAGTTGATCAGCGTCGGCCGGCCTTCGACCACGGCCGTGCC‑GATGGCATTGGTGCCGC‑GCAGCGATTCGCTCCAGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGGCGCGCGACCAGGTAG‑TCGAGTTCGGGGGTAACGGCATCGATCAGCAGGCGGTTGCGCTCCAGCAGCAGGCGCAGGTCATGGCCCTGTT > NC_002947/3934929‑3935225 | cGAGGTAATGTTCGCCGCAGTTGATCAGCGTCGGCCGGCCTTCGACCACGGCCGTGCC‑GATGGCATTGGTGACGC‑GCAGCGATTAGCTACAGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGAAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCt > 1:158683/1‑149 (MQ=255) ggTAATGTTCGCCGCAGTTGATCAGCGTCGGCCGGCCTTCGACCACGGCCGTGCC‑GATGGCATTGGTGCCGC‑GCAGCGATTCGCTCCAGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTc > 6:250785/1‑148 (MQ=255) gTAATGTTCGCCGCAGTTGATCAGCGTCGGCCGGCCTTCGACCACGGCCGTGCC‑GATGGCATTGGTGCCGC‑GCAGCGATTCGCTCCAGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGa < 8:36219/149‑1 (MQ=255) gTAATGTTCGCCGCAGATGATCAGCGTCGGCCGGCCTTCGACCACGGCCGTGCC‑GATGGCATTGGTGCCGC‑GCAGCGATTCGCTCCAGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGa > 1:112767/1‑149 (MQ=255) gTTCGCCGCAGTTGATCAGCGTCGGCCGGCCTTCGACCACGGCCGTGCCGGATGGCATTGGTGCCGC‑GCAGCGATTCGCTCCAGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGc > 1:95168/1‑149 (MQ=255) ttCGCCGCAGTTGATCAGCGTCGGCCGGCCTTCGACCACGGCCGTGCC‑GATGGCATTGGTGCCGC‑GCAGCGATTCGCTCCAGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGc > 8:313582/1‑147 (MQ=255) ttCGCCGCAGTTGATCAGCGTCGGCCGGCCTTCGACCACGGCCGTGCC‑GATGGCATTGGTGCCGC‑GCAGCGATTCGCTCCAGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCa > 4:33380/1‑149 (MQ=255) ttCGCCGCAGTTGATCAGCGTCGGCCGGCCTTCGACCACGGCCGTGCC‑GATGGCATTGGTGCCGC‑GCAGCGATTCGCTCCAGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCa < 7:31624/149‑1 (MQ=255) gccgcAGTTGATCAGCGTCGGCCGGCCTTCGACCACGGCCGTGCC‑GATGGCATTGGTGCCGC‑GCAGCGATTCGCTCCAGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCa > 1:326815/1‑149 (MQ=255) cgcAGTTGATCAGCGTCGGCCGGCCTTCGACCACGGCCGTGCC‑GATGGCATTGGTGCCGC‑GCAGCGATTCGCTCCAGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCATCGAAGGCCAgaagc < 5:77379/149‑5 (MQ=255) cgcAGTTGATCAGCGTCGGCCGGCCTTCGACCACGGCCGTGCC‑GATGGCATTGGTGCCGC‑GCAGCGATTCGCTCCAGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTGCTGGCCATCGAAGGCCAgaagc < 6:138123/149‑5 (MQ=255) gTTGATCAGCGTCGGCCGGCCTTCGACCACGGCCGTGCC‑GATGGCATTGGTGCCGC‑GCAGCGATTCGCTCCAGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTgg > 3:63079/1‑149 (MQ=255) ttGATCAGCGTCGGCCGGCCTTCGACCACGGCCGTGCC‑GATGGCATTGGTGCCGC‑GCAGCGATTCGCTCCAGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTGCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGc < 5:310899/149‑1 (MQ=255) tCAGCGTCGGCCGGCCTTCGACCACGGCCGTGCC‑GATGGCATTGGTGCCGC‑GCAGCGATTCGCTCCAGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTgg < 6:339983/149‑1 (MQ=255) tCAGCGTCGGCCGGCCTTCGACCACGGCCGTGCC‑GATGGCATTGGTGCCGC‑GCAGCGATTCGCTCCAGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTgg < 4:168127/149‑1 (MQ=255) ggccggccTTCGACCACGGCCGTGCC‑GATGGCATTGGTGCCGC‑GCAGCGATTCGCTCCAGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGcc > 7:93926/1‑149 (MQ=255) ggccTTCGACCACGGCCGTGCC‑GATGGCATTGGTGCCGC‑GCAGCGATTCGCTCCAGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAg > 2:112447/1‑148 (MQ=255) gccTTCGACCACGGCCGTGCC‑GATGGCATTGGTGCCGC‑GCAGCGATTCGCTCCAGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGa < 2:326815/149‑1 (MQ=255) ccTTCGACCACGGCCGTGCC‑GATGGCATTGGTGCCGC‑GCAGCGATTCGCTCCAGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGAt > 7:343066/1‑149 (MQ=255) ttCGACCACGGCCGTGCC‑GATGGCATTGGTGCCGC‑GCAGCGATTCGCTCCAGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACg < 6:57911/124‑1 (MQ=255) ttCGACCACGGCCGTGCC‑GATGGCATTGGTGCCGC‑GCAGCGATTCGCTCCAGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACg > 5:57911/1‑124 (MQ=255) aCCACGGCCGTGCC‑GATGGCATTGGTGCCGCGGCAGCGATTCGCTCCAGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGa > 1:253692/1‑149 (MQ=255) cACGGCCGTGCC‑GATGGCATTGGTGCCGC‑GCAGCGATTCGCTCCAGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGc < 5:250785/149‑1 (MQ=255) cc‑GATGGCATTGGTGCCGC‑GCAGCGATTCGCTCCAGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGcc > 7:264412/1‑149 (MQ=255) cc‑GATGGCATTGGTGCCGC‑GCAGCGATTCGCTCCAGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGcc < 5:281475/149‑1 (MQ=255) c‑GATGGCATTGGTGCCGC‑GCAGCGATTCGCTCCAGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGccc > 2:95105/1‑149 (MQ=255) tGGCATTGGTGCCGC‑GCAGCGATTCGCTCCAGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCGTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTgg < 4:63079/149‑1 (MQ=255) gCATTGGTGCCGC‑GCAGCGATTCGCTCCAGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGgc < 8:208370/148‑1 (MQ=255) aTTGGTGCCGC‑GCAGCGATTCGCTCCAGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGgcgcg < 8:96453/149‑1 (MQ=255) aTTGGTGCCGC‑GCAGCGATTCGCTCCAGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGgcgcg > 3:1371/1‑149 (MQ=255) aTTGGTGCCGC‑GCAGCGATTCGCTCCAGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGgcgcg > 1:244811/1‑149 (MQ=255) gTGCCGC‑GCAGCGATTCGCTCCAGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGGCGCGCGAc < 3:33380/149‑1 (MQ=255) cgc‑gCAGCGATTCGCTCCAGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGGCGCGCGACCAgg > 8:82602/1‑149 (MQ=255) c‑gcAGCGATTCGCTCCAGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGGCGCGCGACCAgg > 6:4395/1‑147 (MQ=255) gcAGCGATTCGCTCCAGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGGCGCGCGACCAGGTAg < 8:93926/149‑1 (MQ=255) cGATTCGCTCCAGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGGCGCGCGACCAGGTAG‑Tc > 1:26872/1‑147 (MQ=255) gATTCGCTCCAGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGGCGCGCGACCAGGTAG‑TCGAg < 5:4395/149‑1 (MQ=255) gCTCCAGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGGCGCGCGACCAGGTAG‑TCGAGTTCgg < 1:112447/149‑1 (MQ=255) tCCAGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGGCGCGCGACCAGGTAG‑TCGAGTTCgggg > 8:132170/1‑149 (MQ=255) aGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTACGCTTTTCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGGCGCGCGACCAGGTAG‑TCGAGTTCGGGGGt > 6:247014/1‑148 (MQ=255) aaCTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGGCGCGCGACCAGGTAG‑TCGAGTTCGGGGGTAACg < 7:82602/149‑1 (MQ=255) cccGGGTGCAGCTCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACCTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGGCGCGCGACCAGGTAG‑TCGAGTTCGGGGGTAACGGCATc > 6:103037/1‑149 (MQ=255) ccGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGGCGCGCGACCAGGTAG‑TCGAGTTCGGGGGTAACGGCATCg < 2:26872/149‑1 (MQ=255) gggTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGGCGCGCGACCAGGTAG‑TCGAGTTCGGGGGTAACGGGATCGAt < 4:218044/149‑1 (MQ=255) ggTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGGCGCGCGACCAGGTAG‑TCGAGTTCGGGGGTAACGGCATCGATc < 2:95168/149‑1 (MQ=255) gTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGGCGCGCGACCAGGTAG‑TCGAGTTCgggg > 3:167620/1‑133 (MQ=255) gTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGGCGCGCGACCAGGTAG‑TCGAGTTCgggg < 4:167620/133‑1 (MQ=255) gTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGGCGCGCGACCAGGTAG‑TCGAGTTCGGGGGTAACGGCATCGATca < 3:192292/149‑1 (MQ=255) cAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGGCGCGCGACCAGGTAG‑TCGAGTTCGGGGGTAACGGCATCGATcagc < 4:293410/148‑1 (MQ=255) gcgcAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGGCGCGCGACCAGGTAG‑TCGAGTTCGGGGGTAACGGCATCGATCAGCAGGCgg < 3:108088/148‑1 (MQ=255) cTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGGCGCGCGACCAGGTAG‑TCGAGTTCGGGGGTAACGGCATCGATCAGCAGGCGGTTGCGCTc > 8:347385/1‑148 (MQ=255) cgcgTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGGCGCGCGACCAGGTAG‑TCGAGTTCGGGGGTAACGGCATCGATCAGCAGGCGGTTGCGCTCca < 8:264412/147‑1 (MQ=255) gcgTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGGCGCGCGACCAGGTAGCTCGAGTTCGGGGGTAACGGCATCGATCAGCAGGCGGTTGCGCTCcagc < 1:95105/149‑1 (MQ=255) caCGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGGCGCGCGACCAGGTAG‑TCGAGTTCGGGGGTAACGGCATCGATCAGCAGGCGGTTGCGCTCCAGCAGCAGGCGCa < 7:132170/149‑1 (MQ=255) aCGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGGCGCGCGACCAGGTAG‑TCGAGTTCGGGGGTAACGGCATCGATCAGCAGGCGGTTGCGCTCCAGCAGCAGGCGCAg < 2:112767/149‑1 (MQ=255) cGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGGCGCGCGACCAGGTAG‑TCGAGTTCTGGGGTAACGGCATCGATCAGCAGGCGGTTGCGCTCCAGCAGCAGGCGCAgg < 4:1371/149‑1 (MQ=255) cGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGGCGCGCGACCAGGTAG‑TCGAGTTCGGGGGTAACGGCATCGATCAGCAGGCGGTTGCGCTCCAGCAGCAGGCGCAgg < 2:244811/149‑1 (MQ=255) tgcTGGCCTTCGATGGCCAGCAGGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGGCGCGCGACCAGGTAG‑TCGAGTTCGGGGGTAACGGCATCGATCAGCAGGCGGtta < 8:103090/121‑2 (MQ=255) tgcTGGCCATCGAAGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGGCGCGCGACCAGGTAG‑TCGAGTTCGGGGGTAACGGCATCGATCAGCAGGCGGTTGCGCTCCAGCAGCAGGCGCAGGTCATg > 3:253682/3‑149 (MQ=255) gcTGGCCATCGAAGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGGCGCGCGACCAGGTAG‑TCGAGTTCGGGGGTAACGGCATCGATCAGCAGGCGGTTGCGCTCCAGCAGCAGGCGCAGGTCATgg > 3:205920/2‑149 (MQ=255) ggCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGGCGCGCGACCAGGTAG‑TCGAGTTCGGGGGTAACGGCATCGATCAGCAGGCGGTTGCGCTcc > 2:244574/1‑125 (MQ=255) ggCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGGCGCGCGACCAGGTAG‑TCGAGTTCGGGGGTAACGGCATCGATCAGCAGGCGGTTGCGCTcc < 1:244574/125‑1 (MQ=255) gCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGGCGCGCGACCAGGTAG‑TCGAGTTCGGGGGTAACGGCATCGATCAGCAGGCGGTTgcgc < 7:266336/121‑1 (MQ=255) gCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGGCGCGCGACCAGGTAG‑TCGAGTTCGGGGGTAACGGCATCGATCAGCAGGCGGTTgcgc > 8:266336/1‑121 (MQ=255) gCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGGCGCGCGACCAGGTAG‑TCGAGTTCGGGGGTAACGGCATCGATCAGCAGGCGGTTGCGCTCCAGCAGCAGGCGCAGGTCATGGCCCt < 5:103037/149‑1 (MQ=255) cTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGGCGCGCGACCAGGTAG‑TCGAGTTCGGGGGTAACGGCATCGATCAGCAGGCGGTTGCGCTCcagcagca > 2:217978/1‑129 (MQ=255) cTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGGCGCGCGACCAGGTAG‑TCGAGTTCGGGGGTAACGGCATCGATCAGCAGGCGGTTGCGCTCCAGCAGCAGGCGCAGGTCATGGCCCTGt > 7:117023/1‑149 (MQ=255) ttCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGGCGCGCGACCAg > 4:96065/1‑72 (MQ=255) ttCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGGCGCGCGACCAg < 3:96065/72‑1 (MQ=255) ttCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGGCGCGCGACCAGGTAG‑TCGAGTTCGGGGGTAACGGCATCGATCAGCAGGCGGTTGCGCTCCAGCAGCAGGCGCAGGTCATGGCCCTGtt > 3:368713/1‑149 (MQ=255) | CGAGGTAATGTTCGCCGCAGTTGATCAGCGTCGGCCGGCCTTCGACCACGGCCGTGCC‑GATGGCATTGGTGCCGC‑GCAGCGATTCGCTCCAGCAACTGCCCGGGTGCAGATCGCGCAGGCCTTCGCGTTGCAGCACGTGCTTCTGGCCTTCGATGGCCAGCACGTTGGCCTGGGCATCGCCGAGGATGACGATGCCAGCCTTGCCCTGGCGCGCGACCAGGTAG‑TCGAGTTCGGGGGTAACGGCATCGATCAGCAGGCGGTTGCGCTCCAGCAGCAGGCGCAGGTCATGGCCCTGTT > NC_002947/3934929‑3935225 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |