Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 6,013,885 | T→C | intergenic (+90/+20) | xpt → / ← PP_5266 | xanthine phosphoribosyltransferase/acetyl‑CoA hydrolase family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 6,013,885 | 0 | T | C | 98.2% | 186.1 / ‑6.6 | 57 | intergenic (+90/+20) | xpt/PP_5266 | xanthine phosphoribosyltransferase/acetyl‑CoA hydrolase family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (23/33); total (23/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
AATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑TGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTGCATC > NC_002947/6013740‑6014027 | aaTCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCCCTCCCCCAGGTGCAGCACAGGGGGAGCACGCTGGGCCGTAGCTGTGGGAGCGG‑GCGGGCC‑‑‑cgcg > 4:246422/1‑149 (MQ=255) cTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGGGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCGGTGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATgg < 1:7167/149‑1 (MQ=255) gCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACATGCTTCGCGGGCACGCCAGCTCCCACACGTGCAGCAAAGGTATCGAACGCTGTGCCGTACCGGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAAAGGCCg > 6:347634/1‑149 (MQ=37) gCCCGGGTGAAGTCACTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCTTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCg < 8:194863/149‑1 (MQ=255) gCCCGGGGGAAGGCGCTGGAAGGGGGTGGGGTCAGCTTCATCGAATAACCGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCg < 8:13390/149‑1 (MQ=37) ggTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCCCTCCCACACGTGCAGCACACGTCTCGAACGCGGTGGCGGAACAGTGGGAGCGG‑GCGGGGC‑‑‑CCCGAAAGGCCCCAAcc > 2:286785/1‑149 (MQ=255) tGAAGGCGCTGGAAGGGGGTGGGGTCAGCTTCCTCGACTAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGGCTCGAACGCTGGGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCt < 3:36594/149‑1 (MQ=37) aaGTCTCTGGAAGGTGGTGTTGTCAGCTTCATCGAACAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCGGTGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCttt < 5:347634/149‑1 (MQ=38) gTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTa < 5:187590/149‑1 (MQ=255) cTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTg < 6:95711/149‑1 (MQ=255) gacggtggtGTGGTCACCTTCATCGAATAACCGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGTAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGtt < 7:125101/146‑1 (MQ=38) tggtCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACCCGGGCCGCACAGGGATCCAACGCAGTGGCGGACCTGTGGGCGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CCCGAATGGGCGCAACCCGTTTATATGGTTTGcgcccgcc > 2:270608/1‑149 (MQ=21) aTCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGTGCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCcaacaa < 1:286785/149‑1 (MQ=255) gAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAg < 1:221752/149‑1 (MQ=255) aaTAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTgcc < 7:46893/127‑1 (MQ=255) tAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACCCCCCCGCCCACAAGGGCAGCACACGTCTCGAACGCGGTGCCGTACCGGTGGGCGCGG‑GCGTGGC‑‑‑CGCCCATGGCCCCAACCCATTTTTATGGTTTGCGCCAGGCCCCCCAACAACAAgcgc > 6:334169/1‑149 (MQ=255) aaaCGCGACACCTGCTTCGCGGGCACCCCCCCACCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACCCAGTGCCGTACCGGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAAAGGCCGCAACCCGTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCCACAACAAgcgcg > 4:42028/1‑148 (MQ=37) cgcgACACCTGCTGCCCGGGCACCCCCGCTCCCACAGGTTCAGCCCAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTCCCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGt < 2:271259/149‑1 (MQ=38) acacCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAg < 2:283185/149‑1 (MQ=255) cTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGttctt < 3:309680/147‑1 (MQ=255) cgcgGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCttt < 5:369863/148‑1 (MQ=255) cgcgGGCACGCCCGATCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGGGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCttt < 7:166399/148‑1 (MQ=255) tCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTaa < 6:42871/135‑1 (MQ=255) tCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTaa > 5:42871/1‑135 (MQ=255) cccACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGcc > 5:93397/1‑149 (MQ=255) ccACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAAGAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGccc > 5:313736/1‑149 (MQ=255) ccACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGc < 5:65896/147‑1 (MQ=255) ccACAGGTACGGCACAGCGTTCGAGACCTGTGCTGCACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGccc > 6:51817/1‑149 (MQ=21) cacaGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGcccc < 6:217658/149‑1 (MQ=255) cacaGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGACGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGccc > 3:148971/1‑148 (MQ=255) acaGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCttt < 4:360251/129‑1 (MQ=255) acaGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCttt > 3:360251/1‑129 (MQ=255) ggTGCACCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑TGCGAATGGCCGCAACCCTATTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACt < 1:119542/149‑1 (MQ=255) gTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTg > 2:336037/1‑149 (MQ=255) ggTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGcccc > 2:174425/1‑149 (MQ=255) ggcGAACTCTTGGCCGTAACTGTGGGATGGG‑GCGGGCCCCACGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGcccc < 1:308761/147‑1 (MQ=255) gAACGCCGTGCCGTACCCGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTg < 1:339406/148‑1 (MQ=255) aaCGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGc > 8:135802/1‑149 (MQ=255) aCGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCt < 3:246422/149‑1 (MQ=255) cGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCtt < 6:93397/149‑1 (MQ=255) cTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTc < 7:135802/149‑1 (MQ=255) tgtgCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCcaacaac < 2:67764/80‑1 (MQ=255) tgtgCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCcaacaac > 1:67764/1‑80 (MQ=255) tgtgCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCa > 2:355242/1‑149 (MQ=255) gCCGAACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAAGCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATAc < 5:313951/149‑1 (MQ=255) ccGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATAc < 1:355242/148‑1 (MQ=255) cGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACATCAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATAccc < 1:270608/149‑1 (MQ=255) gtgGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGGCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTGTGCTTTTCGCGCCTGCGGCTGCGCCAGCTGCGTCGGCGCCAGGTGGCTTGGAGACCGCTCCggg > 6:284159/1‑148 (MQ=255) tgGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCACCCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGcc > 4:27745/1‑149 (MQ=255) gggccgggg‑ggGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGcc < 1:352975/142‑1 (MQ=255) attcgCGG‑GCACGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCACCCCTATTATCTGGGTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACCAGCCCGGGTAAAGTTCTTGTTTAAGCCCCTGCGGCAGCCCCAACTGCATGCGCCCCAGGTGGCGTTGCTACCCCTCCGGccc > 1:238654/5‑149 (MQ=255) gAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCg > 7:100555/1‑149 (MQ=255) aGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAg > 2:160549/1‑77 (MQ=255) aGCGG‑GCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAg < 1:160549/77‑1 (MQ=255) g‑gCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTGCa > 4:174366/1‑149 (MQ=255) gCGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCACTCCGGCCCCGGTGCa > 7:14271/1‑148 (MQ=255) cGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTGCATc < 6:313736/149‑1 (MQ=255) cGTGCC‑‑‑CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTGCATc < 3:42028/149‑1 (MQ=255) | AATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCC‑‑‑TGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTGCATC > NC_002947/6013740‑6014027 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |