| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,685,411 | C→G | A494A (GCG→GCC) | PP_4988 ← | signal transduction histidine kinase CheA/CheY‑like receiver |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,685,411 | 0 | C | G | 98.5% | 222.0 / NA | 66 | A494A (GCG→GCC) | PP_4988 | signal transduction histidine kinase CheA/CheY‑like receiver |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (1/0); new base G (35/30); total (36/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TGGCCGGCGGCAAAGTCGGCCAGCAGGTCAGGCAGGTGAACGAACACCTGCTGCAGCGCTACAACCCCTTCCGGACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑CGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTCCGGCAGCAGTTCGCCCGCCTCGTCAA > NC_002947/5685268‑5685556 | tGGCCGGCGGCAAAGTCGGCCAGCAGGTCAGGCAGGTGAACGAACACCTGCTGCAGCGCTACAACCCCTTCCGGACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTc > 1:70731/1‑149 (MQ=255) ggCCGGCGGCAAAGTCGGCCAGCAGGTCAGGCAGGTGAACGAACACCTGCTGCAGCGCTACAACCCCTTCCGGACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCg > 5:181354/1‑149 (MQ=255) cggcggCAAAGTCGGCCAGCAGGTCAGGCAGGTGAACGAACACCTGCTGCAGCGCTACAACCCCTTCCGGACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCa > 6:308398/1‑149 (MQ=255) gcAAAGTCCGCCAGCAGGTCAGGCAGGAGAACGAACACCTGCTGCAGCGCTACAACCCCTTCCGGACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGAc > 1:108925/1‑149 (MQ=255) cGGCCAGCAGGGCAGGCATGTGATCGAACAGCTGCTTCAGCGCTACAACCCCTTCCGGACTTAGCTCGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGTGTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCATGCC‑‑‑‑AGTTCA‑TCAAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCg < 4:99096/148‑1 (MQ=255) ggTCAGGCAGGTGAACGAACACCTGCTGCAGCGCTACAACCCCTTCCGGACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCt < 6:181354/149‑1 (MQ=255) tCAGGCAGGTGAACGAACACCTGCTGCAGCGCTACAACCCCTTCCGGACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCttt < 1:371957/149‑1 (MQ=255) tCAGGCAGGTGAACGAACACCTGCTGCAGCGCTACAACCCCTTCCGGACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCttt > 7:181967/1‑149 (MQ=255) aggcaggTGAACGAACACCTGCTGCAGCGCTACAACCCCTTCCGGACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGa < 5:308398/149‑1 (MQ=255) ggcaggTGAACGAACACCTGCTGCAGCGCTACAACCCCTTCCGGACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAg > 5:304485/1‑149 (MQ=255) gcaggTGAACGAACACCTGCTGTAGCGCTACAACCCCTTCCGGACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCACGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCg > 7:234575/1‑119 (MQ=255) gcaggTGAACGAACACCTGCTGCAGCGCTACAACCCCTTCCGGACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCttt < 7:115776/145‑1 (MQ=255) gcaggTGAACGAACACCTGCTGCAGCGCTACAACCCCTTCCGGACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCttt > 8:115776/1‑145 (MQ=255) ggTGAACGAACACCTGCTGCAGCGCTACAACCCCTTCCGGACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTa < 2:70731/149‑1 (MQ=255) tGAACGAACACCTGCTGCAGCGCTACAACCCCTTCCGGACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATg < 3:281697/149‑1 (MQ=255) tGAACGAACACCTGCTGCAGCGCTACAACCCCTTCCGGACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATg < 1:100031/149‑1 (MQ=255) tGAACGAACACCTGCTGCAGCGCTACAACCCCATCCGGACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGCCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCATTGAGTGTATg > 1:65158/1‑149 (MQ=255) aacgaacACCTGCTGCAGCGCTACAACCCCTTCCGGACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCa < 8:181967/149‑1 (MQ=255) ctgctgCAGCGCTACAACCCCTTCCGGACTGAGCACGCTTCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCATGCC‑‑‑‑AGTTCATCCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATg < 1:269445/139‑1 (MQ=255) ctgctgCAGCGCTACAACCCCTTCCGGACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATg > 2:269445/1‑138 (MQ=255) cAGCGCTACAACCCCTTCCGGACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCAc < 6:118952/147‑1 (MQ=255) cTACAACCCCTTCCGGACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCgg < 2:269871/93‑1 (MQ=255) tACAACCCCTTCCGGACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCAcc > 5:342447/1‑147 (MQ=255) aCAACCCCTTCCGGACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAg > 8:298708/1‑149 (MQ=255) aCAACCCCTTCCGGACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAg > 8:303961/1‑149 (MQ=255) cAACCCCTTCCGGACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCCGGGGGGTTCA‑GCCACGCCGCTCGCCATGCACCATGCGCCCGCTGCCTTTGAGTGTATCCACCGCGCCACGCACTacac > 1:302594/1‑149 (MQ=255) aaCCCCTTCCGGACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTg > 4:360118/1‑149 (MQ=255) ccTTCCGGACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTc > 4:367613/1‑149 (MQ=255) cTTCCGGACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGcc > 8:49053/1‑100 (MQ=255) cTTCCGGACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGcc < 7:49053/100‑1 (MQ=255) ccGGACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTcgcg > 8:164409/1‑148 (MQ=255) ggACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGc > 6:52916/1‑100 (MQ=255) ggACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGc < 5:52916/100‑1 (MQ=255) aCTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCgctgct < 6:304485/149‑1 (MQ=255) aGCAGGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTgg < 2:108925/147‑1 (MQ=255) aCGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTc > 1:75118/1‑149 (MQ=255) gCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCgg < 3:360118/149‑1 (MQ=255) tGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCgctgc < 3:350764/137‑1 (MQ=255) tGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCgctgc > 4:350764/1‑137 (MQ=255) cGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCa < 2:302594/147‑1 (MQ=255) cACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGc > 3:274999/1‑148 (MQ=255) ccGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGtt < 8:80591/126‑1 (MQ=255) ccGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGtt > 7:80591/1‑126 (MQ=255) ccGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGt < 1:253336/128‑1 (MQ=255) ccGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGt > 2:253336/1‑128 (MQ=255) ccGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCa > 7:234462/1‑138 (MQ=255) ccGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCa < 8:234462/138‑1 (MQ=255) ccGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGATGCCTTTGATTGTATGAAGCGCGCGACCCACTTCACCCAGTGCCACGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGACAg > 4:226865/1‑148 (MQ=255) gcagGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTc > 8:144331/1‑148 (MQ=255) gTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCa < 3:308863/131‑1 (MQ=255) gTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCa > 4:308863/1‑131 (MQ=255) gCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTcc < 7:298708/149‑1 (MQ=255) cTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTcc < 7:303961/148‑1 (MQ=255) tCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTCCgg > 8:330026/1‑149 (MQ=255) tCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTCCgg > 2:190259/1‑149 (MQ=255) ggCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTCCgg > 3:280556/1‑147 (MQ=255) ggCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTCCgg < 2:75118/147‑1 (MQ=255) gcCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTCCGgcag > 2:4456/1‑147 (MQ=255) cccATGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGGCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTCCGGCAGCAGt < 3:226865/149‑1 (MQ=255) c‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTCCGGCAGCAGTTcgcccg > 3:126984/1‑149 (MQ=255) a‑GCCAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTCCGGCAGCAGTTCGCCCGCCTCGt < 4:274999/149‑1 (MQ=255) ccAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCTCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTCCGgcagca < 1:176467/132‑1 (MQ=255) ccAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTCCGgcagca > 2:176467/1‑132 (MQ=255) ccAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTCCGGCAGCAGTTCGCCCGCCTCGTc > 6:213266/1‑148 (MQ=255) ccAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCGTTGAGTGTATGCAGCGCGCGCCGCACTTCCCCCCGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCCCGCCCGCGCAGCCAGTGGCGCTCGCTTTCCGGCAGCAGTTcgcccgccgagtc > 3:242378/1‑143 (MQ=255) cAC‑GGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTCCGGCAGCAGTTCGCCCGCCTCGTCaa < 7:164409/149‑1 (MQ=255) | TGGCCGGCGGCAAAGTCGGCCAGCAGGTCAGGCAGGTGAACGAACACCTGCTGCAGCGCTACAACCCCTTCCGGACTGAGCACGCTGCGGCCCTCGAGCACCCGGTTCAGCAGGTGCTCGGCGCCCCAGGCC‑‑‑‑AGTTCA‑GCCAC‑CGCCTCGGCATGGACCATGCGGCCGCTGCCTTTGAGTGTATGCAGCGCGCGACGCACTTCACCCAGTGCCTCGCGCTGCTGGTTGTCGGCACGCCAGCGCAGCCAGTGGCGCTCGATTTCCGGCAGCAGTTCGCCCGCCTCGTCAA > NC_002947/5685268‑5685556 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |