| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 750996 | 0 (0.000) | 72 (1.200) | 57/268 | 0.1 | 69.6% | intergenic (‑133/+11) | PP_0640/PP_5450 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | 5061253 = | 63 (1.050) | intergenic (‑420/‑71) | PP_4458/PP_4459 | opine ABC transporter substrate‑binding protein/transposase | |||||
Only 100 of 139 total aligned reads displayed.
CTCCAAAATGAAACATCGTAGTTACGCCCGCTACCTTCAGTAACATTTCGTGCGTACACTAAGAGCGAGCGTGAATACGGATGAGACGCAGTCGTGTCAATAGCTGGTAGGTCTCCATCTCACATTGAGGCCGCACTGACTCTGCTAGTGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGATGAATTCTCAAGACATCGTGCTCAGTGACGATGAACAAGTTGAGCTGAACCGACGAGTTCGGTCTGCCACCATTAG > NC_002947/5061105‑5061400 | cTCCAAAATGAAACATCGTAGTTACGCCCGCTACCTTCAGTAACATTTCGTGCGTACACTAAGAGCGAGCGTGAATACGGATGAGACGCAGTCGTGTCAATAGCTGGTAGGTCTCCATCTCACATTGAGGCCGCACTGACTCTGCTAgt < 2:311256/149‑1 (MQ=255) cttaataaacattgattcaccttttatggggattcgtgattcgctgctaatctaatccgcttatagatctctggctagcatagcttagctccatgatctattaggttgatggcaatgaaattgcttgatcagacgaccaacctagTGtt < 7:275513‑M2/4‑1 (MQ=255) ttaataaacattgattcaccttttatggggattcgtgattcggtgctattctaatccgcttatagatctctgggtagcatagcttagctccatgatctattaggttgatggcaatgaaattgcttgatcagacgaccaacctagTGTTc > 1:161508‑M2/145‑149 (MQ=255) 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acacTAAGAGCGAGCGTGAATACGGATGAGACGCAGTCGTGTCAATAGCTGGTAGGTCTCCATCTCACATTGAGGCCGCACTGACTCTGCTAGTGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTAc > 6:264787/1‑130 (MQ=255) acacTAAGAGCGAGCGTGAATACGGATGAGACGCAGTCGTGTCAATAGCTGGTAGGTCTCCATCTCACATTGAGGCCGCACTGACTCTGCTAGTGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTAc < 5:264787/130‑1 (MQ=255) aatccgcttatagatctctgggtagcatagcttagctccatgatctattaggttgatggcaatgaaattgcttgatcagacgaccaacctagTGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTgg > 5:81527‑M2/93‑139 (MQ=255) aatccgcttatagatctctgggtagcatagcttagctccatgatctattaggttgatggcaatgaaattgcttgatcagacgaccaacctagTGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTgg < 6:81527‑M2/47‑1 (MQ=255) atccgcttatagatctctgggtagcatagcttagctccatgatctattaggttgatggcaatgaaattgcttgatcagacgaccaacctagTGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAgg < 8:168699‑M2/56‑1 (MQ=255) tAAGAGCGAGCGTGAATACGGATGAGACGCAGTCGTGTCAATAGCTGGTAGGTCTCCATCTCACATTGAGGCCGCACTGACTCTGCTAGTGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTc < 6:64294/138‑1 (MQ=255) tAAGAGCGAGCGTGAATACGGATGAGACGCAGTCGTGTCAATAGCTGGTAGGTCTCCATCTCACATTGAGGCCGCACTGACTCTGCTAGTGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTc > 5:64294/1‑138 (MQ=255) gcttatagatctctgggtagcatagcttagctccatgatctattaggttgatggcaatgaaattgcttgatcagacgaccaacctagTGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCgg > 2:299634‑M2/88‑149 (MQ=255) gcttatagatctctgggtagcatagcttagctccatgatctattaggttgatggcaatgaaattgcttgatcagacgaccaacctagTGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCgg > 3:124528‑M2/88‑149 (MQ=255) gcttatagatctctgggtagcatagcttagctccatgatctattaggttgatggcaatgaaattgcttgatcagacgaccaacctagTGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTCGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCgg < 2:41442‑M2/62‑1 (MQ=255) agtgcgtgcgtGAATACGGATGAGACTCAGTCGTGTCAATAGCTGGTAGGTCTCCATCTCACATTGAGGCCGCACTGACTCTGCTAGTGTTCTGTCTCAAAAATTAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCgg < 2:283381/146‑1 (MQ=255) 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5:141898/119‑1 (MQ=255) gTCTCCATCTCACATTGAGGCCGCACTGACTCTGCTAGTGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGATGAATtctc > 6:141898/1‑119 (MQ=255) tggcaatgaaattgcttgatcagacgaccaacctagTGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGATGAATTCTCAAGACATCGTGCTCAGTGACGATGAACAAGtt > 4:161357‑M2/37‑149 (MQ=255) tggcaatgaaattgcttgatcagacgaccaacctagTGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGATGAATTCTCAAGACATCGTGCTCAGTGACGATGAACAAGtt > 2:68650‑M2/37‑149 (MQ=255) ctcCATCTCACATTGAGGCCGCACTGACTCTGCTAGTGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGATGAATTCTCAAGACATCGTGCTCAGTGACGATGAACAAGt < 5:71259/148‑1 (MQ=255) ggcaatgaaattgcttgatcagacgaccaacctagTGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGATGAATTCTCAAGACATCGTGCTCAGTGACGATGAACAAGtt > 5:147806‑M2/36‑148 (MQ=255) 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tcACATTGAGGCCGCACTGACTCTGCTAGTGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGATGAATTCTCAAGACATCGTGCTCAGTGACGATGAACAAGTTGAGCTg > 7:50870/1‑148 (MQ=255) tcACATTGAGGCCGCACTGACTCTGCTAGTGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGATGAATTCTCAAGACATCGTGCTCAGTGACGATGAACAAGTTGAGCTg > 1:34656/1‑148 (MQ=255) ttGAGGCCGCACTGACTCTGCTAGTGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGATGAATTCTCAAGACATCGTGCTCAGTGACGATGAACAAGTTGAGCTGAACcga > 3:87585/1‑149 (MQ=255) cttgatcagacgaccaacctagTGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGATGAATTCTCAAGACATCGTGCTCAGTGACGATGAACAAGTTGAGCTGAACcgac < 7:162418‑M2/126‑1 (MQ=255) gCCGCACTGACTCTGCTAGTGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGATGAATTCTCAAGACATCGTGCTCAGTGACGAt > 3:183110/1‑123 (MQ=255) tcagacgaccaacctagTGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGATGAATTCTCAAGACATCGTGCTCAGTGACGATGAACAAGTTGAGCTGAACCGACGAGTTc > 2:272494‑M2/18‑149 (MQ=255) gacgaccaacctagTGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGATGAATTCTCAAGACATCGTGCTCAGTGACGATGAACAAGTTGAGCTGAACCGACGAGTTCGGt > 5:347209‑M2/15‑149 (MQ=255) ctctGCTAGTTTTCTGTCTCAATAATAAGTTTTCCATTTGAGCTACGGTTCCTTGGTCAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGATGAATTCTCAAGACATCGTGCTCAGTGACGATGAACAAGTTGAGCTGAACCGACGAGTTCGGTCTGc < 4:193758/148‑1 (MQ=255) ccaacctagTGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTAAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGATGAATTCTCAAGACATCGTGCTCAGTGACGATGAACAAGTTGAGCTGAACCGACGAGTTCGGTCTGc > 5:326376‑M2/10‑148 (MQ=255) caacctagTGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGATGAATTCTCAAGACATCGTGCTCAGTGACGAt > 6:243864‑M2/9‑112 (MQ=255) caacctagTGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGATGAATTCTCAAGACATCGTGCTCAGTGACGATGAACAAGTTGAGCTGAACCGACGAGTTCGGTCTGcca > 2:68770‑M2/9‑149 (MQ=255) caacctagTGTTCTGTCTCAAAAATAACTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGATGAATTCTCAAGACATCGTGCTCAGTGACGATGAACAAGTTGAGCTGAACCGACGAGTTCGGTCTGcca > 1:357180‑M2/9‑149 (MQ=255) gTGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGATGAATTCTCAAGACATCGTGCTCAGTGACGATGAACAAGTTGAGCTGAACCGACGAGTTCGGTCTGCCACCATTa < 1:68650‑M2/147‑1 (MQ=255) gTGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGATGAATTCTCAAGACATCGTGCTCAGTGACGATGAACAAGTTGAGCTGAACCGACGAGTTCGGTCTGCCACCATTAg > 8:343411‑M2/2‑149 (MQ=255) | CTCCAAAATGAAACATCGTAGTTACGCCCGCTACCTTCAGTAACATTTCGTGCGTACACTAAGAGCGAGCGTGAATACGGATGAGACGCAGTCGTGTCAATAGCTGGTAGGTCTCCATCTCACATTGAGGCCGCACTGACTCTGCTAGTGTTCTGTCTCAAAAATAAGTATTCCATTTGAGCTACGCTTCCTTGGTCAAACAGGACGCGGGGTGGAGCGATGAATTCTCAAGACATCGTGCTCAGTGACGATGAACAAGTTGAGCTGAACCGACGAGTTCGGTCTGCCACCATTAG > NC_002947/5061105‑5061400 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |